MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/3

Total Repeats: 23090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021897	AAG	2	6	226864	226869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326639
5002	NC_021897	CCT	2	6	226876	226881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326639
5003	NC_021897	TCCT	2	8	226909	226916	0 %	50 %	0 %	50 %	527326639
5004	NC_021897	AGC	2	6	226939	226944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326639
5005	NC_021897	CTT	2	6	226945	226950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326639
5006	NC_021897	CAA	2	6	226956	226961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326639
5007	NC_021897	AGA	2	6	226991	226996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326639
5008	NC_021897	CTGA	2	8	227001	227008	25 %	25 %	25 %	25 %	527326639
5009	NC_021897	GAA	2	6	227110	227115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326639
5010	NC_021897	TTG	2	6	227157	227162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326639
5011	NC_021897	CTTT	2	8	227185	227192	0 %	75 %	0 %	25 %	527326639
5012	NC_021897	TTTC	2	8	227238	227245	0 %	75 %	0 %	25 %	527326639
5013	NC_021897	TC	3	6	227309	227314	0 %	50 %	0 %	50 %	527326639
5014	NC_021897	A	7	7	227326	227332	100 %	0 %	0 %	0 %	527326639
5015	NC_021897	ACG	2	6	227410	227415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326639
5016	NC_021897	ACA	2	6	227427	227432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326639
5017	NC_021897	AAT	2	6	227433	227438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326639
5018	NC_021897	CTTT	2	8	227442	227449	0 %	75 %	0 %	25 %	527326639
5019	NC_021897	TC	3	6	227536	227541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_021897	AG	3	6	227567	227572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021897	CAATA	2	10	227637	227646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5022	NC_021897	CTA	2	6	227658	227663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326640
5023	NC_021897	GGC	2	6	227682	227687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527326640
5024	NC_021897	TGT	2	6	227688	227693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326640
5025	NC_021897	CTTT	2	8	227702	227709	0 %	75 %	0 %	25 %	527326640
5026	NC_021897	GTA	2	6	227714	227719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326640
5027	NC_021897	T	6	6	227732	227737	0 %	100 %	0 %	0 %	527326640
5028	NC_021897	ATT	2	6	227738	227743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326640
5029	NC_021897	ATG	2	6	227769	227774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326640
5030	NC_021897	TATCT	2	10	227855	227864	20 %	60 %	0 %	20 %	527326640
5031	NC_021897	TAT	2	6	227932	227937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326640
5032	NC_021897	TGC	2	6	227938	227943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326640
5033	NC_021897	A	7	7	228035	228041	100 %	0 %	0 %	0 %	527326640
5034	NC_021897	TTTTC	2	10	228057	228066	0 %	80 %	0 %	20 %	527326640
5035	NC_021897	TC	3	6	228171	228176	0 %	50 %	0 %	50 %	527326640
5036	NC_021897	CATT	2	8	228219	228226	25 %	50 %	0 %	25 %	527326640
5037	NC_021897	A	7	7	228262	228268	100 %	0 %	0 %	0 %	527326640
5038	NC_021897	TTA	2	6	228278	228283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326640
5039	NC_021897	TAA	2	6	228318	228323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326640
5040	NC_021897	AAC	2	6	228379	228384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326640
5041	NC_021897	TTG	2	6	228532	228537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326640
5042	NC_021897	ATA	2	6	228601	228606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326640
5043	NC_021897	TAA	2	6	228610	228615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021897	AAAC	2	8	228626	228633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_021897	ACAA	2	8	228678	228685	75 %	0 %	0 %	25 %	527326641
5046	NC_021897	TTC	2	6	228739	228744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326641
5047	NC_021897	CT	3	6	228873	228878	0 %	50 %	0 %	50 %	527326641
5048	NC_021897	ATT	2	6	228903	228908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326641
5049	NC_021897	ACT	2	6	228923	228928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326641
5050	NC_021897	A	7	7	228956	228962	100 %	0 %	0 %	0 %	527326641
5051	NC_021897	ATT	2	6	229023	229028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326641
5052	NC_021897	TTA	2	6	229032	229037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326641
5053	NC_021897	CTGG	2	8	229087	229094	0 %	25 %	50 %	25 %	527326641
5054	NC_021897	TAT	2	6	229109	229114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326641
5055	NC_021897	TGT	2	6	229153	229158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326641
5056	NC_021897	ATT	2	6	229230	229235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326641
5057	NC_021897	TCA	2	6	229282	229287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326641
5058	NC_021897	CCT	2	6	229311	229316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326641
5059	NC_021897	CATT	2	8	229349	229356	25 %	50 %	0 %	25 %	527326641
5060	NC_021897	CTT	2	6	229379	229384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326641
5061	NC_021897	T	6	6	229395	229400	0 %	100 %	0 %	0 %	527326641
5062	NC_021897	TTA	2	6	229486	229491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326642
5063	NC_021897	GTC	2	6	229507	229512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326642
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5067	NC_021897	GAA	2	6	229737	229742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326642
5068	NC_021897	CAT	2	6	229825	229830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326642
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5070	NC_021897	ATTGCT	2	12	229963	229974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527326642
5071	NC_021897	ATT	2	6	229996	230001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326642
5072	NC_021897	CTA	2	6	230092	230097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326642
5073	NC_021897	TCA	2	6	230099	230104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326642
5074	NC_021897	TG	3	6	230132	230137	0 %	50 %	50 %	0 %	527326642
5075	NC_021897	TCCTAG	2	12	230253	230264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527326642
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5080	NC_021897	TCGA	2	8	230502	230509	25 %	25 %	25 %	25 %	527326643
5081	NC_021897	TCC	2	6	230519	230524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326643
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5088	NC_021897	GCAACG	2	12	230741	230752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326643
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5090	NC_021897	AATT	2	8	230788	230795	50 %	50 %	0 %	0 %	527326643
5091	NC_021897	ATTT	2	8	230851	230858	25 %	75 %	0 %	0 %	527326643
5092	NC_021897	T	6	6	230888	230893	0 %	100 %	0 %	0 %	527326643
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5097	NC_021897	T	8	8	231101	231108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021897	TCCT	2	8	231250	231257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_021897	GTT	2	6	231293	231298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021897	AGA	2	6	231302	231307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021897	ATT	2	6	231339	231344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021897	TTC	2	6	231423	231428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326644
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5107	NC_021897	TC	3	6	231676	231681	0 %	50 %	0 %	50 %	527326644
5108	NC_021897	TGA	2	6	231703	231708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326644
5109	NC_021897	TCG	2	6	231792	231797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326644
5110	NC_021897	A	7	7	231864	231870	100 %	0 %	0 %	0 %	527326644
5111	NC_021897	CCTT	2	8	231872	231879	0 %	50 %	0 %	50 %	527326644
5112	NC_021897	TTG	2	6	231894	231899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326644
5113	NC_021897	T	6	6	231930	231935	0 %	100 %	0 %	0 %	527326644
5114	NC_021897	GATA	2	8	231967	231974	50 %	25 %	25 %	0 %	527326644
5115	NC_021897	ATT	2	6	232007	232012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326644
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5118	NC_021897	AGA	2	6	232081	232086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326644
5119	NC_021897	CTT	2	6	232173	232178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326645
5120	NC_021897	TAC	2	6	232275	232280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326645
5121	NC_021897	TAT	2	6	232284	232289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326645
5122	NC_021897	TCT	2	6	232344	232349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326645
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5124	NC_021897	TTTC	2	8	232420	232427	0 %	75 %	0 %	25 %	527326645
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5497	NC_021897	ATG	2	6	250472	250477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326659
5498	NC_021897	CTG	2	6	250504	250509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326659
5499	NC_021897	GTA	2	6	250549	250554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326659
5500	NC_021897	AGA	2	6	250563	250568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326659

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