MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 22941

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14003	NC_021887	TCGAG	2	10	631038	631047	20 %	20 %	40 %	20 %	527318395
14004	NC_021887	T	6	6	631065	631070	0 %	100 %	0 %	0 %	527318395
14005	NC_021887	TTG	2	6	631095	631100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318395
14006	NC_021887	TCCT	2	8	631130	631137	0 %	50 %	0 %	50 %	527318395
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14061	NC_021887	A	6	6	633245	633250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14106	NC_021887	ATGC	2	8	635036	635043	25 %	25 %	25 %	25 %	527318401
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14108	NC_021887	GA	4	8	635135	635142	50 %	0 %	50 %	0 %	527318401
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14112	NC_021887	ACA	2	6	635238	635243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318402
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14122	NC_021887	ATA	2	6	635499	635504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318402
14123	NC_021887	CAT	2	6	635525	635530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318402
14124	NC_021887	T	8	8	635557	635564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_021887	TTC	2	6	635568	635573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_021887	CCT	2	6	635582	635587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14127	NC_021887	GAA	2	6	635621	635626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318403
14128	NC_021887	AATC	2	8	635640	635647	50 %	25 %	0 %	25 %	527318403
14129	NC_021887	ACC	2	6	635755	635760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527318403
14130	NC_021887	TTC	2	6	635775	635780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318403
14131	NC_021887	TCC	2	6	635850	635855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318403
14132	NC_021887	AAC	2	6	635859	635864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318403
14133	NC_021887	CTT	2	6	635876	635881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318403
14134	NC_021887	CCT	2	6	635953	635958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318403
14135	NC_021887	CAG	2	6	635966	635971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318403
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14138	NC_021887	TCC	2	6	636111	636116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318403
14139	NC_021887	TTTC	2	8	636206	636213	0 %	75 %	0 %	25 %	527318403
14140	NC_021887	AGAA	2	8	636235	636242	75 %	0 %	25 %	0 %	527318403
14141	NC_021887	CAC	2	6	636243	636248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527318403
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14145	NC_021887	AAG	2	6	636479	636484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318403
14146	NC_021887	CAGC	2	8	636494	636501	25 %	0 %	25 %	50 %	527318403
14147	NC_021887	TAA	3	9	636564	636572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318403
14148	NC_021887	TC	4	8	636624	636631	0 %	50 %	0 %	50 %	527318403
14149	NC_021887	AGC	2	6	636666	636671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318403
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14151	NC_021887	CT	3	6	636678	636683	0 %	50 %	0 %	50 %	527318403
14152	NC_021887	CGT	2	6	636718	636723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318403
14153	NC_021887	T	6	6	636723	636728	0 %	100 %	0 %	0 %	527318403
14154	NC_021887	CCT	2	6	636772	636777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14155	NC_021887	CGGAA	2	10	636988	636997	40 %	0 %	40 %	20 %	527318404
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14157	NC_021887	CA	3	6	637085	637090	50 %	0 %	0 %	50 %	527318404
14158	NC_021887	TTG	2	6	637150	637155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318404
14159	NC_021887	ATA	2	6	637159	637164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318404
14160	NC_021887	CAT	2	6	637213	637218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318404
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14162	NC_021887	TCT	2	6	637422	637427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318404
14163	NC_021887	TA	3	6	637474	637479	50 %	50 %	0 %	0 %	527318404
14164	NC_021887	GTC	2	6	637485	637490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318404
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14167	NC_021887	ACC	2	6	637632	637637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527318404
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14171	NC_021887	GCTC	2	8	637884	637891	0 %	25 %	25 %	50 %	527318404
14172	NC_021887	AAG	2	6	637958	637963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318404
14173	NC_021887	TA	3	6	638047	638052	50 %	50 %	0 %	0 %	527318404
14174	NC_021887	AAT	2	6	638069	638074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318404
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14179	NC_021887	A	6	6	638223	638228	100 %	0 %	0 %	0 %	527318404
14180	NC_021887	CAT	2	6	638279	638284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318404
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14183	NC_021887	TTTC	2	8	638338	638345	0 %	75 %	0 %	25 %	527318405
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14199	NC_021887	ACG	2	6	638896	638901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527318405
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14201	NC_021887	T	7	7	639143	639149	0 %	100 %	0 %	0 %	527318405
14202	NC_021887	CAA	2	6	639168	639173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318405
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14205	NC_021887	CTT	2	6	639266	639271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318405
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14210	NC_021887	AGCG	2	8	639556	639563	25 %	0 %	50 %	25 %	527318405
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14220	NC_021887	C	9	9	640214	640222	0 %	0 %	0 %	100 %	527318405
14221	NC_021887	GTT	2	6	640268	640273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527318405
14222	NC_021887	TC	3	6	640322	640327	0 %	50 %	0 %	50 %	527318405
14223	NC_021887	GA	3	6	640338	640343	50 %	0 %	50 %	0 %	527318405
14224	NC_021887	CTT	2	6	640349	640354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318405
14225	NC_021887	CAT	2	6	640373	640378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318405
14226	NC_021887	CAAA	2	8	640506	640513	75 %	0 %	0 %	25 %	527318405
14227	NC_021887	TCC	2	6	640557	640562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318406
14228	NC_021887	CAA	2	6	640655	640660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527318406
14229	NC_021887	TCT	2	6	640768	640773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318406
14230	NC_021887	ATC	2	6	640827	640832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318406
14231	NC_021887	AGAA	2	8	640836	640843	75 %	0 %	25 %	0 %	527318406
14232	NC_021887	CTG	2	6	640859	640864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318406
14233	NC_021887	TAA	2	6	640865	640870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527318406
14234	NC_021887	GAA	2	6	640939	640944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318406
14235	NC_021887	CTG	2	6	640965	640970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318406
14236	NC_021887	TCA	2	6	640973	640978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318406
14237	NC_021887	CAT	2	6	641007	641012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318406
14238	NC_021887	ATC	2	6	641016	641021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527318406
14239	NC_021887	AAG	2	6	641214	641219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527318406
14240	NC_021887	CA	3	6	641235	641240	50 %	0 %	0 %	50 %	527318406
14241	NC_021887	GCT	2	6	641249	641254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527318406
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14243	NC_021887	CCT	2	6	641365	641370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527318406
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14352	NC_021887	CAAG	2	8	645735	645742	50 %	0 %	25 %	25 %	527318410
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14361	NC_021887	TGA	2	6	646062	646067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527318410
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14364	NC_021887	TCT	2	6	646123	646128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527318411
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