MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 7763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021487	TA	3	6	640	645	50 %	50 %	0 %	0 %	512550082
2	NC_021487	AG	3	6	975	980	50 %	0 %	50 %	0 %	512550082
3	NC_021487	AG	3	6	1640	1645	50 %	0 %	50 %	0 %	512550083
4	NC_021487	GC	3	6	1943	1948	0 %	0 %	50 %	50 %	512550083
5	NC_021487	CG	3	6	1971	1976	0 %	0 %	50 %	50 %	512550083
6	NC_021487	GC	4	8	1999	2006	0 %	0 %	50 %	50 %	512550083
7	NC_021487	GA	3	6	2040	2045	50 %	0 %	50 %	0 %	512550083
8	NC_021487	CG	3	6	3451	3456	0 %	0 %	50 %	50 %	512550085
9	NC_021487	CT	3	6	3545	3550	0 %	50 %	0 %	50 %	512550085
10	NC_021487	TC	3	6	4125	4130	0 %	50 %	0 %	50 %	512550086
11	NC_021487	CA	3	6	4238	4243	50 %	0 %	0 %	50 %	512550086
12	NC_021487	GA	3	6	4436	4441	50 %	0 %	50 %	0 %	512550086
13	NC_021487	GC	3	6	4771	4776	0 %	0 %	50 %	50 %	512550087
14	NC_021487	CT	3	6	4953	4958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021487	AG	3	6	6025	6030	50 %	0 %	50 %	0 %	512550088
16	NC_021487	GA	3	6	6068	6073	50 %	0 %	50 %	0 %	512550088
17	NC_021487	GT	3	6	6313	6318	0 %	50 %	50 %	0 %	512550088
18	NC_021487	CG	3	6	6743	6748	0 %	0 %	50 %	50 %	512550089
19	NC_021487	TG	3	6	7194	7199	0 %	50 %	50 %	0 %	512550090
20	NC_021487	GC	3	6	7231	7236	0 %	0 %	50 %	50 %	512550090
21	NC_021487	GC	3	6	7866	7871	0 %	0 %	50 %	50 %	512550090
22	NC_021487	GC	3	6	8091	8096	0 %	0 %	50 %	50 %	512550091
23	NC_021487	GA	3	6	9332	9337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021487	CG	3	6	9804	9809	0 %	0 %	50 %	50 %	512550092
25	NC_021487	AG	3	6	10185	10190	50 %	0 %	50 %	0 %	512550092
26	NC_021487	AC	3	6	11637	11642	50 %	0 %	0 %	50 %	512550095
27	NC_021487	AG	3	6	13026	13031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021487	GT	3	6	13800	13805	0 %	50 %	50 %	0 %	512550096
29	NC_021487	CA	3	6	16897	16902	50 %	0 %	0 %	50 %	512550098
30	NC_021487	TC	3	6	17110	17115	0 %	50 %	0 %	50 %	512550098
31	NC_021487	TC	3	6	17201	17206	0 %	50 %	0 %	50 %	512550099
32	NC_021487	TG	3	6	17250	17255	0 %	50 %	50 %	0 %	512550099
33	NC_021487	TC	3	6	17707	17712	0 %	50 %	0 %	50 %	512550099
34	NC_021487	GC	3	6	19627	19632	0 %	0 %	50 %	50 %	512550100
35	NC_021487	CA	3	6	20445	20450	50 %	0 %	0 %	50 %	512550101
36	NC_021487	GC	3	6	21436	21441	0 %	0 %	50 %	50 %	512550101
37	NC_021487	GT	3	6	21505	21510	0 %	50 %	50 %	0 %	512550101
38	NC_021487	CT	3	6	21768	21773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021487	CA	3	6	21834	21839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021487	AC	3	6	21914	21919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021487	TG	3	6	21925	21930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021487	CA	3	6	21983	21988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021487	CT	3	6	22615	22620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021487	CG	3	6	23981	23986	0 %	0 %	50 %	50 %	512550103
45	NC_021487	GA	3	6	24137	24142	50 %	0 %	50 %	0 %	512550103
46	NC_021487	GA	3	6	24452	24457	50 %	0 %	50 %	0 %	512550103
47	NC_021487	GC	3	6	25067	25072	0 %	0 %	50 %	50 %	512550104
48	NC_021487	AG	3	6	25187	25192	50 %	0 %	50 %	0 %	512550104
49	NC_021487	AG	4	8	25545	25552	50 %	0 %	50 %	0 %	512550105
50	NC_021487	TC	3	6	25676	25681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021487	TA	3	6	25913	25918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021487	TG	3	6	25920	25925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021487	GC	3	6	25964	25969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021487	AG	3	6	26017	26022	50 %	0 %	50 %	0 %	512550106
55	NC_021487	TG	3	6	26224	26229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021487	GA	3	6	27025	27030	50 %	0 %	50 %	0 %	512550108
57	NC_021487	GA	3	6	27443	27448	50 %	0 %	50 %	0 %	512550108
58	NC_021487	AG	3	6	28664	28669	50 %	0 %	50 %	0 %	512550110
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60	NC_021487	GA	4	8	29575	29582	50 %	0 %	50 %	0 %	512550111
61	NC_021487	TG	3	6	29880	29885	0 %	50 %	50 %	0 %	512550111
62	NC_021487	AG	3	6	30400	30405	50 %	0 %	50 %	0 %	512550111
63	NC_021487	CG	3	6	30908	30913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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70	NC_021487	GT	3	6	35864	35869	0 %	50 %	50 %	0 %	512550116
71	NC_021487	AG	4	8	36275	36282	50 %	0 %	50 %	0 %	512550116
72	NC_021487	TC	3	6	36437	36442	0 %	50 %	0 %	50 %	512550116
73	NC_021487	TC	3	6	36731	36736	0 %	50 %	0 %	50 %	512550116
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76	NC_021487	CT	3	6	38609	38614	0 %	50 %	0 %	50 %	512550118
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80	NC_021487	TA	3	6	39172	39177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_021487	GA	3	6	40503	40508	50 %	0 %	50 %	0 %	512550119
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89	NC_021487	CT	3	6	43301	43306	0 %	50 %	0 %	50 %	512550120
90	NC_021487	AG	3	6	43651	43656	50 %	0 %	50 %	0 %	512550120
91	NC_021487	GA	3	6	45650	45655	50 %	0 %	50 %	0 %	512550123
92	NC_021487	AG	3	6	45833	45838	50 %	0 %	50 %	0 %	512550123
93	NC_021487	TC	3	6	45966	45971	0 %	50 %	0 %	50 %	512550123
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105	NC_021487	TA	3	6	49535	49540	50 %	50 %	0 %	0 %	512550127
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108	NC_021487	AG	4	8	52139	52146	50 %	0 %	50 %	0 %	512550130
109	NC_021487	AG	3	6	52757	52762	50 %	0 %	50 %	0 %	512550130
110	NC_021487	GA	3	6	53931	53936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021487	AG	3	6	54423	54428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021487	AG	3	6	54582	54587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021487	CG	3	6	54692	54697	0 %	0 %	50 %	50 %	512550132
114	NC_021487	AG	3	6	54902	54907	50 %	0 %	50 %	0 %	512550132
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119	NC_021487	GC	3	6	55725	55730	0 %	0 %	50 %	50 %	512550134
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121	NC_021487	GC	3	6	55996	56001	0 %	0 %	50 %	50 %	512550134
122	NC_021487	GA	3	6	56440	56445	50 %	0 %	50 %	0 %	512550134
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125	NC_021487	TC	3	6	57389	57394	0 %	50 %	0 %	50 %	512550134
126	NC_021487	AG	3	6	58207	58212	50 %	0 %	50 %	0 %	512550134
127	NC_021487	CA	3	6	58867	58872	50 %	0 %	0 %	50 %	512550134
128	NC_021487	CG	3	6	59694	59699	0 %	0 %	50 %	50 %	512550135
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131	NC_021487	CT	3	6	60156	60161	0 %	50 %	0 %	50 %	512550135
132	NC_021487	AG	3	6	61228	61233	50 %	0 %	50 %	0 %	512550136
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134	NC_021487	GA	3	6	61459	61464	50 %	0 %	50 %	0 %	512550136
135	NC_021487	GA	3	6	61469	61474	50 %	0 %	50 %	0 %	512550136
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142	NC_021487	GT	3	6	63810	63815	0 %	50 %	50 %	0 %	512550139
143	NC_021487	AC	3	6	64772	64777	50 %	0 %	0 %	50 %	512550140
144	NC_021487	CA	3	6	64789	64794	50 %	0 %	0 %	50 %	512550140
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