MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii DC

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021894	ATTTT	2	10	542	551	20 %	80 %	0 %	0 %	527324387
2	NC_021894	ATAAA	2	10	953	962	80 %	20 %	0 %	0 %	527324387
3	NC_021894	ATATT	2	10	1217	1226	40 %	60 %	0 %	0 %	527324387
4	NC_021894	AAAAT	2	10	2679	2688	80 %	20 %	0 %	0 %	527324388
5	NC_021894	TTTAA	2	10	3352	3361	40 %	60 %	0 %	0 %	527324389
6	NC_021894	ATTTT	2	10	4338	4347	20 %	80 %	0 %	0 %	527324392
7	NC_021894	TATTT	2	10	5790	5799	20 %	80 %	0 %	0 %	527324393
8	NC_021894	TCAAA	2	10	6901	6910	60 %	20 %	0 %	20 %	527324395
9	NC_021894	TAATT	2	10	8520	8529	40 %	60 %	0 %	0 %	527324397
10	NC_021894	TTATT	2	10	8973	8982	20 %	80 %	0 %	0 %	527324397
11	NC_021894	ATTAA	2	10	11570	11579	60 %	40 %	0 %	0 %	527324399
12	NC_021894	TAAAT	2	10	11896	11905	60 %	40 %	0 %	0 %	527324400
13	NC_021894	AAATA	2	10	12541	12550	80 %	20 %	0 %	0 %	527324400
14	NC_021894	ATTTT	2	10	13923	13932	20 %	80 %	0 %	0 %	527324402
15	NC_021894	TTGTT	2	10	14338	14347	0 %	80 %	20 %	0 %	527324403
16	NC_021894	AAATA	2	10	14576	14585	80 %	20 %	0 %	0 %	527324403
17	NC_021894	ATTAA	2	10	14793	14802	60 %	40 %	0 %	0 %	527324403
18	NC_021894	TAAAA	2	10	14963	14972	80 %	20 %	0 %	0 %	527324403
19	NC_021894	CTAAA	2	10	15513	15522	60 %	20 %	0 %	20 %	527324404
20	NC_021894	TATTT	2	10	16195	16204	20 %	80 %	0 %	0 %	527324404
21	NC_021894	TTATT	2	10	16457	16466	20 %	80 %	0 %	0 %	527324405
22	NC_021894	ATTTT	2	10	16808	16817	20 %	80 %	0 %	0 %	527324405
23	NC_021894	AATTT	2	10	17607	17616	40 %	60 %	0 %	0 %	527324407
24	NC_021894	ATTTT	2	10	18147	18156	20 %	80 %	0 %	0 %	527324407
25	NC_021894	TATAA	2	10	20233	20242	60 %	40 %	0 %	0 %	527324409
26	NC_021894	TTAAA	2	10	20828	20837	60 %	40 %	0 %	0 %	527324409
27	NC_021894	AAATA	2	10	21189	21198	80 %	20 %	0 %	0 %	527324409
28	NC_021894	TAAAA	2	10	22478	22487	80 %	20 %	0 %	0 %	527324410
29	NC_021894	CATTA	2	10	22905	22914	40 %	40 %	0 %	20 %	527324411
30	NC_021894	AATAT	2	10	23245	23254	60 %	40 %	0 %	0 %	527324411
31	NC_021894	CAATA	2	10	23396	23405	60 %	20 %	0 %	20 %	527324411
32	NC_021894	AATTA	2	10	24571	24580	60 %	40 %	0 %	0 %	527324411
33	NC_021894	ATATT	2	10	24798	24807	40 %	60 %	0 %	0 %	527324412
34	NC_021894	ATTTT	2	10	25363	25372	20 %	80 %	0 %	0 %	527324414
35	NC_021894	AATTA	2	10	26197	26206	60 %	40 %	0 %	0 %	527324415
36	NC_021894	CAAAT	2	10	27656	27665	60 %	20 %	0 %	20 %	527324416
37	NC_021894	TTTGT	2	10	28227	28236	0 %	80 %	20 %	0 %	527324417
38	NC_021894	AAATT	2	10	28394	28403	60 %	40 %	0 %	0 %	527324417
39	NC_021894	AGAAA	2	10	28919	28928	80 %	0 %	20 %	0 %	527324417
40	NC_021894	TTAAT	2	10	29254	29263	40 %	60 %	0 %	0 %	527324418
41	NC_021894	AATAA	2	10	29907	29916	80 %	20 %	0 %	0 %	527324418
42	NC_021894	ACAAA	2	10	30021	30030	80 %	0 %	0 %	20 %	527324418
43	NC_021894	ATTAA	2	10	30342	30351	60 %	40 %	0 %	0 %	527324418
44	NC_021894	TATAA	2	10	30697	30706	60 %	40 %	0 %	0 %	527324419
45	NC_021894	TAATT	2	10	31998	32007	40 %	60 %	0 %	0 %	527324421
46	NC_021894	TAAAA	2	10	32064	32073	80 %	20 %	0 %	0 %	527324421
47	NC_021894	TTTTA	2	10	34136	34145	20 %	80 %	0 %	0 %	527324423
48	NC_021894	TTTAA	2	10	35214	35223	40 %	60 %	0 %	0 %	527324425
49	NC_021894	ATTTT	2	10	35867	35876	20 %	80 %	0 %	0 %	527324425
50	NC_021894	TTTAT	2	10	35981	35990	20 %	80 %	0 %	0 %	527324425
51	NC_021894	AAATT	2	10	36196	36205	60 %	40 %	0 %	0 %	527324425
52	NC_021894	ATTTT	2	10	37227	37236	20 %	80 %	0 %	0 %	527324427
53	NC_021894	AAGAA	2	10	39827	39836	80 %	0 %	20 %	0 %	527324430
54	NC_021894	GAATG	2	10	40320	40329	40 %	20 %	40 %	0 %	527324430
55	NC_021894	ATATT	2	10	41502	41511	40 %	60 %	0 %	0 %	527324432
56	NC_021894	ATTTT	2	10	42064	42073	20 %	80 %	0 %	0 %	527324433
57	NC_021894	ATTTA	2	10	42464	42473	40 %	60 %	0 %	0 %	527324433
58	NC_021894	TTAAT	2	10	42944	42953	40 %	60 %	0 %	0 %	527324434
59	NC_021894	TCTTG	2	10	43721	43730	0 %	60 %	20 %	20 %	527324435
60	NC_021894	TATAT	2	10	43888	43897	40 %	60 %	0 %	0 %	527324435
61	NC_021894	ATTTT	2	10	44693	44702	20 %	80 %	0 %	0 %	527324436
62	NC_021894	TATTT	2	10	44721	44730	20 %	80 %	0 %	0 %	527324437
63	NC_021894	ATTTT	2	10	46105	46114	20 %	80 %	0 %	0 %	527324438
64	NC_021894	ATTTA	2	10	46137	46146	40 %	60 %	0 %	0 %	527324438
65	NC_021894	TTATT	2	10	46925	46934	20 %	80 %	0 %	0 %	527324438
66	NC_021894	TTTGT	2	10	47060	47069	0 %	80 %	20 %	0 %	527324438
67	NC_021894	TTTCT	2	10	49641	49650	0 %	80 %	0 %	20 %	527324443
68	NC_021894	TTTAA	2	10	50344	50353	40 %	60 %	0 %	0 %	527324444
69	NC_021894	ATTTA	2	10	50458	50467	40 %	60 %	0 %	0 %	527324445
70	NC_021894	TAAAA	2	10	51777	51786	80 %	20 %	0 %	0 %	527324446
71	NC_021894	ATTTT	2	10	51863	51872	20 %	80 %	0 %	0 %	527324446
72	NC_021894	AAAAT	2	10	52097	52106	80 %	20 %	0 %	0 %	527324446
73	NC_021894	TTTTA	2	10	54163	54172	20 %	80 %	0 %	0 %	527324448
74	NC_021894	TAGTT	2	10	55609	55618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021894	ATTAA	2	10	56362	56371	60 %	40 %	0 %	0 %	527324451
76	NC_021894	TTTTC	2	10	57273	57282	0 %	80 %	0 %	20 %	527324452
77	NC_021894	ATTTT	2	10	57825	57834	20 %	80 %	0 %	0 %	527324452
78	NC_021894	TAATA	2	10	58088	58097	60 %	40 %	0 %	0 %	527324453
79	NC_021894	ATTTT	2	10	58133	58142	20 %	80 %	0 %	0 %	527324453
80	NC_021894	AATTA	2	10	58337	58346	60 %	40 %	0 %	0 %	527324453
81	NC_021894	TTTAG	2	10	58725	58734	20 %	60 %	20 %	0 %	527324455
82	NC_021894	GTTTT	2	10	58936	58945	0 %	80 %	20 %	0 %	527324455
83	NC_021894	ATCTA	2	10	59006	59015	40 %	40 %	0 %	20 %	527324455
84	NC_021894	ATTGA	2	10	60227	60236	40 %	40 %	20 %	0 %	527324456
85	NC_021894	TAATT	2	10	60328	60337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021894	TATAA	2	10	60602	60611	60 %	40 %	0 %	0 %	527324457
87	NC_021894	AATTT	2	10	60695	60704	40 %	60 %	0 %	0 %	527324457
88	NC_021894	CTAAA	2	10	60752	60761	60 %	20 %	0 %	20 %	527324457
89	NC_021894	AATTA	2	10	60786	60795	60 %	40 %	0 %	0 %	527324457
90	NC_021894	ATTTT	2	10	60974	60983	20 %	80 %	0 %	0 %	527324457
91	NC_021894	AATTT	2	10	62195	62204	40 %	60 %	0 %	0 %	527324459
92	NC_021894	TATTT	2	10	62413	62422	20 %	80 %	0 %	0 %	527324459
93	NC_021894	TAATA	2	10	63418	63427	60 %	40 %	0 %	0 %	527324461
94	NC_021894	TTTTA	2	10	63770	63779	20 %	80 %	0 %	0 %	527324461
95	NC_021894	TAATT	2	10	63798	63807	40 %	60 %	0 %	0 %	527324461
96	NC_021894	GATAT	2	10	64119	64128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021894	ATTTT	2	10	64289	64298	20 %	80 %	0 %	0 %	527324462
98	NC_021894	ATAAA	2	10	64423	64432	80 %	20 %	0 %	0 %	527324462
99	NC_021894	ATTTT	2	10	64448	64457	20 %	80 %	0 %	0 %	527324462
100	NC_021894	TCAAA	2	10	64791	64800	60 %	20 %	0 %	20 %	527324463
101	NC_021894	ATTTT	2	10	67030	67039	20 %	80 %	0 %	0 %	527324465
102	NC_021894	ATTTT	2	10	67495	67504	20 %	80 %	0 %	0 %	527324465
103	NC_021894	TTAAT	2	10	67857	67866	40 %	60 %	0 %	0 %	527324466
104	NC_021894	TAATA	2	10	68270	68279	60 %	40 %	0 %	0 %	527324467
105	NC_021894	AAAAT	2	10	68636	68645	80 %	20 %	0 %	0 %	527324467
106	NC_021894	ATTTT	2	10	68867	68876	20 %	80 %	0 %	0 %	527324468
107	NC_021894	AATTT	2	10	69683	69692	40 %	60 %	0 %	0 %	527324468
108	NC_021894	CGAAT	2	10	70184	70193	40 %	20 %	20 %	20 %	527324468
109	NC_021894	AAAAC	2	10	71827	71836	80 %	0 %	0 %	20 %	527324469
110	NC_021894	ACAAT	2	10	72992	73001	60 %	20 %	0 %	20 %	527324469
111	NC_021894	ATTCT	2	10	73443	73452	20 %	60 %	0 %	20 %	527324471
112	NC_021894	AATTC	2	10	73903	73912	40 %	40 %	0 %	20 %	527324471
113	NC_021894	AAAAT	2	10	74520	74529	80 %	20 %	0 %	0 %	527324472
114	NC_021894	AATAA	2	10	75284	75293	80 %	20 %	0 %	0 %	527324472
115	NC_021894	TAAAA	2	10	75435	75444	80 %	20 %	0 %	0 %	527324472
116	NC_021894	CAATT	2	10	75929	75938	40 %	40 %	0 %	20 %	527324473
117	NC_021894	TTTTC	2	10	76027	76036	0 %	80 %	0 %	20 %	527324473
118	NC_021894	TAATT	2	10	76933	76942	40 %	60 %	0 %	0 %	527324474
119	NC_021894	AAAAT	2	10	77295	77304	80 %	20 %	0 %	0 %	527324474
120	NC_021894	TAAAA	2	10	78533	78542	80 %	20 %	0 %	0 %	527324476
121	NC_021894	ATTTT	2	10	78636	78645	20 %	80 %	0 %	0 %	527324476
122	NC_021894	AATAA	2	10	78690	78699	80 %	20 %	0 %	0 %	527324476
123	NC_021894	TATAT	2	10	79203	79212	40 %	60 %	0 %	0 %	527324476
124	NC_021894	AAAAT	2	10	80055	80064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021894	ATTTA	2	10	80765	80774	40 %	60 %	0 %	0 %	527324479
126	NC_021894	TATAA	2	10	80855	80864	60 %	40 %	0 %	0 %	527324479
127	NC_021894	TATTT	2	10	82649	82658	20 %	80 %	0 %	0 %	527324479
128	NC_021894	TGAAA	2	10	83310	83319	60 %	20 %	20 %	0 %	527324479
129	NC_021894	GATAT	2	10	83714	83723	40 %	40 %	20 %	0 %	527324480
130	NC_021894	AATAC	2	10	84268	84277	60 %	20 %	0 %	20 %	527324480
131	NC_021894	AAAGA	2	10	85146	85155	80 %	0 %	20 %	0 %	527324481
132	NC_021894	TAATA	2	10	87907	87916	60 %	40 %	0 %	0 %	527324483
133	NC_021894	TAAAA	2	10	89171	89180	80 %	20 %	0 %	0 %	527324485
134	NC_021894	TAAAA	2	10	89699	89708	80 %	20 %	0 %	0 %	527324485
135	NC_021894	TTTTA	2	10	89957	89966	20 %	80 %	0 %	0 %	527324485
136	NC_021894	AAAAT	2	10	89969	89978	80 %	20 %	0 %	0 %	527324485
137	NC_021894	TTTAT	2	10	90387	90396	20 %	80 %	0 %	0 %	527324486
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.