MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021487	AGA	2	6	24915	24920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550104
502	NC_021487	TGA	2	6	25000	25005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550104
503	NC_021487	GC	3	6	25067	25072	0 %	0 %	50 %	50 %	512550104
504	NC_021487	CGA	2	6	25111	25116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550104
505	NC_021487	G	6	6	25139	25144	0 %	0 %	100 %	0 %	512550104
506	NC_021487	AG	3	6	25187	25192	50 %	0 %	50 %	0 %	512550104
507	NC_021487	TGC	2	6	25250	25255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550104
508	NC_021487	TTC	2	6	25273	25278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550104
509	NC_021487	AGC	4	12	25281	25292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550104
510	NC_021487	CGG	2	6	25312	25317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550104
511	NC_021487	CGA	3	9	25429	25437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550105
512	NC_021487	GAAC	2	8	25453	25460	50 %	0 %	25 %	25 %	512550105
513	NC_021487	AG	4	8	25545	25552	50 %	0 %	50 %	0 %	512550105
514	NC_021487	ACG	2	6	25563	25568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550105
515	NC_021487	AGAA	2	8	25627	25634	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021487	GCT	2	6	25662	25667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021487	TC	3	6	25676	25681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_021487	TTA	2	6	25687	25692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021487	GAG	2	6	25723	25728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021487	TTG	2	6	25838	25843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021487	TA	3	6	25913	25918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021487	TG	3	6	25920	25925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021487	GC	3	6	25964	25969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_021487	ACC	2	6	25978	25983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_021487	AG	3	6	26017	26022	50 %	0 %	50 %	0 %	512550106
526	NC_021487	ATTC	2	8	26050	26057	25 %	50 %	0 %	25 %	512550106
527	NC_021487	GCT	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550106
528	NC_021487	GAT	2	6	26090	26095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550106
529	NC_021487	GAG	2	6	26129	26134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550106
530	NC_021487	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021487	TAT	2	6	26194	26199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021487	TGT	2	6	26201	26206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021487	TG	3	6	26224	26229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021487	CGA	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021487	CGC	2	6	26265	26270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_021487	GTT	2	6	26355	26360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550107
537	NC_021487	ACT	2	6	26500	26505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550107
538	NC_021487	CCT	2	6	26561	26566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550107
539	NC_021487	TTG	2	6	26585	26590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550107
540	NC_021487	CGG	2	6	26602	26607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550107
541	NC_021487	TTG	2	6	26641	26646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550107
542	NC_021487	GAG	2	6	26663	26668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550107
543	NC_021487	G	7	7	26702	26708	0 %	0 %	100 %	0 %	512550107
544	NC_021487	AGG	2	6	26808	26813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550107
545	NC_021487	AGC	2	6	26831	26836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550107
546	NC_021487	AAG	2	6	26843	26848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550107
547	NC_021487	GCT	2	6	26868	26873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550107
548	NC_021487	CTG	3	9	26983	26991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550108
549	NC_021487	GGT	2	6	26992	26997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550108
550	NC_021487	AAAAGG	2	12	27005	27016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550108
551	NC_021487	GA	3	6	27025	27030	50 %	0 %	50 %	0 %	512550108
552	NC_021487	GTCG	2	8	27036	27043	0 %	25 %	50 %	25 %	512550108
553	NC_021487	CGA	2	6	27126	27131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550108
554	NC_021487	CGG	2	6	27132	27137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550108
555	NC_021487	CGC	2	6	27141	27146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550108
556	NC_021487	GGT	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550108
557	NC_021487	CAG	2	6	27237	27242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550108
558	NC_021487	AGGG	2	8	27254	27261	25 %	0 %	75 %	0 %	512550108
559	NC_021487	GGA	2	6	27439	27444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550108
560	NC_021487	GA	3	6	27443	27448	50 %	0 %	50 %	0 %	512550108
561	NC_021487	A	7	7	27474	27480	100 %	0 %	0 %	0 %	512550108
562	NC_021487	GTTC	2	8	27584	27591	0 %	50 %	25 %	25 %	512550108
563	NC_021487	GTC	2	6	27664	27669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550108
564	NC_021487	TTC	2	6	27686	27691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550108
565	NC_021487	AGCC	2	8	27758	27765	25 %	0 %	25 %	50 %	512550108
566	NC_021487	CCAC	2	8	27767	27774	25 %	0 %	0 %	75 %	512550108
567	NC_021487	CGCT	2	8	27787	27794	0 %	25 %	25 %	50 %	512550108
568	NC_021487	AGG	2	6	27805	27810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550108
569	NC_021487	AGA	2	6	27857	27862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550108
570	NC_021487	ATCGGC	2	12	27899	27910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512550108
571	NC_021487	AAG	2	6	27911	27916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550108
572	NC_021487	TCA	2	6	27951	27956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550109
573	NC_021487	TCA	2	6	27983	27988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550109
574	NC_021487	GCT	2	6	27998	28003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550109
575	NC_021487	TCT	2	6	28009	28014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550109
576	NC_021487	GCC	2	6	28122	28127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550109
577	NC_021487	TTG	2	6	28213	28218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021487	CTGC	2	8	28276	28283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_021487	CGA	2	6	28301	28306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021487	AGG	2	6	28444	28449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550110
581	NC_021487	CAGC	2	8	28451	28458	25 %	0 %	25 %	50 %	512550110
582	NC_021487	GCA	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550110
583	NC_021487	AG	3	6	28664	28669	50 %	0 %	50 %	0 %	512550110
584	NC_021487	GGC	3	9	28701	28709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550110
585	NC_021487	TGCA	2	8	28770	28777	25 %	25 %	25 %	25 %	512550110
586	NC_021487	CAA	2	6	28805	28810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550110
587	NC_021487	GAT	2	6	28820	28825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550110
588	NC_021487	AGC	2	6	28957	28962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550110
589	NC_021487	AGGA	2	8	29024	29031	50 %	0 %	50 %	0 %	512550110
590	NC_021487	TAGA	2	8	29046	29053	50 %	25 %	25 %	0 %	512550110
591	NC_021487	TGGT	2	8	29075	29082	0 %	50 %	50 %	0 %	512550110
592	NC_021487	CTT	2	6	29215	29220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550111
593	NC_021487	CAG	2	6	29240	29245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550111
594	NC_021487	GGT	3	9	29279	29287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550111
595	NC_021487	CAC	2	6	29294	29299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550111
596	NC_021487	GGC	2	6	29302	29307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550111
597	NC_021487	GCC	2	6	29334	29339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550111
598	NC_021487	TGT	2	6	29343	29348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550111
599	NC_021487	GGC	2	6	29354	29359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550111
600	NC_021487	CTC	2	6	29407	29412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550111
601	NC_021487	CGGG	2	8	29433	29440	0 %	0 %	75 %	25 %	512550111
602	NC_021487	AG	4	8	29492	29499	50 %	0 %	50 %	0 %	512550111
603	NC_021487	GGC	2	6	29521	29526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550111
604	NC_021487	GA	4	8	29575	29582	50 %	0 %	50 %	0 %	512550111
605	NC_021487	CGGAA	2	10	29589	29598	40 %	0 %	40 %	20 %	512550111
606	NC_021487	GCT	3	9	29620	29628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550111
607	NC_021487	AACAG	2	10	29664	29673	60 %	0 %	20 %	20 %	512550111
608	NC_021487	GCG	2	6	29724	29729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550111
609	NC_021487	GAA	2	6	29753	29758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550111
610	NC_021487	GCGGG	2	10	29824	29833	0 %	0 %	80 %	20 %	512550111
611	NC_021487	TG	3	6	29880	29885	0 %	50 %	50 %	0 %	512550111
612	NC_021487	AGG	2	6	29905	29910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550111
613	NC_021487	GTT	2	6	29959	29964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550111
614	NC_021487	CGT	2	6	30024	30029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550111
615	NC_021487	CAT	2	6	30086	30091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550111
616	NC_021487	ACC	2	6	30219	30224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550111
617	NC_021487	GCC	3	9	30228	30236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550111
618	NC_021487	CCA	2	6	30278	30283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550111
619	NC_021487	GAA	2	6	30305	30310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550111
620	NC_021487	AG	3	6	30400	30405	50 %	0 %	50 %	0 %	512550111
621	NC_021487	CAA	2	6	30481	30486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550111
622	NC_021487	AGG	2	6	30527	30532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550111
623	NC_021487	GCCA	2	8	30537	30544	25 %	0 %	25 %	50 %	512550111
624	NC_021487	AGG	2	6	30549	30554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550111
625	NC_021487	CAGA	2	8	30556	30563	50 %	0 %	25 %	25 %	512550111
626	NC_021487	TCT	2	6	30633	30638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550111
627	NC_021487	TCT	2	6	30693	30698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021487	GGA	2	6	30710	30715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021487	GAAG	2	8	30819	30826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021487	CG	3	6	30908	30913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_021487	GGATA	2	10	30964	30973	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021487	TGC	2	6	31011	31016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550112
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634	NC_021487	ACT	2	6	31047	31052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550112
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651	NC_021487	CAA	2	6	32218	32223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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673	NC_021487	GTA	2	6	33460	33465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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