MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 22957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_021898	TGT	2	6	69235	69240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327431
1503	NC_021898	TGAT	2	8	69327	69334	25 %	50 %	25 %	0 %	527327431
1504	NC_021898	T	6	6	69375	69380	0 %	100 %	0 %	0 %	527327431
1505	NC_021898	TCT	2	6	69491	69496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327431
1506	NC_021898	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527327431
1507	NC_021898	TGC	2	6	69697	69702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327431
1508	NC_021898	A	7	7	69734	69740	100 %	0 %	0 %	0 %	527327431
1509	NC_021898	CT	3	6	69742	69747	0 %	50 %	0 %	50 %	527327431
1510	NC_021898	AGA	2	6	69751	69756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327431
1511	NC_021898	ATT	2	6	69762	69767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327431
1512	NC_021898	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527327431
1513	NC_021898	GTT	2	6	69826	69831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327431
1514	NC_021898	GCT	2	6	69848	69853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327431
1515	NC_021898	GCA	3	9	69950	69958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327431
1516	NC_021898	AAAG	2	8	69983	69990	75 %	0 %	25 %	0 %	527327431
1517	NC_021898	GCA	2	6	69997	70002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327431
1518	NC_021898	ATT	2	6	70011	70016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327431
1519	NC_021898	TAT	2	6	70119	70124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327431
1520	NC_021898	CTT	2	6	70143	70148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327431
1521	NC_021898	GA	3	6	70152	70157	50 %	0 %	50 %	0 %	527327431
1522	NC_021898	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527327431
1523	NC_021898	AGAA	2	8	70170	70177	75 %	0 %	25 %	0 %	527327431
1524	NC_021898	TGA	2	6	70198	70203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327431
1525	NC_021898	TTG	2	6	70287	70292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327431
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1527	NC_021898	GA	3	6	70351	70356	50 %	0 %	50 %	0 %	527327431
1528	NC_021898	AGCT	2	8	70392	70399	25 %	25 %	25 %	25 %	527327431
1529	NC_021898	TGA	2	6	70438	70443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327431
1530	NC_021898	GCAT	2	8	70453	70460	25 %	25 %	25 %	25 %	527327431
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1532	NC_021898	TCAA	2	8	70597	70604	50 %	25 %	0 %	25 %	527327431
1533	NC_021898	GT	3	6	70627	70632	0 %	50 %	50 %	0 %	527327431
1534	NC_021898	CT	3	6	70708	70713	0 %	50 %	0 %	50 %	527327431
1535	NC_021898	GA	3	6	70729	70734	50 %	0 %	50 %	0 %	527327431
1536	NC_021898	AGT	2	6	70771	70776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327431
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1538	NC_021898	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527327431
1539	NC_021898	AGA	2	6	70918	70923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327431
1540	NC_021898	TGA	2	6	70954	70959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327431
1541	NC_021898	TAT	2	6	70965	70970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327431
1542	NC_021898	T	6	6	71054	71059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021898	T	8	8	71075	71082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021898	CAT	2	6	71140	71145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327432
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1546	NC_021898	GCTT	2	8	71199	71206	0 %	50 %	25 %	25 %	527327432
1547	NC_021898	A	6	6	71294	71299	100 %	0 %	0 %	0 %	527327432
1548	NC_021898	ATT	2	6	71344	71349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327432
1549	NC_021898	CAA	2	6	71491	71496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327432
1550	NC_021898	TCC	2	6	71515	71520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327432
1551	NC_021898	TTCT	2	8	71537	71544	0 %	75 %	0 %	25 %	527327432
1552	NC_021898	ATG	2	6	71549	71554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327432
1553	NC_021898	GCTT	2	8	71583	71590	0 %	50 %	25 %	25 %	527327432
1554	NC_021898	AGA	2	6	71592	71597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327432
1555	NC_021898	GAGC	2	8	71611	71618	25 %	0 %	50 %	25 %	527327432
1556	NC_021898	TCA	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327432
1557	NC_021898	A	7	7	71643	71649	100 %	0 %	0 %	0 %	527327432
1558	NC_021898	CTATTT	2	12	71654	71665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527327432
1559	NC_021898	TGA	2	6	71688	71693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327432
1560	NC_021898	ATG	2	6	71726	71731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327432
1561	NC_021898	AGA	2	6	71856	71861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021898	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_021898	CGT	2	6	71904	71909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021898	T	7	7	71909	71915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021898	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1566	NC_021898	GATA	2	8	71959	71966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021898	TTC	2	6	72050	72055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327433
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1569	NC_021898	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527327433
1570	NC_021898	T	6	6	72152	72157	0 %	100 %	0 %	0 %	527327433
1571	NC_021898	AGC	2	6	72167	72172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327433
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1573	NC_021898	ATA	2	6	72280	72285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327433
1574	NC_021898	GCT	2	6	72300	72305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327433
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1584	NC_021898	GATT	2	8	72587	72594	25 %	50 %	25 %	0 %	527327433
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1587	NC_021898	CTC	2	6	72715	72720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327433
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1594	NC_021898	TAG	2	6	72985	72990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327433
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1599	NC_021898	A	7	7	73214	73220	100 %	0 %	0 %	0 %	527327433
1600	NC_021898	AGG	2	6	73240	73245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327433
1601	NC_021898	TGG	2	6	73318	73323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327434
1602	NC_021898	TTTCTG	2	12	73333	73344	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527327434
1603	NC_021898	AGA	2	6	73370	73375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327434
1604	NC_021898	GA	3	6	73393	73398	50 %	0 %	50 %	0 %	527327434
1605	NC_021898	TAC	2	6	73418	73423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327434
1606	NC_021898	GATCAT	2	12	73463	73474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527327434
1607	NC_021898	TGA	2	6	73496	73501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327434
1608	NC_021898	G	6	6	73554	73559	0 %	0 %	100 %	0 %	527327434
1609	NC_021898	TAT	2	6	73566	73571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327434
1610	NC_021898	A	6	6	73602	73607	100 %	0 %	0 %	0 %	527327434
1611	NC_021898	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527327434
1612	NC_021898	GCT	2	6	73734	73739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327434
1613	NC_021898	GGTG	2	8	73742	73749	0 %	25 %	75 %	0 %	527327434
1614	NC_021898	GAC	2	6	73750	73755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327434
1615	NC_021898	AGG	2	6	73778	73783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327434
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1617	NC_021898	T	6	6	73908	73913	0 %	100 %	0 %	0 %	527327434
1618	NC_021898	CCT	2	6	73943	73948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327434
1619	NC_021898	AGC	3	9	73952	73960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327434
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1623	NC_021898	AAG	2	6	74194	74199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327434
1624	NC_021898	TGC	2	6	74272	74277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327434
1625	NC_021898	TC	3	6	74287	74292	0 %	50 %	0 %	50 %	527327434
1626	NC_021898	TCA	2	6	74381	74386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327434
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