MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 23812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021890	T	6	6	227771	227776	0 %	100 %	0 %	0 %	527320806
5002	NC_021890	ATT	2	6	227777	227782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320806
5003	NC_021890	ATG	2	6	227808	227813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320806
5004	NC_021890	TATCT	2	10	227894	227903	20 %	60 %	0 %	20 %	527320806
5005	NC_021890	TAT	2	6	227971	227976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320806
5006	NC_021890	TGC	2	6	227977	227982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320806
5007	NC_021890	A	7	7	228074	228080	100 %	0 %	0 %	0 %	527320806
5008	NC_021890	TTTTC	2	10	228096	228105	0 %	80 %	0 %	20 %	527320806
5009	NC_021890	TC	3	6	228210	228215	0 %	50 %	0 %	50 %	527320806
5010	NC_021890	CATT	2	8	228258	228265	25 %	50 %	0 %	25 %	527320806
5011	NC_021890	A	7	7	228301	228307	100 %	0 %	0 %	0 %	527320806
5012	NC_021890	TTA	2	6	228317	228322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320806
5013	NC_021890	TAA	2	6	228357	228362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320806
5014	NC_021890	AAC	2	6	228418	228423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320806
5015	NC_021890	TTG	2	6	228571	228576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320806
5016	NC_021890	ATA	2	6	228640	228645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320806
5017	NC_021890	TAA	2	6	228649	228654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021890	AAAC	2	8	228665	228672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_021890	ACAA	2	8	228717	228724	75 %	0 %	0 %	25 %	527320807
5020	NC_021890	TTC	2	6	228778	228783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320807
5021	NC_021890	CT	3	6	228912	228917	0 %	50 %	0 %	50 %	527320807
5022	NC_021890	ATT	2	6	228942	228947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320807
5023	NC_021890	ACT	2	6	228962	228967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320807
5024	NC_021890	A	7	7	228995	229001	100 %	0 %	0 %	0 %	527320807
5025	NC_021890	ATT	2	6	229062	229067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320807
5026	NC_021890	TTA	2	6	229071	229076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320807
5027	NC_021890	CTGG	2	8	229126	229133	0 %	25 %	50 %	25 %	527320807
5028	NC_021890	TAT	2	6	229148	229153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320807
5029	NC_021890	TGT	2	6	229192	229197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320807
5030	NC_021890	ATT	2	6	229269	229274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320807
5031	NC_021890	TCA	2	6	229321	229326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320807
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5033	NC_021890	CATT	2	8	229388	229395	25 %	50 %	0 %	25 %	527320807
5034	NC_021890	CTT	2	6	229418	229423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320807
5035	NC_021890	T	6	6	229434	229439	0 %	100 %	0 %	0 %	527320807
5036	NC_021890	TTA	2	6	229525	229530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320808
5037	NC_021890	GTC	2	6	229546	229551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320808
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5039	NC_021890	GAA	2	6	229709	229714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320808
5040	NC_021890	GAA	2	6	229776	229781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320808
5041	NC_021890	CAT	2	6	229864	229869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320808
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5043	NC_021890	ATTGCT	2	12	230002	230013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320808
5044	NC_021890	ATT	2	6	230035	230040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320808
5045	NC_021890	ACA	2	6	230053	230058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320808
5046	NC_021890	CTA	2	6	230131	230136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320808
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5048	NC_021890	TG	3	6	230171	230176	0 %	50 %	50 %	0 %	527320808
5049	NC_021890	TCCTAG	2	12	230292	230303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320808
5050	NC_021890	CAA	2	6	230330	230335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320808
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5052	NC_021890	GAG	2	6	230446	230451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320809
5053	NC_021890	CT	3	6	230492	230497	0 %	50 %	0 %	50 %	527320809
5054	NC_021890	GATT	2	8	230543	230550	25 %	50 %	25 %	0 %	527320809
5055	NC_021890	TCC	2	6	230558	230563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320809
5056	NC_021890	GAT	2	6	230591	230596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320809
5057	NC_021890	ATG	2	6	230628	230633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320809
5058	NC_021890	CAT	2	6	230666	230671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320809
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5060	NC_021890	AAG	2	6	230698	230703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320809
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5064	NC_021890	AATT	2	8	230827	230834	50 %	50 %	0 %	0 %	527320809
5065	NC_021890	ATTT	2	8	230890	230897	25 %	75 %	0 %	0 %	527320809
5066	NC_021890	T	6	6	230927	230932	0 %	100 %	0 %	0 %	527320809
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5071	NC_021890	T	8	8	231140	231147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021890	AGA	2	6	231338	231343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021890	ATT	2	6	231375	231380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021890	TTC	2	6	231459	231464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320810
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5095	NC_021890	GCTTG	2	10	232444	232453	0 %	40 %	40 %	20 %	527320811
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5105	NC_021890	ATT	2	6	232996	233001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320811
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5107	NC_021890	TTCT	2	8	233132	233139	0 %	75 %	0 %	25 %	527320811
5108	NC_021890	ACT	2	6	233143	233148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320811
5109	NC_021890	ATG	2	6	233185	233190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320811
5110	NC_021890	CTTC	2	8	233192	233199	0 %	50 %	0 %	50 %	527320811
5111	NC_021890	TTAT	2	8	233294	233301	25 %	75 %	0 %	0 %	527320811
5112	NC_021890	CTAT	2	8	233313	233320	25 %	50 %	0 %	25 %	527320811
5113	NC_021890	TCTT	2	8	233360	233367	0 %	75 %	0 %	25 %	527320811
5114	NC_021890	TGC	2	6	233403	233408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320811
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5117	NC_021890	CA	3	6	233448	233453	50 %	0 %	0 %	50 %	527320811
5118	NC_021890	TGG	2	6	233512	233517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320811
5119	NC_021890	TTGG	2	8	233556	233563	0 %	50 %	50 %	0 %	527320811
5120	NC_021890	TGG	3	9	233575	233583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320811
5121	NC_021890	GTC	2	6	233629	233634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320812
5122	NC_021890	CTT	2	6	233667	233672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320812
5123	NC_021890	AGA	2	6	233713	233718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320812
5124	NC_021890	CTT	2	6	233735	233740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320812
5125	NC_021890	CTA	2	6	233794	233799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320812
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5153	NC_021890	A	6	6	235433	235438	100 %	0 %	0 %	0 %	527320813
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5247	NC_021890	AAGT	2	8	240178	240185	50 %	25 %	25 %	0 %	527320816
5248	NC_021890	TTCCTT	2	12	240241	240252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320816
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5251	NC_021890	TGC	2	6	240577	240582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320816
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5496	NC_021890	TTA	2	6	251957	251962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320826
5497	NC_021890	GCA	2	6	251987	251992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320826
5498	NC_021890	AAG	2	6	252036	252041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320826
5499	NC_021890	TAGC	2	8	252108	252115	25 %	25 %	25 %	25 %	527320826
5500	NC_021890	CTT	2	6	252128	252133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320826

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