MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021891	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527321569
2	NC_021891	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527321570
3	NC_021891	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527321570
4	NC_021891	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527321570
5	NC_021891	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527321570
6	NC_021891	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527321571
7	NC_021891	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021891	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527321574
9	NC_021891	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527321575
10	NC_021891	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527321576
11	NC_021891	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527321577
12	NC_021891	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527321577
13	NC_021891	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527321578
14	NC_021891	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527321579
15	NC_021891	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527321579
16	NC_021891	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527321581
17	NC_021891	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527321582
18	NC_021891	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527321582
19	NC_021891	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527321582
20	NC_021891	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527321585
21	NC_021891	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527321586
22	NC_021891	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527321586
23	NC_021891	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527321586
24	NC_021891	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527321587
25	NC_021891	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527321588
26	NC_021891	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527321588
27	NC_021891	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527321590
28	NC_021891	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527321590
29	NC_021891	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527321591
30	NC_021891	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527321592
31	NC_021891	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527321593
32	NC_021891	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021891	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527321599
34	NC_021891	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527321599
35	NC_021891	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527321600
36	NC_021891	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527321601
37	NC_021891	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527321603
38	NC_021891	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527321603
39	NC_021891	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021891	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527321607
41	NC_021891	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527321609
42	NC_021891	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527321609
43	NC_021891	GAAGA	2	10	47939	47948	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021891	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527321612
45	NC_021891	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527321613
46	NC_021891	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527321616
47	NC_021891	AATTT	2	10	54048	54057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021891	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527321617
49	NC_021891	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527321618
50	NC_021891	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527321620
51	NC_021891	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527321622
52	NC_021891	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527321623
53	NC_021891	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527321623
54	NC_021891	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527321625
55	NC_021891	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527321625
56	NC_021891	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527321627
57	NC_021891	AAAAG	2	10	68992	69001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021891	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527321628
59	NC_021891	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527321628
60	NC_021891	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527321628
61	NC_021891	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527321628
62	NC_021891	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527321628
63	NC_021891	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021891	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527321630
65	NC_021891	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527321630
66	NC_021891	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527321631
67	NC_021891	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527321632
68	NC_021891	AAAAG	2	10	76685	76694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021891	ATCAA	2	10	78383	78392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021891	TGTCT	2	10	79945	79954	0 %	60 %	20 %	20 %	527321636
71	NC_021891	TTACT	2	10	80452	80461	20 %	60 %	0 %	20 %	527321636
72	NC_021891	AGAAA	2	10	81842	81851	80 %	0 %	20 %	0 %	527321638
73	NC_021891	GGAAG	2	10	82355	82364	40 %	0 %	60 %	0 %	527321638
74	NC_021891	TTTGT	2	10	85120	85129	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021891	GATCC	2	10	85906	85915	20 %	20 %	20 %	40 %	527321641
76	NC_021891	AGAGC	2	10	87241	87250	40 %	0 %	40 %	20 %	527321642
77	NC_021891	AATAA	2	10	88119	88128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021891	TTTTC	2	10	90973	90982	0 %	80 %	0 %	20 %	527321645
79	NC_021891	GGATG	2	10	91233	91242	20 %	20 %	60 %	0 %	527321646
80	NC_021891	CAACA	2	10	92772	92781	60 %	0 %	0 %	40 %	527321647
81	NC_021891	ACAGC	2	10	93817	93826	40 %	0 %	20 %	40 %	527321649
82	NC_021891	CTTTT	2	10	94191	94200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_021891	GGAAC	2	10	94529	94538	40 %	0 %	40 %	20 %	527321650
84	NC_021891	GGATT	2	10	95429	95438	20 %	40 %	40 %	0 %	527321650
85	NC_021891	CAATC	2	10	96531	96540	40 %	20 %	0 %	40 %	527321652
86	NC_021891	TTTGC	2	10	96665	96674	0 %	60 %	20 %	20 %	527321652
87	NC_021891	ATTCA	2	10	96929	96938	40 %	40 %	0 %	20 %	527321652
88	NC_021891	GATCC	2	10	97188	97197	20 %	20 %	20 %	40 %	527321652
89	NC_021891	GTTTT	2	10	97609	97618	0 %	80 %	20 %	0 %	527321652
90	NC_021891	ACAAA	2	10	97736	97745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021891	AAGCT	2	10	98813	98822	40 %	20 %	20 %	20 %	527321653
92	NC_021891	AGGGG	2	10	99172	99181	20 %	0 %	80 %	0 %	527321653
93	NC_021891	ATAGC	2	10	99871	99880	40 %	20 %	20 %	20 %	527321654
94	NC_021891	TTCCC	2	10	100475	100484	0 %	40 %	0 %	60 %	527321655
95	NC_021891	AGCGA	2	10	102799	102808	40 %	0 %	40 %	20 %	527321657
96	NC_021891	TTTCT	2	10	103157	103166	0 %	80 %	0 %	20 %	527321657
97	NC_021891	ATCAT	2	10	104363	104372	40 %	40 %	0 %	20 %	527321658
98	NC_021891	GGCAT	2	10	105071	105080	20 %	20 %	40 %	20 %	527321658
99	NC_021891	AAAGC	2	10	108797	108806	60 %	0 %	20 %	20 %	527321661
100	NC_021891	GCATT	2	10	109957	109966	20 %	40 %	20 %	20 %	527321663
101	NC_021891	GCTCT	2	10	114022	114031	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_021891	TGTTT	2	10	114646	114655	0 %	80 %	20 %	0 %	527321666
103	NC_021891	CATGT	2	10	115024	115033	20 %	40 %	20 %	20 %	527321666
104	NC_021891	TATCG	2	10	115728	115737	20 %	40 %	20 %	20 %	527321666
105	NC_021891	TTTCT	2	10	116244	116253	0 %	80 %	0 %	20 %	527321667
106	NC_021891	AAAGA	2	10	118489	118498	80 %	0 %	20 %	0 %	527321669
107	NC_021891	GCTTC	2	10	122480	122489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021891	TACAA	2	10	126227	126236	60 %	20 %	0 %	20 %	527321675
109	NC_021891	ATCCA	2	10	128635	128644	40 %	20 %	0 %	40 %	527321678
110	NC_021891	GAAGA	2	10	130185	130194	60 %	0 %	40 %	0 %	527321678
111	NC_021891	AAAAG	2	10	132098	132107	80 %	0 %	20 %	0 %	527321680
112	NC_021891	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	527321680
113	NC_021891	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	527321683
114	NC_021891	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	527321684
115	NC_021891	TTGCA	2	10	136963	136972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021891	TCCAG	2	10	139918	139927	20 %	20 %	20 %	40 %	527321689
117	NC_021891	GTACA	2	10	140649	140658	40 %	20 %	20 %	20 %	527321690
118	NC_021891	TAGAT	2	10	141022	141031	40 %	40 %	20 %	0 %	527321690
119	NC_021891	AAAAG	2	10	141434	141443	80 %	0 %	20 %	0 %	527321691
120	NC_021891	AAAAC	2	10	141914	141923	80 %	0 %	0 %	20 %	527321692
121	NC_021891	TGCTA	2	10	143000	143009	20 %	40 %	20 %	20 %	527321694
122	NC_021891	GGAGC	2	10	143047	143056	20 %	0 %	60 %	20 %	527321694
123	NC_021891	CTGGG	2	10	144461	144470	0 %	20 %	60 %	20 %	527321696
124	NC_021891	GTTTT	2	10	145208	145217	0 %	80 %	20 %	0 %	527321697
125	NC_021891	GAACC	2	10	148942	148951	40 %	0 %	20 %	40 %	527321698
126	NC_021891	ATTCT	2	10	152438	152447	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021891	CTGTG	2	10	152641	152650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021891	TTCTT	2	10	155114	155123	0 %	80 %	0 %	20 %	527321704
129	NC_021891	AGGAA	2	10	159673	159682	60 %	0 %	40 %	0 %	527321708
130	NC_021891	CAAAA	2	10	161685	161694	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021891	AGAGA	2	10	162913	162922	60 %	0 %	40 %	0 %	527321711
132	NC_021891	AGCAA	2	10	163348	163357	60 %	0 %	20 %	20 %	527321711
133	NC_021891	TATGA	2	10	163772	163781	40 %	40 %	20 %	0 %	527321712
134	NC_021891	CAAAA	2	10	166851	166860	80 %	0 %	0 %	20 %	527321713
135	NC_021891	AAGAG	2	10	167684	167693	60 %	0 %	40 %	0 %	527321713
136	NC_021891	GATTG	2	10	168029	168038	20 %	40 %	40 %	0 %	527321713
137	NC_021891	GTTTT	2	10	174510	174519	0 %	80 %	20 %	0 %	527321717
138	NC_021891	TATTG	2	10	174533	174542	20 %	60 %	20 %	0 %	527321717
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156	NC_021891	AGCTT	2	10	191562	191571	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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255	NC_021891	CTTGT	2	10	337270	337279	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_021891	CCTTT	2	10	337728	337737	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_021891	CTAAA	2	10	340822	340831	60 %	20 %	0 %	20 %	527321861
258	NC_021891	TCCAA	2	10	341457	341466	40 %	20 %	0 %	40 %	527321861
259	NC_021891	TCCAT	2	10	341540	341549	20 %	40 %	0 %	40 %	527321861
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262	NC_021891	CATTG	2	10	345735	345744	20 %	40 %	20 %	20 %	527321865
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265	NC_021891	GTTAC	2	10	353441	353450	20 %	40 %	20 %	20 %	527321873
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267	NC_021891	ATGTC	2	10	356679	356688	20 %	40 %	20 %	20 %	527321874
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