MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 22957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021898	CTTAGC	2	12	226056	226067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527327573
5003	NC_021898	GGA	2	6	226087	226092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327573
5004	NC_021898	CA	3	6	226095	226100	50 %	0 %	0 %	50 %	527327573
5005	NC_021898	TGG	2	6	226159	226164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327573
5006	NC_021898	TTGG	2	8	226203	226210	0 %	50 %	50 %	0 %	527327573
5007	NC_021898	TGG	3	9	226222	226230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327573
5008	NC_021898	GTC	2	6	226276	226281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327574
5009	NC_021898	CTT	2	6	226314	226319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327574
5010	NC_021898	AGA	2	6	226360	226365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327574
5011	NC_021898	CTT	2	6	226382	226387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327574
5012	NC_021898	CTA	2	6	226441	226446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327574
5013	NC_021898	ATTT	2	8	226450	226457	25 %	75 %	0 %	0 %	527327574
5014	NC_021898	TGG	2	6	226528	226533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327574
5015	NC_021898	AAT	3	9	226628	226636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327574
5016	NC_021898	GAA	2	6	226727	226732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327574
5017	NC_021898	GC	3	6	226739	226744	0 %	0 %	50 %	50 %	527327574
5018	NC_021898	ATT	2	6	226787	226792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327574
5019	NC_021898	GCA	2	6	226900	226905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327574
5020	NC_021898	CTA	2	6	226941	226946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327574
5021	NC_021898	CATC	2	8	226956	226963	25 %	25 %	0 %	50 %	527327574
5022	NC_021898	TTA	2	6	227013	227018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327574
5023	NC_021898	TCT	3	9	227033	227041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327574
5024	NC_021898	A	6	6	227109	227114	100 %	0 %	0 %	0 %	527327574
5025	NC_021898	ATA	2	6	227153	227158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327574
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5028	NC_021898	T	6	6	227482	227487	0 %	100 %	0 %	0 %	527327574
5029	NC_021898	GC	3	6	227641	227646	0 %	0 %	50 %	50 %	527327574
5030	NC_021898	GAC	2	6	227668	227673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327574
5031	NC_021898	A	8	8	227710	227717	100 %	0 %	0 %	0 %	527327574
5032	NC_021898	TAA	2	6	227746	227751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327574
5033	NC_021898	AGA	2	6	227782	227787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327574
5034	NC_021898	GGA	2	6	227827	227832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327574
5035	NC_021898	TGA	2	6	227842	227847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327574
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5037	NC_021898	AATG	2	8	227879	227886	50 %	25 %	25 %	0 %	527327574
5038	NC_021898	ATT	2	6	227928	227933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327574
5039	NC_021898	ATG	2	6	227974	227979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327575
5040	NC_021898	CAA	2	6	227980	227985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327575
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5042	NC_021898	A	6	6	228080	228085	100 %	0 %	0 %	0 %	527327575
5043	NC_021898	AAG	2	6	228176	228181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327575
5044	NC_021898	A	6	6	228275	228280	100 %	0 %	0 %	0 %	527327575
5045	NC_021898	AGG	2	6	228345	228350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327575
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5050	NC_021898	A	6	6	228517	228522	100 %	0 %	0 %	0 %	527327575
5051	NC_021898	AAG	2	6	228578	228583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327575
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5054	NC_021898	TCA	2	6	228699	228704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327575
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5057	NC_021898	CTT	2	6	228886	228891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327576
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5059	NC_021898	CTT	3	9	228973	228981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327576
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5065	NC_021898	ATT	2	6	229168	229173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327576
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5071	NC_021898	AGG	2	6	229292	229297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327576
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5082	NC_021898	GCT	2	6	230070	230075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327576
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5090	NC_021898	AGA	2	6	230451	230456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021898	GAG	2	6	230468	230473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021898	GCT	2	6	230520	230525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021898	ACC	2	6	230529	230534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_021898	A	6	6	230560	230565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021898	ACT	2	6	230624	230629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_021898	T	7	7	230775	230781	0 %	100 %	0 %	0 %	527327577
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5102	NC_021898	TAA	2	6	230930	230935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327577
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5105	NC_021898	CTG	2	6	230986	230991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327577
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5108	NC_021898	AGA	2	6	231158	231163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327577
5109	NC_021898	AG	3	6	231294	231299	50 %	0 %	50 %	0 %	527327577
5110	NC_021898	GTT	2	6	231370	231375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327577
5111	NC_021898	GTA	2	6	231391	231396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327577
5112	NC_021898	TTCC	2	8	231423	231430	0 %	50 %	0 %	50 %	527327577
5113	NC_021898	A	6	6	231441	231446	100 %	0 %	0 %	0 %	527327577
5114	NC_021898	A	6	6	231525	231530	100 %	0 %	0 %	0 %	527327577
5115	NC_021898	TAA	2	6	231595	231600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327577
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5119	NC_021898	AAG	2	6	231737	231742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327577
5120	NC_021898	GACT	2	8	231754	231761	25 %	25 %	25 %	25 %	527327577
5121	NC_021898	AT	3	6	231852	231857	50 %	50 %	0 %	0 %	527327577
5122	NC_021898	A	6	6	231880	231885	100 %	0 %	0 %	0 %	527327577
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5500	NC_021898	GCT	2	6	248926	248931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327594

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