MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021889	CCT	2	6	608283	608288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320256
13503	NC_021889	TTTA	2	8	608291	608298	25 %	75 %	0 %	0 %	527320256
13504	NC_021889	CT	3	6	608331	608336	0 %	50 %	0 %	50 %	527320256
13505	NC_021889	ATT	2	6	608355	608360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320256
13506	NC_021889	TTTG	2	8	608389	608396	0 %	75 %	25 %	0 %	527320256
13507	NC_021889	ATT	2	6	608407	608412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320256
13508	NC_021889	GGCT	2	8	608429	608436	0 %	25 %	50 %	25 %	527320256
13509	NC_021889	TCT	2	6	608481	608486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320256
13510	NC_021889	ATT	2	6	608494	608499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320256
13511	NC_021889	TGG	2	6	608543	608548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320256
13512	NC_021889	T	6	6	608578	608583	0 %	100 %	0 %	0 %	527320256
13513	NC_021889	ATG	2	6	608600	608605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320256
13514	NC_021889	ATTGG	2	10	608606	608615	20 %	40 %	40 %	0 %	527320256
13515	NC_021889	A	6	6	608636	608641	100 %	0 %	0 %	0 %	527320256
13516	NC_021889	AGC	2	6	608689	608694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320256
13517	NC_021889	TTG	2	6	608751	608756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320256
13518	NC_021889	TCAA	2	8	608916	608923	50 %	25 %	0 %	25 %	527320257
13519	NC_021889	TTG	2	6	608929	608934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320257
13520	NC_021889	CGCT	2	8	608962	608969	0 %	25 %	25 %	50 %	527320257
13521	NC_021889	TTTG	2	8	608987	608994	0 %	75 %	25 %	0 %	527320257
13522	NC_021889	ATC	2	6	609042	609047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320257
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13524	NC_021889	CTT	2	6	609129	609134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320257
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13527	NC_021889	CTCTC	2	10	609171	609180	0 %	40 %	0 %	60 %	527320257
13528	NC_021889	ATAG	2	8	609216	609223	50 %	25 %	25 %	0 %	527320257
13529	NC_021889	GAA	2	6	609309	609314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320257
13530	NC_021889	AAG	2	6	609355	609360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320257
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13532	NC_021889	GAA	2	6	609417	609422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320257
13533	NC_021889	AAAAC	2	10	609431	609440	80 %	0 %	0 %	20 %	527320257
13534	NC_021889	AAC	2	6	609460	609465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320257
13535	NC_021889	GCTC	2	8	609560	609567	0 %	25 %	25 %	50 %	527320257
13536	NC_021889	AG	3	6	609594	609599	50 %	0 %	50 %	0 %	527320257
13537	NC_021889	TAG	2	6	609659	609664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320257
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13539	NC_021889	GCA	2	6	609708	609713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320257
13540	NC_021889	CTATC	2	10	609788	609797	20 %	40 %	0 %	40 %	527320257
13541	NC_021889	A	8	8	609817	609824	100 %	0 %	0 %	0 %	527320257
13542	NC_021889	AGA	2	6	609836	609841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320257
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13544	NC_021889	AGA	2	6	609872	609877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320257
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13546	NC_021889	TAT	3	9	609998	610006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320257
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13549	NC_021889	TCA	2	6	610180	610185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320257
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13551	NC_021889	AG	3	6	610239	610244	50 %	0 %	50 %	0 %	527320257
13552	NC_021889	TTA	2	6	610249	610254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320257
13553	NC_021889	ATT	2	6	610296	610301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320257
13554	NC_021889	TGTA	2	8	610456	610463	25 %	50 %	25 %	0 %	527320257
13555	NC_021889	A	6	6	610500	610505	100 %	0 %	0 %	0 %	527320257
13556	NC_021889	TGC	2	6	610538	610543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320257
13557	NC_021889	T	6	6	610670	610675	0 %	100 %	0 %	0 %	527320257
13558	NC_021889	CA	3	6	610709	610714	50 %	0 %	0 %	50 %	527320257
13559	NC_021889	A	7	7	610725	610731	100 %	0 %	0 %	0 %	527320257
13560	NC_021889	TC	3	6	610783	610788	0 %	50 %	0 %	50 %	527320257
13561	NC_021889	TTC	2	6	610789	610794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320257
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13565	NC_021889	A	6	6	611112	611117	100 %	0 %	0 %	0 %	527320257
13566	NC_021889	GA	3	6	611143	611148	50 %	0 %	50 %	0 %	527320257
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13574	NC_021889	A	7	7	611530	611536	100 %	0 %	0 %	0 %	527320257
13575	NC_021889	A	6	6	611583	611588	100 %	0 %	0 %	0 %	527320257
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13592	NC_021889	AG	3	6	612321	612326	50 %	0 %	50 %	0 %	527320257
13593	NC_021889	TC	3	6	612328	612333	0 %	50 %	0 %	50 %	527320257
13594	NC_021889	TAAA	2	8	612355	612362	75 %	25 %	0 %	0 %	527320257
13595	NC_021889	TTAT	2	8	612378	612385	25 %	75 %	0 %	0 %	527320257
13596	NC_021889	CT	4	8	612426	612433	0 %	50 %	0 %	50 %	527320257
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13598	NC_021889	T	6	6	612485	612490	0 %	100 %	0 %	0 %	527320257
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13602	NC_021889	TGT	2	6	612642	612647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_021889	A	6	6	612688	612693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_021889	CT	3	6	612702	612707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13605	NC_021889	AG	3	6	612744	612749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_021889	A	6	6	612757	612762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_021889	GGAA	2	8	612772	612779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_021889	A	7	7	612784	612790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_021889	ACT	2	6	612870	612875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320258
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13611	NC_021889	TGAAT	2	10	613044	613053	40 %	40 %	20 %	0 %	527320258
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13614	NC_021889	TC	3	6	613201	613206	0 %	50 %	0 %	50 %	527320258
13615	NC_021889	TCC	2	6	613215	613220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320258
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13622	NC_021889	TATT	2	8	613684	613691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_021889	TAA	2	6	613693	613698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13997	NC_021889	A	6	6	630480	630485	100 %	0 %	0 %	0 %	527320273
13998	NC_021889	ACA	2	6	630501	630506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320273
13999	NC_021889	AAGA	2	8	630522	630529	75 %	0 %	25 %	0 %	527320273
14000	NC_021889	GATT	2	8	630550	630557	25 %	50 %	25 %	0 %	527320274

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