MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 2380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021895	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021895	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021895	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021895	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527324598
5	NC_021895	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527324598
6	NC_021895	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527324598
7	NC_021895	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527324599
8	NC_021895	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527324600
9	NC_021895	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527324600
10	NC_021895	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527324600
11	NC_021895	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527324600
12	NC_021895	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527324600
13	NC_021895	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527324600
14	NC_021895	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021895	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527324602
16	NC_021895	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527324603
17	NC_021895	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527324603
18	NC_021895	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	527324603
19	NC_021895	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021895	GA	3	6	9869	9874	50 %	0 %	50 %	0 %	527324605
21	NC_021895	AG	3	6	10086	10091	50 %	0 %	50 %	0 %	527324605
22	NC_021895	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021895	AG	3	6	11312	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	527324606
24	NC_021895	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	527324606
25	NC_021895	TG	3	6	12775	12780	0 %	50 %	50 %	0 %	527324607
26	NC_021895	AG	3	6	12924	12929	50 %	0 %	50 %	0 %	527324607
27	NC_021895	AG	4	8	13080	13087	50 %	0 %	50 %	0 %	527324607
28	NC_021895	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021895	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021895	AC	3	6	14409	14414	50 %	0 %	0 %	50 %	527324608
31	NC_021895	CT	3	6	14698	14703	0 %	50 %	0 %	50 %	527324608
32	NC_021895	AG	3	6	15748	15753	50 %	0 %	50 %	0 %	527324609
33	NC_021895	TC	3	6	15788	15793	0 %	50 %	0 %	50 %	527324609
34	NC_021895	GA	3	6	16317	16322	50 %	0 %	50 %	0 %	527324610
35	NC_021895	AG	3	6	16388	16393	50 %	0 %	50 %	0 %	527324610
36	NC_021895	GA	3	6	17172	17177	50 %	0 %	50 %	0 %	527324610
37	NC_021895	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021895	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021895	GA	3	6	17775	17780	50 %	0 %	50 %	0 %	527324611
40	NC_021895	TC	3	6	18225	18230	0 %	50 %	0 %	50 %	527324611
41	NC_021895	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021895	TC	3	6	18653	18658	0 %	50 %	0 %	50 %	527324612
43	NC_021895	GA	3	6	18668	18673	50 %	0 %	50 %	0 %	527324612
44	NC_021895	GA	3	6	18767	18772	50 %	0 %	50 %	0 %	527324612
45	NC_021895	AG	3	6	19233	19238	50 %	0 %	50 %	0 %	527324612
46	NC_021895	AG	4	8	19519	19526	50 %	0 %	50 %	0 %	527324612
47	NC_021895	GT	3	6	19782	19787	0 %	50 %	50 %	0 %	527324612
48	NC_021895	AG	3	6	20010	20015	50 %	0 %	50 %	0 %	527324613
49	NC_021895	TG	3	6	20123	20128	0 %	50 %	50 %	0 %	527324613
50	NC_021895	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	527324614
51	NC_021895	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021895	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021895	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021895	CT	4	8	21920	21927	0 %	50 %	0 %	50 %	527324615
55	NC_021895	AT	3	6	22190	22195	50 %	50 %	0 %	0 %	527324615
56	NC_021895	AT	3	6	22514	22519	50 %	50 %	0 %	0 %	527324615
57	NC_021895	GA	3	6	23833	23838	50 %	0 %	50 %	0 %	527324615
58	NC_021895	GA	3	6	23925	23930	50 %	0 %	50 %	0 %	527324615
59	NC_021895	AG	3	6	24306	24311	50 %	0 %	50 %	0 %	527324615
60	NC_021895	GA	3	6	25722	25727	50 %	0 %	50 %	0 %	527324616
61	NC_021895	GT	3	6	25742	25747	0 %	50 %	50 %	0 %	527324616
62	NC_021895	TA	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	527324616
63	NC_021895	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	527324616
64	NC_021895	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021895	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021895	AT	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	527324617
67	NC_021895	GA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	527324617
68	NC_021895	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021895	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021895	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	527324619
71	NC_021895	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	527324619
72	NC_021895	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	527324619
73	NC_021895	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	527324619
74	NC_021895	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	527324620
75	NC_021895	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	527324621
76	NC_021895	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	527324621
77	NC_021895	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	527324621
78	NC_021895	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	527324621
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80	NC_021895	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	527324623
81	NC_021895	CT	3	6	32137	32142	0 %	50 %	0 %	50 %	527324623
82	NC_021895	AG	3	6	32269	32274	50 %	0 %	50 %	0 %	527324623
83	NC_021895	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	527324625
84	NC_021895	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	527324625
85	NC_021895	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	527324626
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87	NC_021895	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	527324627
88	NC_021895	TG	3	6	35458	35463	0 %	50 %	50 %	0 %	527324628
89	NC_021895	CT	3	6	36277	36282	0 %	50 %	0 %	50 %	527324628
90	NC_021895	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021895	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021895	GA	3	6	36535	36540	50 %	0 %	50 %	0 %	527324629
93	NC_021895	CT	3	6	37019	37024	0 %	50 %	0 %	50 %	527324629
94	NC_021895	AG	3	6	37530	37535	50 %	0 %	50 %	0 %	527324629
95	NC_021895	AG	3	6	38076	38081	50 %	0 %	50 %	0 %	527324629
96	NC_021895	AG	3	6	38603	38608	50 %	0 %	50 %	0 %	527324629
97	NC_021895	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021895	GA	3	6	39387	39392	50 %	0 %	50 %	0 %	527324630
99	NC_021895	AG	3	6	39524	39529	50 %	0 %	50 %	0 %	527324630
100	NC_021895	AG	3	6	39624	39629	50 %	0 %	50 %	0 %	527324630
101	NC_021895	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021895	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	527324631
103	NC_021895	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	527324631
104	NC_021895	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	527324631
105	NC_021895	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	527324631
106	NC_021895	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	527324631
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108	NC_021895	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	527324631
109	NC_021895	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	527324632
110	NC_021895	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	527324632
111	NC_021895	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	527324632
112	NC_021895	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021895	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021895	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021895	TG	3	6	43009	43014	0 %	50 %	50 %	0 %	527324633
116	NC_021895	AC	3	6	43404	43409	50 %	0 %	0 %	50 %	527324634
117	NC_021895	TC	3	6	43573	43578	0 %	50 %	0 %	50 %	527324634
118	NC_021895	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021895	TA	3	6	43890	43895	50 %	50 %	0 %	0 %	527324635
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123	NC_021895	AG	3	6	45514	45519	50 %	0 %	50 %	0 %	527324637
124	NC_021895	AG	4	8	45954	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	527324638
125	NC_021895	CT	3	6	46145	46150	0 %	50 %	0 %	50 %	527324638
126	NC_021895	TG	3	6	46346	46351	0 %	50 %	50 %	0 %	527324638
127	NC_021895	AG	3	6	46399	46404	50 %	0 %	50 %	0 %	527324638
128	NC_021895	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021895	AG	3	6	49326	49331	50 %	0 %	50 %	0 %	527324640
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131	NC_021895	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021895	TC	3	6	52896	52901	0 %	50 %	0 %	50 %	527324644
133	NC_021895	CA	3	6	52947	52952	50 %	0 %	0 %	50 %	527324644
134	NC_021895	GA	3	6	53368	53373	50 %	0 %	50 %	0 %	527324645
135	NC_021895	CT	3	6	53685	53690	0 %	50 %	0 %	50 %	527324645
136	NC_021895	CT	3	6	54348	54353	0 %	50 %	0 %	50 %	527324646
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139	NC_021895	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021895	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021895	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021895	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527324648
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146	NC_021895	GA	3	6	60790	60795	50 %	0 %	50 %	0 %	527324651
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