MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/971

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021899	CAA	2	6	249070	249075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328519
5503	NC_021899	CCCA	2	8	249195	249202	25 %	0 %	0 %	75 %	527328520
5504	NC_021899	CTT	2	6	249324	249329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328520
5505	NC_021899	AAT	2	6	249403	249408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328520
5506	NC_021899	CTC	2	6	249414	249419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328520
5507	NC_021899	ACT	2	6	249422	249427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527328520
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5509	NC_021899	CTC	2	6	249471	249476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328520
5510	NC_021899	GCAA	2	8	249485	249492	50 %	0 %	25 %	25 %	527328520
5511	NC_021899	AAC	2	6	249502	249507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527328520
5512	NC_021899	GTT	2	6	249547	249552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328520
5513	NC_021899	AAC	2	6	249586	249591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_021899	A	6	6	249600	249605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021899	TAA	2	6	249651	249656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021899	TTC	2	6	249669	249674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328521
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5518	NC_021899	T	7	7	249710	249716	0 %	100 %	0 %	0 %	527328521
5519	NC_021899	AGCA	2	8	249747	249754	50 %	0 %	25 %	25 %	527328521
5520	NC_021899	CTT	2	6	249764	249769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328521
5521	NC_021899	TCT	3	9	249775	249783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328521
5522	NC_021899	GATAA	2	10	249803	249812	60 %	20 %	20 %	0 %	527328521
5523	NC_021899	TCG	2	6	249869	249874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527328521
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5534	NC_021899	A	8	8	250171	250178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021899	TA	3	6	250220	250225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021899	CCAA	2	8	250255	250262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_021899	A	7	7	250279	250285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_021899	TAT	2	6	250298	250303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328522
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5541	NC_021899	TGTT	2	8	250404	250411	0 %	75 %	25 %	0 %	527328522
5542	NC_021899	CGA	2	6	250525	250530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527328522
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5544	NC_021899	AATA	2	8	250623	250630	75 %	25 %	0 %	0 %	527328522
5545	NC_021899	A	6	6	250689	250694	100 %	0 %	0 %	0 %	527328522
5546	NC_021899	A	7	7	250720	250726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021899	ATA	2	6	250733	250738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021899	AACCCT	2	12	250779	250790	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_021899	AAAC	2	8	250853	250860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_021899	AAG	2	6	250977	250982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527328523
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5553	NC_021899	TTA	2	6	251189	251194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328523
5554	NC_021899	CTTCT	2	10	251221	251230	0 %	60 %	0 %	40 %	527328523
5555	NC_021899	T	6	6	251264	251269	0 %	100 %	0 %	0 %	527328523
5556	NC_021899	CA	3	6	251323	251328	50 %	0 %	0 %	50 %	527328523
5557	NC_021899	AAT	2	6	251338	251343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527328523
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5560	NC_021899	TTG	2	6	251478	251483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527328523
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5564	NC_021899	GAG	2	6	251702	251707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021899	ATT	2	6	251714	251719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328524
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5572	NC_021899	TCC	2	6	251878	251883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527328524
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5598	NC_021899	TTA	2	6	252898	252903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527328525
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5606	NC_021899	TC	3	6	253324	253329	0 %	50 %	0 %	50 %	527328525
5607	NC_021899	TCT	2	6	253386	253391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527328525
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5612	NC_021899	CAC	2	6	253517	253522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527328525
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5623	NC_021899	TTG	2	6	253965	253970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_021899	ACT	2	6	253996	254001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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