MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	TA	4	8	81	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	AT	3	6	980	985	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
3	NC_021183	AT	3	6	1044	1049	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
4	NC_021183	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
5	NC_021183	AC	3	6	1388	1393	50 %	0 %	0 %	50 %	498827229
6	NC_021183	GA	3	6	1482	1487	50 %	0 %	50 %	0 %	498827229
7	NC_021183	AT	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021183	AT	3	6	2041	2046	50 %	50 %	0 %	0 %	498827230
9	NC_021183	AT	3	6	2541	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
10	NC_021183	AT	3	6	3120	3125	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
11	NC_021183	AT	3	6	3174	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
12	NC_021183	AT	3	6	3315	3320	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
13	NC_021183	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021183	AT	3	6	3558	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021183	TA	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
16	NC_021183	TA	3	6	4188	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
17	NC_021183	AT	3	6	4658	4663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021183	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
19	NC_021183	AT	3	6	5352	5357	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
20	NC_021183	AT	3	6	5439	5444	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
21	NC_021183	AT	3	6	5451	5456	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
22	NC_021183	TA	3	6	6024	6029	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
23	NC_021183	AT	3	6	6519	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021183	GA	3	6	6832	6837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021183	AT	3	6	6899	6904	50 %	50 %	0 %	0 %	498827235
26	NC_021183	AT	3	6	6953	6958	50 %	50 %	0 %	0 %	498827235
27	NC_021183	CA	3	6	7097	7102	50 %	0 %	0 %	50 %	498827235
28	NC_021183	TG	3	6	7216	7221	0 %	50 %	50 %	0 %	498827235
29	NC_021183	TC	4	8	8272	8279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021183	TA	3	6	9424	9429	50 %	50 %	0 %	0 %	498827236
31	NC_021183	CA	3	6	9758	9763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021183	GT	3	6	10190	10195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021183	AT	4	8	10203	10210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021183	TA	3	6	10617	10622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021183	AT	3	6	11676	11681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021183	AT	3	6	11724	11729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021183	TA	4	8	11732	11739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021183	AT	3	6	12017	12022	50 %	50 %	0 %	0 %	498827237
39	NC_021183	AG	3	6	12033	12038	50 %	0 %	50 %	0 %	498827237
40	NC_021183	TA	5	10	12254	12263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021183	TA	4	8	12265	12272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021183	TA	3	6	12274	12279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021183	AT	3	6	12280	12285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021183	TA	3	6	12911	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021183	TA	3	6	13505	13510	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
46	NC_021183	AT	3	6	13672	13677	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
47	NC_021183	GA	4	8	13740	13747	50 %	0 %	50 %	0 %	498827239
48	NC_021183	AT	3	6	13765	13770	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
49	NC_021183	AT	3	6	13900	13905	50 %	50 %	0 %	0 %	498827239
50	NC_021183	AG	3	6	14604	14609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021183	AT	3	6	14622	14627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021183	TA	3	6	14683	14688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021183	AT	3	6	14708	14713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021183	AT	3	6	14923	14928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021183	AT	3	6	14942	14947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021183	AT	3	6	15317	15322	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
57	NC_021183	TA	3	6	15394	15399	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
58	NC_021183	AT	3	6	15462	15467	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
59	NC_021183	AT	3	6	15924	15929	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
60	NC_021183	AT	3	6	16119	16124	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
61	NC_021183	AT	3	6	16233	16238	50 %	50 %	0 %	0 %	498827241
62	NC_021183	AT	3	6	16449	16454	50 %	50 %	0 %	0 %	498827241
63	NC_021183	AT	3	6	16886	16891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021183	TA	3	6	16911	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021183	AT	3	6	16972	16977	50 %	50 %	0 %	0 %	498827242
66	NC_021183	TA	3	6	17214	17219	50 %	50 %	0 %	0 %	498827242
67	NC_021183	GA	3	6	17809	17814	50 %	0 %	50 %	0 %	498827242
68	NC_021183	TA	4	8	17890	17897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021183	TA	3	6	18061	18066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021183	TA	3	6	18097	18102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021183	AT	4	8	18143	18150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021183	AT	3	6	18152	18157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021183	AT	3	6	18486	18491	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
74	NC_021183	TA	3	6	18493	18498	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
75	NC_021183	AG	3	6	18652	18657	50 %	0 %	50 %	0 %	498827243
76	NC_021183	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
77	NC_021183	AT	3	6	19123	19128	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
78	NC_021183	TA	3	6	19330	19335	50 %	50 %	0 %	0 %	498827243
79	NC_021183	TG	3	6	19473	19478	0 %	50 %	50 %	0 %	498827243
80	NC_021183	TA	3	6	20404	20409	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
81	NC_021183	TA	3	6	20428	20433	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
82	NC_021183	AT	3	6	20472	20477	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
83	NC_021183	TA	3	6	20771	20776	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
84	NC_021183	TG	3	6	21160	21165	0 %	50 %	50 %	0 %	498827245
85	NC_021183	AT	3	6	21407	21412	50 %	50 %	0 %	0 %	498827245
86	NC_021183	TA	3	6	22147	22152	50 %	50 %	0 %	0 %	498827246
87	NC_021183	TA	3	6	22293	22298	50 %	50 %	0 %	0 %	498827246
88	NC_021183	TA	3	6	23203	23208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021183	TA	3	6	23270	23275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021183	TA	3	6	23314	23319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021183	TA	3	6	23344	23349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021183	AT	3	6	23423	23428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021183	TA	3	6	23967	23972	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
94	NC_021183	TA	3	6	24549	24554	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
95	NC_021183	AT	3	6	24722	24727	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
96	NC_021183	AT	3	6	24847	24852	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
97	NC_021183	TA	3	6	24903	24908	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
98	NC_021183	AT	3	6	25030	25035	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
99	NC_021183	AT	3	6	25196	25201	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
100	NC_021183	TA	3	6	26719	26724	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
101	NC_021183	AT	3	6	27384	27389	50 %	50 %	0 %	0 %	498827250
102	NC_021183	AT	3	6	27951	27956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021183	TA	3	6	29320	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	498827251
104	NC_021183	TC	3	6	29532	29537	0 %	50 %	0 %	50 %	498827251
105	NC_021183	AT	3	6	29570	29575	50 %	50 %	0 %	0 %	498827251
106	NC_021183	TC	4	8	30809	30816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021183	AT	3	6	32189	32194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021183	AT	3	6	32795	32800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021183	TA	3	6	34969	34974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021183	TA	3	6	35164	35169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021183	TA	3	6	35238	35243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021183	CT	3	6	35380	35385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021183	TA	3	6	36005	36010	50 %	50 %	0 %	0 %	498827254
114	NC_021183	AT	3	6	36149	36154	50 %	50 %	0 %	0 %	498827254
115	NC_021183	GT	3	6	36167	36172	0 %	50 %	50 %	0 %	498827254
116	NC_021183	AT	3	6	36749	36754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021183	TA	4	8	36781	36788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021183	AT	3	6	37327	37332	50 %	50 %	0 %	0 %	498827255
119	NC_021183	TA	3	6	37462	37467	50 %	50 %	0 %	0 %	498827255
120	NC_021183	TA	3	6	37556	37561	50 %	50 %	0 %	0 %	498827255
121	NC_021183	AT	3	6	38271	38276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021183	AT	3	6	38525	38530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021183	AT	3	6	38768	38773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021183	AC	3	6	38874	38879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021183	TA	3	6	40870	40875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021183	AT	3	6	41121	41126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021183	TA	3	6	41188	41193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021183	AT	4	8	41301	41308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021183	AT	3	6	41771	41776	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
130	NC_021183	AT	3	6	41783	41788	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
131	NC_021183	AT	3	6	41810	41815	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
132	NC_021183	CT	3	6	41820	41825	0 %	50 %	0 %	50 %	498827257
133	NC_021183	AT	3	6	42031	42036	50 %	50 %	0 %	0 %	498827257
134	NC_021183	AG	3	6	42241	42246	50 %	0 %	50 %	0 %	498827258
135	NC_021183	AT	3	6	42581	42586	50 %	50 %	0 %	0 %	498827259
136	NC_021183	AT	3	6	43246	43251	50 %	50 %	0 %	0 %	498827260
137	NC_021183	AT	3	6	43289	43294	50 %	50 %	0 %	0 %	498827260
138	NC_021183	AT	4	8	43723	43730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021183	TA	3	6	43796	43801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021183	AT	3	6	44055	44060	50 %	50 %	0 %	0 %	498827261
141	NC_021183	TA	3	6	44673	44678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021183	TG	3	6	44820	44825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021183	TA	3	6	44926	44931	50 %	50 %	0 %	0 %	498827262
144	NC_021183	TA	3	6	45096	45101	50 %	50 %	0 %	0 %	498827262
145	NC_021183	TA	3	6	45369	45374	50 %	50 %	0 %	0 %	498827262
146	NC_021183	TA	3	6	46090	46095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021183	AT	3	6	46262	46267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021183	TA	3	6	46399	46404	50 %	50 %	0 %	0 %	498827263
149	NC_021183	TA	3	6	46879	46884	50 %	50 %	0 %	0 %	498827263
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151	NC_021183	AT	3	6	48286	48291	50 %	50 %	0 %	0 %	498827264
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.