MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021487	AGG	2	6	127894	127899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550196
2502	NC_021487	TCT	2	6	127918	127923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550196
2503	NC_021487	GAA	2	6	127940	127945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550196
2504	NC_021487	TGT	2	6	127967	127972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550196
2505	NC_021487	CGCTC	2	10	128002	128011	0 %	20 %	20 %	60 %	512550196
2506	NC_021487	GCT	2	6	128045	128050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550196
2507	NC_021487	TC	4	8	128068	128075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2508	NC_021487	GT	4	8	128096	128103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_021487	CGA	2	6	128113	128118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_021487	CTG	2	6	128151	128156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_021487	AGA	2	6	128158	128163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_021487	GA	3	6	128162	128167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_021487	CAT	2	6	128195	128200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_021487	CTT	2	6	128228	128233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_021487	TAT	2	6	128236	128241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_021487	CAG	2	6	128297	128302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_021487	CTA	2	6	128409	128414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550197
2518	NC_021487	TGC	2	6	128464	128469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550197
2519	NC_021487	GC	3	6	128488	128493	0 %	0 %	50 %	50 %	512550197
2520	NC_021487	ACT	2	6	128560	128565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550197
2521	NC_021487	CCT	2	6	128595	128600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550197
2522	NC_021487	AGA	2	6	128737	128742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550197
2523	NC_021487	AG	3	6	128768	128773	50 %	0 %	50 %	0 %	512550197
2524	NC_021487	GGT	2	6	128779	128784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550197
2525	NC_021487	GA	3	6	128796	128801	50 %	0 %	50 %	0 %	512550197
2526	NC_021487	GGT	2	6	128818	128823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550197
2527	NC_021487	GCA	2	6	128878	128883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550197
2528	NC_021487	GC	4	8	128926	128933	0 %	0 %	50 %	50 %	512550197
2529	NC_021487	GATG	2	8	128962	128969	25 %	25 %	50 %	0 %	512550197
2530	NC_021487	TCA	2	6	128977	128982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550197
2531	NC_021487	TCC	2	6	128991	128996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550197
2532	NC_021487	TGG	2	6	129004	129009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550197
2533	NC_021487	GCA	2	6	129040	129045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550197
2534	NC_021487	ACGCG	2	10	129135	129144	20 %	0 %	40 %	40 %	512550197
2535	NC_021487	GAG	2	6	129150	129155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550197
2536	NC_021487	CTC	2	6	129159	129164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550197
2537	NC_021487	CAA	2	6	129244	129249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550197
2538	NC_021487	CAT	2	6	129275	129280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550197
2539	NC_021487	AG	3	6	129286	129291	50 %	0 %	50 %	0 %	512550197
2540	NC_021487	AGG	2	6	129360	129365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550197
2541	NC_021487	ATT	2	6	129383	129388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550197
2542	NC_021487	GGACG	2	10	129411	129420	20 %	0 %	60 %	20 %	512550197
2543	NC_021487	TGG	2	6	129460	129465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550198
2544	NC_021487	GGTGAG	2	12	129472	129483	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512550198
2545	NC_021487	CTT	2	6	129532	129537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550198
2546	NC_021487	TGC	2	6	129596	129601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550198
2547	NC_021487	CAA	2	6	129738	129743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550198
2548	NC_021487	GAA	2	6	129777	129782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550198
2549	NC_021487	CGGC	2	8	129941	129948	0 %	0 %	50 %	50 %	512550198
2550	NC_021487	TCCA	2	8	129968	129975	25 %	25 %	0 %	50 %	512550198
2551	NC_021487	GCT	2	6	130044	130049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550198
2552	NC_021487	ATG	2	6	130288	130293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550198
2553	NC_021487	ATC	2	6	130345	130350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550198
2554	NC_021487	CCA	2	6	130365	130370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550198
2555	NC_021487	GTAGCC	2	12	130463	130474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550198
2556	NC_021487	CCG	2	6	130484	130489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550198
2557	NC_021487	TGA	2	6	130616	130621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550199
2558	NC_021487	GAA	2	6	130623	130628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550199
2559	NC_021487	GGTG	2	8	130629	130636	0 %	25 %	75 %	0 %	512550199
2560	NC_021487	GGC	2	6	130848	130853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550199
2561	NC_021487	GCC	2	6	130870	130875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550199
2562	NC_021487	GGGAT	2	10	130947	130956	20 %	20 %	60 %	0 %	512550199
2563	NC_021487	GGC	2	6	130980	130985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550199
2564	NC_021487	CCA	2	6	131021	131026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550199
2565	NC_021487	TAC	2	6	131123	131128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550199
2566	NC_021487	CAA	2	6	131141	131146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550199
2567	NC_021487	AGT	2	6	131170	131175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550199
2568	NC_021487	TGC	2	6	131236	131241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550199
2569	NC_021487	AGC	2	6	131262	131267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550199
2570	NC_021487	AT	3	6	131335	131340	50 %	50 %	0 %	0 %	512550199
2571	NC_021487	CCA	2	6	131346	131351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550199
2572	NC_021487	AAG	2	6	131400	131405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550199
2573	NC_021487	GC	3	6	131409	131414	0 %	0 %	50 %	50 %	512550199
2574	NC_021487	GGC	2	6	131433	131438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550199
2575	NC_021487	AGC	2	6	131569	131574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550199
2576	NC_021487	GGTA	2	8	131634	131641	25 %	25 %	50 %	0 %	512550199
2577	NC_021487	TAC	2	6	131699	131704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550199
2578	NC_021487	AG	3	6	131772	131777	50 %	0 %	50 %	0 %	512550199
2579	NC_021487	TGT	2	6	131789	131794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550199
2580	NC_021487	CG	3	6	131888	131893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_021487	GCA	2	6	131941	131946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_021487	TCA	2	6	131985	131990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_021487	AGC	2	6	131998	132003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_021487	G	7	7	132102	132108	0 %	0 %	100 %	0 %	512550200
2585	NC_021487	GA	3	6	132132	132137	50 %	0 %	50 %	0 %	512550200
2586	NC_021487	GCA	2	6	132153	132158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550200
2587	NC_021487	TGT	2	6	132236	132241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550200
2588	NC_021487	AG	3	6	132267	132272	50 %	0 %	50 %	0 %	512550200
2589	NC_021487	AAG	2	6	132305	132310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550200
2590	NC_021487	AGG	2	6	132392	132397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_021487	ATA	2	6	132554	132559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550201
2592	NC_021487	TC	3	6	132617	132622	0 %	50 %	0 %	50 %	512550201
2593	NC_021487	GTG	2	6	132656	132661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550201
2594	NC_021487	TGAA	2	8	132749	132756	50 %	25 %	25 %	0 %	512550201
2595	NC_021487	CGGT	2	8	132797	132804	0 %	25 %	50 %	25 %	512550201
2596	NC_021487	GAT	2	6	132817	132822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550201
2597	NC_021487	CCT	2	6	132852	132857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550201
2598	NC_021487	TGGGG	2	10	132868	132877	0 %	20 %	80 %	0 %	512550201
2599	NC_021487	AAT	2	6	132922	132927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550201
2600	NC_021487	GGC	2	6	132952	132957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550201
2601	NC_021487	TACC	2	8	132984	132991	25 %	25 %	0 %	50 %	512550201
2602	NC_021487	CTC	2	6	132993	132998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550201
2603	NC_021487	CTG	2	6	133005	133010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550201
2604	NC_021487	CCG	2	6	133011	133016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550201
2605	NC_021487	GGC	2	6	133038	133043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550201
2606	NC_021487	TGGA	2	8	133053	133060	25 %	25 %	50 %	0 %	512550201
2607	NC_021487	TTGGC	2	10	133061	133070	0 %	40 %	40 %	20 %	512550201
2608	NC_021487	GAT	2	6	133078	133083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550201
2609	NC_021487	GGA	2	6	133101	133106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550201
2610	NC_021487	ATC	2	6	133121	133126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550201
2611	NC_021487	TTA	2	6	133153	133158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021487	GCC	2	6	133165	133170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_021487	CTT	2	6	133192	133197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_021487	AGG	2	6	133203	133208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_021487	GAA	2	6	133209	133214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550202
2616	NC_021487	GTT	3	9	133243	133251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550202
2617	NC_021487	T	6	6	133278	133283	0 %	100 %	0 %	0 %	512550202
2618	NC_021487	GAG	2	6	133317	133322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550202
2619	NC_021487	GCT	2	6	133357	133362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550202
2620	NC_021487	GCTCA	2	10	133421	133430	20 %	20 %	20 %	40 %	512550202
2621	NC_021487	CAG	2	6	133475	133480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550202
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2623	NC_021487	AGC	2	6	133560	133565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550202
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2870	NC_021487	CTT	2	6	146491	146496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550214
2871	NC_021487	GAA	2	6	146525	146530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550214
2872	NC_021487	C	6	6	146555	146560	0 %	0 %	0 %	100 %	512550214
2873	NC_021487	AGC	2	6	146592	146597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550214
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2885	NC_021487	TGT	2	6	146981	146986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550214
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2991	NC_021487	CAT	2	6	152815	152820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550219
2992	NC_021487	TAA	2	6	152835	152840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550219
2993	NC_021487	CTAC	2	8	152855	152862	25 %	25 %	0 %	50 %	512550219
2994	NC_021487	GTG	2	6	153043	153048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550219
2995	NC_021487	GC	3	6	153064	153069	0 %	0 %	50 %	50 %	512550219
2996	NC_021487	G	6	6	153085	153090	0 %	0 %	100 %	0 %	512550219
2997	NC_021487	CG	3	6	153284	153289	0 %	0 %	50 %	50 %	512550220
2998	NC_021487	CG	3	6	153307	153312	0 %	0 %	50 %	50 %	512550220
2999	NC_021487	GC	3	6	153327	153332	0 %	0 %	50 %	50 %	512550220
3000	NC_021487	GAG	2	6	153478	153483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550220

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