MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chthonomonas calidirosea T49 complete genome

Total Repeats: 66458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021487	CTC	2	6	229699	229704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550283
4502	NC_021487	CTC	2	6	229735	229740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550284
4503	NC_021487	CT	3	6	229786	229791	0 %	50 %	0 %	50 %	512550284
4504	NC_021487	TGG	2	6	229839	229844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550284
4505	NC_021487	CAC	2	6	229850	229855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512550284
4506	NC_021487	CCT	2	6	229879	229884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550284
4507	NC_021487	GTT	2	6	229910	229915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550284
4508	NC_021487	ATC	2	6	229937	229942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550284
4509	NC_021487	TAG	2	6	229956	229961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550284
4510	NC_021487	GAT	2	6	230002	230007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550284
4511	NC_021487	AAGGA	2	10	230031	230040	60 %	0 %	40 %	0 %	512550284
4512	NC_021487	CAGG	2	8	230041	230048	25 %	0 %	50 %	25 %	512550284
4513	NC_021487	AGCC	2	8	230101	230108	25 %	0 %	25 %	50 %	512550284
4514	NC_021487	TTA	2	6	230173	230178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550284
4515	NC_021487	TGT	2	6	230190	230195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550284
4516	NC_021487	AGC	2	6	230256	230261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550284
4517	NC_021487	AGC	2	6	230393	230398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550284
4518	NC_021487	GATC	2	8	230403	230410	25 %	25 %	25 %	25 %	512550284
4519	NC_021487	CGT	2	6	230455	230460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550284
4520	NC_021487	TGG	2	6	230487	230492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550284
4521	NC_021487	TAG	2	6	230494	230499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550284
4522	NC_021487	GAA	2	6	230557	230562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550285
4523	NC_021487	TAA	2	6	230616	230621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550285
4524	NC_021487	AGGC	2	8	230661	230668	25 %	0 %	50 %	25 %	512550285
4525	NC_021487	GGT	2	6	230698	230703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550285
4526	NC_021487	ATG	2	6	230711	230716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550285
4527	NC_021487	ATCTT	2	10	230747	230756	20 %	60 %	0 %	20 %	512550285
4528	NC_021487	TGA	2	6	230775	230780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550285
4529	NC_021487	CGT	2	6	230796	230801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550285
4530	NC_021487	GAA	2	6	230868	230873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550285
4531	NC_021487	ATCC	2	8	231056	231063	25 %	25 %	0 %	50 %	512550285
4532	NC_021487	ATG	2	6	231071	231076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550285
4533	NC_021487	TG	3	6	231100	231105	0 %	50 %	50 %	0 %	512550285
4534	NC_021487	GAT	2	6	231106	231111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550285
4535	NC_021487	CCAC	2	8	231119	231126	25 %	0 %	0 %	75 %	512550285
4536	NC_021487	TTTC	2	8	231136	231143	0 %	75 %	0 %	25 %	512550285
4537	NC_021487	CCT	2	6	231144	231149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550285
4538	NC_021487	GCG	2	6	231179	231184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550285
4539	NC_021487	ACG	2	6	231185	231190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550285
4540	NC_021487	CAA	2	6	231291	231296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550285
4541	NC_021487	CGA	2	6	231297	231302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550285
4542	NC_021487	ATG	2	6	231319	231324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550285
4543	NC_021487	CCT	2	6	231354	231359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550285
4544	NC_021487	CGA	3	9	231366	231374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550285
4545	NC_021487	GGCA	2	8	231487	231494	25 %	0 %	50 %	25 %	512550285
4546	NC_021487	TCGGA	2	10	231603	231612	20 %	20 %	40 %	20 %	512550285
4547	NC_021487	GCA	2	6	231636	231641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550285
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4549	NC_021487	GAT	2	6	231667	231672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550285
4550	NC_021487	ATA	2	6	231704	231709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550285
4551	NC_021487	TC	4	8	231745	231752	0 %	50 %	0 %	50 %	512550286
4552	NC_021487	TAA	2	6	231763	231768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512550286
4553	NC_021487	GTT	2	6	231777	231782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550286
4554	NC_021487	CAG	2	6	231839	231844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550286
4555	NC_021487	CA	3	6	231935	231940	50 %	0 %	0 %	50 %	512550286
4556	NC_021487	AGG	2	6	232115	232120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550286
4557	NC_021487	ACG	2	6	232134	232139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550286
4558	NC_021487	GAA	2	6	232277	232282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550286
4559	NC_021487	AG	3	6	232283	232288	50 %	0 %	50 %	0 %	512550286
4560	NC_021487	T	7	7	232317	232323	0 %	100 %	0 %	0 %	512550286
4561	NC_021487	GAA	2	6	232345	232350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550286
4562	NC_021487	GCG	2	6	232366	232371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550286
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4565	NC_021487	AGT	2	6	232446	232451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550286
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4569	NC_021487	AG	3	6	232553	232558	50 %	0 %	50 %	0 %	512550286
4570	NC_021487	GCA	2	6	232591	232596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550286
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4572	NC_021487	GACA	2	8	232690	232697	50 %	0 %	25 %	25 %	512550286
4573	NC_021487	GCG	2	6	232762	232767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550286
4574	NC_021487	GAA	2	6	232814	232819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550286
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4580	NC_021487	TGA	2	6	233055	233060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550286
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4587	NC_021487	CAG	2	6	233384	233389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550286
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4589	NC_021487	AGT	2	6	233436	233441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550286
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4593	NC_021487	ACCA	2	8	233673	233680	50 %	0 %	0 %	50 %	512550286
4594	NC_021487	CAT	2	6	233696	233701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550286
4595	NC_021487	GTA	2	6	233737	233742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550286
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4598	NC_021487	AGCA	2	8	233857	233864	50 %	0 %	25 %	25 %	512550286
4599	NC_021487	GCG	2	6	233928	233933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512550286
4600	NC_021487	ACGA	2	8	233943	233950	50 %	0 %	25 %	25 %	512550286
4601	NC_021487	TAG	2	6	233962	233967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550286
4602	NC_021487	GCC	2	6	234015	234020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550286
4603	NC_021487	TTG	2	6	234116	234121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512550286
4604	NC_021487	AAG	2	6	234123	234128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550286
4605	NC_021487	A	6	6	234195	234200	100 %	0 %	0 %	0 %	512550286
4606	NC_021487	CTA	2	6	234278	234283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_021487	AG	3	6	234343	234348	50 %	0 %	50 %	0 %	512550287
4608	NC_021487	AGG	2	6	234367	234372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550287
4609	NC_021487	CCG	2	6	234507	234512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512550287
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4612	NC_021487	GT	3	6	234616	234621	0 %	50 %	50 %	0 %	512550287
4613	NC_021487	CCT	2	6	234657	234662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550287
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4616	NC_021487	TGA	2	6	234911	234916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021487	ATG	2	6	235022	235027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4619	NC_021487	GGA	2	6	235062	235067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_021487	GA	3	6	235066	235071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_021487	A	6	6	235226	235231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_021487	AG	3	6	235253	235258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_021487	GTT	2	6	235277	235282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_021487	CTC	2	6	235448	235453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550288
4625	NC_021487	CGCT	2	8	235477	235484	0 %	25 %	25 %	50 %	512550288
4626	NC_021487	CAT	2	6	235509	235514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550288
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4628	NC_021487	AAC	2	6	235761	235766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512550288
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4630	NC_021487	TGA	2	6	235789	235794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550288
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4632	NC_021487	CCT	2	6	235869	235874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512550288
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4637	NC_021487	TGG	2	6	236105	236110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_021487	GC	3	6	236172	236177	0 %	0 %	50 %	50 %	512550289
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4651	NC_021487	AGCC	2	8	237074	237081	25 %	0 %	25 %	50 %	512550289
4652	NC_021487	GCA	2	6	237110	237115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550289
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4731	NC_021487	GGGATG	2	12	241691	241702	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512550292
4732	NC_021487	CGAT	2	8	241753	241760	25 %	25 %	25 %	25 %	512550292
4733	NC_021487	ATG	2	6	241788	241793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550292
4734	NC_021487	CGAT	2	8	241849	241856	25 %	25 %	25 %	25 %	512550292
4735	NC_021487	TCG	2	6	241863	241868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550292
4736	NC_021487	CATA	2	8	241951	241958	50 %	25 %	0 %	25 %	512550292
4737	NC_021487	TCA	2	6	242021	242026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550292
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4739	NC_021487	AGC	2	6	242183	242188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550293
4740	NC_021487	GGGT	2	8	242209	242216	0 %	25 %	75 %	0 %	512550293
4741	NC_021487	GC	3	6	242274	242279	0 %	0 %	50 %	50 %	512550293
4742	NC_021487	G	6	6	242285	242290	0 %	0 %	100 %	0 %	512550293
4743	NC_021487	CAT	2	6	242380	242385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550293
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4745	NC_021487	AGG	2	6	242533	242538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550293
4746	NC_021487	TGA	2	6	242648	242653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550293
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4749	NC_021487	GCTG	2	8	242747	242754	0 %	25 %	50 %	25 %	512550293
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4865	NC_021487	GTTT	2	8	249406	249413	0 %	75 %	25 %	0 %	512550300
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4868	NC_021487	TGGGGA	2	12	249514	249525	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512550300
4869	NC_021487	ATT	2	6	249527	249532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512550300
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4871	NC_021487	T	7	7	249677	249683	0 %	100 %	0 %	0 %	512550301
4872	NC_021487	G	6	6	249691	249696	0 %	0 %	100 %	0 %	512550301
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4944	NC_021487	TTA	2	6	253049	253054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4945	NC_021487	CGT	2	6	253088	253093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550304
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4972	NC_021487	TGCC	2	8	254259	254266	0 %	25 %	25 %	50 %	512550304
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4977	NC_021487	TTC	2	6	254480	254485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4978	NC_021487	CT	3	6	254525	254530	0 %	50 %	0 %	50 %	512550305
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4990	NC_021487	GCT	2	6	255127	255132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512550305
4991	NC_021487	CGA	2	6	255292	255297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512550305
4992	NC_021487	GAA	2	6	255447	255452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550305
4993	NC_021487	CG	3	6	255518	255523	0 %	0 %	50 %	50 %	512550305
4994	NC_021487	TGG	2	6	255529	255534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512550305
4995	NC_021487	GAG	2	6	255557	255562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512550305
4996	NC_021487	GCTG	2	8	255584	255591	0 %	25 %	50 %	25 %	512550305
4997	NC_021487	TCA	2	6	255592	255597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512550305
4998	NC_021487	GAA	2	6	255670	255675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512550305
4999	NC_021487	TTAC	2	8	255687	255694	25 %	50 %	0 %	25 %	512550305
5000	NC_021487	TGA	2	6	255732	255737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512550305

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