MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021896	GGA	2	6	135375	135380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325638
3003	NC_021896	AG	3	6	135405	135410	50 %	0 %	50 %	0 %	527325638
3004	NC_021896	AAC	2	6	135441	135446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325638
3005	NC_021896	CAG	2	6	135460	135465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325638
3006	NC_021896	A	6	6	135537	135542	100 %	0 %	0 %	0 %	527325638
3007	NC_021896	AGG	2	6	135611	135616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021896	AAC	2	6	135704	135709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325639
3009	NC_021896	AGC	2	6	135728	135733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325639
3010	NC_021896	GTT	2	6	135747	135752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325639
3011	NC_021896	ATT	2	6	135759	135764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325639
3012	NC_021896	GTG	2	6	135808	135813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325639
3013	NC_021896	TAT	2	6	135833	135838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325639
3014	NC_021896	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527325639
3015	NC_021896	TGG	2	6	135904	135909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325639
3016	NC_021896	CTG	2	6	135955	135960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325639
3017	NC_021896	TGA	2	6	136034	136039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325640
3018	NC_021896	TCA	2	6	136077	136082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325640
3019	NC_021896	TG	3	6	136105	136110	0 %	50 %	50 %	0 %	527325640
3020	NC_021896	GCTA	2	8	136119	136126	25 %	25 %	25 %	25 %	527325640
3021	NC_021896	CGC	2	6	136152	136157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527325640
3022	NC_021896	TG	3	6	136178	136183	0 %	50 %	50 %	0 %	527325640
3023	NC_021896	TG	3	6	136204	136209	0 %	50 %	50 %	0 %	527325640
3024	NC_021896	TAG	2	6	136241	136246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325640
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3028	NC_021896	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527325640
3029	NC_021896	GCT	2	6	136294	136299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325640
3030	NC_021896	GGAT	2	8	136309	136316	25 %	25 %	50 %	0 %	527325640
3031	NC_021896	T	6	6	136378	136383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021896	TGT	2	6	136431	136436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325641
3033	NC_021896	CAAT	2	8	136458	136465	50 %	25 %	0 %	25 %	527325641
3034	NC_021896	AAGC	2	8	136512	136519	50 %	0 %	25 %	25 %	527325641
3035	NC_021896	GTT	2	6	136521	136526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325641
3036	NC_021896	TTTG	2	8	136538	136545	0 %	75 %	25 %	0 %	527325641
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3040	NC_021896	CTG	2	6	136623	136628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325641
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3052	NC_021896	ACA	2	6	136897	136902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325641
3053	NC_021896	AGG	2	6	136958	136963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021896	CCT	2	6	136968	136973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_021896	T	9	9	136975	136983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021896	TG	3	6	137015	137020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021896	TTGCA	2	10	137071	137080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_021896	GAG	2	6	137135	137140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325642
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3060	NC_021896	CT	3	6	137174	137179	0 %	50 %	0 %	50 %	527325642
3061	NC_021896	TTC	2	6	137272	137277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325642
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3063	NC_021896	CT	3	6	137356	137361	0 %	50 %	0 %	50 %	527325642
3064	NC_021896	TCT	2	6	137423	137428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325642
3065	NC_021896	CAG	2	6	137517	137522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325642
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3069	NC_021896	AATT	2	8	137595	137602	50 %	50 %	0 %	0 %	527325642
3070	NC_021896	AAG	2	6	137707	137712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325642
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3072	NC_021896	GCT	2	6	137807	137812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325642
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3081	NC_021896	AAGAG	2	10	138323	138332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021896	A	6	6	138339	138344	100 %	0 %	0 %	0 %	527325644
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3090	NC_021896	GAAG	2	8	138849	138856	50 %	0 %	50 %	0 %	527325644
3091	NC_021896	TTGA	2	8	138861	138868	25 %	50 %	25 %	0 %	527325644
3092	NC_021896	GGT	2	6	138876	138881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325644
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3095	NC_021896	GAAA	2	8	138974	138981	75 %	0 %	25 %	0 %	527325644
3096	NC_021896	GAA	2	6	139002	139007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325644
3097	NC_021896	AGT	2	6	139071	139076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325645
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3099	NC_021896	GA	3	6	139159	139164	50 %	0 %	50 %	0 %	527325645
3100	NC_021896	T	6	6	139367	139372	0 %	100 %	0 %	0 %	527325645
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3103	NC_021896	TTA	2	6	139520	139525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325645
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3105	NC_021896	GAGTTA	2	12	139663	139674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325646
3106	NC_021896	AAGA	2	8	139745	139752	75 %	0 %	25 %	0 %	527325646
3107	NC_021896	AG	3	6	139794	139799	50 %	0 %	50 %	0 %	527325646
3108	NC_021896	GAA	2	6	139806	139811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325646
3109	NC_021896	TTA	2	6	139901	139906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325646
3110	NC_021896	GTT	2	6	139936	139941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325646
3111	NC_021896	AGA	2	6	140001	140006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325646
3112	NC_021896	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527325646
3113	NC_021896	GAA	2	6	140079	140084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325647
3114	NC_021896	ATTG	2	8	140088	140095	25 %	50 %	25 %	0 %	527325647
3115	NC_021896	ATT	2	6	140122	140127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325647
3116	NC_021896	AAG	2	6	140183	140188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325647
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3118	NC_021896	GCA	2	6	140239	140244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325647
3119	NC_021896	CCTA	2	8	140249	140256	25 %	25 %	0 %	50 %	527325647
3120	NC_021896	GCT	2	6	140275	140280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325647
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3122	NC_021896	TCA	2	6	140540	140545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325647
3123	NC_021896	TAA	2	6	140649	140654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325647
3124	NC_021896	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527325647
3125	NC_021896	AGA	2	6	140790	140795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325647
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3128	NC_021896	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527325647
3129	NC_021896	TAT	2	6	141142	141147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325647
3130	NC_021896	CTCC	2	8	141148	141155	0 %	25 %	0 %	75 %	527325647
3131	NC_021896	CTG	2	6	141164	141169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325647
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3133	NC_021896	TAT	2	6	141214	141219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325647
3134	NC_021896	TGG	2	6	141309	141314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325647
3135	NC_021896	TCA	2	6	141336	141341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325647
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3138	NC_021896	T	8	8	141454	141461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_021896	T	6	6	141499	141504	0 %	100 %	0 %	0 %	527325648
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3142	NC_021896	T	6	6	141568	141573	0 %	100 %	0 %	0 %	527325648
3143	NC_021896	GCT	2	6	141604	141609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3145	NC_021896	ATC	2	6	141628	141633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_021896	A	6	6	141677	141682	100 %	0 %	0 %	0 %	527325649
3147	NC_021896	CTC	2	6	141827	141832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325649
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3154	NC_021896	AAGA	2	8	142475	142482	75 %	0 %	25 %	0 %	527325650
3155	NC_021896	A	6	6	142487	142492	100 %	0 %	0 %	0 %	527325650
3156	NC_021896	AT	3	6	142555	142560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_021896	CTT	2	6	142582	142587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_021896	AAG	2	6	142592	142597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325651
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3160	NC_021896	T	6	6	142716	142721	0 %	100 %	0 %	0 %	527325651
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3164	NC_021896	TGCT	2	8	142782	142789	0 %	50 %	25 %	25 %	527325651
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3203	NC_021896	T	7	7	144344	144350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3204	NC_021896	T	7	7	144373	144379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3205	NC_021896	T	7	7	144406	144412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3244	NC_021896	TC	3	6	146103	146108	0 %	50 %	0 %	50 %	527325655
3245	NC_021896	AAG	2	6	146321	146326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325655
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3248	NC_021896	TAA	2	6	146696	146701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325655
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