MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	A	6	6	13	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	A	6	6	841	846	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
3	NC_021183	A	6	6	911	916	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
4	NC_021183	A	8	8	1234	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
5	NC_021183	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
6	NC_021183	A	6	6	1954	1959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021183	T	6	6	2216	2221	0 %	100 %	0 %	0 %	498827230
8	NC_021183	T	7	7	2330	2336	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
9	NC_021183	T	6	6	2564	2569	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
10	NC_021183	T	6	6	2795	2800	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
11	NC_021183	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	498827231
12	NC_021183	T	7	7	3398	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021183	A	7	7	3462	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021183	T	6	6	3512	3517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021183	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
16	NC_021183	A	6	6	4193	4198	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
17	NC_021183	A	7	7	4225	4231	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
18	NC_021183	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
19	NC_021183	A	6	6	4564	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	498827233
20	NC_021183	A	6	6	4639	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021183	T	6	6	4652	4657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021183	T	6	6	4924	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021183	T	7	7	4959	4965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021183	A	6	6	5062	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	498827234
25	NC_021183	T	6	6	5237	5242	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
26	NC_021183	T	6	6	5744	5749	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
27	NC_021183	T	6	6	5794	5799	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
28	NC_021183	T	6	6	6444	6449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021183	A	6	6	6463	6468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021183	T	6	6	6474	6479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021183	T	6	6	6492	6497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021183	T	6	6	6513	6518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021183	A	6	6	6587	6592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021183	A	6	6	6745	6750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021183	A	7	7	6990	6996	100 %	0 %	0 %	0 %	498827235
36	NC_021183	A	6	6	7419	7424	100 %	0 %	0 %	0 %	498827235
37	NC_021183	A	7	7	7556	7562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021183	T	6	6	7586	7591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021183	C	6	6	9854	9859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_021183	A	6	6	10383	10388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021183	A	6	6	11433	11438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021183	A	6	6	11444	11449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021183	A	6	6	12161	12166	100 %	0 %	0 %	0 %	498827237
44	NC_021183	A	7	7	12787	12793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021183	T	7	7	12885	12891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021183	A	7	7	13051	13057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021183	A	7	7	13448	13454	100 %	0 %	0 %	0 %	498827238
48	NC_021183	A	6	6	13866	13871	100 %	0 %	0 %	0 %	498827239
49	NC_021183	A	6	6	13907	13912	100 %	0 %	0 %	0 %	498827239
50	NC_021183	A	7	7	14151	14157	100 %	0 %	0 %	0 %	498827239
51	NC_021183	A	7	7	14282	14288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021183	A	6	6	14337	14342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021183	A	7	7	14366	14372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021183	T	7	7	14747	14753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021183	T	7	7	15194	15200	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
56	NC_021183	T	6	6	15230	15235	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
57	NC_021183	T	6	6	15252	15257	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
58	NC_021183	T	7	7	15340	15346	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
59	NC_021183	T	7	7	15544	15550	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
60	NC_021183	T	6	6	15707	15712	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
61	NC_021183	T	6	6	15756	15761	0 %	100 %	0 %	0 %	498827240
62	NC_021183	A	6	6	16073	16078	100 %	0 %	0 %	0 %	498827240
63	NC_021183	T	6	6	16502	16507	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
64	NC_021183	T	7	7	16548	16554	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
65	NC_021183	T	7	7	16571	16577	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
66	NC_021183	A	6	6	16594	16599	100 %	0 %	0 %	0 %	498827241
67	NC_021183	T	6	6	16683	16688	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
68	NC_021183	T	6	6	16701	16706	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
69	NC_021183	T	6	6	16757	16762	0 %	100 %	0 %	0 %	498827241
70	NC_021183	A	7	7	16846	16852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021183	A	6	6	17150	17155	100 %	0 %	0 %	0 %	498827242
72	NC_021183	T	7	7	17743	17749	0 %	100 %	0 %	0 %	498827242
73	NC_021183	A	6	6	17770	17775	100 %	0 %	0 %	0 %	498827242
74	NC_021183	A	7	7	18590	18596	100 %	0 %	0 %	0 %	498827243
75	NC_021183	T	6	6	18751	18756	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
76	NC_021183	T	7	7	18946	18952	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
77	NC_021183	A	8	8	18971	18978	100 %	0 %	0 %	0 %	498827243
78	NC_021183	T	6	6	19040	19045	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
79	NC_021183	T	6	6	19074	19079	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
80	NC_021183	T	8	8	19232	19239	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
81	NC_021183	T	6	6	19278	19283	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
82	NC_021183	T	7	7	19304	19310	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
83	NC_021183	T	6	6	19348	19353	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
84	NC_021183	T	7	7	19430	19436	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
85	NC_021183	T	9	9	19455	19463	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
86	NC_021183	T	6	6	19839	19844	0 %	100 %	0 %	0 %	498827243
87	NC_021183	T	6	6	20036	20041	0 %	100 %	0 %	0 %	498827244
88	NC_021183	T	6	6	20374	20379	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
89	NC_021183	A	7	7	20588	20594	100 %	0 %	0 %	0 %	498827245
90	NC_021183	T	6	6	20794	20799	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
91	NC_021183	T	7	7	20902	20908	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
92	NC_021183	T	6	6	21001	21006	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
93	NC_021183	T	6	6	21018	21023	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
94	NC_021183	T	6	6	21066	21071	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
95	NC_021183	T	6	6	21100	21105	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
96	NC_021183	T	6	6	21132	21137	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
97	NC_021183	A	6	6	21209	21214	100 %	0 %	0 %	0 %	498827245
98	NC_021183	T	6	6	21228	21233	0 %	100 %	0 %	0 %	498827245
99	NC_021183	A	6	6	21491	21496	100 %	0 %	0 %	0 %	498827246
100	NC_021183	T	6	6	21535	21540	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
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102	NC_021183	T	7	7	21856	21862	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
103	NC_021183	T	6	6	21921	21926	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
104	NC_021183	T	6	6	22015	22020	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
105	NC_021183	T	6	6	22058	22063	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
106	NC_021183	A	6	6	22081	22086	100 %	0 %	0 %	0 %	498827246
107	NC_021183	T	7	7	22163	22169	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
108	NC_021183	T	7	7	22356	22362	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
109	NC_021183	T	7	7	22518	22524	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
110	NC_021183	T	6	6	22670	22675	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
111	NC_021183	T	6	6	22760	22765	0 %	100 %	0 %	0 %	498827246
112	NC_021183	A	6	6	22766	22771	100 %	0 %	0 %	0 %	498827246
113	NC_021183	T	7	7	22928	22934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021183	T	6	6	22951	22956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021183	T	6	6	23145	23150	0 %	100 %	0 %	0 %	498827247
116	NC_021183	A	7	7	23391	23397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_021183	T	7	7	23569	23575	0 %	100 %	0 %	0 %	498827248
119	NC_021183	A	6	6	23671	23676	100 %	0 %	0 %	0 %	498827248
120	NC_021183	T	8	8	24104	24111	0 %	100 %	0 %	0 %	498827248
121	NC_021183	A	7	7	24272	24278	100 %	0 %	0 %	0 %	498827248
122	NC_021183	A	6	6	24742	24747	100 %	0 %	0 %	0 %	498827248
123	NC_021183	A	8	8	24917	24924	100 %	0 %	0 %	0 %	498827248
124	NC_021183	T	6	6	25035	25040	0 %	100 %	0 %	0 %	498827249
125	NC_021183	T	6	6	25055	25060	0 %	100 %	0 %	0 %	498827249
126	NC_021183	A	6	6	25169	25174	100 %	0 %	0 %	0 %	498827249
127	NC_021183	A	6	6	25277	25282	100 %	0 %	0 %	0 %	498827249
128	NC_021183	T	6	6	25447	25452	0 %	100 %	0 %	0 %	498827249
129	NC_021183	A	6	6	25696	25701	100 %	0 %	0 %	0 %	498827249
130	NC_021183	A	7	7	26495	26501	100 %	0 %	0 %	0 %	498827249
131	NC_021183	A	7	7	26565	26571	100 %	0 %	0 %	0 %	498827249
132	NC_021183	A	6	6	26706	26711	100 %	0 %	0 %	0 %	498827249
133	NC_021183	T	6	6	26825	26830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021183	A	7	7	27721	27727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021183	T	7	7	27799	27805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021183	T	8	8	28322	28329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021183	T	7	7	28530	28536	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
138	NC_021183	T	7	7	28641	28647	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
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140	NC_021183	T	7	7	28825	28831	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
141	NC_021183	T	6	6	28846	28851	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
142	NC_021183	T	7	7	28861	28867	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
143	NC_021183	T	6	6	29112	29117	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
144	NC_021183	T	7	7	29132	29138	0 %	100 %	0 %	0 %	498827251
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148	NC_021183	T	6	6	30159	30164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.