MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 23434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021891	AAG	2	6	250646	250651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321776
5502	NC_021891	TAA	2	6	250746	250751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321776
5503	NC_021891	TTA	2	6	250776	250781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321776
5504	NC_021891	T	6	6	250863	250868	0 %	100 %	0 %	0 %	527321776
5505	NC_021891	AAG	2	6	250871	250876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321776
5506	NC_021891	GGAA	2	8	251055	251062	50 %	0 %	50 %	0 %	527321776
5507	NC_021891	TCG	2	6	251064	251069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321776
5508	NC_021891	GAA	3	9	251200	251208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321776
5509	NC_021891	TGT	2	6	251243	251248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321776
5510	NC_021891	CTT	2	6	251255	251260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321776
5511	NC_021891	AGA	3	9	251268	251276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321776
5512	NC_021891	T	6	6	251319	251324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_021891	TACAA	2	10	251348	251357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5514	NC_021891	ATA	2	6	251380	251385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021891	CAG	2	6	251419	251424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321777
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5517	NC_021891	TCT	2	6	251470	251475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321777
5518	NC_021891	TC	3	6	251491	251496	0 %	50 %	0 %	50 %	527321777
5519	NC_021891	TC	3	6	251512	251517	0 %	50 %	0 %	50 %	527321777
5520	NC_021891	TC	3	6	251543	251548	0 %	50 %	0 %	50 %	527321777
5521	NC_021891	T	6	6	251563	251568	0 %	100 %	0 %	0 %	527321777
5522	NC_021891	CTT	2	6	251665	251670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321777
5523	NC_021891	TGC	2	6	251687	251692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321777
5524	NC_021891	CT	3	6	251699	251704	0 %	50 %	0 %	50 %	527321777
5525	NC_021891	TTG	2	6	251727	251732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321777
5526	NC_021891	TC	3	6	251755	251760	0 %	50 %	0 %	50 %	527321777
5527	NC_021891	T	6	6	251869	251874	0 %	100 %	0 %	0 %	527321777
5528	NC_021891	CAT	2	6	251877	251882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321777
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5530	NC_021891	TC	3	6	251897	251902	0 %	50 %	0 %	50 %	527321777
5531	NC_021891	TTA	2	6	251920	251925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321777
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5534	NC_021891	TAGC	2	8	252071	252078	25 %	25 %	25 %	25 %	527321777
5535	NC_021891	CTT	2	6	252091	252096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321777
5536	NC_021891	TCT	2	6	252125	252130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321777
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5539	NC_021891	TTTC	2	8	252225	252232	0 %	75 %	0 %	25 %	527321777
5540	NC_021891	T	6	6	252259	252264	0 %	100 %	0 %	0 %	527321777
5541	NC_021891	GTG	2	6	252315	252320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321778
5542	NC_021891	GTATT	2	10	252340	252349	20 %	60 %	20 %	0 %	527321778
5543	NC_021891	CAT	2	6	252387	252392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321778
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5546	NC_021891	TAT	2	6	252432	252437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321778
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5549	NC_021891	AT	3	6	252505	252510	50 %	50 %	0 %	0 %	527321778
5550	NC_021891	ATC	2	6	252530	252535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321778
5551	NC_021891	TAT	2	6	252560	252565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321778
5552	NC_021891	GCA	2	6	252591	252596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321778
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5555	NC_021891	A	6	6	252655	252660	100 %	0 %	0 %	0 %	527321778
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5581	NC_021891	ACT	2	6	253861	253866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5583	NC_021891	AATA	2	8	253978	253985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_021891	CAAA	2	8	254369	254376	75 %	0 %	0 %	25 %	527321781
5593	NC_021891	CAAT	2	8	254476	254483	50 %	25 %	0 %	25 %	527321781
5594	NC_021891	CTTT	3	12	254528	254539	0 %	75 %	0 %	25 %	527321781
5595	NC_021891	CGA	2	6	254570	254575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321781
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5599	NC_021891	CAA	2	6	254666	254671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021891	AG	3	6	254711	254716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_021891	A	8	8	254717	254724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021891	AAG	2	6	254735	254740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021891	ATC	2	6	254789	254794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321782
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5608	NC_021891	TCTT	2	8	255047	255054	0 %	75 %	0 %	25 %	527321782
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5613	NC_021891	TTG	2	6	255203	255208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321782
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5621	NC_021891	CAG	2	6	255409	255414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321782
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5623	NC_021891	TCC	2	6	255569	255574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_021891	GA	3	6	255590	255595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5759	NC_021891	A	6	6	261108	261113	100 %	0 %	0 %	0 %	527321789
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