MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_021896	TGT	2	6	69235	69240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325582
1503	NC_021896	TGAT	2	8	69327	69334	25 %	50 %	25 %	0 %	527325582
1504	NC_021896	T	6	6	69375	69380	0 %	100 %	0 %	0 %	527325582
1505	NC_021896	TCT	2	6	69491	69496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325582
1506	NC_021896	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527325582
1507	NC_021896	TGC	2	6	69697	69702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325582
1508	NC_021896	A	7	7	69734	69740	100 %	0 %	0 %	0 %	527325582
1509	NC_021896	CT	3	6	69742	69747	0 %	50 %	0 %	50 %	527325582
1510	NC_021896	AGA	2	6	69751	69756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325582
1511	NC_021896	ATT	2	6	69762	69767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325582
1512	NC_021896	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527325582
1513	NC_021896	GTT	2	6	69826	69831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325582
1514	NC_021896	GCT	2	6	69848	69853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325582
1515	NC_021896	GCA	3	9	69950	69958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325582
1516	NC_021896	AAAG	2	8	69983	69990	75 %	0 %	25 %	0 %	527325582
1517	NC_021896	GCA	2	6	69997	70002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325582
1518	NC_021896	ATT	2	6	70011	70016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325582
1519	NC_021896	TAT	2	6	70119	70124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325582
1520	NC_021896	CTT	2	6	70143	70148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325582
1521	NC_021896	GA	3	6	70152	70157	50 %	0 %	50 %	0 %	527325582
1522	NC_021896	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527325582
1523	NC_021896	AGAA	2	8	70170	70177	75 %	0 %	25 %	0 %	527325582
1524	NC_021896	TGA	2	6	70198	70203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325582
1525	NC_021896	TTG	2	6	70287	70292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325582
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1527	NC_021896	GA	3	6	70351	70356	50 %	0 %	50 %	0 %	527325582
1528	NC_021896	AGCT	2	8	70392	70399	25 %	25 %	25 %	25 %	527325582
1529	NC_021896	TGA	2	6	70438	70443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325582
1530	NC_021896	GCAT	2	8	70453	70460	25 %	25 %	25 %	25 %	527325582
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1532	NC_021896	TCAA	2	8	70597	70604	50 %	25 %	0 %	25 %	527325582
1533	NC_021896	GT	3	6	70627	70632	0 %	50 %	50 %	0 %	527325582
1534	NC_021896	CT	3	6	70708	70713	0 %	50 %	0 %	50 %	527325582
1535	NC_021896	GA	3	6	70729	70734	50 %	0 %	50 %	0 %	527325582
1536	NC_021896	AGT	2	6	70771	70776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325582
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1538	NC_021896	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527325582
1539	NC_021896	AGA	2	6	70918	70923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325582
1540	NC_021896	TGA	2	6	70954	70959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325582
1541	NC_021896	TAT	2	6	70965	70970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325582
1542	NC_021896	T	6	6	71054	71059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021896	T	8	8	71075	71082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021896	CAT	2	6	71140	71145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325583
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1546	NC_021896	GCTT	2	8	71199	71206	0 %	50 %	25 %	25 %	527325583
1547	NC_021896	A	6	6	71294	71299	100 %	0 %	0 %	0 %	527325583
1548	NC_021896	ATT	2	6	71344	71349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325583
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1551	NC_021896	TTCT	2	8	71537	71544	0 %	75 %	0 %	25 %	527325583
1552	NC_021896	ATG	2	6	71549	71554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325583
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1555	NC_021896	GAGC	2	8	71611	71618	25 %	0 %	50 %	25 %	527325583
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1558	NC_021896	CTATTT	2	12	71654	71665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527325583
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1560	NC_021896	ATG	2	6	71726	71731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325583
1561	NC_021896	AGA	2	6	71856	71861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021896	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_021896	CGT	2	6	71904	71909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021896	T	7	7	71909	71915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021896	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1566	NC_021896	GATA	2	8	71959	71966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1569	NC_021896	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527325584
1570	NC_021896	T	6	6	72152	72157	0 %	100 %	0 %	0 %	527325584
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1574	NC_021896	GCT	2	6	72300	72305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325584
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1594	NC_021896	TAG	2	6	72985	72990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325584
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1599	NC_021896	A	7	7	73214	73220	100 %	0 %	0 %	0 %	527325584
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1603	NC_021896	AGA	2	6	73370	73375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325585
1604	NC_021896	GA	3	6	73393	73398	50 %	0 %	50 %	0 %	527325585
1605	NC_021896	TAC	2	6	73418	73423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325585
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1607	NC_021896	TGA	2	6	73496	73501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325585
1608	NC_021896	G	6	6	73554	73559	0 %	0 %	100 %	0 %	527325585
1609	NC_021896	TAT	2	6	73566	73571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325585
1610	NC_021896	A	6	6	73602	73607	100 %	0 %	0 %	0 %	527325585
1611	NC_021896	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527325585
1612	NC_021896	GCT	2	6	73734	73739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325585
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1614	NC_021896	GAC	2	6	73750	73755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325585
1615	NC_021896	AGG	2	6	73778	73783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325585
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1617	NC_021896	T	6	6	73908	73913	0 %	100 %	0 %	0 %	527325585
1618	NC_021896	CCT	2	6	73943	73948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325585
1619	NC_021896	AGC	3	9	73952	73960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325585
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