MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_021487	TCC	2	6	2296879	2296884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512551949
44503	NC_021487	AAG	2	6	2297062	2297067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44504	NC_021487	GGA	2	6	2297136	2297141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44505	NC_021487	AAC	2	6	2297154	2297159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512551950
44506	NC_021487	CTA	2	6	2297171	2297176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551950
44507	NC_021487	TTGC	2	8	2297190	2297197	0 %	50 %	25 %	25 %	512551950
44508	NC_021487	CTT	2	6	2297222	2297227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551950
44509	NC_021487	CTGG	2	8	2297260	2297267	0 %	25 %	50 %	25 %	512551950
44510	NC_021487	CT	5	10	2297300	2297309	0 %	50 %	0 %	50 %	512551950
44511	NC_021487	CGGC	2	8	2297338	2297345	0 %	0 %	50 %	50 %	512551950
44512	NC_021487	GGT	2	6	2297348	2297353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551950
44513	NC_021487	GC	3	6	2297372	2297377	0 %	0 %	50 %	50 %	512551950
44514	NC_021487	GCG	2	6	2297460	2297465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551950
44515	NC_021487	GGT	2	6	2297507	2297512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551950
44516	NC_021487	CGT	2	6	2297519	2297524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551950
44517	NC_021487	GAGC	2	8	2297561	2297568	25 %	0 %	50 %	25 %	512551950
44518	NC_021487	CG	4	8	2297655	2297662	0 %	0 %	50 %	50 %	512551950
44519	NC_021487	GTG	2	6	2297787	2297792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551950
44520	NC_021487	TGG	2	6	2297890	2297895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551950
44521	NC_021487	GCA	2	6	2297899	2297904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551950
44522	NC_021487	AG	3	6	2297921	2297926	50 %	0 %	50 %	0 %	512551950
44523	NC_021487	CCCT	2	8	2297967	2297974	0 %	25 %	0 %	75 %	512551950
44524	NC_021487	GGA	2	6	2298011	2298016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551950
44525	NC_021487	ACG	2	6	2298056	2298061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551950
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44527	NC_021487	G	6	6	2298186	2298191	0 %	0 %	100 %	0 %	512551950
44528	NC_021487	CCGAG	2	10	2298257	2298266	20 %	0 %	40 %	40 %	512551950
44529	NC_021487	GAG	2	6	2298315	2298320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551950
44530	NC_021487	GCTC	2	8	2298371	2298378	0 %	25 %	25 %	50 %	512551950
44531	NC_021487	TC	3	6	2298503	2298508	0 %	50 %	0 %	50 %	512551951
44532	NC_021487	GCG	2	6	2298538	2298543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551951
44533	NC_021487	CTT	2	6	2298557	2298562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551951
44534	NC_021487	GCT	2	6	2298589	2298594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551951
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44536	NC_021487	AGG	3	9	2298747	2298755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551951
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44539	NC_021487	GGT	2	6	2298904	2298909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551951
44540	NC_021487	GCC	2	6	2299090	2299095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551951
44541	NC_021487	CCG	2	6	2299105	2299110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551951
44542	NC_021487	CAT	2	6	2299117	2299122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551951
44543	NC_021487	CCG	2	6	2299183	2299188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551951
44544	NC_021487	GCG	2	6	2299288	2299293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551951
44545	NC_021487	TGG	2	6	2299296	2299301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551951
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44551	NC_021487	GAA	2	6	2299650	2299655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551952
44552	NC_021487	GCT	2	6	2299729	2299734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551952
44553	NC_021487	GC	4	8	2299858	2299865	0 %	0 %	50 %	50 %	512551952
44554	NC_021487	TGGCCG	2	12	2299886	2299897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512551952
44555	NC_021487	TGT	2	6	2299947	2299952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551952
44556	NC_021487	GAG	2	6	2299960	2299965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512551952
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44562	NC_021487	GCT	2	6	2300115	2300120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551952
44563	NC_021487	AC	3	6	2300126	2300131	50 %	0 %	0 %	50 %	512551952
44564	NC_021487	A	6	6	2300199	2300204	100 %	0 %	0 %	0 %	512551952
44565	NC_021487	TTC	2	6	2300219	2300224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512551952
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44568	NC_021487	CAT	2	6	2300430	2300435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551952
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44579	NC_021487	GGAG	2	8	2301134	2301141	25 %	0 %	75 %	0 %	512551953
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44601	NC_021487	GTG	2	6	2302088	2302093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551954
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44608	NC_021487	CCCT	2	8	2302391	2302398	0 %	25 %	0 %	75 %	512551954
44609	NC_021487	GGC	2	6	2302435	2302440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551954
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44618	NC_021487	ATC	2	6	2302720	2302725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551955
44619	NC_021487	CGT	2	6	2302749	2302754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551955
44620	NC_021487	TGC	2	6	2302763	2302768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551955
44621	NC_021487	GGT	2	6	2302800	2302805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551955
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44623	NC_021487	CGA	2	6	2302899	2302904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551955
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44626	NC_021487	T	7	7	2302988	2302994	0 %	100 %	0 %	0 %	512551955
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44630	NC_021487	CATCA	2	10	2303068	2303077	40 %	20 %	0 %	40 %	512551955
44631	NC_021487	CGC	2	6	2303098	2303103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551955
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44645	NC_021487	GCG	2	6	2304091	2304096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551956
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44647	NC_021487	GC	3	6	2304204	2304209	0 %	0 %	50 %	50 %	512551956
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44649	NC_021487	GT	4	8	2304442	2304449	0 %	50 %	50 %	0 %	512551956
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44671	NC_021487	TCCC	2	8	2305398	2305405	0 %	25 %	0 %	75 %	512551957
44672	NC_021487	CGG	2	6	2305437	2305442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512551957
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44687	NC_021487	GAGATG	2	12	2306104	2306115	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	512551957
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44716	NC_021487	A	7	7	2307000	2307006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44721	NC_021487	GC	3	6	2307287	2307292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44722	NC_021487	AG	3	6	2307293	2307298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44723	NC_021487	GC	3	6	2307306	2307311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44724	NC_021487	GA	3	6	2307418	2307423	50 %	0 %	50 %	0 %	512551959
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44734	NC_021487	GTG	2	6	2307627	2307632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551959
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44856	NC_021487	GTG	2	6	2313051	2313056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551963
44857	NC_021487	GC	3	6	2313092	2313097	0 %	0 %	50 %	50 %	512551963
44858	NC_021487	GCGCC	2	10	2313148	2313157	0 %	0 %	40 %	60 %	512551963
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44866	NC_021487	TAG	2	6	2313535	2313540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551963
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44970	NC_021487	AGC	2	6	2318325	2318330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551968
44971	NC_021487	TCA	2	6	2318470	2318475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551968
44972	NC_021487	GTG	2	6	2318601	2318606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551968
44973	NC_021487	TCG	2	6	2318688	2318693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551968
44974	NC_021487	TTG	2	6	2318718	2318723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512551968
44975	NC_021487	CA	3	6	2318732	2318737	50 %	0 %	0 %	50 %	512551968
44976	NC_021487	GC	3	6	2318843	2318848	0 %	0 %	50 %	50 %	512551968
44977	NC_021487	GC	3	6	2318861	2318866	0 %	0 %	50 %	50 %	512551968
44978	NC_021487	ATC	2	6	2318877	2318882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551968
44979	NC_021487	GCC	2	6	2318900	2318905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551968
44980	NC_021487	GCA	2	6	2319010	2319015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512551968
44981	NC_021487	T	6	6	2319046	2319051	0 %	100 %	0 %	0 %	512551968
44982	NC_021487	GGCGA	2	10	2319122	2319131	20 %	0 %	60 %	20 %	512551968
44983	NC_021487	CCA	2	6	2319148	2319153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551968
44984	NC_021487	GAT	2	6	2319193	2319198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551968
44985	NC_021487	AGA	2	6	2319289	2319294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512551968
44986	NC_021487	TCG	2	6	2319342	2319347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551968
44987	NC_021487	GTC	2	6	2319374	2319379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551968
44988	NC_021487	CGC	2	6	2319400	2319405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512551968
44989	NC_021487	TCA	2	6	2319514	2319519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512551968
44990	NC_021487	AGCC	2	8	2319667	2319674	25 %	0 %	25 %	50 %	512551968
44991	NC_021487	TGC	2	6	2319709	2319714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512551968
44992	NC_021487	GAT	2	6	2319722	2319727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551968
44993	NC_021487	TGG	2	6	2319760	2319765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551968
44994	NC_021487	TGG	2	6	2319832	2319837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512551968
44995	NC_021487	AAT	2	6	2319932	2319937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512551968
44996	NC_021487	ACC	2	6	2320008	2320013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512551968
44997	NC_021487	GATC	2	8	2320036	2320043	25 %	25 %	25 %	25 %	512551968
44998	NC_021487	CCCA	2	8	2320056	2320063	25 %	0 %	0 %	75 %	512551968
44999	NC_021487	AGT	2	6	2320177	2320182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551968
45000	NC_021487	ATG	2	6	2320191	2320196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512551968

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