MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 23812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021890	TG	3	6	136147	136152	0 %	50 %	50 %	0 %	527320731
3003	NC_021890	TG	3	6	136173	136178	0 %	50 %	50 %	0 %	527320731
3004	NC_021890	TAG	2	6	136210	136215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320731
3005	NC_021890	ACA	2	6	136218	136223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320731
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3007	NC_021890	TGTTT	2	10	136250	136259	0 %	80 %	20 %	0 %	527320731
3008	NC_021890	GCT	2	6	136263	136268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320731
3009	NC_021890	GGAT	2	8	136278	136285	25 %	25 %	50 %	0 %	527320731
3010	NC_021890	CTG	2	6	136399	136404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021890	CAAT	2	8	136427	136434	50 %	25 %	0 %	25 %	527320732
3012	NC_021890	AAGC	2	8	136481	136488	50 %	0 %	25 %	25 %	527320732
3013	NC_021890	TTTG	2	8	136507	136514	0 %	75 %	25 %	0 %	527320732
3014	NC_021890	GCG	2	6	136550	136555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527320732
3015	NC_021890	TGC	2	6	136573	136578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320732
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3017	NC_021890	CTG	2	6	136592	136597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320732
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3019	NC_021890	TTTG	2	8	136622	136629	0 %	75 %	25 %	0 %	527320732
3020	NC_021890	CAG	2	6	136659	136664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320732
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3022	NC_021890	GCT	2	6	136709	136714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320732
3023	NC_021890	CAG	2	6	136727	136732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320732
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3029	NC_021890	ACA	2	6	136866	136871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320732
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3032	NC_021890	T	9	9	136944	136952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021890	TTGCA	2	10	137040	137049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_021890	GAG	2	6	137104	137109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021890	TC	3	6	137114	137119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_021890	CT	3	6	137143	137148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_021890	TTC	2	6	137241	137246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021890	CTT	2	6	137291	137296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021890	CT	3	6	137325	137330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_021890	A	6	6	137374	137379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021890	TCT	2	6	137391	137396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021890	CAG	2	6	137485	137490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3045	NC_021890	TTCT	2	8	137537	137544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_021890	AATT	2	8	137563	137570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021890	AAG	2	6	137675	137680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021890	CAA	2	6	137713	137718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3053	NC_021890	TTG	2	6	137993	137998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320733
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3058	NC_021890	AG	3	6	138227	138232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021890	GA	3	6	138290	138295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021890	A	6	6	138306	138311	100 %	0 %	0 %	0 %	527320734
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3098	NC_021890	GCT	2	6	140242	140247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320737
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3108	NC_021890	CTG	2	6	141131	141136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320737
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3110	NC_021890	TAT	2	6	141181	141186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320737
3111	NC_021890	TGG	2	6	141276	141281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320737
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3114	NC_021890	ATTA	2	8	141352	141359	50 %	50 %	0 %	0 %	527320737
3115	NC_021890	T	8	8	141421	141428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021890	T	6	6	141466	141471	0 %	100 %	0 %	0 %	527320738
3117	NC_021890	AAG	2	6	141475	141480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320738
3118	NC_021890	AAAAG	2	10	141511	141520	80 %	0 %	20 %	0 %	527320738
3119	NC_021890	T	6	6	141535	141540	0 %	100 %	0 %	0 %	527320738
3120	NC_021890	GCT	2	6	141571	141576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_021890	A	6	6	141587	141592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021890	ATC	2	6	141595	141600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_021890	A	6	6	141644	141649	100 %	0 %	0 %	0 %	527320739
3124	NC_021890	CTC	2	6	141794	141799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320739
3125	NC_021890	AAAAC	2	10	141991	142000	80 %	0 %	0 %	20 %	527320739
3126	NC_021890	AGA	2	6	142145	142150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320740
3127	NC_021890	GGA	2	6	142319	142324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320740
3128	NC_021890	AGAA	2	8	142383	142390	75 %	0 %	25 %	0 %	527320740
3129	NC_021890	CTT	2	6	142420	142425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320740
3130	NC_021890	AAGA	2	8	142442	142449	75 %	0 %	25 %	0 %	527320740
3131	NC_021890	A	6	6	142454	142459	100 %	0 %	0 %	0 %	527320740
3132	NC_021890	AT	3	6	142522	142527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021890	CTT	2	6	142549	142554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021890	AAG	2	6	142559	142564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320741
3135	NC_021890	AAAG	2	8	142639	142646	75 %	0 %	25 %	0 %	527320741
3136	NC_021890	T	6	6	142683	142688	0 %	100 %	0 %	0 %	527320741
3137	NC_021890	GCA	2	6	142691	142696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320741
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3139	NC_021890	TCA	2	6	142722	142727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320741
3140	NC_021890	TGCT	2	8	142749	142756	0 %	50 %	25 %	25 %	527320741
3141	NC_021890	TCC	2	6	142774	142779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320741
3142	NC_021890	TTC	2	6	142851	142856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320741
3143	NC_021890	AGT	2	6	142871	142876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320741
3144	NC_021890	TATC	2	8	142953	142960	25 %	50 %	0 %	25 %	527320741
3145	NC_021890	GAAA	2	8	142972	142979	75 %	0 %	25 %	0 %	527320741
3146	NC_021890	AG	3	6	142991	142996	50 %	0 %	50 %	0 %	527320741
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3149	NC_021890	TGGAAT	2	12	143058	143069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320741
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3152	NC_021890	GGAGC	2	10	143124	143133	20 %	0 %	60 %	20 %	527320741
3153	NC_021890	A	6	6	143165	143170	100 %	0 %	0 %	0 %	527320741
3154	NC_021890	CTT	2	6	143172	143177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320741
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3157	NC_021890	AG	3	6	143237	143242	50 %	0 %	50 %	0 %	527320741
3158	NC_021890	AGA	2	6	143266	143271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320741
3159	NC_021890	ATGGTT	2	12	143302	143313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320741
3160	NC_021890	TTG	2	6	143461	143466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_021890	TCA	2	6	143509	143514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320742
3162	NC_021890	TCTT	2	8	143538	143545	0 %	75 %	0 %	25 %	527320742
3163	NC_021890	TTG	2	6	143592	143597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320742
3164	NC_021890	TGA	2	6	143621	143626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320742
3165	NC_021890	TAA	2	6	143644	143649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320742
3166	NC_021890	TCTA	2	8	143688	143695	25 %	50 %	0 %	25 %	527320742
3167	NC_021890	GAA	2	6	143755	143760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320742
3168	NC_021890	TTG	2	6	143766	143771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320742
3169	NC_021890	CTT	2	6	143831	143836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320742
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3171	NC_021890	GTC	2	6	143975	143980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320742
3172	NC_021890	TAA	2	6	143982	143987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320742
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3174	NC_021890	ATA	3	9	144208	144216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320742
3175	NC_021890	ATC	2	6	144240	144245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3176	NC_021890	TAA	2	6	144247	144252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3177	NC_021890	T	7	7	144311	144317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3178	NC_021890	T	6	6	144339	144344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3179	NC_021890	T	7	7	144372	144378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3180	NC_021890	CTT	2	6	144475	144480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320743
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3182	NC_021890	CTGGG	2	10	144538	144547	0 %	20 %	60 %	20 %	527320743
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3184	NC_021890	CTT	2	6	144674	144679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320743
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3242	NC_021890	AG	3	6	147597	147602	50 %	0 %	50 %	0 %	527320745
3243	NC_021890	AGA	2	6	147736	147741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320745
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3245	NC_021890	GAA	2	6	147979	147984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320745
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3247	NC_021890	AG	3	6	148058	148063	50 %	0 %	50 %	0 %	527320745
3248	NC_021890	AGGA	2	8	148078	148085	50 %	0 %	50 %	0 %	527320745
3249	NC_021890	CTC	2	6	148090	148095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320745
3250	NC_021890	GAA	3	9	148110	148118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320745
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3252	NC_021890	GA	3	6	148263	148268	50 %	0 %	50 %	0 %	527320745
3253	NC_021890	CTT	2	6	148300	148305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320745
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3376	NC_021890	A	6	6	153379	153384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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