MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 23781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021892	A	6	6	251028	251033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_021892	ACA	2	6	251128	251133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322723
5503	NC_021892	CTT	2	6	251135	251140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322723
5504	NC_021892	AAG	2	6	251166	251171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322723
5505	NC_021892	GCA	2	6	251185	251190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322723
5506	NC_021892	TTG	2	6	251205	251210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021892	CAAA	2	8	251369	251376	75 %	0 %	0 %	25 %	527322724
5508	NC_021892	ATA	2	6	251392	251397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322724
5509	NC_021892	CAAT	2	8	251479	251486	50 %	25 %	0 %	25 %	527322724
5510	NC_021892	CTTT	3	12	251531	251542	0 %	75 %	0 %	25 %	527322724
5511	NC_021892	CGA	2	6	251573	251578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322724
5512	NC_021892	CTT	2	6	251584	251589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322724
5513	NC_021892	ACA	2	6	251606	251611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322724
5514	NC_021892	CTC	2	6	251625	251630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_021892	CAA	2	6	251669	251674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_021892	AG	3	6	251714	251719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_021892	A	8	8	251720	251727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021892	AAG	2	6	251738	251743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_021892	CAT	4	12	251788	251799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322725
5520	NC_021892	TTA	2	6	251934	251939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322725
5521	NC_021892	CTC	2	6	251965	251970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322725
5522	NC_021892	AGT	2	6	251989	251994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322725
5523	NC_021892	GCAG	2	8	252036	252043	25 %	0 %	50 %	25 %	527322725
5524	NC_021892	TCTT	2	8	252053	252060	0 %	75 %	0 %	25 %	527322725
5525	NC_021892	AGA	2	6	252081	252086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322725
5526	NC_021892	CTT	2	6	252097	252102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322725
5527	NC_021892	ACA	2	6	252113	252118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322725
5528	NC_021892	TC	3	6	252155	252160	0 %	50 %	0 %	50 %	527322725
5529	NC_021892	TCT	2	6	252234	252239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322725
5530	NC_021892	CAA	2	6	252291	252296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322725
5531	NC_021892	AGA	3	9	252364	252372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322725
5532	NC_021892	GGC	2	6	252375	252380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527322725
5533	NC_021892	ACA	2	6	252405	252410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322725
5534	NC_021892	CAC	2	6	252412	252417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322725
5535	NC_021892	CAG	2	6	252418	252423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322725
5536	NC_021892	T	8	8	252487	252494	0 %	100 %	0 %	0 %	527322725
5537	NC_021892	TCC	2	6	252578	252583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_021892	GAAA	2	8	252599	252606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_021892	T	7	7	252620	252626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_021892	GCAG	2	8	252648	252655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_021892	AG	3	6	252723	252728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_021892	TAT	2	6	252746	252751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021892	ACA	2	6	252787	252792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_021892	A	6	6	252836	252841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_021892	TTG	2	6	253016	253021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322726
5546	NC_021892	TCT	2	6	253038	253043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322726
5547	NC_021892	TC	3	6	253085	253090	0 %	50 %	0 %	50 %	527322726
5548	NC_021892	T	7	7	253121	253127	0 %	100 %	0 %	0 %	527322726
5549	NC_021892	CCA	2	6	253134	253139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322726
5550	NC_021892	AAC	2	6	253187	253192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322726
5551	NC_021892	AATA	2	8	253241	253248	75 %	25 %	0 %	0 %	527322726
5552	NC_021892	GCT	2	6	253251	253256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322726
5553	NC_021892	ACA	2	6	253316	253321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322726
5554	NC_021892	CCA	2	6	253348	253353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322726
5555	NC_021892	CAA	2	6	253396	253401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322726
5556	NC_021892	CCCA	2	8	253504	253511	25 %	0 %	0 %	75 %	527322727
5557	NC_021892	CTT	2	6	253633	253638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322727
5558	NC_021892	AAT	2	6	253712	253717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322727
5559	NC_021892	CTC	2	6	253723	253728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322727
5560	NC_021892	ACT	2	6	253731	253736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322727
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5562	NC_021892	CTC	2	6	253780	253785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322727
5563	NC_021892	GCAA	2	8	253794	253801	50 %	0 %	25 %	25 %	527322727
5564	NC_021892	AAC	2	6	253811	253816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322727
5565	NC_021892	GTT	2	6	253856	253861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322727
5566	NC_021892	AAC	2	6	253895	253900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_021892	A	6	6	253909	253914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_021892	TAA	2	6	253960	253965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_021892	TTC	2	6	253978	253983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322728
5570	NC_021892	GCT	2	6	254010	254015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322728
5571	NC_021892	T	7	7	254019	254025	0 %	100 %	0 %	0 %	527322728
5572	NC_021892	AGCA	2	8	254056	254063	50 %	0 %	25 %	25 %	527322728
5573	NC_021892	CTT	2	6	254073	254078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322728
5574	NC_021892	TCT	3	9	254084	254092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322728
5575	NC_021892	GATAA	2	10	254112	254121	60 %	20 %	20 %	0 %	527322728
5576	NC_021892	TCG	2	6	254178	254183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322728
5577	NC_021892	CATA	2	8	254199	254206	50 %	25 %	0 %	25 %	527322728
5578	NC_021892	TCC	2	6	254218	254223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322728
5579	NC_021892	TAA	2	6	254251	254256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322728
5580	NC_021892	AG	3	6	254276	254281	50 %	0 %	50 %	0 %	527322728
5581	NC_021892	A	6	6	254295	254300	100 %	0 %	0 %	0 %	527322728
5582	NC_021892	AGA	2	6	254306	254311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322728
5583	NC_021892	CAC	2	6	254313	254318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322728
5584	NC_021892	CAA	2	6	254359	254364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322728
5585	NC_021892	GTA	2	6	254381	254386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322728
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5587	NC_021892	A	8	8	254480	254487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_021892	TA	3	6	254529	254534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_021892	CCAA	2	8	254564	254571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_021892	A	7	7	254588	254594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021892	TAT	2	6	254607	254612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322729
5592	NC_021892	TTCA	2	8	254639	254646	25 %	50 %	0 %	25 %	527322729
5593	NC_021892	AGA	2	6	254675	254680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322729
5594	NC_021892	TGTT	2	8	254713	254720	0 %	75 %	25 %	0 %	527322729
5595	NC_021892	CGA	2	6	254834	254839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322729
5596	NC_021892	GCAAA	2	10	254846	254855	60 %	0 %	20 %	20 %	527322729
5597	NC_021892	AATA	2	8	254932	254939	75 %	25 %	0 %	0 %	527322729
5598	NC_021892	A	6	6	254998	255003	100 %	0 %	0 %	0 %	527322729
5599	NC_021892	A	7	7	255029	255035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_021892	ATA	2	6	255042	255047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021892	AACCCT	2	12	255088	255099	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_021892	AAAC	2	8	255162	255169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_021892	AAG	2	6	255286	255291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322730
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5605	NC_021892	CAAT	2	8	255426	255433	50 %	25 %	0 %	25 %	527322730
5606	NC_021892	TTA	2	6	255498	255503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322730
5607	NC_021892	CTTCT	2	10	255530	255539	0 %	60 %	0 %	40 %	527322730
5608	NC_021892	T	6	6	255573	255578	0 %	100 %	0 %	0 %	527322730
5609	NC_021892	CA	3	6	255632	255637	50 %	0 %	0 %	50 %	527322730
5610	NC_021892	AAT	2	6	255647	255652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322730
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5612	NC_021892	ACA	2	6	255723	255728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322730
5613	NC_021892	TTG	2	6	255787	255792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322730
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5615	NC_021892	TAG	2	6	255862	255867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322730
5616	NC_021892	ATTTTT	2	12	255883	255894	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021892	GAG	2	6	256011	256016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021892	ATT	2	6	256023	256028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527322731
5619	NC_021892	T	6	6	256027	256032	0 %	100 %	0 %	0 %	527322731
5620	NC_021892	ACG	2	6	256033	256038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322731
5621	NC_021892	CCTGCA	2	12	256044	256055	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527322731
5622	NC_021892	CTG	2	6	256101	256106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322731
5623	NC_021892	TTG	2	6	256132	256137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322731
5624	NC_021892	TCTG	2	8	256157	256164	0 %	50 %	25 %	25 %	527322731
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5626	NC_021892	TTC	2	6	256243	256248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322731
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6000	NC_021892	CA	3	6	273735	273740	50 %	0 %	0 %	50 %	527322746

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