MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F/69

Total Repeats: 23101

< Previous12...35363738394041424344454647Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_021895	A	6	6	1041665	1041670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23002	NC_021895	AAG	2	6	1041749	1041754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23003	NC_021895	TGT	2	6	1041758	1041763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_021895	TAA	3	9	1041802	1041810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23005	NC_021895	A	6	6	1041809	1041814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23006	NC_021895	TTA	2	6	1041847	1041852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_021895	TGC	2	6	1041910	1041915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325516
23008	NC_021895	CA	3	6	1042015	1042020	50 %	0 %	0 %	50 %	527325516
23009	NC_021895	ATC	2	6	1042058	1042063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325516
23010	NC_021895	A	7	7	1042086	1042092	100 %	0 %	0 %	0 %	527325516
23011	NC_021895	TGT	2	6	1042105	1042110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325516
23012	NC_021895	AAAAG	2	10	1042113	1042122	80 %	0 %	20 %	0 %	527325516
23013	NC_021895	TA	3	6	1042208	1042213	50 %	50 %	0 %	0 %	527325516
23014	NC_021895	GA	3	6	1042247	1042252	50 %	0 %	50 %	0 %	527325516
23015	NC_021895	AG	3	6	1042293	1042298	50 %	0 %	50 %	0 %	527325516
23016	NC_021895	GTTAG	2	10	1042306	1042315	20 %	40 %	40 %	0 %	527325516
23017	NC_021895	GGGA	2	8	1042368	1042375	25 %	0 %	75 %	0 %	527325516
23018	NC_021895	AAG	2	6	1042394	1042399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325516
23019	NC_021895	A	7	7	1042505	1042511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23020	NC_021895	GCA	2	6	1042633	1042638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325517
23021	NC_021895	CA	3	6	1042637	1042642	50 %	0 %	0 %	50 %	527325517
23022	NC_021895	TAG	2	6	1042824	1042829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325517
23023	NC_021895	T	6	6	1042837	1042842	0 %	100 %	0 %	0 %	527325517
23024	NC_021895	T	8	8	1042847	1042854	0 %	100 %	0 %	0 %	527325517
23025	NC_021895	TC	3	6	1042915	1042920	0 %	50 %	0 %	50 %	527325517
23026	NC_021895	CTC	2	6	1042928	1042933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325517
23027	NC_021895	CTT	2	6	1043074	1043079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325517
23028	NC_021895	AG	3	6	1043154	1043159	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23029	NC_021895	TA	3	6	1043186	1043191	50 %	50 %	0 %	0 %	527325517
23030	NC_021895	TAA	2	6	1043212	1043217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325517
23031	NC_021895	AGAA	2	8	1043260	1043267	75 %	0 %	25 %	0 %	527325517
23032	NC_021895	ATG	2	6	1043318	1043323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325517
23033	NC_021895	CAG	2	6	1043377	1043382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325517
23034	NC_021895	ATAG	2	8	1043398	1043405	50 %	25 %	25 %	0 %	527325517
23035	NC_021895	CTC	2	6	1043407	1043412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325517
23036	NC_021895	TGT	2	6	1043420	1043425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325517
23037	NC_021895	ATC	2	6	1043430	1043435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325517
23038	NC_021895	TCA	2	6	1043556	1043561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325517
23039	NC_021895	AG	3	6	1043609	1043614	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23040	NC_021895	AG	3	6	1043732	1043737	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23041	NC_021895	T	6	6	1043782	1043787	0 %	100 %	0 %	0 %	527325517
23042	NC_021895	AAG	2	6	1043851	1043856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325517
23043	NC_021895	GAG	2	6	1043873	1043878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325517
23044	NC_021895	GA	5	10	1043893	1043902	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23045	NC_021895	GCT	2	6	1043962	1043967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325517
23046	NC_021895	T	6	6	1043995	1044000	0 %	100 %	0 %	0 %	527325517
23047	NC_021895	CTT	2	6	1044001	1044006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325517
23048	NC_021895	AGG	2	6	1044112	1044117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325517
23049	NC_021895	TGC	2	6	1044133	1044138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325517
23050	NC_021895	AAAGA	2	10	1044161	1044170	80 %	0 %	20 %	0 %	527325517
23051	NC_021895	GAA	2	6	1044195	1044200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325517
23052	NC_021895	GAACA	2	10	1044275	1044284	60 %	0 %	20 %	20 %	527325517
23053	NC_021895	AG	3	6	1044305	1044310	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23054	NC_021895	CTCC	2	8	1044312	1044319	0 %	25 %	0 %	75 %	527325517
23055	NC_021895	TGT	2	6	1044355	1044360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325517
23056	NC_021895	TTGC	2	8	1044438	1044445	0 %	50 %	25 %	25 %	527325517
23057	NC_021895	CAAG	2	8	1044465	1044472	50 %	0 %	25 %	25 %	527325517
23058	NC_021895	AG	6	12	1044471	1044482	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23059	NC_021895	ACA	2	6	1044512	1044517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325517
23060	NC_021895	AG	3	6	1044556	1044561	50 %	0 %	50 %	0 %	527325517
23061	NC_021895	TAC	2	6	1044589	1044594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325517
23062	NC_021895	GCC	2	6	1044605	1044610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527325517
23063	NC_021895	GAAA	2	8	1044635	1044642	75 %	0 %	25 %	0 %	527325517
23064	NC_021895	AGA	2	6	1044704	1044709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325517
23065	NC_021895	CTC	2	6	1044772	1044777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325517
23066	NC_021895	ATT	2	6	1044818	1044823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527325517
23067	NC_021895	TGA	2	6	1044849	1044854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325517
23068	NC_021895	ATA	2	6	1044855	1044860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325517
23069	NC_021895	AAGGA	2	10	1044894	1044903	60 %	0 %	40 %	0 %	527325517
23070	NC_021895	TACA	2	8	1045007	1045014	50 %	25 %	0 %	25 %	527325517
23071	NC_021895	A	6	6	1045079	1045084	100 %	0 %	0 %	0 %	527325517
23072	NC_021895	GAC	2	6	1045091	1045096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325517
23073	NC_021895	GAG	2	6	1045115	1045120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325517
23074	NC_021895	AGC	2	6	1045175	1045180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325517
23075	NC_021895	ACA	2	6	1045187	1045192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325517
23076	NC_021895	AGA	2	6	1045240	1045245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325518
23077	NC_021895	A	8	8	1045255	1045262	100 %	0 %	0 %	0 %	527325518
23078	NC_021895	TAA	2	6	1045264	1045269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325518
23079	NC_021895	A	6	6	1045384	1045389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23080	NC_021895	AAT	2	6	1045393	1045398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23081	NC_021895	TATT	2	8	1045415	1045422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23082	NC_021895	T	7	7	1045428	1045434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23083	NC_021895	AATTTT	2	12	1045435	1045446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23084	NC_021895	TAAAAT	2	12	1045447	1045458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23085	NC_021895	TTTTA	2	10	1045463	1045472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23086	NC_021895	GGTT	2	8	1045479	1045486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23087	NC_021895	AGG	2	6	1045508	1045513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23088	NC_021895	GGAT	2	8	1045547	1045554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23089	NC_021895	TAA	3	9	1045583	1045591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23090	NC_021895	AGT	2	6	1045658	1045663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23091	NC_021895	GA	3	6	1045702	1045707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23092	NC_021895	AAG	2	6	1045814	1045819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23093	NC_021895	CAA	2	6	1045828	1045833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23094	NC_021895	AGT	2	6	1045854	1045859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23095	NC_021895	GTG	2	6	1045870	1045875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23096	NC_021895	GGGA	2	8	1045884	1045891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23097	NC_021895	CAG	2	6	1045903	1045908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23098	NC_021895	GCT	2	6	1046022	1046027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23099	NC_021895	AGTG	2	8	1046034	1046041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23100	NC_021895	ATT	2	6	1046047	1046052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23101	NC_021895	TGGC	2	8	1046068	1046075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

< Previous12...35363738394041424344454647Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.