MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 23434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2506	NC_021891	GCA	2	6	113635	113640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321665
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2509	NC_021891	GCA	2	6	113851	113856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321665
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2514	NC_021891	A	8	8	113988	113995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_021891	TTA	2	6	118553	118558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321670
2627	NC_021891	T	6	6	118658	118663	0 %	100 %	0 %	0 %	527321670
2628	NC_021891	TTC	2	6	118744	118749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321670
2629	NC_021891	TCC	2	6	118757	118762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321670
2630	NC_021891	TTTA	2	8	118775	118782	25 %	75 %	0 %	0 %	527321670
2631	NC_021891	CTG	2	6	118973	118978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321670
2632	NC_021891	AGA	2	6	119002	119007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321670
2633	NC_021891	TTGCCA	2	12	119025	119036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527321670
2634	NC_021891	GA	4	8	119048	119055	50 %	0 %	50 %	0 %	527321670
2635	NC_021891	GAA	2	6	119062	119067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321670
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2637	NC_021891	TACT	2	8	119163	119170	25 %	50 %	0 %	25 %	527321670
2638	NC_021891	GTT	2	6	119207	119212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321670
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2640	NC_021891	GAT	2	6	119258	119263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321670
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2643	NC_021891	AG	3	6	119483	119488	50 %	0 %	50 %	0 %	527321671
2644	NC_021891	GCTA	2	8	119505	119512	25 %	25 %	25 %	25 %	527321671
2645	NC_021891	GA	3	6	119516	119521	50 %	0 %	50 %	0 %	527321671
2646	NC_021891	AAG	2	6	119524	119529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321671
2647	NC_021891	GCT	3	9	119530	119538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321671
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2651	NC_021891	GCTA	2	8	119637	119644	25 %	25 %	25 %	25 %	527321671
2652	NC_021891	CGGC	2	8	119686	119693	0 %	0 %	50 %	50 %	527321671
2653	NC_021891	AGC	2	6	119727	119732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321671
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2656	NC_021891	AG	3	6	119794	119799	50 %	0 %	50 %	0 %	527321671
2657	NC_021891	GA	4	8	119837	119844	50 %	0 %	50 %	0 %	527321671
2658	NC_021891	GGC	2	6	119877	119882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527321671
2659	NC_021891	T	6	6	119976	119981	0 %	100 %	0 %	0 %	527321671
2660	NC_021891	TCT	2	6	120061	120066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321671
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2664	NC_021891	GA	3	6	120345	120350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_021891	TAT	2	6	120369	120374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2666	NC_021891	ATA	2	6	120390	120395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_021891	CTGG	2	8	120413	120420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2668	NC_021891	TAAAAA	2	12	120517	120528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2669	NC_021891	TTGGTA	2	12	120565	120576	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2670	NC_021891	TG	3	6	120604	120609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2671	NC_021891	TCA	2	6	120612	120617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2673	NC_021891	CGC	2	6	120665	120670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2678	NC_021891	GTA	2	6	120921	120926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2682	NC_021891	AGG	2	6	121169	121174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2683	NC_021891	CT	3	6	121229	121234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2695	NC_021891	GTT	2	6	121972	121977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2699	NC_021891	TGA	2	6	122076	122081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2700	NC_021891	CTT	2	6	122119	122124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2702	NC_021891	ATC	2	6	122325	122330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2704	NC_021891	GA	3	6	122472	122477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2705	NC_021891	GCTTC	2	10	122480	122489	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2706	NC_021891	TCTA	2	8	122521	122528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2707	NC_021891	T	6	6	122585	122590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2712	NC_021891	AGCT	2	8	122785	122792	25 %	25 %	25 %	25 %	527321672
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2717	NC_021891	TAA	2	6	123139	123144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321672
2718	NC_021891	TGA	2	6	123228	123233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321672
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2723	NC_021891	GT	3	6	123528	123533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2724	NC_021891	T	6	6	123572	123577	0 %	100 %	0 %	0 %	527321673
2725	NC_021891	GA	3	6	123650	123655	50 %	0 %	50 %	0 %	527321673
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2731	NC_021891	GCAA	2	8	123776	123783	50 %	0 %	25 %	25 %	527321673
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2737	NC_021891	A	7	7	123973	123979	100 %	0 %	0 %	0 %	527321673
2738	NC_021891	CTG	2	6	123982	123987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321673
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2741	NC_021891	ATCG	2	8	124041	124048	25 %	25 %	25 %	25 %	527321673
2742	NC_021891	AG	3	6	124062	124067	50 %	0 %	50 %	0 %	527321673
2743	NC_021891	AGC	2	6	124250	124255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321673
2744	NC_021891	TGT	2	6	124277	124282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321673
2745	NC_021891	TGA	2	6	124309	124314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321673
2746	NC_021891	AAGAGA	2	12	124324	124335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321673
2747	NC_021891	TAC	2	6	124362	124367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321673
2748	NC_021891	AGA	2	6	124379	124384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321673
2749	NC_021891	TTG	2	6	124385	124390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321673
2750	NC_021891	GA	3	6	124432	124437	50 %	0 %	50 %	0 %	527321673
2751	NC_021891	TAG	2	6	124451	124456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321673
2752	NC_021891	CTTC	2	8	124458	124465	0 %	50 %	0 %	50 %	527321673
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2754	NC_021891	T	6	6	124607	124612	0 %	100 %	0 %	0 %	527321673
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