MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 23781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021892	GCA	2	6	113678	113683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322602
2503	NC_021892	CGA	2	6	113802	113807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322602
2504	NC_021892	A	6	6	113820	113825	100 %	0 %	0 %	0 %	527322602
2505	NC_021892	GCA	2	6	113894	113899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322602
2506	NC_021892	CTA	2	6	113925	113930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322602
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2509	NC_021892	A	7	7	114022	114028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021892	A	8	8	114031	114038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_021892	GCTCT	2	10	114065	114074	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2516	NC_021892	TAC	2	6	114367	114372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322603
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2521	NC_021892	T	6	6	114538	114543	0 %	100 %	0 %	0 %	527322603
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2524	NC_021892	TGTTT	2	10	114689	114698	0 %	80 %	20 %	0 %	527322603
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2552	NC_021892	TATCG	2	10	115771	115780	20 %	40 %	20 %	20 %	527322603
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2557	NC_021892	TAA	2	6	115914	115919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_021892	A	7	7	115936	115942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2602	NC_021892	TAA	2	6	118016	118021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2607	NC_021892	GTAG	2	8	118201	118208	25 %	25 %	50 %	0 %	527322606
2608	NC_021892	ATGCT	2	10	118210	118219	20 %	40 %	20 %	20 %	527322606
2609	NC_021892	G	6	6	118249	118254	0 %	0 %	100 %	0 %	527322606
2610	NC_021892	T	6	6	118272	118277	0 %	100 %	0 %	0 %	527322606
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2625	NC_021892	TTTA	2	8	118817	118824	25 %	75 %	0 %	0 %	527322607
2626	NC_021892	CTG	2	6	119015	119020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322607
2627	NC_021892	AGA	2	6	119044	119049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322607
2628	NC_021892	TTGCCA	2	12	119067	119078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527322607
2629	NC_021892	GA	4	8	119090	119097	50 %	0 %	50 %	0 %	527322607
2630	NC_021892	GAA	2	6	119104	119109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322607
2631	NC_021892	TTC	2	6	119143	119148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322607
2632	NC_021892	TACT	2	8	119205	119212	25 %	50 %	0 %	25 %	527322607
2633	NC_021892	GTT	2	6	119249	119254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322607
2634	NC_021892	TAT	2	6	119284	119289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322607
2635	NC_021892	GAT	2	6	119300	119305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322607
2636	NC_021892	GAG	2	6	119331	119336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322607
2637	NC_021892	TC	3	6	119422	119427	0 %	50 %	0 %	50 %	527322607
2638	NC_021892	AG	3	6	119525	119530	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2639	NC_021892	GCTA	2	8	119547	119554	25 %	25 %	25 %	25 %	527322608
2640	NC_021892	GA	3	6	119558	119563	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2641	NC_021892	AAG	2	6	119566	119571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322608
2642	NC_021892	GCT	3	9	119572	119580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322608
2643	NC_021892	GTA	2	6	119631	119636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322608
2644	NC_021892	CCA	2	6	119639	119644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322608
2645	NC_021892	TC	3	6	119646	119651	0 %	50 %	0 %	50 %	527322608
2646	NC_021892	GCTA	2	8	119679	119686	25 %	25 %	25 %	25 %	527322608
2647	NC_021892	CGGC	2	8	119728	119735	0 %	0 %	50 %	50 %	527322608
2648	NC_021892	AGC	2	6	119769	119774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322608
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2650	NC_021892	TCC	2	6	119790	119795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322608
2651	NC_021892	AG	3	6	119836	119841	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2652	NC_021892	GA	4	8	119879	119886	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2653	NC_021892	GGC	2	6	119919	119924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527322608
2654	NC_021892	T	6	6	120018	120023	0 %	100 %	0 %	0 %	527322608
2655	NC_021892	TCT	2	6	120103	120108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322608
2656	NC_021892	GA	3	6	120212	120217	50 %	0 %	50 %	0 %	527322608
2657	NC_021892	ATC	2	6	120306	120311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322608
2658	NC_021892	TCT	2	6	120380	120385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2659	NC_021892	GA	3	6	120387	120392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2660	NC_021892	TAT	2	6	120411	120416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_021892	ATA	2	6	120432	120437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2662	NC_021892	CTGG	2	8	120455	120462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2663	NC_021892	TAAAAA	2	12	120559	120570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_021892	TTGGTA	2	12	120607	120618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527322609
2665	NC_021892	TG	3	6	120646	120651	0 %	50 %	50 %	0 %	527322609
2666	NC_021892	TCA	2	6	120654	120659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322609
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2700	NC_021892	GA	3	6	122513	122518	50 %	0 %	50 %	0 %	527322609
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2703	NC_021892	TA	3	6	122622	122627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2704	NC_021892	T	6	6	122668	122673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2705	NC_021892	ACT	2	6	122723	122728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322610
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2715	NC_021892	TGA	2	6	123311	123316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322610
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2720	NC_021892	GT	3	6	123611	123616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2721	NC_021892	T	6	6	123655	123660	0 %	100 %	0 %	0 %	527322611
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2723	NC_021892	GGGTTT	2	12	123756	123767	0 %	50 %	50 %	0 %	527322611
2724	NC_021892	CAA	2	6	123782	123787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322611
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2734	NC_021892	A	7	7	124056	124062	100 %	0 %	0 %	0 %	527322611
2735	NC_021892	CTG	2	6	124065	124070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322611
2736	NC_021892	TGA	2	6	124092	124097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322611
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2739	NC_021892	AG	3	6	124145	124150	50 %	0 %	50 %	0 %	527322611
2740	NC_021892	TGT	2	6	124360	124365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322611
2741	NC_021892	TGA	2	6	124392	124397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322611
2742	NC_021892	AAGAGA	2	12	124407	124418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322611
2743	NC_021892	TAC	2	6	124445	124450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322611
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2745	NC_021892	TTG	2	6	124468	124473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322611
2746	NC_021892	GA	3	6	124515	124520	50 %	0 %	50 %	0 %	527322611
2747	NC_021892	TAG	2	6	124534	124539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322611
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2885	NC_021892	AG	3	6	130569	130574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2997	NC_021892	AGG	2	6	135330	135335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322619
2998	NC_021892	GGA	2	6	135346	135351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322619
2999	NC_021892	AG	3	6	135376	135381	50 %	0 %	50 %	0 %	527322619
3000	NC_021892	AAC	2	6	135412	135417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322619

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