MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021555	TTTG	2	8	44299	44306	0 %	75 %	25 %	0 %	557940150
1002	NC_021555	CTG	2	6	44318	44323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940150
1003	NC_021555	CT	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	557940150
1004	NC_021555	CTT	2	6	44418	44423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940150
1005	NC_021555	CAGTTG	2	12	44445	44456	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	557940150
1006	NC_021555	ATT	2	6	44543	44548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940150
1007	NC_021555	CCA	2	6	44588	44593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940150
1008	NC_021555	AAC	2	6	44608	44613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940150
1009	NC_021555	CAGT	2	8	44752	44759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_021555	TGAC	2	8	44772	44779	25 %	25 %	25 %	25 %	557940151
1011	NC_021555	CTT	3	9	44805	44813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940151
1012	NC_021555	TTC	2	6	44830	44835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940151
1013	NC_021555	CTT	2	6	44889	44894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940151
1014	NC_021555	TCT	2	6	45031	45036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940151
1015	NC_021555	CAG	2	6	45072	45077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940151
1016	NC_021555	CAGCT	2	10	45162	45171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_021555	CA	4	8	45175	45182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_021555	TC	4	8	45243	45250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_021555	CT	3	6	45259	45264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_021555	CAG	2	6	45311	45316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_021555	GCT	2	6	45328	45333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021555	AAC	2	6	45348	45353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021555	TGA	2	6	45401	45406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1024	NC_021555	AAG	2	6	45482	45487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940152
1025	NC_021555	AG	3	6	45503	45508	50 %	0 %	50 %	0 %	557940152
1026	NC_021555	ATG	2	6	45569	45574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1027	NC_021555	AGG	2	6	45580	45585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940152
1028	NC_021555	TAT	2	6	45600	45605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940152
1029	NC_021555	GCC	2	6	45695	45700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557940152
1030	NC_021555	GGC	2	6	45741	45746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557940152
1031	NC_021555	TGGT	2	8	45760	45767	0 %	50 %	50 %	0 %	557940152
1032	NC_021555	AGG	2	6	45801	45806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940152
1033	NC_021555	GCACA	2	10	45921	45930	40 %	0 %	20 %	40 %	557940152
1034	NC_021555	GTT	2	6	45988	45993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940152
1035	NC_021555	ATCCA	2	10	46001	46010	40 %	20 %	0 %	40 %	557940152
1036	NC_021555	TTTC	2	8	46029	46036	0 %	75 %	0 %	25 %	557940152
1037	NC_021555	TTGG	2	8	46103	46110	0 %	50 %	50 %	0 %	557940152
1038	NC_021555	GTT	2	6	46146	46151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940152
1039	NC_021555	AGG	2	6	46318	46323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940152
1040	NC_021555	AGT	2	6	46392	46397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1041	NC_021555	GGT	2	6	46448	46453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940152
1042	NC_021555	AAAG	2	8	46457	46464	75 %	0 %	25 %	0 %	557940152
1043	NC_021555	TTTTG	2	10	46515	46524	0 %	80 %	20 %	0 %	557940152
1044	NC_021555	CTT	2	6	46558	46563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940152
1045	NC_021555	AAG	2	6	46629	46634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940152
1046	NC_021555	TAT	2	6	46648	46653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940152
1047	NC_021555	GA	3	6	46656	46661	50 %	0 %	50 %	0 %	557940152
1048	NC_021555	AAC	2	6	46710	46715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940152
1049	NC_021555	TAG	2	6	46766	46771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1050	NC_021555	ATC	2	6	46805	46810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940152
1051	NC_021555	AAG	2	6	46834	46839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940152
1052	NC_021555	TGG	2	6	46944	46949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940152
1053	NC_021555	ATG	2	6	47017	47022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1054	NC_021555	CTAA	2	8	47062	47069	50 %	25 %	0 %	25 %	557940152
1055	NC_021555	ACA	2	6	47202	47207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940152
1056	NC_021555	CAATA	2	10	47211	47220	60 %	20 %	0 %	20 %	557940152
1057	NC_021555	ATA	2	6	47279	47284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940152
1058	NC_021555	CT	3	6	47309	47314	0 %	50 %	0 %	50 %	557940152
1059	NC_021555	T	7	7	47346	47352	0 %	100 %	0 %	0 %	557940152
1060	NC_021555	GGA	2	6	47370	47375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940152
1061	NC_021555	TTAC	2	8	47378	47385	25 %	50 %	0 %	25 %	557940152
1062	NC_021555	TTA	2	6	47395	47400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940152
1063	NC_021555	AGA	2	6	47412	47417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940152
1064	NC_021555	TAAG	2	8	47516	47523	50 %	25 %	25 %	0 %	557940152
1065	NC_021555	GTT	2	6	47577	47582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940152
1066	NC_021555	TGC	3	9	47661	47669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940152
1067	NC_021555	TGC	2	6	47730	47735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940152
1068	NC_021555	AGGG	2	8	47798	47805	25 %	0 %	75 %	0 %	557940152
1069	NC_021555	CTT	2	6	47812	47817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940152
1070	NC_021555	CT	3	6	47835	47840	0 %	50 %	0 %	50 %	557940152
1071	NC_021555	AGA	2	6	47859	47864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940152
1072	NC_021555	CAGAT	2	10	47876	47885	40 %	20 %	20 %	20 %	557940152
1073	NC_021555	TGGGT	2	10	47901	47910	0 %	40 %	60 %	0 %	557940152
1074	NC_021555	AGA	2	6	47961	47966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940152
1075	NC_021555	AGT	2	6	48015	48020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1076	NC_021555	TAG	2	6	48021	48026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940152
1077	NC_021555	TAA	2	6	48044	48049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940152
1078	NC_021555	ATC	2	6	48118	48123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940152
1079	NC_021555	TTC	2	6	48164	48169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940152
1080	NC_021555	ACC	2	6	48400	48405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940152
1081	NC_021555	CTA	2	6	48496	48501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940152
1082	NC_021555	CCATT	2	10	48630	48639	20 %	40 %	0 %	40 %	557940152
1083	NC_021555	TAC	2	6	48686	48691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940152
1084	NC_021555	AAAT	2	8	48698	48705	75 %	25 %	0 %	0 %	557940152
1085	NC_021555	GTT	2	6	48724	48729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940152
1086	NC_021555	CTA	2	6	48768	48773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940152
1087	NC_021555	TGT	2	6	48903	48908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940153
1088	NC_021555	ATG	2	6	48932	48937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940153
1089	NC_021555	CAA	2	6	48960	48965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940153
1090	NC_021555	CTT	2	6	49007	49012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940153
1091	NC_021555	AGATG	2	10	49042	49051	40 %	20 %	40 %	0 %	557940153
1092	NC_021555	TG	3	6	49059	49064	0 %	50 %	50 %	0 %	557940153
1093	NC_021555	CTG	2	6	49065	49070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940153
1094	NC_021555	TTA	3	9	49083	49091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940153
1095	NC_021555	CAG	2	6	49174	49179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940153
1096	NC_021555	AAG	2	6	49213	49218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021555	CAA	2	6	49232	49237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_021555	TGG	2	6	49345	49350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940154
1099	NC_021555	ATG	2	6	49368	49373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940154
1100	NC_021555	CTT	2	6	49446	49451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940154
1101	NC_021555	GTT	2	6	49481	49486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940154
1102	NC_021555	AGA	2	6	49693	49698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940154
1103	NC_021555	A	6	6	49717	49722	100 %	0 %	0 %	0 %	557940154
1104	NC_021555	GTT	2	6	49837	49842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940154
1105	NC_021555	CCT	2	6	49885	49890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940154
1106	NC_021555	TGG	2	6	49918	49923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940154
1107	NC_021555	GTT	2	6	49952	49957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940154
1108	NC_021555	CTG	2	6	49964	49969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940154
1109	NC_021555	AACAGC	2	12	50021	50032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	557940154
1110	NC_021555	TGA	2	6	50122	50127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940154
1111	NC_021555	ATC	2	6	50174	50179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940154
1112	NC_021555	GT	3	6	50260	50265	0 %	50 %	50 %	0 %	557940154
1113	NC_021555	TC	3	6	50273	50278	0 %	50 %	0 %	50 %	557940154
1114	NC_021555	AGC	2	6	50294	50299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940154
1115	NC_021555	CAT	2	6	50300	50305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940154
1116	NC_021555	GTTG	2	8	50313	50320	0 %	50 %	50 %	0 %	557940154
1117	NC_021555	TTA	2	6	50344	50349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940154
1118	NC_021555	GTTG	2	8	50371	50378	0 %	50 %	50 %	0 %	557940154
1119	NC_021555	CTT	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940154
1120	NC_021555	TAG	2	6	50454	50459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940154
1121	NC_021555	ACTTCA	2	12	50466	50477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940154
1122	NC_021555	TGG	2	6	50503	50508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940154
1123	NC_021555	GCT	2	6	50549	50554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940154
1124	NC_021555	ATA	2	6	50571	50576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940154
1125	NC_021555	CTTT	2	8	50601	50608	0 %	75 %	0 %	25 %	557940154
1126	NC_021555	ACC	2	6	50657	50662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940154
1127	NC_021555	ATA	2	6	50673	50678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940154
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1253	NC_021555	CTTT	2	8	56513	56520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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