MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 22955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021896	CTTAGC	2	12	226056	226067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527325723
5003	NC_021896	GGA	2	6	226087	226092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325723
5004	NC_021896	CA	3	6	226095	226100	50 %	0 %	0 %	50 %	527325723
5005	NC_021896	TGG	2	6	226159	226164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325723
5006	NC_021896	TTGG	2	8	226203	226210	0 %	50 %	50 %	0 %	527325723
5007	NC_021896	TGG	3	9	226222	226230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325723
5008	NC_021896	GTC	2	6	226276	226281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325724
5009	NC_021896	CTT	2	6	226314	226319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325724
5010	NC_021896	AGA	2	6	226360	226365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325724
5011	NC_021896	CTT	2	6	226382	226387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325724
5012	NC_021896	CTA	2	6	226441	226446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325724
5013	NC_021896	ATTT	2	8	226450	226457	25 %	75 %	0 %	0 %	527325724
5014	NC_021896	TGG	2	6	226528	226533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527325724
5015	NC_021896	AAT	3	9	226628	226636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325724
5016	NC_021896	GAA	2	6	226727	226732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325724
5017	NC_021896	GC	3	6	226739	226744	0 %	0 %	50 %	50 %	527325724
5018	NC_021896	ATT	2	6	226787	226792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325724
5019	NC_021896	GCA	2	6	226900	226905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325724
5020	NC_021896	CTA	2	6	226941	226946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325724
5021	NC_021896	CATC	2	8	226956	226963	25 %	25 %	0 %	50 %	527325724
5022	NC_021896	TTA	2	6	227013	227018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325724
5023	NC_021896	TCT	3	9	227033	227041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325724
5024	NC_021896	A	6	6	227109	227114	100 %	0 %	0 %	0 %	527325724
5025	NC_021896	ATA	2	6	227153	227158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325724
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5027	NC_021896	TCT	2	6	227303	227308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325724
5028	NC_021896	T	6	6	227482	227487	0 %	100 %	0 %	0 %	527325724
5029	NC_021896	GC	3	6	227641	227646	0 %	0 %	50 %	50 %	527325724
5030	NC_021896	GAC	2	6	227668	227673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325724
5031	NC_021896	A	8	8	227710	227717	100 %	0 %	0 %	0 %	527325724
5032	NC_021896	TAA	2	6	227746	227751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325724
5033	NC_021896	AGA	2	6	227782	227787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325724
5034	NC_021896	GGA	2	6	227827	227832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325724
5035	NC_021896	TGA	2	6	227842	227847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325724
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5037	NC_021896	AATG	2	8	227879	227886	50 %	25 %	25 %	0 %	527325724
5038	NC_021896	ATT	2	6	227928	227933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325724
5039	NC_021896	ATG	2	6	227974	227979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325725
5040	NC_021896	CAA	2	6	227980	227985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325725
5041	NC_021896	A	6	6	228006	228011	100 %	0 %	0 %	0 %	527325725
5042	NC_021896	A	6	6	228080	228085	100 %	0 %	0 %	0 %	527325725
5043	NC_021896	AAG	2	6	228176	228181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325725
5044	NC_021896	A	6	6	228275	228280	100 %	0 %	0 %	0 %	527325725
5045	NC_021896	AGG	2	6	228345	228350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325725
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5050	NC_021896	A	6	6	228517	228522	100 %	0 %	0 %	0 %	527325725
5051	NC_021896	AAG	2	6	228578	228583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325725
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5054	NC_021896	TCA	2	6	228699	228704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325725
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5057	NC_021896	CTT	2	6	228886	228891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325726
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5059	NC_021896	CTT	3	9	228973	228981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325726
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5065	NC_021896	ATT	2	6	229168	229173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325726
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5071	NC_021896	AGG	2	6	229292	229297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325726
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5090	NC_021896	AGA	2	6	230451	230456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021896	GAG	2	6	230468	230473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021896	GCT	2	6	230520	230525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021896	ACC	2	6	230529	230534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_021896	A	6	6	230560	230565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021896	ACT	2	6	230624	230629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5102	NC_021896	TAA	2	6	230930	230935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325727
5103	NC_021896	CCT	2	6	230943	230948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325727
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5105	NC_021896	CTG	2	6	230986	230991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325727
5106	NC_021896	AAG	2	6	231052	231057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325727
5107	NC_021896	TAG	2	6	231098	231103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325727
5108	NC_021896	AGA	2	6	231158	231163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325727
5109	NC_021896	AG	3	6	231294	231299	50 %	0 %	50 %	0 %	527325727
5110	NC_021896	GTT	2	6	231370	231375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325727
5111	NC_021896	GTA	2	6	231391	231396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325727
5112	NC_021896	TTCC	2	8	231423	231430	0 %	50 %	0 %	50 %	527325727
5113	NC_021896	A	6	6	231441	231446	100 %	0 %	0 %	0 %	527325727
5114	NC_021896	A	6	6	231525	231530	100 %	0 %	0 %	0 %	527325727
5115	NC_021896	TAA	2	6	231595	231600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325727
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5118	NC_021896	TC	3	6	231723	231728	0 %	50 %	0 %	50 %	527325727
5119	NC_021896	AAG	2	6	231737	231742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325727
5120	NC_021896	GACT	2	8	231754	231761	25 %	25 %	25 %	25 %	527325727
5121	NC_021896	AT	3	6	231852	231857	50 %	50 %	0 %	0 %	527325727
5122	NC_021896	A	6	6	231880	231885	100 %	0 %	0 %	0 %	527325727
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5124	NC_021896	CAT	2	6	231925	231930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325727
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5500	NC_021896	GCT	2	6	248926	248931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325744

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