MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021487	GAG	2	6	178963	178968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550239
3502	NC_021487	CGC	2	6	178975	178980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550239
3503	NC_021487	GCT	2	6	179007	179012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550239
3504	NC_021487	CGTT	2	8	179046	179053	0 %	50 %	25 %	25 %	512550239
3505	NC_021487	GC	3	6	179064	179069	0 %	0 %	50 %	50 %	512550239
3506	NC_021487	CG	3	6	179177	179182	0 %	0 %	50 %	50 %	512550239
3507	NC_021487	CCG	2	6	179231	179236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550239
3508	NC_021487	CTG	2	6	179321	179326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550239
3509	NC_021487	AGGA	2	8	179447	179454	50 %	0 %	50 %	0 %	512550239
3510	NC_021487	CAC	2	6	179514	179519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550239
3511	NC_021487	TGG	2	6	179613	179618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550240
3512	NC_021487	GCC	2	6	179626	179631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550240
3513	NC_021487	AGC	2	6	179644	179649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550240
3514	NC_021487	TTC	2	6	179650	179655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550240
3515	NC_021487	A	6	6	179679	179684	100 %	0 %	0 %	0 %	512550240
3516	NC_021487	GGT	2	6	179756	179761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550240
3517	NC_021487	GC	3	6	179825	179830	0 %	0 %	50 %	50 %	512550240
3518	NC_021487	CGATG	2	10	179831	179840	20 %	20 %	40 %	20 %	512550240
3519	NC_021487	CGA	2	6	179906	179911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550240
3520	NC_021487	GCG	2	6	179916	179921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550240
3521	NC_021487	GTT	2	6	179930	179935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550240
3522	NC_021487	GGA	2	6	180050	180055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550240
3523	NC_021487	A	6	6	180085	180090	100 %	0 %	0 %	0 %	512550240
3524	NC_021487	C	7	7	180168	180174	0 %	0 %	0 %	100 %	512550240
3525	NC_021487	GGC	2	6	180176	180181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550240
3526	NC_021487	TTA	2	6	180202	180207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550240
3527	NC_021487	AG	3	6	180320	180325	50 %	0 %	50 %	0 %	512550240
3528	NC_021487	GGT	2	6	180350	180355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550240
3529	NC_021487	GAAGA	2	10	180375	180384	60 %	0 %	40 %	0 %	512550241
3530	NC_021487	ATCT	2	8	180474	180481	25 %	50 %	0 %	25 %	512550241
3531	NC_021487	CTG	2	6	180735	180740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550241
3532	NC_021487	GTT	2	6	180782	180787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550241
3533	NC_021487	AAG	2	6	180854	180859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550241
3534	NC_021487	AGA	2	6	180961	180966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550241
3535	NC_021487	TGT	2	6	181002	181007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550241
3536	NC_021487	GTT	2	6	181031	181036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550241
3537	NC_021487	CTT	2	6	181064	181069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550241
3538	NC_021487	AGAT	2	8	181096	181103	50 %	25 %	25 %	0 %	512550241
3539	NC_021487	CGT	2	6	181194	181199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550241
3540	NC_021487	TCAGC	2	10	181251	181260	20 %	20 %	20 %	40 %	512550241
3541	NC_021487	CT	3	6	181342	181347	0 %	50 %	0 %	50 %	512550241
3542	NC_021487	TGT	2	6	181398	181403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550241
3543	NC_021487	GT	3	6	181414	181419	0 %	50 %	50 %	0 %	512550241
3544	NC_021487	CAA	2	6	181628	181633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021487	ACT	2	6	181637	181642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021487	TAG	2	6	181645	181650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021487	CCT	2	6	181662	181667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_021487	ACA	2	6	181680	181685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_021487	CTC	2	6	181739	181744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550242
3550	NC_021487	GGA	2	6	181780	181785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550242
3551	NC_021487	AGCC	2	8	181860	181867	25 %	0 %	25 %	50 %	512550242
3552	NC_021487	ACG	2	6	181900	181905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550242
3553	NC_021487	AGA	2	6	181908	181913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550242
3554	NC_021487	TTTCC	2	10	181930	181939	0 %	60 %	0 %	40 %	512550243
3555	NC_021487	CCAG	2	8	181951	181958	25 %	0 %	25 %	50 %	512550243
3556	NC_021487	CCA	2	6	181961	181966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550243
3557	NC_021487	TCAGG	2	10	181972	181981	20 %	20 %	40 %	20 %	512550243
3558	NC_021487	CGG	2	6	182018	182023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550243
3559	NC_021487	TAG	2	6	182079	182084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550243
3560	NC_021487	CAC	2	6	182114	182119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550243
3561	NC_021487	GTA	2	6	182156	182161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550243
3562	NC_021487	TC	3	6	182182	182187	0 %	50 %	0 %	50 %	512550243
3563	NC_021487	AGAT	2	8	182214	182221	50 %	25 %	25 %	0 %	512550243
3564	NC_021487	TCA	2	6	182253	182258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550243
3565	NC_021487	ATC	2	6	182280	182285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550243
3566	NC_021487	TTG	2	6	182318	182323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550243
3567	NC_021487	ACA	2	6	182397	182402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550243
3568	NC_021487	CCT	2	6	182404	182409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550243
3569	NC_021487	GCGCCT	2	12	182452	182463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512550243
3570	NC_021487	GGC	2	6	182541	182546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550243
3571	NC_021487	GCGG	2	8	182624	182631	0 %	0 %	75 %	25 %	512550243
3572	NC_021487	GC	3	6	182672	182677	0 %	0 %	50 %	50 %	512550243
3573	NC_021487	GCA	2	6	182746	182751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550243
3574	NC_021487	AAGG	2	8	182759	182766	50 %	0 %	50 %	0 %	512550243
3575	NC_021487	CTG	2	6	182783	182788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550243
3576	NC_021487	GGCACG	2	12	182810	182821	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512550243
3577	NC_021487	CT	3	6	182837	182842	0 %	50 %	0 %	50 %	512550243
3578	NC_021487	TGC	2	6	182862	182867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550243
3579	NC_021487	TTG	2	6	182870	182875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550243
3580	NC_021487	GC	3	6	182934	182939	0 %	0 %	50 %	50 %	512550243
3581	NC_021487	CTC	2	6	182975	182980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550243
3582	NC_021487	CCT	2	6	183010	183015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550243
3583	NC_021487	ACG	2	6	183101	183106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550243
3584	NC_021487	GGCT	2	8	183217	183224	0 %	25 %	50 %	25 %	512550243
3585	NC_021487	G	6	6	183306	183311	0 %	0 %	100 %	0 %	512550243
3586	NC_021487	GAG	2	6	183342	183347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550243
3587	NC_021487	GC	4	8	183360	183367	0 %	0 %	50 %	50 %	512550243
3588	NC_021487	CTT	2	6	183409	183414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550243
3589	NC_021487	CG	3	6	183439	183444	0 %	0 %	50 %	50 %	512550243
3590	NC_021487	T	6	6	183607	183612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021487	GCA	2	6	183615	183620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_021487	CTT	2	6	183663	183668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550244
3593	NC_021487	CA	3	6	183739	183744	50 %	0 %	0 %	50 %	512550244
3594	NC_021487	AAG	2	6	183774	183779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550244
3595	NC_021487	TAG	2	6	183826	183831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550244
3596	NC_021487	TGG	2	6	183871	183876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550244
3597	NC_021487	AAG	2	6	183881	183886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550244
3598	NC_021487	TGA	2	6	184012	184017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550244
3599	NC_021487	GTG	2	6	184098	184103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550244
3600	NC_021487	GAG	2	6	184118	184123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550244
3601	NC_021487	CGCTGG	2	12	184161	184172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512550244
3602	NC_021487	T	6	6	184204	184209	0 %	100 %	0 %	0 %	512550244
3603	NC_021487	GCCTT	2	10	184266	184275	0 %	40 %	20 %	40 %	512550244
3604	NC_021487	TGG	2	6	184327	184332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550244
3605	NC_021487	TCT	2	6	184372	184377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550244
3606	NC_021487	CGG	2	6	184402	184407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550244
3607	NC_021487	CTC	2	6	184421	184426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550244
3608	NC_021487	GCC	2	6	184445	184450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550244
3609	NC_021487	G	6	6	184463	184468	0 %	0 %	100 %	0 %	512550244
3610	NC_021487	AG	3	6	184556	184561	50 %	0 %	50 %	0 %	512550244
3611	NC_021487	AAG	2	6	184657	184662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550245
3612	NC_021487	CGT	2	6	184719	184724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550245
3613	NC_021487	GA	3	6	184802	184807	50 %	0 %	50 %	0 %	512550245
3614	NC_021487	GA	3	6	184820	184825	50 %	0 %	50 %	0 %	512550245
3615	NC_021487	AAG	2	6	184841	184846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550245
3616	NC_021487	CAT	2	6	184864	184869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550245
3617	NC_021487	GATCT	2	10	184936	184945	20 %	40 %	20 %	20 %	512550245
3618	NC_021487	CTA	2	6	184961	184966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550245
3619	NC_021487	GCA	2	6	185016	185021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550245
3620	NC_021487	GAT	2	6	185143	185148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550245
3621	NC_021487	GC	3	6	185212	185217	0 %	0 %	50 %	50 %	512550245
3622	NC_021487	AG	3	6	185224	185229	50 %	0 %	50 %	0 %	512550245
3623	NC_021487	CG	3	6	185300	185305	0 %	0 %	50 %	50 %	512550245
3624	NC_021487	GCG	2	6	185387	185392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550245
3625	NC_021487	GAG	2	6	185393	185398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550245
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3627	NC_021487	TCT	2	6	185477	185482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550245
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3633	NC_021487	TCA	2	6	185720	185725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550246
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3745	NC_021487	CT	4	8	191606	191613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3746	NC_021487	AGG	2	6	191726	191731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3748	NC_021487	TCC	2	6	191817	191822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3749	NC_021487	CGT	2	6	191841	191846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3994	NC_021487	GTT	2	6	205058	205063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550263
3995	NC_021487	AGA	2	6	205123	205128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550263
3996	NC_021487	AAC	2	6	205170	205175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550263
3997	NC_021487	GC	3	6	205222	205227	0 %	0 %	50 %	50 %	512550263
3998	NC_021487	CTT	2	6	205244	205249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550263
3999	NC_021487	GCC	2	6	205300	205305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550263
4000	NC_021487	TGG	2	6	205392	205397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550263

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