MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021888	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527318741
2	NC_021888	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527318742
3	NC_021888	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527318742
4	NC_021888	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527318742
5	NC_021888	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527318742
6	NC_021888	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527318743
7	NC_021888	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021888	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527318746
9	NC_021888	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527318747
10	NC_021888	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527318748
11	NC_021888	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527318749
12	NC_021888	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527318749
13	NC_021888	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527318750
14	NC_021888	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527318751
15	NC_021888	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527318751
16	NC_021888	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527318753
17	NC_021888	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527318754
18	NC_021888	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527318754
19	NC_021888	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527318754
20	NC_021888	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527318757
21	NC_021888	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527318758
22	NC_021888	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527318758
23	NC_021888	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527318758
24	NC_021888	AGAGG	2	10	25536	25545	40 %	0 %	60 %	0 %	527318759
25	NC_021888	GGAGA	2	10	27315	27324	40 %	0 %	60 %	0 %	527318760
26	NC_021888	ATCCG	2	10	28066	28075	20 %	20 %	20 %	40 %	527318762
27	NC_021888	AGGGT	2	10	28584	28593	20 %	20 %	60 %	0 %	527318762
28	NC_021888	CCTAT	2	10	29624	29633	20 %	40 %	0 %	40 %	527318763
29	NC_021888	GAAGG	2	10	30423	30432	40 %	0 %	60 %	0 %	527318764
30	NC_021888	GAGCT	2	10	31463	31472	20 %	20 %	40 %	20 %	527318765
31	NC_021888	AAAGA	2	10	33096	33105	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021888	TCAGT	2	10	35702	35711	20 %	40 %	20 %	20 %	527318771
33	NC_021888	CTATT	2	10	36136	36145	20 %	60 %	0 %	20 %	527318771
34	NC_021888	TCCTA	2	10	36183	36192	20 %	40 %	0 %	40 %	527318771
35	NC_021888	ACGAT	2	10	38099	38108	40 %	20 %	20 %	20 %	527318772
36	NC_021888	TTTGA	2	10	38464	38473	20 %	60 %	20 %	0 %	527318772
37	NC_021888	AGCAA	2	10	42115	42124	60 %	0 %	20 %	20 %	527318775
38	NC_021888	CGATG	2	10	42172	42181	20 %	20 %	40 %	20 %	527318775
39	NC_021888	TGCAA	2	10	42330	42339	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021888	CAAAA	2	10	42648	42657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021888	TTTAT	2	10	44245	44254	20 %	80 %	0 %	0 %	527318780
42	NC_021888	CTTTC	2	10	46342	46351	0 %	60 %	0 %	40 %	527318782
43	NC_021888	AGTTT	2	10	46881	46890	20 %	60 %	20 %	0 %	527318782
44	NC_021888	GAAGA	2	10	48014	48023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021888	CTATT	2	10	49593	49602	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021888	CTTTT	2	10	50044	50053	0 %	80 %	0 %	20 %	527318785
47	NC_021888	ATTAA	2	10	51384	51393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021888	CCGTA	2	10	53927	53936	20 %	20 %	20 %	40 %	527318788
49	NC_021888	AATTT	2	10	54167	54176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021888	TTATC	2	10	55330	55339	20 %	60 %	0 %	20 %	527318789
51	NC_021888	GTTGT	2	10	56398	56407	0 %	60 %	40 %	0 %	527318790
52	NC_021888	GAGCA	2	10	59843	59852	40 %	0 %	40 %	20 %	527318792
53	NC_021888	TGTGA	2	10	62292	62301	20 %	40 %	40 %	0 %	527318795
54	NC_021888	AGTGA	2	10	63813	63822	40 %	20 %	40 %	0 %	527318796
55	NC_021888	CCTTC	2	10	64087	64096	0 %	40 %	0 %	60 %	527318796
56	NC_021888	AGGAG	2	10	66315	66324	40 %	0 %	60 %	0 %	527318798
57	NC_021888	GTTAA	2	10	66445	66454	40 %	40 %	20 %	0 %	527318798
58	NC_021888	AAAAG	2	10	69071	69080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021888	GCGAT	2	10	69883	69892	20 %	20 %	40 %	20 %	527318801
60	NC_021888	CTCTT	2	10	70237	70246	0 %	60 %	0 %	40 %	527318801
61	NC_021888	AGGGG	2	10	70883	70892	20 %	0 %	80 %	0 %	527318801
62	NC_021888	AAGAA	2	10	70925	70934	80 %	0 %	20 %	0 %	527318801
63	NC_021888	CTTGC	2	10	72014	72023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021888	ATTGG	2	10	72215	72224	20 %	40 %	40 %	0 %	527318803
65	NC_021888	GAAAA	2	10	73287	73296	80 %	0 %	20 %	0 %	527318803
66	NC_021888	TGGGA	2	10	73704	73713	20 %	20 %	60 %	0 %	527318804
67	NC_021888	TATTT	2	10	76231	76240	20 %	80 %	0 %	0 %	527318805
68	NC_021888	AAAAG	2	10	76764	76773	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021888	ATCAA	2	10	78462	78471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021888	TGTCT	2	10	80023	80032	0 %	60 %	20 %	20 %	527318809
71	NC_021888	TTACT	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	527318809
72	NC_021888	AGAAA	2	10	81920	81929	80 %	0 %	20 %	0 %	527318811
73	NC_021888	GGAAG	2	10	82433	82442	40 %	0 %	60 %	0 %	527318811
74	NC_021888	TTTGT	2	10	85198	85207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021888	GATCC	2	10	85984	85993	20 %	20 %	20 %	40 %	527318814
76	NC_021888	AGAGC	2	10	87319	87328	40 %	0 %	40 %	20 %	527318815
77	NC_021888	AATAA	2	10	88197	88206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021888	TTTTC	2	10	91051	91060	0 %	80 %	0 %	20 %	527318818
79	NC_021888	GGATG	2	10	91311	91320	20 %	20 %	60 %	0 %	527318819
80	NC_021888	CAACA	2	10	92850	92859	60 %	0 %	0 %	40 %	527318820
81	NC_021888	TTTAA	2	10	93733	93742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021888	ACAGC	2	10	93894	93903	40 %	0 %	20 %	40 %	527318822
83	NC_021888	CTTTT	2	10	94268	94277	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021888	GGAAC	2	10	94607	94616	40 %	0 %	40 %	20 %	527318823
85	NC_021888	GGATT	2	10	95507	95516	20 %	40 %	40 %	0 %	527318823
86	NC_021888	CAATC	2	10	96609	96618	40 %	20 %	0 %	40 %	527318825
87	NC_021888	TTTGC	2	10	96743	96752	0 %	60 %	20 %	20 %	527318825
88	NC_021888	ATTCA	2	10	97007	97016	40 %	40 %	0 %	20 %	527318825
89	NC_021888	GATCC	2	10	97266	97275	20 %	20 %	20 %	40 %	527318825
90	NC_021888	GTTTT	2	10	97687	97696	0 %	80 %	20 %	0 %	527318825
91	NC_021888	ACAAA	2	10	97814	97823	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021888	AAGCT	2	10	98891	98900	40 %	20 %	20 %	20 %	527318826
93	NC_021888	AGGGG	2	10	99250	99259	20 %	0 %	80 %	0 %	527318826
94	NC_021888	ATAGC	2	10	99949	99958	40 %	20 %	20 %	20 %	527318827
95	NC_021888	TTCCC	2	10	100553	100562	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_021888	AGCGA	2	10	102876	102885	40 %	0 %	40 %	20 %	527318829
97	NC_021888	TTTCT	2	10	103234	103243	0 %	80 %	0 %	20 %	527318829
98	NC_021888	ATCAT	2	10	104440	104449	40 %	40 %	0 %	20 %	527318830
99	NC_021888	GGCAT	2	10	105148	105157	20 %	20 %	40 %	20 %	527318830
100	NC_021888	AAAGC	2	10	108874	108883	60 %	0 %	20 %	20 %	527318833
101	NC_021888	GCATT	2	10	110034	110043	20 %	40 %	20 %	20 %	527318835
102	NC_021888	GCTCT	2	10	114099	114108	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021888	TGTTT	2	10	114723	114732	0 %	80 %	20 %	0 %	527318838
104	NC_021888	CATGT	2	10	115101	115110	20 %	40 %	20 %	20 %	527318838
105	NC_021888	TATCG	2	10	115805	115814	20 %	40 %	20 %	20 %	527318838
106	NC_021888	TTTCT	2	10	116321	116330	0 %	80 %	0 %	20 %	527318839
107	NC_021888	AAAGA	2	10	118566	118575	80 %	0 %	20 %	0 %	527318841
108	NC_021888	GCTTC	2	10	122557	122566	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021888	TACAA	2	10	126304	126313	60 %	20 %	0 %	20 %	527318847
110	NC_021888	ATCCA	2	10	128712	128721	40 %	20 %	0 %	40 %	527318850
111	NC_021888	GAAGA	2	10	130262	130271	60 %	0 %	40 %	0 %	527318850
112	NC_021888	AAAAG	2	10	132175	132184	80 %	0 %	20 %	0 %	527318852
113	NC_021888	GATTC	2	10	132506	132515	20 %	40 %	20 %	20 %	527318852
114	NC_021888	ATTGG	2	10	135791	135800	20 %	40 %	40 %	0 %	527318855
115	NC_021888	TGTTT	2	10	136250	136259	0 %	80 %	20 %	0 %	527318856
116	NC_021888	TTGCA	2	10	137040	137049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021888	TCCAG	2	10	139995	140004	20 %	20 %	20 %	40 %	527318861
118	NC_021888	GTACA	2	10	140726	140735	40 %	20 %	20 %	20 %	527318862
119	NC_021888	TAGAT	2	10	141099	141108	40 %	40 %	20 %	0 %	527318862
120	NC_021888	AAAAG	2	10	141511	141520	80 %	0 %	20 %	0 %	527318863
121	NC_021888	AAAAC	2	10	141991	142000	80 %	0 %	0 %	20 %	527318864
122	NC_021888	TGCTA	2	10	143077	143086	20 %	40 %	20 %	20 %	527318866
123	NC_021888	GGAGC	2	10	143124	143133	20 %	0 %	60 %	20 %	527318866
124	NC_021888	CTGGG	2	10	144538	144547	0 %	20 %	60 %	20 %	527318868
125	NC_021888	GTTTT	2	10	145285	145294	0 %	80 %	20 %	0 %	527318869
126	NC_021888	GAACC	2	10	149019	149028	40 %	0 %	20 %	40 %	527318870
127	NC_021888	ATTCT	2	10	152515	152524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021888	CTGTG	2	10	152718	152727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021888	TTCTT	2	10	155191	155200	0 %	80 %	0 %	20 %	527318876
130	NC_021888	TTCTA	2	10	157296	157305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021888	AGGAA	2	10	159749	159758	60 %	0 %	40 %	0 %	527318880
132	NC_021888	CAAAA	2	10	161752	161761	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021888	AGAGA	2	10	162980	162989	60 %	0 %	40 %	0 %	527318883
134	NC_021888	AGCAA	2	10	163415	163424	60 %	0 %	20 %	20 %	527318883
135	NC_021888	CAAAA	2	10	166918	166927	80 %	0 %	0 %	20 %	527318885
136	NC_021888	AAGAG	2	10	167751	167760	60 %	0 %	40 %	0 %	527318885
137	NC_021888	GATTG	2	10	168096	168105	20 %	40 %	40 %	0 %	527318885
138	NC_021888	GTTTT	2	10	174578	174587	0 %	80 %	20 %	0 %	527318889
139	NC_021888	TATTG	2	10	174601	174610	20 %	60 %	20 %	0 %	527318889
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256	NC_021888	CTTGT	2	10	337365	337374	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_021888	CCTTT	2	10	337823	337832	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
258	NC_021888	CTAAA	2	10	340917	340926	60 %	20 %	0 %	20 %	527319036
259	NC_021888	TCCAA	2	10	341552	341561	40 %	20 %	0 %	40 %	527319036
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263	NC_021888	CATTG	2	10	345831	345840	20 %	40 %	20 %	20 %	527319039
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