MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 23434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021891	CTA	2	6	273424	273429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321800
6003	NC_021891	ACTAA	2	10	273489	273498	60 %	20 %	0 %	20 %	527321800
6004	NC_021891	TCTA	2	8	273510	273517	25 %	50 %	0 %	25 %	527321800
6005	NC_021891	TTA	2	6	273522	273527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321800
6006	NC_021891	A	6	6	273531	273536	100 %	0 %	0 %	0 %	527321800
6007	NC_021891	AAC	3	9	273584	273592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321800
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6011	NC_021891	AGG	2	6	273701	273706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321800
6012	NC_021891	CTA	2	6	273717	273722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321800
6013	NC_021891	AGA	2	6	273728	273733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321800
6014	NC_021891	AGA	2	6	273806	273811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321800
6015	NC_021891	ATG	2	6	273870	273875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321800
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6017	NC_021891	AAT	2	6	273933	273938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321800
6018	NC_021891	A	6	6	273940	273945	100 %	0 %	0 %	0 %	527321800
6019	NC_021891	TTC	2	6	273963	273968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321800
6020	NC_021891	GAG	2	6	273979	273984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321800
6021	NC_021891	AGGAGA	2	12	274001	274012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_021891	T	6	6	274040	274045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021891	TTA	2	6	274071	274076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321801
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6039	NC_021891	TTA	2	6	274543	274548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321801
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6042	NC_021891	GAG	2	6	274596	274601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021891	T	6	6	274646	274651	0 %	100 %	0 %	0 %	527321802
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6050	NC_021891	ATT	2	6	274959	274964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321802
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6052	NC_021891	ATCC	2	8	275088	275095	25 %	25 %	0 %	50 %	527321802
6053	NC_021891	AGT	2	6	275099	275104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321802
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6058	NC_021891	TTGCA	2	10	275462	275471	20 %	40 %	20 %	20 %	527321802
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6094	NC_021891	A	7	7	277189	277195	100 %	0 %	0 %	0 %	527321804
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6110	NC_021891	TCTT	2	8	277746	277753	0 %	75 %	0 %	25 %	527321804
6111	NC_021891	ATTT	2	8	277775	277782	25 %	75 %	0 %	0 %	527321804
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6116	NC_021891	ATCCT	2	10	277940	277949	20 %	40 %	0 %	40 %	527321804
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6229	NC_021891	GTTT	2	8	282874	282881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6230	NC_021891	ATATTA	2	12	282897	282908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6232	NC_021891	A	6	6	282964	282969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_021891	T	6	6	282988	282993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6249	NC_021891	GAA	2	6	283537	283542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321809
6250	NC_021891	GA	3	6	283562	283567	50 %	0 %	50 %	0 %	527321809
6251	NC_021891	AAAG	2	8	283594	283601	75 %	0 %	25 %	0 %	527321809
6252	NC_021891	ATA	2	6	283692	283697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321809
6253	NC_021891	CAT	2	6	283760	283765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321809
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6259	NC_021891	TAAT	2	8	284015	284022	50 %	50 %	0 %	0 %	527321809
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6263	NC_021891	GAA	2	6	284112	284117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321809
6264	NC_021891	CTT	2	6	284120	284125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321809
6265	NC_021891	TCC	2	6	284295	284300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321809
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6269	NC_021891	ATT	3	9	284586	284594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321809
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6272	NC_021891	TAC	2	6	284836	284841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6276	NC_021891	TGTT	2	8	284916	284923	0 %	75 %	25 %	0 %	527321810
6277	NC_021891	TTG	2	6	284929	284934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321810
6278	NC_021891	AGA	2	6	284953	284958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321810
6279	NC_021891	AAC	2	6	285011	285016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321810
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6286	NC_021891	TATC	2	8	285204	285211	25 %	50 %	0 %	25 %	527321810
6287	NC_021891	AGCT	2	8	285225	285232	25 %	25 %	25 %	25 %	527321810
6288	NC_021891	CTG	2	6	285391	285396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321810
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6325	NC_021891	ATTC	2	8	287212	287219	25 %	50 %	0 %	25 %	527321810
6326	NC_021891	GGGA	2	8	287245	287252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6327	NC_021891	A	7	7	287291	287297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6329	NC_021891	AT	4	8	287511	287518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6330	NC_021891	CAT	2	6	287531	287536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321811
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6339	NC_021891	CTCC	2	8	288098	288105	0 %	25 %	0 %	75 %	527321811
6340	NC_021891	AAGC	2	8	288120	288127	50 %	0 %	25 %	25 %	527321811
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6343	NC_021891	CTC	2	6	288199	288204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321811
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6348	NC_021891	TAAA	2	8	288387	288394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6349	NC_021891	A	6	6	288392	288397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6350	NC_021891	T	6	6	288412	288417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6351	NC_021891	A	6	6	288432	288437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6352	NC_021891	TC	4	8	288454	288461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6353	NC_021891	T	6	6	288582	288587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6354	NC_021891	CTT	2	6	288624	288629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321812
6355	NC_021891	ACT	2	6	288653	288658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321812
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6357	NC_021891	GTC	2	6	288734	288739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321812
6358	NC_021891	T	6	6	288753	288758	0 %	100 %	0 %	0 %	527321812
6359	NC_021891	ACT	2	6	288781	288786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321812
6360	NC_021891	ACT	2	6	288850	288855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321812
6361	NC_021891	TGC	2	6	288886	288891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321812
6362	NC_021891	T	7	7	288896	288902	0 %	100 %	0 %	0 %	527321812
6363	NC_021891	CTCCTA	2	12	288903	288914	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527321812
6364	NC_021891	AAC	2	6	288988	288993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321812
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6366	NC_021891	ATC	2	6	289128	289133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321812
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6368	NC_021891	TTCGA	2	10	289157	289166	20 %	40 %	20 %	20 %	527321812
6369	NC_021891	ATT	2	6	289192	289197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321812
6370	NC_021891	AG	3	6	289199	289204	50 %	0 %	50 %	0 %	527321812
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6372	NC_021891	ACT	2	6	289239	289244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321812
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6498	NC_021891	GAC	2	6	294603	294608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321818
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6500	NC_021891	AGT	2	6	294811	294816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321818

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