MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 23434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021891	CCT	2	6	226876	226881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321756
5002	NC_021891	TCCT	2	8	226909	226916	0 %	50 %	0 %	50 %	527321756
5003	NC_021891	AGC	2	6	226939	226944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321756
5004	NC_021891	CTT	2	6	226945	226950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321756
5005	NC_021891	CAA	2	6	226956	226961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321756
5006	NC_021891	AGA	2	6	226991	226996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321756
5007	NC_021891	CTGA	2	8	227001	227008	25 %	25 %	25 %	25 %	527321756
5008	NC_021891	GAA	2	6	227110	227115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321756
5009	NC_021891	TTG	2	6	227157	227162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321756
5010	NC_021891	CTTT	2	8	227185	227192	0 %	75 %	0 %	25 %	527321756
5011	NC_021891	TTTC	2	8	227238	227245	0 %	75 %	0 %	25 %	527321756
5012	NC_021891	TC	3	6	227309	227314	0 %	50 %	0 %	50 %	527321756
5013	NC_021891	A	7	7	227326	227332	100 %	0 %	0 %	0 %	527321756
5014	NC_021891	ACG	2	6	227410	227415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321756
5015	NC_021891	ACA	2	6	227427	227432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321756
5016	NC_021891	AAT	2	6	227433	227438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321756
5017	NC_021891	CTTT	2	8	227442	227449	0 %	75 %	0 %	25 %	527321756
5018	NC_021891	TC	3	6	227536	227541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_021891	AG	3	6	227567	227572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021891	CAATA	2	10	227637	227646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5021	NC_021891	CTA	2	6	227658	227663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321757
5022	NC_021891	GGC	2	6	227682	227687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527321757
5023	NC_021891	TGT	2	6	227688	227693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321757
5024	NC_021891	CTTT	2	8	227702	227709	0 %	75 %	0 %	25 %	527321757
5025	NC_021891	GTA	2	6	227714	227719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321757
5026	NC_021891	T	6	6	227732	227737	0 %	100 %	0 %	0 %	527321757
5027	NC_021891	ATT	2	6	227738	227743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321757
5028	NC_021891	ATG	2	6	227769	227774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321757
5029	NC_021891	TATCT	2	10	227855	227864	20 %	60 %	0 %	20 %	527321757
5030	NC_021891	TAT	2	6	227932	227937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321757
5031	NC_021891	TGC	2	6	227938	227943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321757
5032	NC_021891	A	7	7	228035	228041	100 %	0 %	0 %	0 %	527321757
5033	NC_021891	TTTTC	2	10	228057	228066	0 %	80 %	0 %	20 %	527321757
5034	NC_021891	TC	3	6	228171	228176	0 %	50 %	0 %	50 %	527321757
5035	NC_021891	CATT	2	8	228219	228226	25 %	50 %	0 %	25 %	527321757
5036	NC_021891	A	7	7	228262	228268	100 %	0 %	0 %	0 %	527321757
5037	NC_021891	TTA	2	6	228278	228283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321757
5038	NC_021891	TAA	2	6	228318	228323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321757
5039	NC_021891	AAC	2	6	228379	228384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321757
5040	NC_021891	TTG	2	6	228532	228537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321757
5041	NC_021891	ATA	2	6	228601	228606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321757
5042	NC_021891	TAA	2	6	228610	228615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021891	AAAC	2	8	228626	228633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_021891	ACAA	2	8	228678	228685	75 %	0 %	0 %	25 %	527321758
5045	NC_021891	TTC	2	6	228739	228744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321758
5046	NC_021891	CT	3	6	228873	228878	0 %	50 %	0 %	50 %	527321758
5047	NC_021891	ATT	2	6	228903	228908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321758
5048	NC_021891	ACT	2	6	228923	228928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321758
5049	NC_021891	A	7	7	228956	228962	100 %	0 %	0 %	0 %	527321758
5050	NC_021891	ATT	2	6	229023	229028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321758
5051	NC_021891	TTA	2	6	229032	229037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321758
5052	NC_021891	CTGG	2	8	229087	229094	0 %	25 %	50 %	25 %	527321758
5053	NC_021891	TAT	2	6	229109	229114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321758
5054	NC_021891	TGT	2	6	229153	229158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321758
5055	NC_021891	ATT	2	6	229230	229235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321758
5056	NC_021891	TCA	2	6	229282	229287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321758
5057	NC_021891	CCT	2	6	229311	229316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321758
5058	NC_021891	CATT	2	8	229349	229356	25 %	50 %	0 %	25 %	527321758
5059	NC_021891	CTT	2	6	229379	229384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321758
5060	NC_021891	T	6	6	229395	229400	0 %	100 %	0 %	0 %	527321758
5061	NC_021891	TTA	2	6	229486	229491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321759
5062	NC_021891	GTC	2	6	229507	229512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321759
5063	NC_021891	A	6	6	229518	229523	100 %	0 %	0 %	0 %	527321759
5064	NC_021891	AAC	2	6	229611	229616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321759
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5067	NC_021891	CAT	2	6	229825	229830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321759
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5069	NC_021891	ATTGCT	2	12	229963	229974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527321759
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5071	NC_021891	CTA	2	6	230092	230097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321759
5072	NC_021891	TCA	2	6	230099	230104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321759
5073	NC_021891	TG	3	6	230132	230137	0 %	50 %	50 %	0 %	527321759
5074	NC_021891	TCCTAG	2	12	230253	230264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527321759
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5079	NC_021891	TCGA	2	8	230502	230509	25 %	25 %	25 %	25 %	527321760
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5087	NC_021891	GCAACG	2	12	230741	230752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321760
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5089	NC_021891	AATT	2	8	230788	230795	50 %	50 %	0 %	0 %	527321760
5090	NC_021891	ATTT	2	8	230851	230858	25 %	75 %	0 %	0 %	527321760
5091	NC_021891	T	6	6	230888	230893	0 %	100 %	0 %	0 %	527321760
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5096	NC_021891	T	8	8	231101	231108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021891	TCCT	2	8	231250	231257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_021891	GTT	2	6	231293	231298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021891	AGA	2	6	231302	231307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021891	ATT	2	6	231339	231344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021891	TTC	2	6	231423	231428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321761
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5106	NC_021891	TC	3	6	231676	231681	0 %	50 %	0 %	50 %	527321761
5107	NC_021891	TGA	2	6	231703	231708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321761
5108	NC_021891	TCG	2	6	231792	231797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321761
5109	NC_021891	A	7	7	231864	231870	100 %	0 %	0 %	0 %	527321761
5110	NC_021891	CCTT	2	8	231872	231879	0 %	50 %	0 %	50 %	527321761
5111	NC_021891	TTG	2	6	231894	231899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321761
5112	NC_021891	T	6	6	231930	231935	0 %	100 %	0 %	0 %	527321761
5113	NC_021891	GATA	2	8	231967	231974	50 %	25 %	25 %	0 %	527321761
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5118	NC_021891	CTT	2	6	232173	232178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321762
5119	NC_021891	TAC	2	6	232275	232280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321762
5120	NC_021891	TAT	2	6	232284	232289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321762
5121	NC_021891	TCT	2	6	232344	232349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321762
5122	NC_021891	GCTTG	2	10	232408	232417	0 %	40 %	40 %	20 %	527321762
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5124	NC_021891	CTT	2	6	232482	232487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321762
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5230	NC_021891	GAG	2	6	237785	237790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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