MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022106	TGAT	2	8	69414	69421	25 %	50 %	25 %	0 %	532349565
1502	NC_022106	T	6	6	69462	69467	0 %	100 %	0 %	0 %	532349565
1503	NC_022106	TCT	2	6	69578	69583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349565
1504	NC_022106	GGAGC	2	10	69701	69710	20 %	0 %	60 %	20 %	532349565
1505	NC_022106	TGC	2	6	69784	69789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349565
1506	NC_022106	A	7	7	69821	69827	100 %	0 %	0 %	0 %	532349565
1507	NC_022106	CT	3	6	69829	69834	0 %	50 %	0 %	50 %	532349565
1508	NC_022106	AGA	2	6	69838	69843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349565
1509	NC_022106	GCGAT	2	10	69891	69900	20 %	20 %	40 %	20 %	532349565
1510	NC_022106	GTT	2	6	69913	69918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349565
1511	NC_022106	GCT	2	6	69935	69940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349565
1512	NC_022106	GCA	3	9	70037	70045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349565
1513	NC_022106	AAAG	2	8	70070	70077	75 %	0 %	25 %	0 %	532349565
1514	NC_022106	GCA	2	6	70084	70089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349565
1515	NC_022106	ATT	2	6	70098	70103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349565
1516	NC_022106	TAT	2	6	70206	70211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349565
1517	NC_022106	CTT	2	6	70230	70235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349565
1518	NC_022106	GA	3	6	70239	70244	50 %	0 %	50 %	0 %	532349565
1519	NC_022106	CTCTT	2	10	70245	70254	0 %	60 %	0 %	40 %	532349565
1520	NC_022106	AGAA	2	8	70257	70264	75 %	0 %	25 %	0 %	532349565
1521	NC_022106	TGA	2	6	70285	70290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349565
1522	NC_022106	TTG	2	6	70374	70379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349565
1523	NC_022106	TCT	2	6	70397	70402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349565
1524	NC_022106	GA	3	6	70438	70443	50 %	0 %	50 %	0 %	532349565
1525	NC_022106	AGCT	2	8	70479	70486	25 %	25 %	25 %	25 %	532349565
1526	NC_022106	TGA	2	6	70525	70530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349565
1527	NC_022106	GCAT	2	8	70540	70547	25 %	25 %	25 %	25 %	532349565
1528	NC_022106	AGA	2	6	70558	70563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349565
1529	NC_022106	TCAA	2	8	70684	70691	50 %	25 %	0 %	25 %	532349565
1530	NC_022106	GT	3	6	70714	70719	0 %	50 %	50 %	0 %	532349565
1531	NC_022106	CT	3	6	70795	70800	0 %	50 %	0 %	50 %	532349565
1532	NC_022106	GA	3	6	70816	70821	50 %	0 %	50 %	0 %	532349565
1533	NC_022106	AGT	2	6	70858	70863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349565
1534	NC_022106	AGGGG	2	10	70891	70900	20 %	0 %	80 %	0 %	532349565
1535	NC_022106	AAGAA	2	10	70933	70942	80 %	0 %	20 %	0 %	532349565
1536	NC_022106	AGA	2	6	71005	71010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349565
1537	NC_022106	TGA	2	6	71041	71046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349565
1538	NC_022106	TAT	2	6	71052	71057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349565
1539	NC_022106	T	6	6	71141	71146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_022106	T	8	8	71162	71169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_022106	CAT	2	6	71227	71232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349566
1542	NC_022106	CCTT	2	8	71256	71263	0 %	50 %	0 %	50 %	532349566
1543	NC_022106	GCTT	2	8	71286	71293	0 %	50 %	25 %	25 %	532349566
1544	NC_022106	A	6	6	71381	71386	100 %	0 %	0 %	0 %	532349566
1545	NC_022106	ATT	2	6	71431	71436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349566
1546	NC_022106	CAA	2	6	71578	71583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349566
1547	NC_022106	TCC	2	6	71602	71607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349566
1548	NC_022106	TTCT	2	8	71624	71631	0 %	75 %	0 %	25 %	532349566
1549	NC_022106	ATG	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349566
1550	NC_022106	GCTT	2	8	71670	71677	0 %	50 %	25 %	25 %	532349566
1551	NC_022106	AGA	2	6	71679	71684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349566
1552	NC_022106	GAGC	2	8	71698	71705	25 %	0 %	50 %	25 %	532349566
1553	NC_022106	TCA	2	6	71723	71728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349566
1554	NC_022106	A	7	7	71730	71736	100 %	0 %	0 %	0 %	532349566
1555	NC_022106	CTATTT	2	12	71741	71752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532349566
1556	NC_022106	TGA	2	6	71775	71780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349566
1557	NC_022106	ATG	2	6	71813	71818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349566
1558	NC_022106	AGA	2	6	71943	71948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_022106	CGT	2	6	71991	71996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350351
1560	NC_022106	T	7	7	71996	72002	0 %	100 %	0 %	0 %	532350351
1561	NC_022106	CTTGC	2	10	72022	72031	0 %	40 %	20 %	40 %	532350351
1562	NC_022106	GATA	2	8	72046	72053	50 %	25 %	25 %	0 %	532350351
1563	NC_022106	TTC	2	6	72137	72142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349567
1564	NC_022106	CTT	2	6	72205	72210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349567
1565	NC_022106	ATTGG	2	10	72223	72232	20 %	40 %	40 %	0 %	532349567
1566	NC_022106	T	6	6	72239	72244	0 %	100 %	0 %	0 %	532349567
1567	NC_022106	AGC	2	6	72254	72259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349567
1568	NC_022106	TTG	2	6	72283	72288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349567
1569	NC_022106	ATA	2	6	72367	72372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349567
1570	NC_022106	GCT	2	6	72387	72392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349567
1571	NC_022106	GCTA	2	8	72396	72403	25 %	25 %	25 %	25 %	532349567
1572	NC_022106	AAT	2	6	72426	72431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349567
1573	NC_022106	TGG	2	6	72457	72462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349567
1574	NC_022106	T	6	6	72464	72469	0 %	100 %	0 %	0 %	532349567
1575	NC_022106	AGC	2	6	72526	72531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349567
1576	NC_022106	TTAT	2	8	72572	72579	25 %	75 %	0 %	0 %	532349567
1577	NC_022106	TGC	2	6	72580	72585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349567
1578	NC_022106	TGT	2	6	72623	72628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349567
1579	NC_022106	GGAG	2	8	72639	72646	25 %	0 %	75 %	0 %	532349567
1580	NC_022106	GATT	2	8	72674	72681	25 %	50 %	25 %	0 %	532349567
1581	NC_022106	GAA	2	6	72749	72754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349567
1582	NC_022106	CTGG	2	8	72782	72789	0 %	25 %	50 %	25 %	532349567
1583	NC_022106	CTC	2	6	72802	72807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349567
1584	NC_022106	ACTCTT	2	12	72870	72881	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532349567
1585	NC_022106	GAA	2	6	72891	72896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349567
1586	NC_022106	TGA	2	6	72908	72913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349567
1587	NC_022106	GAA	2	6	72941	72946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349567
1588	NC_022106	T	6	6	73023	73028	0 %	100 %	0 %	0 %	532349567
1589	NC_022106	TAG	2	6	73063	73068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349567
1590	NC_022106	TAG	2	6	73072	73077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349567
1591	NC_022106	AGA	2	6	73179	73184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349567
1592	NC_022106	ATCA	2	8	73209	73216	50 %	25 %	0 %	25 %	532349567
1593	NC_022106	TGT	2	6	73282	73287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349567
1594	NC_022106	GAAAA	2	10	73295	73304	80 %	0 %	20 %	0 %	532349567
1595	NC_022106	A	7	7	73301	73307	100 %	0 %	0 %	0 %	532349567
1596	NC_022106	AGG	2	6	73327	73332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349567
1597	NC_022106	TGG	2	6	73405	73410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349568
1598	NC_022106	TTTCTG	2	12	73420	73431	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532349568
1599	NC_022106	AGA	2	6	73457	73462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349568
1600	NC_022106	GA	3	6	73480	73485	50 %	0 %	50 %	0 %	532349568
1601	NC_022106	TAC	2	6	73505	73510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349568
1602	NC_022106	GATCAT	2	12	73550	73561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532349568
1603	NC_022106	TGA	2	6	73583	73588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349568
1604	NC_022106	G	6	6	73641	73646	0 %	0 %	100 %	0 %	532349568
1605	NC_022106	TAT	2	6	73653	73658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349568
1606	NC_022106	A	6	6	73689	73694	100 %	0 %	0 %	0 %	532349568
1607	NC_022106	TGGGA	2	10	73712	73721	20 %	20 %	60 %	0 %	532349568
1608	NC_022106	GCT	2	6	73821	73826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349568
1609	NC_022106	TGGA	2	8	73831	73838	25 %	25 %	50 %	0 %	532349568
1610	NC_022106	AGG	2	6	73865	73870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349568
1611	NC_022106	TC	3	6	73967	73972	0 %	50 %	0 %	50 %	532349568
1612	NC_022106	T	6	6	73995	74000	0 %	100 %	0 %	0 %	532349568
1613	NC_022106	AGC	3	9	74039	74047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349568
1614	NC_022106	AGGC	2	8	74155	74162	25 %	0 %	50 %	25 %	532349568
1615	NC_022106	ATT	2	6	74178	74183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349568
1616	NC_022106	AAG	2	6	74218	74223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349568
1617	NC_022106	AAG	2	6	74281	74286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349568
1618	NC_022106	TGC	2	6	74359	74364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349568
1619	NC_022106	TC	3	6	74374	74379	0 %	50 %	0 %	50 %	532349568
1620	NC_022106	TCA	2	6	74468	74473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349568
1621	NC_022106	ATT	2	6	74518	74523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349568
1622	NC_022106	TCT	2	6	74610	74615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349568
1623	NC_022106	ATG	2	6	74629	74634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349568
1624	NC_022106	AAG	2	6	74784	74789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_022106	ACT	2	6	74799	74804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_022106	T	6	6	74810	74815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022106	AGT	2	6	74835	74840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022106	CAA	2	6	74861	74866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349569
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