MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 22957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021898	CCA	2	6	249023	249028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327594
5503	NC_021898	CAA	2	6	249071	249076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327594
5504	NC_021898	CCCA	2	8	249196	249203	25 %	0 %	0 %	75 %	527327595
5505	NC_021898	CTT	2	6	249325	249330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327595
5506	NC_021898	AAT	2	6	249404	249409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327595
5507	NC_021898	CTC	2	6	249415	249420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327595
5508	NC_021898	ACT	2	6	249423	249428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327595
5509	NC_021898	GAA	2	6	249441	249446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327595
5510	NC_021898	CTC	2	6	249472	249477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327595
5511	NC_021898	GCAA	2	8	249486	249493	50 %	0 %	25 %	25 %	527327595
5512	NC_021898	AAC	2	6	249503	249508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327595
5513	NC_021898	GTT	2	6	249548	249553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327595
5514	NC_021898	AAC	2	6	249587	249592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_021898	A	6	6	249601	249606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021898	TAA	2	6	249652	249657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021898	TTC	2	6	249670	249675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327596
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5519	NC_021898	T	7	7	249711	249717	0 %	100 %	0 %	0 %	527327596
5520	NC_021898	AGCA	2	8	249748	249755	50 %	0 %	25 %	25 %	527327596
5521	NC_021898	CTT	2	6	249765	249770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327596
5522	NC_021898	TCT	3	9	249776	249784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327596
5523	NC_021898	GATAA	2	10	249804	249813	60 %	20 %	20 %	0 %	527327596
5524	NC_021898	TCG	2	6	249870	249875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327596
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5533	NC_021898	GTA	2	6	250073	250078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327596
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5535	NC_021898	A	6	6	250172	250177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_021898	TA	3	6	250219	250224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_021898	CCAA	2	8	250254	250261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_021898	A	7	7	250278	250284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021898	TAT	2	6	250297	250302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327597
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5541	NC_021898	AGA	3	9	250365	250373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327597
5542	NC_021898	TGTT	2	8	250403	250410	0 %	75 %	25 %	0 %	527327597
5543	NC_021898	CGA	2	6	250524	250529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327597
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5545	NC_021898	AATA	2	8	250622	250629	75 %	25 %	0 %	0 %	527327597
5546	NC_021898	A	6	6	250688	250693	100 %	0 %	0 %	0 %	527327597
5547	NC_021898	A	7	7	250719	250725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021898	ATA	2	6	250733	250738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021898	CCT	2	6	250788	250793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_021898	AAAC	2	8	250862	250869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_021898	AAG	2	6	250986	250991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327598
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5554	NC_021898	TTA	2	6	251198	251203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327598
5555	NC_021898	CTTCT	2	10	251230	251239	0 %	60 %	0 %	40 %	527327598
5556	NC_021898	T	6	6	251273	251278	0 %	100 %	0 %	0 %	527327598
5557	NC_021898	CA	3	6	251332	251337	50 %	0 %	0 %	50 %	527327598
5558	NC_021898	AAT	2	6	251347	251352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327598
5559	NC_021898	ACA	2	6	251423	251428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327598
5560	NC_021898	TTG	2	6	251487	251492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327598
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5564	NC_021898	GAG	2	6	251711	251716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021898	ATT	2	6	251723	251728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327599
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5575	NC_021898	TACT	2	8	251962	251969	25 %	50 %	0 %	25 %	527327599
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5588	NC_021898	AAT	2	6	252448	252453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021898	AG	3	6	252510	252515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5600	NC_021898	CT	4	8	252842	252849	0 %	50 %	0 %	50 %	527327600
5601	NC_021898	TTA	2	6	252907	252912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327600
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5608	NC_021898	TC	3	6	253333	253338	0 %	50 %	0 %	50 %	527327600
5609	NC_021898	TCT	2	6	253395	253400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327600
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5614	NC_021898	CAC	2	6	253526	253531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327600
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5620	NC_021898	A	6	6	253791	253796	100 %	0 %	0 %	0 %	527327600
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5624	NC_021898	ACT	2	6	254005	254010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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