MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 23781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021892	ATT	2	6	23169	23174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322522
502	NC_021892	AAT	2	6	23211	23216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322522
503	NC_021892	TTG	2	6	23274	23279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322522
504	NC_021892	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	527322522
505	NC_021892	TGC	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322522
506	NC_021892	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	527322522
507	NC_021892	GCA	2	6	23631	23636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322522
508	NC_021892	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	527322522
509	NC_021892	AGA	2	6	23705	23710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
510	NC_021892	GAG	2	6	23728	23733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322522
511	NC_021892	TTC	2	6	23791	23796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322522
512	NC_021892	GGAAA	2	10	23804	23813	60 %	0 %	40 %	0 %	527322522
513	NC_021892	GA	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	527322522
514	NC_021892	GA	3	6	23919	23924	50 %	0 %	50 %	0 %	527322522
515	NC_021892	GAA	2	6	24050	24055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
516	NC_021892	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	527322522
517	NC_021892	GTT	2	6	24144	24149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322522
518	NC_021892	CTT	2	6	24238	24243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322522
519	NC_021892	TAA	2	6	24311	24316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322522
520	NC_021892	GAA	2	6	24331	24336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
521	NC_021892	AAG	2	6	24472	24477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322522
522	NC_021892	A	7	7	24557	24563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021892	TTA	2	6	24570	24575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021892	T	9	9	24585	24593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021892	T	6	6	24617	24622	0 %	100 %	0 %	0 %	527322523
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527	NC_021892	TAA	2	6	24876	24881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322523
528	NC_021892	GGA	3	9	24908	24916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322523
529	NC_021892	GAT	2	6	24953	24958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322523
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532	NC_021892	TGT	2	6	25366	25371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322523
533	NC_021892	TTA	2	6	25376	25381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322523
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536	NC_021892	GTGAGG	2	12	25471	25482	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	527322523
537	NC_021892	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	527322523
538	NC_021892	AGAGG	2	10	25529	25538	40 %	0 %	60 %	0 %	527322523
539	NC_021892	AGC	2	6	25555	25560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322523
540	NC_021892	T	6	6	25595	25600	0 %	100 %	0 %	0 %	527322523
541	NC_021892	AAG	2	6	25701	25706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322523
542	NC_021892	GA	3	6	25717	25722	50 %	0 %	50 %	0 %	527322523
543	NC_021892	GT	3	6	25737	25742	0 %	50 %	50 %	0 %	527322523
544	NC_021892	TA	3	6	25939	25944	50 %	50 %	0 %	0 %	527322523
545	NC_021892	T	6	6	25948	25953	0 %	100 %	0 %	0 %	527322523
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548	NC_021892	TAG	2	6	26133	26138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322523
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554	NC_021892	GA	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	527322523
555	NC_021892	GAA	2	6	26420	26425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322523
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557	NC_021892	CGA	2	6	26435	26440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322523
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559	NC_021892	CT	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021892	ACT	2	6	26524	26529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021892	A	6	6	26540	26545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021892	T	7	7	26552	26558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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566	NC_021892	T	7	7	26815	26821	0 %	100 %	0 %	0 %	527322524
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571	NC_021892	GA	3	6	27016	27021	50 %	0 %	50 %	0 %	527322524
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593	NC_021892	A	6	6	27807	27812	100 %	0 %	0 %	0 %	527322525
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610	NC_021892	AGGGT	2	10	28577	28586	20 %	20 %	60 %	0 %	527322526
611	NC_021892	TTC	2	6	28613	28618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322526
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616	NC_021892	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	527322526
617	NC_021892	AAG	2	6	28865	28870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322526
618	NC_021892	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	527322526
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625	NC_021892	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	527322527
626	NC_021892	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	527322527
627	NC_021892	CCTAT	2	10	29617	29626	20 %	40 %	0 %	40 %	527322527
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632	NC_021892	ATG	2	6	29892	29897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322527
633	NC_021892	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	527322527
634	NC_021892	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
635	NC_021892	GTT	2	6	30109	30114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322528
636	NC_021892	GAA	2	6	30118	30123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322528
637	NC_021892	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	527322528
638	NC_021892	TCT	2	6	30184	30189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322528
639	NC_021892	ACT	2	6	30274	30279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322528
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644	NC_021892	T	6	6	30408	30413	0 %	100 %	0 %	0 %	527322528
645	NC_021892	GAAGG	2	10	30416	30425	40 %	0 %	60 %	0 %	527322528
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649	NC_021892	TAG	2	6	30545	30550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322528
650	NC_021892	GTT	2	6	30619	30624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322528
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659	NC_021892	ATT	2	6	31066	31071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322528
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663	NC_021892	GA	3	6	31226	31231	50 %	0 %	50 %	0 %	527322528
664	NC_021892	A	7	7	31249	31255	100 %	0 %	0 %	0 %	527322528
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668	NC_021892	T	6	6	31435	31440	0 %	100 %	0 %	0 %	527322529
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671	NC_021892	A	6	6	31561	31566	100 %	0 %	0 %	0 %	527322529
672	NC_021892	TGC	2	6	31589	31594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322529
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746	NC_021892	CTT	2	6	35590	35595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322535
747	NC_021892	TCT	2	6	35925	35930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322535
748	NC_021892	GGATTT	2	12	35948	35959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527322535
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752	NC_021892	TCCTA	2	10	36177	36186	20 %	40 %	0 %	40 %	527322535
753	NC_021892	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	527322535
754	NC_021892	T	6	6	36291	36296	0 %	100 %	0 %	0 %	527322535
755	NC_021892	ATT	2	6	36335	36340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322535
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757	NC_021892	T	8	8	36415	36422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
758	NC_021892	CTT	2	6	36474	36479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
759	NC_021892	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
760	NC_021892	GA	3	6	36530	36535	50 %	0 %	50 %	0 %	527322536
761	NC_021892	AAG	2	6	36555	36560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322536
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763	NC_021892	CTTT	2	8	36632	36639	0 %	75 %	0 %	25 %	527322536
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892	NC_021892	A	7	7	42648	42654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
893	NC_021892	GAT	2	6	42672	42677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
894	NC_021892	AAG	2	6	42678	42683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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