MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021555	CAC	2	6	152679	152684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_021555	CTTT	2	8	152704	152711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_021555	CTT	2	6	152742	152747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021555	CA	3	6	152748	152753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_021555	CTG	2	6	152801	152806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021555	TGGC	2	8	152845	152852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_021555	CAA	2	6	152904	152909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_021555	ATTA	2	8	152993	153000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021555	CCA	2	6	153068	153073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_021555	GATTTT	2	12	153155	153166	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021555	ACA	2	6	153170	153175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021555	TTTG	2	8	153188	153195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021555	CTT	2	6	153218	153223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021555	T	7	7	153254	153260	0 %	100 %	0 %	0 %	557940263
3515	NC_021555	CTA	3	9	153278	153286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940263
3516	NC_021555	CAAC	2	8	153303	153310	50 %	0 %	0 %	50 %	557940263
3517	NC_021555	T	7	7	153332	153338	0 %	100 %	0 %	0 %	557940263
3518	NC_021555	T	6	6	153345	153350	0 %	100 %	0 %	0 %	557940263
3519	NC_021555	CCAAA	2	10	153359	153368	60 %	0 %	0 %	40 %	557940263
3520	NC_021555	TTA	2	6	153397	153402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940263
3521	NC_021555	AAG	2	6	153507	153512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940263
3522	NC_021555	AAACAG	2	12	153546	153557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	557940263
3523	NC_021555	AGAA	2	8	153616	153623	75 %	0 %	25 %	0 %	557940263
3524	NC_021555	GATT	2	8	153655	153662	25 %	50 %	25 %	0 %	557940263
3525	NC_021555	CAA	2	6	153680	153685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940263
3526	NC_021555	AAT	2	6	153800	153805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940263
3527	NC_021555	CTTT	2	8	153818	153825	0 %	75 %	0 %	25 %	557940263
3528	NC_021555	TGT	2	6	153841	153846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940263
3529	NC_021555	CTGT	2	8	153890	153897	0 %	50 %	25 %	25 %	557940263
3530	NC_021555	TTC	2	6	153964	153969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940263
3531	NC_021555	C	6	6	153982	153987	0 %	0 %	0 %	100 %	557940263
3532	NC_021555	TCT	2	6	154039	154044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940263
3533	NC_021555	AAAGC	2	10	154100	154109	60 %	0 %	20 %	20 %	557940263
3534	NC_021555	AAC	2	6	154140	154145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940263
3535	NC_021555	CCAA	2	8	154274	154281	50 %	0 %	0 %	50 %	557940263
3536	NC_021555	GCT	2	6	154293	154298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940263
3537	NC_021555	TGA	2	6	154527	154532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940263
3538	NC_021555	AAC	2	6	154534	154539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940263
3539	NC_021555	CCAAC	2	10	154571	154580	40 %	0 %	0 %	60 %	557940263
3540	NC_021555	AGA	2	6	154602	154607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940263
3541	NC_021555	CAAC	2	8	154620	154627	50 %	0 %	0 %	50 %	557940264
3542	NC_021555	AACT	2	8	154699	154706	50 %	25 %	0 %	25 %	557940264
3543	NC_021555	TAAC	2	8	154785	154792	50 %	25 %	0 %	25 %	557940264
3544	NC_021555	GCT	2	6	154816	154821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940264
3545	NC_021555	CCA	2	6	154829	154834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940264
3546	NC_021555	TGG	2	6	154866	154871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940264
3547	NC_021555	ACAAA	2	10	154875	154884	80 %	0 %	0 %	20 %	557940264
3548	NC_021555	TCCAA	2	10	155018	155027	40 %	20 %	0 %	40 %	557940264
3549	NC_021555	TTG	2	6	155033	155038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940264
3550	NC_021555	TGA	2	6	155097	155102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940264
3551	NC_021555	AGA	2	6	155202	155207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940264
3552	NC_021555	AACT	2	8	155355	155362	50 %	25 %	0 %	25 %	557940264
3553	NC_021555	TGCT	2	8	155446	155453	0 %	50 %	25 %	25 %	557940264
3554	NC_021555	AGA	2	6	155458	155463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940264
3555	NC_021555	CAC	2	6	155518	155523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940264
3556	NC_021555	C	6	6	155554	155559	0 %	0 %	0 %	100 %	557940264
3557	NC_021555	CAT	2	6	155646	155651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940264
3558	NC_021555	TAA	2	6	155672	155677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940264
3559	NC_021555	CTG	2	6	155766	155771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940264
3560	NC_021555	CCCA	2	8	155823	155830	25 %	0 %	0 %	75 %	557940264
3561	NC_021555	ACT	2	6	155954	155959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940264
3562	NC_021555	GTGG	2	8	155998	156005	0 %	25 %	75 %	0 %	557940264
3563	NC_021555	CAG	2	6	156015	156020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940264
3564	NC_021555	GAG	2	6	156037	156042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940264
3565	NC_021555	GA	3	6	156133	156138	50 %	0 %	50 %	0 %	557940265
3566	NC_021555	CCT	2	6	156183	156188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940265
3567	NC_021555	AGG	2	6	156275	156280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940265
3568	NC_021555	ATT	2	6	156380	156385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021555	ACCCCA	2	12	156467	156478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_021555	TTG	2	6	156536	156541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940266
3571	NC_021555	CCT	2	6	156588	156593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940266
3572	NC_021555	AAG	2	6	156655	156660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940266
3573	NC_021555	TAA	2	6	156680	156685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940266
3574	NC_021555	A	7	7	156684	156690	100 %	0 %	0 %	0 %	557940266
3575	NC_021555	CTGA	2	8	156709	156716	25 %	25 %	25 %	25 %	557940266
3576	NC_021555	AGT	2	6	156737	156742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940266
3577	NC_021555	AGG	2	6	156775	156780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940266
3578	NC_021555	CCA	2	6	156826	156831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940266
3579	NC_021555	AGA	2	6	156891	156896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940266
3580	NC_021555	AAC	2	6	157107	157112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021555	ACTA	2	8	157113	157120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_021555	GGT	2	6	157125	157130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021555	CTG	2	6	157138	157143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_021555	GATT	2	8	157241	157248	25 %	50 %	25 %	0 %	557940267
3585	NC_021555	C	7	7	157254	157260	0 %	0 %	0 %	100 %	557940267
3586	NC_021555	CAG	2	6	157268	157273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940267
3587	NC_021555	AGA	2	6	157305	157310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940267
3588	NC_021555	CCT	2	6	157334	157339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940267
3589	NC_021555	CCT	2	6	157375	157380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940267
3590	NC_021555	GATT	2	8	157423	157430	25 %	50 %	25 %	0 %	557940267
3591	NC_021555	GCT	2	6	157534	157539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940267
3592	NC_021555	GCT	2	6	157557	157562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940267
3593	NC_021555	ATTG	2	8	157574	157581	25 %	50 %	25 %	0 %	557940267
3594	NC_021555	ATA	2	6	157622	157627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021555	CTT	2	6	157693	157698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021555	A	6	6	157727	157732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021555	CTT	2	6	157815	157820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_021555	CT	3	6	157878	157883	0 %	50 %	0 %	50 %	557940268
3599	NC_021555	TTG	2	6	157959	157964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940268
3600	NC_021555	GAT	2	6	157973	157978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940268
3601	NC_021555	AGG	2	6	157989	157994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940268
3602	NC_021555	CAAT	2	8	158006	158013	50 %	25 %	0 %	25 %	557940268
3603	NC_021555	CAA	2	6	158022	158027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940268
3604	NC_021555	TCC	2	6	158049	158054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940268
3605	NC_021555	AAG	2	6	158068	158073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940268
3606	NC_021555	AGAT	2	8	158128	158135	50 %	25 %	25 %	0 %	557940268
3607	NC_021555	CT	3	6	158156	158161	0 %	50 %	0 %	50 %	557940268
3608	NC_021555	GTT	2	6	158299	158304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940268
3609	NC_021555	CTT	2	6	158319	158324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940268
3610	NC_021555	TAA	2	6	158328	158333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940268
3611	NC_021555	CTA	2	6	158358	158363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940268
3612	NC_021555	AAG	2	6	158368	158373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940268
3613	NC_021555	CTC	2	6	158434	158439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940268
3614	NC_021555	GTC	2	6	158483	158488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940268
3615	NC_021555	GAT	2	6	158492	158497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940268
3616	NC_021555	AAC	2	6	158535	158540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940268
3617	NC_021555	GT	4	8	158564	158571	0 %	50 %	50 %	0 %	557940268
3618	NC_021555	GTA	2	6	158610	158615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940268
3619	NC_021555	AATT	2	8	158656	158663	50 %	50 %	0 %	0 %	557940268
3620	NC_021555	TCC	2	6	158668	158673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940268
3621	NC_021555	ATA	2	6	158693	158698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940268
3622	NC_021555	AT	3	6	158757	158762	50 %	50 %	0 %	0 %	557940268
3623	NC_021555	AGC	2	6	158766	158771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940269
3624	NC_021555	AAAAC	2	10	158808	158817	80 %	0 %	0 %	20 %	557940269
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3626	NC_021555	CTA	2	6	158854	158859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940269
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3873	NC_021555	A	6	6	169952	169957	100 %	0 %	0 %	0 %	557940279
3874	NC_021555	ATG	2	6	169977	169982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940279
3875	NC_021555	CTC	2	6	169987	169992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940279
3876	NC_021555	TGA	2	6	169997	170002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940279
3877	NC_021555	TG	3	6	170014	170019	0 %	50 %	50 %	0 %	557940279
3878	NC_021555	GTTT	2	8	170110	170117	0 %	75 %	25 %	0 %	557940279
3879	NC_021555	AGA	2	6	170158	170163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940279
3880	NC_021555	AAG	2	6	170167	170172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940279
3881	NC_021555	TGA	2	6	170179	170184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940279
3882	NC_021555	GAA	2	6	170279	170284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940279
3883	NC_021555	TGT	2	6	170288	170293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940279
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3886	NC_021555	C	6	6	170311	170316	0 %	0 %	0 %	100 %	557940279
3887	NC_021555	AAAG	2	8	170339	170346	75 %	0 %	25 %	0 %	557940279
3888	NC_021555	CAA	2	6	170368	170373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940279
3889	NC_021555	TCA	2	6	170400	170405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940279
3890	NC_021555	A	6	6	170409	170414	100 %	0 %	0 %	0 %	557940279
3891	NC_021555	G	7	7	170485	170491	0 %	0 %	100 %	0 %	557940279
3892	NC_021555	ATC	2	6	170526	170531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940279
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3894	NC_021555	ACC	2	6	170578	170583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3895	NC_021555	A	7	7	170686	170692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3896	NC_021555	T	7	7	170693	170699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_021555	A	8	8	170716	170723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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