MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 23821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021888	TG	3	6	136147	136152	0 %	50 %	50 %	0 %	527318856
3003	NC_021888	TG	3	6	136173	136178	0 %	50 %	50 %	0 %	527318856
3004	NC_021888	TAG	2	6	136210	136215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318856
3005	NC_021888	ACA	2	6	136218	136223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318856
3006	NC_021888	CTT	2	6	136232	136237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318856
3007	NC_021888	TGTTT	2	10	136250	136259	0 %	80 %	20 %	0 %	527318856
3008	NC_021888	GCT	2	6	136263	136268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318856
3009	NC_021888	GGAT	2	8	136278	136285	25 %	25 %	50 %	0 %	527318856
3010	NC_021888	CTG	2	6	136399	136404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318857
3011	NC_021888	CAAT	2	8	136427	136434	50 %	25 %	0 %	25 %	527318857
3012	NC_021888	AAGC	2	8	136481	136488	50 %	0 %	25 %	25 %	527318857
3013	NC_021888	TTTG	2	8	136507	136514	0 %	75 %	25 %	0 %	527318857
3014	NC_021888	GCG	2	6	136550	136555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527318857
3015	NC_021888	TGC	2	6	136573	136578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318857
3016	NC_021888	TTC	2	6	136581	136586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318857
3017	NC_021888	CTG	2	6	136592	136597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318857
3018	NC_021888	CAG	2	6	136605	136610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318857
3019	NC_021888	TTTG	2	8	136622	136629	0 %	75 %	25 %	0 %	527318857
3020	NC_021888	CAG	2	6	136659	136664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318857
3021	NC_021888	GAA	2	6	136694	136699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318857
3022	NC_021888	GCT	2	6	136709	136714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318857
3023	NC_021888	CAG	2	6	136727	136732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318857
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3027	NC_021888	GAT	2	6	136850	136855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318857
3028	NC_021888	ATAA	2	8	136856	136863	75 %	25 %	0 %	0 %	527318857
3029	NC_021888	ACA	2	6	136866	136871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318857
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3032	NC_021888	T	9	9	136944	136952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021888	TTGCA	2	10	137040	137049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_021888	GAG	2	6	137104	137109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021888	TC	3	6	137114	137119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_021888	CT	3	6	137143	137148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_021888	TTC	2	6	137241	137246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021888	CTT	2	6	137291	137296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021888	CT	3	6	137325	137330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_021888	A	6	6	137374	137379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021888	TCT	2	6	137391	137396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_021888	CAG	2	6	137485	137490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_021888	AG	3	6	137489	137494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021888	GAA	2	6	137530	137535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021888	TTCT	2	8	137537	137544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_021888	AATT	2	8	137563	137570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021888	AAG	2	6	137675	137680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021888	CAA	2	6	137713	137718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3050	NC_021888	GCT	2	6	137775	137780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3052	NC_021888	GGA	2	6	137853	137858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021888	TTG	2	6	137993	137998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318858
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3058	NC_021888	AG	3	6	138227	138232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021888	GA	3	6	138290	138295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021888	A	6	6	138306	138311	100 %	0 %	0 %	0 %	527318859
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3097	NC_021888	CCTA	2	8	140216	140223	25 %	25 %	0 %	50 %	527318862
3098	NC_021888	GCT	2	6	140242	140247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318862
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3105	NC_021888	TAGAT	2	10	141099	141108	40 %	40 %	20 %	0 %	527318862
3106	NC_021888	TAT	2	6	141109	141114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318862
3107	NC_021888	CTCC	2	8	141115	141122	0 %	25 %	0 %	75 %	527318862
3108	NC_021888	CTG	2	6	141131	141136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318862
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3110	NC_021888	TAT	2	6	141181	141186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527318862
3111	NC_021888	TGG	2	6	141276	141281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527318862
3112	NC_021888	TCA	2	6	141303	141308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318862
3113	NC_021888	TCT	2	6	141333	141338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318862
3114	NC_021888	ATTA	2	8	141352	141359	50 %	50 %	0 %	0 %	527318862
3115	NC_021888	T	8	8	141421	141428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021888	T	6	6	141466	141471	0 %	100 %	0 %	0 %	527318863
3117	NC_021888	AAG	2	6	141475	141480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318863
3118	NC_021888	AAAAG	2	10	141511	141520	80 %	0 %	20 %	0 %	527318863
3119	NC_021888	T	6	6	141535	141540	0 %	100 %	0 %	0 %	527318863
3120	NC_021888	GCT	2	6	141571	141576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_021888	A	6	6	141587	141592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021888	ATC	2	6	141595	141600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_021888	A	6	6	141644	141649	100 %	0 %	0 %	0 %	527318864
3124	NC_021888	CTC	2	6	141794	141799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318864
3125	NC_021888	AAAAC	2	10	141991	142000	80 %	0 %	0 %	20 %	527318864
3126	NC_021888	AGA	2	6	142145	142150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318865
3127	NC_021888	GGA	2	6	142319	142324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527318865
3128	NC_021888	AGAA	2	8	142383	142390	75 %	0 %	25 %	0 %	527318865
3129	NC_021888	CTT	2	6	142420	142425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318865
3130	NC_021888	AAGA	2	8	142442	142449	75 %	0 %	25 %	0 %	527318865
3131	NC_021888	A	6	6	142454	142459	100 %	0 %	0 %	0 %	527318865
3132	NC_021888	AT	3	6	142522	142527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021888	CTT	2	6	142549	142554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021888	AAG	2	6	142559	142564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318866
3135	NC_021888	AAAG	2	8	142639	142646	75 %	0 %	25 %	0 %	527318866
3136	NC_021888	T	6	6	142683	142688	0 %	100 %	0 %	0 %	527318866
3137	NC_021888	GCA	2	6	142691	142696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318866
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3139	NC_021888	TCA	2	6	142722	142727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318866
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3141	NC_021888	TCC	2	6	142774	142779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318866
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3143	NC_021888	AGT	2	6	142871	142876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318866
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3145	NC_021888	GAAA	2	8	142972	142979	75 %	0 %	25 %	0 %	527318866
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3152	NC_021888	GGAGC	2	10	143124	143133	20 %	0 %	60 %	20 %	527318866
3153	NC_021888	A	6	6	143165	143170	100 %	0 %	0 %	0 %	527318866
3154	NC_021888	CTT	2	6	143172	143177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318866
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3158	NC_021888	AGA	2	6	143266	143271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318866
3159	NC_021888	ATGGTT	2	12	143302	143313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527318866
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3161	NC_021888	TCA	2	6	143509	143514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318867
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3163	NC_021888	TTG	2	6	143592	143597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318867
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3174	NC_021888	ATA	3	9	144208	144216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318867
3175	NC_021888	ATC	2	6	144240	144245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3176	NC_021888	TAA	2	6	144247	144252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3177	NC_021888	T	7	7	144311	144317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3179	NC_021888	T	7	7	144372	144378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_021888	AG	3	6	148058	148063	50 %	0 %	50 %	0 %	527318870
3248	NC_021888	AGGA	2	8	148078	148085	50 %	0 %	50 %	0 %	527318870
3249	NC_021888	CTC	2	6	148090	148095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318870
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