MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 23812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021890	TCT	2	6	252162	252167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320826
5502	NC_021890	TTC	2	6	252198	252203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320826
5503	NC_021890	CAA	2	6	252254	252259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320826
5504	NC_021890	TTTC	2	8	252262	252269	0 %	75 %	0 %	25 %	527320826
5505	NC_021890	T	6	6	252296	252301	0 %	100 %	0 %	0 %	527320826
5506	NC_021890	GTG	2	6	252352	252357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320827
5507	NC_021890	GTATT	2	10	252377	252386	20 %	60 %	20 %	0 %	527320827
5508	NC_021890	CAT	2	6	252424	252429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320827
5509	NC_021890	TCA	2	6	252437	252442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320827
5510	NC_021890	A	6	6	252458	252463	100 %	0 %	0 %	0 %	527320827
5511	NC_021890	TAT	2	6	252469	252474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320827
5512	NC_021890	T	6	6	252492	252497	0 %	100 %	0 %	0 %	527320827
5513	NC_021890	TTC	2	6	252533	252538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320827
5514	NC_021890	AT	3	6	252542	252547	50 %	50 %	0 %	0 %	527320827
5515	NC_021890	TAT	2	6	252597	252602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320827
5516	NC_021890	GCA	2	6	252628	252633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320827
5517	NC_021890	AAG	2	6	252663	252668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320827
5518	NC_021890	GAAA	2	8	252687	252694	75 %	0 %	25 %	0 %	527320827
5519	NC_021890	A	6	6	252692	252697	100 %	0 %	0 %	0 %	527320827
5520	NC_021890	CTC	2	6	252725	252730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320827
5521	NC_021890	C	6	6	252789	252794	0 %	0 %	0 %	100 %	527320827
5522	NC_021890	AGA	2	6	252828	252833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320827
5523	NC_021890	TCT	2	6	252982	252987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320828
5524	NC_021890	AGA	2	6	253042	253047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320828
5525	NC_021890	ACC	2	6	253068	253073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320828
5526	NC_021890	TGCA	2	8	253077	253084	25 %	25 %	25 %	25 %	527320828
5527	NC_021890	GCC	2	6	253266	253271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527320828
5528	NC_021890	GAA	2	6	253284	253289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320828
5529	NC_021890	CT	3	6	253325	253330	0 %	50 %	0 %	50 %	527320828
5530	NC_021890	GAT	2	6	253341	253346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320828
5531	NC_021890	TCCGT	2	10	253357	253366	0 %	40 %	20 %	40 %	527320828
5532	NC_021890	CTC	2	6	253373	253378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320828
5533	NC_021890	AAT	2	6	253386	253391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320828
5534	NC_021890	CCA	2	6	253420	253425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320828
5535	NC_021890	ATA	2	6	253522	253527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320828
5536	NC_021890	ATC	2	6	253537	253542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320828
5537	NC_021890	ATG	2	6	253582	253587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320828
5538	NC_021890	ACA	2	6	253601	253606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320828
5539	NC_021890	GGAA	2	8	253618	253625	50 %	0 %	50 %	0 %	527320828
5540	NC_021890	GCT	2	6	253645	253650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320828
5541	NC_021890	CCA	2	6	253672	253677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320828
5542	NC_021890	GTATG	2	10	253796	253805	20 %	40 %	40 %	0 %	527320828
5543	NC_021890	GA	3	6	253838	253843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_021890	ACT	2	6	253898	253903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021890	TG	3	6	253948	253953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_021890	AATA	2	8	254015	254022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021890	T	6	6	254038	254043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_021890	T	7	7	254057	254063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_021890	A	6	6	254065	254070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_021890	ACA	2	6	254165	254170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320829
5551	NC_021890	CTT	2	6	254172	254177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320829
5552	NC_021890	AAG	2	6	254203	254208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320829
5553	NC_021890	GCA	2	6	254222	254227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320829
5554	NC_021890	TTG	2	6	254242	254247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320829
5555	NC_021890	CAAA	2	8	254407	254414	75 %	0 %	0 %	25 %	527320829
5556	NC_021890	ATA	2	6	254430	254435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320829
5557	NC_021890	CAAT	2	8	254517	254524	50 %	25 %	0 %	25 %	527320829
5558	NC_021890	CTTT	3	12	254569	254580	0 %	75 %	0 %	25 %	527320829
5559	NC_021890	CGA	2	6	254611	254616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320829
5560	NC_021890	CTT	2	6	254622	254627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320829
5561	NC_021890	ACA	2	6	254644	254649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320829
5562	NC_021890	CTC	2	6	254663	254668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_021890	CAA	2	6	254707	254712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_021890	AG	3	6	254752	254757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_021890	A	9	9	254758	254766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_021890	AAG	2	6	254777	254782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_021890	CAT	4	12	254827	254838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320830
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5570	NC_021890	AGT	2	6	255028	255033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320830
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5572	NC_021890	C	7	7	255104	255110	0 %	0 %	0 %	100 %	527320830
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5576	NC_021890	TC	3	6	255194	255199	0 %	50 %	0 %	50 %	527320830
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5588	NC_021890	T	7	7	255659	255665	0 %	100 %	0 %	0 %	527320831
5589	NC_021890	GCAG	2	8	255687	255694	25 %	0 %	50 %	25 %	527320831
5590	NC_021890	AG	3	6	255762	255767	50 %	0 %	50 %	0 %	527320831
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5593	NC_021890	A	6	6	255875	255880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_021890	TTG	2	6	256055	256060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320832
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5596	NC_021890	TC	3	6	256124	256129	0 %	50 %	0 %	50 %	527320832
5597	NC_021890	T	7	7	256160	256166	0 %	100 %	0 %	0 %	527320832
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5605	NC_021890	A	6	6	256465	256470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021890	T	6	6	256614	256619	0 %	100 %	0 %	0 %	527320833
5607	NC_021890	CTT	2	6	256673	256678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320833
5608	NC_021890	AAT	2	6	256752	256757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320833
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5612	NC_021890	CTC	2	6	256820	256825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320833
5613	NC_021890	GCAA	2	8	256834	256841	50 %	0 %	25 %	25 %	527320833
5614	NC_021890	AAC	2	6	256851	256856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320833
5615	NC_021890	GTT	2	6	256896	256901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320833
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5617	NC_021890	A	6	6	256949	256954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021890	TAA	2	6	257000	257005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5621	NC_021890	T	7	7	257059	257065	0 %	100 %	0 %	0 %	527320834
5622	NC_021890	AGCA	2	8	257096	257103	50 %	0 %	25 %	25 %	527320834
5623	NC_021890	CTT	2	6	257113	257118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320834
5624	NC_021890	TCT	3	9	257124	257132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320834
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5626	NC_021890	TCG	2	6	257218	257223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320834
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