MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021895	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527324598
2	NC_021895	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527324599
3	NC_021895	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527324599
4	NC_021895	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527324599
5	NC_021895	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527324599
6	NC_021895	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527324600
7	NC_021895	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021895	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527324602
9	NC_021895	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527324603
10	NC_021895	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527324604
11	NC_021895	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527324605
12	NC_021895	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527324605
13	NC_021895	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527324606
14	NC_021895	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527324607
15	NC_021895	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527324607
16	NC_021895	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527324609
17	NC_021895	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527324610
18	NC_021895	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527324610
19	NC_021895	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527324610
20	NC_021895	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527324613
21	NC_021895	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527324615
22	NC_021895	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527324615
23	NC_021895	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527324615
24	NC_021895	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527324616
25	NC_021895	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527324617
26	NC_021895	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527324617
27	NC_021895	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527324619
28	NC_021895	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527324619
29	NC_021895	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527324620
30	NC_021895	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527324621
31	NC_021895	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527324622
32	NC_021895	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021895	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527324628
34	NC_021895	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527324628
35	NC_021895	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527324629
36	NC_021895	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527324630
37	NC_021895	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527324632
38	NC_021895	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527324632
39	NC_021895	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021895	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527324636
41	NC_021895	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527324638
42	NC_021895	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527324638
43	NC_021895	GAAGA	2	10	47939	47948	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021895	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527324641
45	NC_021895	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527324642
46	NC_021895	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527324645
47	NC_021895	AATTT	2	10	54048	54057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021895	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527324646
49	NC_021895	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527324647
50	NC_021895	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527324649
51	NC_021895	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527324652
52	NC_021895	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527324653
53	NC_021895	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527324653
54	NC_021895	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527324655
55	NC_021895	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527324655
56	NC_021895	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527324657
57	NC_021895	AAAAG	2	10	68992	69001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021895	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527324658
59	NC_021895	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527324658
60	NC_021895	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527324658
61	NC_021895	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527324658
62	NC_021895	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527324658
63	NC_021895	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021895	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527324660
65	NC_021895	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527324660
66	NC_021895	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527324661
67	NC_021895	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527324662
68	NC_021895	AAAAG	2	10	76685	76694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021895	ATCAA	2	10	78383	78392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021895	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527324666
71	NC_021895	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527324666
72	NC_021895	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527324668
73	NC_021895	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527324668
74	NC_021895	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527324670
75	NC_021895	TTTGT	2	10	85122	85131	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021895	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527324671
77	NC_021895	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527324672
78	NC_021895	AATAA	2	10	88121	88130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021895	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527324675
80	NC_021895	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527324676
81	NC_021895	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527324677
82	NC_021895	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527324679
83	NC_021895	CTTTT	2	10	94193	94202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021895	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527324680
85	NC_021895	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527324680
86	NC_021895	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527324682
87	NC_021895	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527324682
88	NC_021895	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527324682
89	NC_021895	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527324682
90	NC_021895	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527324682
91	NC_021895	ACAAA	2	10	97738	97747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021895	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527324683
93	NC_021895	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527324684
94	NC_021895	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527324685
95	NC_021895	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527324687
96	NC_021895	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527324687
97	NC_021895	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527324687
98	NC_021895	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527324688
99	NC_021895	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527324688
100	NC_021895	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527324691
101	NC_021895	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527324693
102	NC_021895	GCTCT	2	10	114018	114027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021895	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527324696
104	NC_021895	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527324696
105	NC_021895	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527324696
106	NC_021895	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527324697
107	NC_021895	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527324697
108	NC_021895	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527324700
109	NC_021895	CCAAT	2	10	121450	121459	40 %	20 %	0 %	40 %	527324703
110	NC_021895	GCTTC	2	10	122551	122560	0 %	40 %	20 %	40 %	527324703
111	NC_021895	TACAA	2	10	126340	126349	60 %	20 %	0 %	20 %	527324707
112	NC_021895	ATCCA	2	10	128747	128756	40 %	20 %	0 %	40 %	527324711
113	NC_021895	GAAGA	2	10	130297	130306	60 %	0 %	40 %	0 %	527324711
114	NC_021895	AAAAG	2	10	132209	132218	80 %	0 %	20 %	0 %	527324713
115	NC_021895	GATTC	2	10	132540	132549	20 %	40 %	20 %	20 %	527324713
116	NC_021895	GGATA	2	10	135158	135167	40 %	20 %	40 %	0 %	527324715
117	NC_021895	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527324716
118	NC_021895	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527324717
119	NC_021895	TTGCA	2	10	137071	137080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021895	AAGAG	2	10	138323	138332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021895	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527324723
122	NC_021895	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527324724
123	NC_021895	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527324724
124	NC_021895	AAAAG	2	10	141544	141553	80 %	0 %	20 %	0 %	527324725
125	NC_021895	AAAAC	2	10	142024	142033	80 %	0 %	0 %	20 %	527324726
126	NC_021895	TGCTA	2	10	143110	143119	20 %	40 %	20 %	20 %	527324728
127	NC_021895	GGAGC	2	10	143157	143166	20 %	0 %	60 %	20 %	527324728
128	NC_021895	CTGGG	2	10	144572	144581	0 %	20 %	60 %	20 %	527324730
129	NC_021895	GTTTT	2	10	145319	145328	0 %	80 %	20 %	0 %	527324731
130	NC_021895	GAACC	2	10	149053	149062	40 %	0 %	20 %	40 %	527324732
131	NC_021895	ATTCT	2	10	152550	152559	20 %	60 %	0 %	20 %	527324736
132	NC_021895	CTGTG	2	10	152754	152763	0 %	40 %	40 %	20 %	527324736
133	NC_021895	TTCTT	2	10	155227	155236	0 %	80 %	0 %	20 %	527324739
134	NC_021895	AGGAA	2	10	159786	159795	60 %	0 %	40 %	0 %	527324743
135	NC_021895	CAAAA	2	10	161798	161807	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021895	AGAGA	2	10	163026	163035	60 %	0 %	40 %	0 %	527324746
137	NC_021895	AGCAA	2	10	163461	163470	60 %	0 %	20 %	20 %	527324746
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260	NC_021895	GCAAC	2	10	337353	337362	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
261	NC_021895	CTTGT	2	10	337413	337422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_021895	CCTTT	2	10	337871	337880	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_021895	CTAAA	2	10	340965	340974	60 %	20 %	0 %	20 %	527324899
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265	NC_021895	TCCAT	2	10	341683	341692	20 %	40 %	0 %	40 %	527324899
266	NC_021895	CAGAG	2	10	344077	344086	40 %	0 %	40 %	20 %	527324900
267	NC_021895	CTTCA	2	10	345775	345784	20 %	40 %	0 %	40 %	527324902
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392	NC_021895	CCTTT	2	10	512949	512958	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
393	NC_021895	CGAAT	2	10	515931	515940	40 %	20 %	20 %	20 %	527325051
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397	NC_021895	ACGAC	2	10	519346	519355	40 %	0 %	20 %	40 %	527325054
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400	NC_021895	ATGAA	2	10	519913	519922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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