MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021487	AGG	2	6	281235	281240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550331
5502	NC_021487	GAA	2	6	281384	281389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550332
5503	NC_021487	TTC	2	6	281428	281433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550332
5504	NC_021487	TCTA	2	8	281444	281451	25 %	50 %	0 %	25 %	512550332
5505	NC_021487	GAT	2	6	281463	281468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550332
5506	NC_021487	C	6	6	281473	281478	0 %	0 %	0 %	100 %	512550332
5507	NC_021487	CTC	2	6	281584	281589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550332
5508	NC_021487	GAC	2	6	281606	281611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550332
5509	NC_021487	CCA	2	6	281638	281643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550332
5510	NC_021487	TGG	2	6	281913	281918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550332
5511	NC_021487	AC	3	6	281938	281943	50 %	0 %	0 %	50 %	512550332
5512	NC_021487	CCTG	2	8	281952	281959	0 %	25 %	25 %	50 %	512550332
5513	NC_021487	CTA	2	6	281984	281989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550332
5514	NC_021487	CG	3	6	282146	282151	0 %	0 %	50 %	50 %	512550332
5515	NC_021487	GA	3	6	282183	282188	50 %	0 %	50 %	0 %	512550332
5516	NC_021487	TAG	2	6	282236	282241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550332
5517	NC_021487	CGTGG	2	10	282263	282272	0 %	20 %	60 %	20 %	512550332
5518	NC_021487	GCC	2	6	282274	282279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550332
5519	NC_021487	TCAGT	2	10	282284	282293	20 %	40 %	20 %	20 %	512550332
5520	NC_021487	GGGC	2	8	282353	282360	0 %	0 %	75 %	25 %	512550332
5521	NC_021487	CGA	2	6	282381	282386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550332
5522	NC_021487	ACA	2	6	282439	282444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550332
5523	NC_021487	CAG	2	6	282471	282476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550332
5524	NC_021487	GGCGA	2	10	282552	282561	20 %	0 %	60 %	20 %	512550332
5525	NC_021487	TGG	2	6	282729	282734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550333
5526	NC_021487	TCC	2	6	282832	282837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550333
5527	NC_021487	GTG	2	6	283019	283024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550333
5528	NC_021487	ATT	2	6	283094	283099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550333
5529	NC_021487	ATC	2	6	283178	283183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550333
5530	NC_021487	A	6	6	283220	283225	100 %	0 %	0 %	0 %	512550333
5531	NC_021487	TCT	2	6	283272	283277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550333
5532	NC_021487	AAG	2	6	283290	283295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550333
5533	NC_021487	AGG	2	6	283326	283331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550333
5534	NC_021487	ACA	2	6	283341	283346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550333
5535	NC_021487	ATG	2	6	283380	283385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550333
5536	NC_021487	TGC	2	6	283392	283397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550333
5537	NC_021487	TCTG	2	8	283417	283424	0 %	50 %	25 %	25 %	512550333
5538	NC_021487	TGG	2	6	283440	283445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550333
5539	NC_021487	CAA	2	6	283537	283542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550333
5540	NC_021487	TC	3	6	283564	283569	0 %	50 %	0 %	50 %	512550333
5541	NC_021487	ATG	3	9	283574	283582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550333
5542	NC_021487	GGC	2	6	283606	283611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550333
5543	NC_021487	ATT	2	6	283914	283919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550334
5544	NC_021487	GAG	2	6	283956	283961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550334
5545	NC_021487	GTG	2	6	283980	283985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550334
5546	NC_021487	GAC	2	6	284025	284030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550334
5547	NC_021487	AGG	2	6	284071	284076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550334
5548	NC_021487	ACA	2	6	284079	284084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550334
5549	NC_021487	GT	3	6	284176	284181	0 %	50 %	50 %	0 %	512550334
5550	NC_021487	GGC	2	6	284366	284371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550334
5551	NC_021487	ATCGT	2	10	284406	284415	20 %	40 %	20 %	20 %	512550334
5552	NC_021487	CTA	2	6	284435	284440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550334
5553	NC_021487	GCG	2	6	284451	284456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550334
5554	NC_021487	GAT	2	6	284465	284470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550334
5555	NC_021487	G	6	6	284535	284540	0 %	0 %	100 %	0 %	512550334
5556	NC_021487	GAT	2	6	284550	284555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550334
5557	NC_021487	CTG	2	6	284653	284658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550334
5558	NC_021487	TGC	2	6	284707	284712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550334
5559	NC_021487	TAGGG	2	10	284727	284736	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_021487	CAT	2	6	284745	284750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_021487	TTCCT	2	10	284767	284776	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5562	NC_021487	GATG	2	8	284811	284818	25 %	25 %	50 %	0 %	512550335
5563	NC_021487	GGT	2	6	284844	284849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550335
5564	NC_021487	AGA	2	6	285048	285053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550335
5565	NC_021487	AAGG	2	8	285154	285161	50 %	0 %	50 %	0 %	512550335
5566	NC_021487	AGC	2	6	285167	285172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5567	NC_021487	CCA	2	6	285450	285455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550335
5568	NC_021487	TGG	2	6	285494	285499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550335
5569	NC_021487	CGG	2	6	285513	285518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550335
5570	NC_021487	AG	4	8	285561	285568	50 %	0 %	50 %	0 %	512550335
5571	NC_021487	TTC	2	6	285570	285575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550335
5572	NC_021487	C	6	6	285621	285626	0 %	0 %	0 %	100 %	512550335
5573	NC_021487	CGC	2	6	285693	285698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550335
5574	NC_021487	GAC	2	6	285724	285729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5575	NC_021487	AG	3	6	285738	285743	50 %	0 %	50 %	0 %	512550335
5576	NC_021487	ACG	2	6	285868	285873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5577	NC_021487	CAA	2	6	285876	285881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550335
5578	NC_021487	CGA	2	6	285894	285899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5579	NC_021487	TCT	2	6	285979	285984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512550335
5580	NC_021487	TA	3	6	286129	286134	50 %	50 %	0 %	0 %	512550335
5581	NC_021487	ACT	2	6	286148	286153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550335
5582	NC_021487	CGG	2	6	286223	286228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550335
5583	NC_021487	GGT	2	6	286242	286247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550335
5584	NC_021487	TGG	2	6	286254	286259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550335
5585	NC_021487	AAG	2	6	286264	286269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550335
5586	NC_021487	TGT	2	6	286301	286306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550335
5587	NC_021487	GAC	2	6	286308	286313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5588	NC_021487	GCT	2	6	286345	286350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5589	NC_021487	GAT	2	6	286351	286356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550335
5590	NC_021487	GT	3	6	286504	286509	0 %	50 %	50 %	0 %	512550335
5591	NC_021487	CGT	2	6	286541	286546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550335
5592	NC_021487	GAAG	2	8	286551	286558	50 %	0 %	50 %	0 %	512550335
5593	NC_021487	GAT	2	6	286909	286914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550335
5594	NC_021487	CGC	2	6	286926	286931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550335
5595	NC_021487	TTG	2	6	287040	287045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5596	NC_021487	TTG	2	6	287118	287123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5597	NC_021487	TCC	2	6	287133	287138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550336
5598	NC_021487	GAGG	2	8	287160	287167	25 %	0 %	75 %	0 %	512550336
5599	NC_021487	GCA	2	6	287195	287200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550336
5600	NC_021487	GGTTG	2	10	287202	287211	0 %	40 %	60 %	0 %	512550336
5601	NC_021487	GT	3	6	287257	287262	0 %	50 %	50 %	0 %	512550336
5602	NC_021487	CTG	2	6	287355	287360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550336
5603	NC_021487	GTT	2	6	287363	287368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5604	NC_021487	CAT	3	9	287411	287419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550336
5605	NC_021487	GTT	2	6	287460	287465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5606	NC_021487	CT	3	6	287557	287562	0 %	50 %	0 %	50 %	512550336
5607	NC_021487	GCTG	2	8	287681	287688	0 %	25 %	50 %	25 %	512550336
5608	NC_021487	TTA	2	6	287772	287777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550336
5609	NC_021487	TGT	2	6	287785	287790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5610	NC_021487	TGCT	2	8	287797	287804	0 %	50 %	25 %	25 %	512550336
5611	NC_021487	TGT	2	6	287851	287856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5612	NC_021487	GTT	2	6	287861	287866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550336
5613	NC_021487	GCA	2	6	287976	287981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550336
5614	NC_021487	AGAA	2	8	288133	288140	75 %	0 %	25 %	0 %	512550336
5615	NC_021487	TGGCT	2	10	288167	288176	0 %	40 %	40 %	20 %	512550336
5616	NC_021487	GGA	2	6	288266	288271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550336
5617	NC_021487	CT	3	6	288297	288302	0 %	50 %	0 %	50 %	512550336
5618	NC_021487	GA	3	6	288313	288318	50 %	0 %	50 %	0 %	512550336
5619	NC_021487	CTTGAT	2	12	288321	288332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512550336
5620	NC_021487	GGC	2	6	288340	288345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550336
5621	NC_021487	CTG	2	6	288429	288434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550336
5622	NC_021487	GAA	2	6	288465	288470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550336
5623	NC_021487	TCG	2	6	288653	288658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550336
5624	NC_021487	CTG	2	6	288670	288675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550336
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5631	NC_021487	GGTG	2	8	288991	288998	0 %	25 %	75 %	0 %	512550337
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5654	NC_021487	CGA	2	6	290304	290309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550337
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5656	NC_021487	CT	3	6	290372	290377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5681	NC_021487	GAG	2	6	292063	292068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5733	NC_021487	A	6	6	295487	295492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5734	NC_021487	AGG	3	9	295496	295504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5735	NC_021487	GCT	2	6	295737	295742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550342
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5737	NC_021487	AGGCC	2	10	295779	295788	20 %	0 %	40 %	40 %	512550342
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5865	NC_021487	GTTAG	2	10	302328	302337	20 %	40 %	40 %	0 %	512550348
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5868	NC_021487	GAT	2	6	302600	302605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550348
5869	NC_021487	TGC	2	6	302639	302644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550348
5870	NC_021487	CCGT	2	8	302685	302692	0 %	25 %	25 %	50 %	512550348
5871	NC_021487	TCG	2	6	302796	302801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550348
5872	NC_021487	ATTG	2	8	302955	302962	25 %	50 %	25 %	0 %	512550348
5873	NC_021487	TG	3	6	302978	302983	0 %	50 %	50 %	0 %	512550348
5874	NC_021487	CGA	2	6	303037	303042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550348
5875	NC_021487	CAT	2	6	303112	303117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550348
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5880	NC_021487	TC	3	6	303275	303280	0 %	50 %	0 %	50 %	512550348
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5883	NC_021487	TGCA	2	8	303368	303375	25 %	25 %	25 %	25 %	512550348
5884	NC_021487	TCT	2	6	303380	303385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5885	NC_021487	AAC	2	6	303452	303457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5886	NC_021487	TAT	2	6	303458	303463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5887	NC_021487	CA	3	6	303499	303504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5888	NC_021487	A	6	6	303512	303517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5889	NC_021487	TGTC	2	8	303528	303535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5890	NC_021487	TG	3	6	303585	303590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5891	NC_021487	GGCATG	2	12	303647	303658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5892	NC_021487	AGA	2	6	303667	303672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5893	NC_021487	AGA	2	6	303676	303681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5894	NC_021487	T	7	7	303694	303700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5895	NC_021487	T	6	6	303706	303711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5896	NC_021487	ACT	2	6	303728	303733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5897	NC_021487	ACT	2	6	303738	303743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5898	NC_021487	CTT	2	6	303750	303755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5899	NC_021487	A	7	7	303759	303765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5901	NC_021487	AAAG	2	8	303814	303821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5902	NC_021487	TGA	2	6	303826	303831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5903	NC_021487	GGT	2	6	303892	303897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5904	NC_021487	A	6	6	303921	303926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5905	NC_021487	CTC	2	6	303937	303942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5906	NC_021487	TAT	2	6	303960	303965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5907	NC_021487	TGCCA	2	10	304000	304009	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5908	NC_021487	TGC	2	6	304052	304057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5910	NC_021487	GGGC	2	8	304160	304167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5911	NC_021487	CAA	2	6	304260	304265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5912	NC_021487	ATCGC	2	10	304271	304280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5913	NC_021487	AGAGC	2	10	304289	304298	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5914	NC_021487	TCG	2	6	304342	304347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550349
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5981	NC_021487	GGTGA	2	10	307453	307462	20 %	20 %	60 %	0 %	512550350
5982	NC_021487	CGC	2	6	307554	307559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550350
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5987	NC_021487	GAT	2	6	307810	307815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550350
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5993	NC_021487	GAT	2	6	308154	308159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550350
5994	NC_021487	GAG	2	6	308161	308166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550350
5995	NC_021487	CGCC	2	8	308188	308195	0 %	0 %	25 %	75 %	512550350
5996	NC_021487	AGGC	2	8	308237	308244	25 %	0 %	50 %	25 %	512550350
5997	NC_021487	AGG	2	6	308316	308321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550350
5998	NC_021487	CCG	2	6	308376	308381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550351
5999	NC_021487	AAGC	2	8	308453	308460	50 %	0 %	25 %	25 %	512550351
6000	NC_021487	G	6	6	308530	308535	0 %	0 %	100 %	0 %	512550351

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