MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	TAAA	2	8	27	34	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	TATG	2	8	421	428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021183	TAGC	2	8	546	553	25 %	25 %	25 %	25 %	498827229
4	NC_021183	AGAA	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	498827229
5	NC_021183	GTAT	2	8	1818	1825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021183	TAAA	2	8	2347	2354	75 %	25 %	0 %	0 %	498827231
7	NC_021183	CTTT	2	8	2533	2540	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
8	NC_021183	ATTT	2	8	2897	2904	25 %	75 %	0 %	0 %	498827231
9	NC_021183	TTCT	3	12	3090	3101	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
10	NC_021183	ACAT	2	8	3414	3421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021183	ACAT	2	8	3426	3433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021183	AATT	2	8	3604	3611	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
13	NC_021183	ATTA	2	8	4319	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021183	TTAT	2	8	4387	4394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021183	TTCT	2	8	4745	4752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021183	TCCG	2	8	5094	5101	0 %	25 %	25 %	50 %	498827234
17	NC_021183	CTTT	2	8	5514	5521	0 %	75 %	0 %	25 %	498827234
18	NC_021183	ATAA	2	8	6288	6295	75 %	25 %	0 %	0 %	498827234
19	NC_021183	TCAG	2	8	7447	7454	25 %	25 %	25 %	25 %	498827235
20	NC_021183	CCAT	2	8	8389	8396	25 %	25 %	0 %	50 %	498827236
21	NC_021183	TCCA	2	8	8925	8932	25 %	25 %	0 %	50 %	498827236
22	NC_021183	CCCT	2	8	10041	10048	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021183	CTTT	2	8	10655	10662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021183	ATTT	2	8	10698	10705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021183	CTTT	2	8	10711	10718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021183	TCCT	2	8	10932	10939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021183	CCTT	2	8	11002	11009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021183	TAGG	2	8	11095	11102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021183	TGTT	2	8	11120	11127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021183	CAAA	2	8	11146	11153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021183	CGTA	2	8	12403	12410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021183	ATAA	2	8	12420	12427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021183	AATA	2	8	13198	13205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021183	AATT	2	8	13387	13394	50 %	50 %	0 %	0 %	498827238
35	NC_021183	ATAG	2	8	13416	13423	50 %	25 %	25 %	0 %	498827238
36	NC_021183	AAAT	2	8	13561	13568	75 %	25 %	0 %	0 %	498827239
37	NC_021183	TAAA	2	8	13647	13654	75 %	25 %	0 %	0 %	498827239
38	NC_021183	TGAT	2	8	13785	13792	25 %	50 %	25 %	0 %	498827239
39	NC_021183	GAAA	2	8	14191	14198	75 %	0 %	25 %	0 %	498827239
40	NC_021183	AAAT	2	8	14236	14243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021183	ACTT	2	8	14546	14553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021183	CTAA	2	8	14798	14805	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021183	TAAT	2	8	15171	15178	50 %	50 %	0 %	0 %	498827240
44	NC_021183	TTTA	2	8	16037	16044	25 %	75 %	0 %	0 %	498827240
45	NC_021183	TAAA	2	8	16196	16203	75 %	25 %	0 %	0 %	498827241
46	NC_021183	GATT	2	8	16512	16519	25 %	50 %	25 %	0 %	498827241
47	NC_021183	TTTG	2	8	16534	16541	0 %	75 %	25 %	0 %	498827241
48	NC_021183	GATA	2	8	16692	16699	50 %	25 %	25 %	0 %	498827241
49	NC_021183	TTAG	2	8	16794	16801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021183	TAAC	2	8	16827	16834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021183	ATAA	2	8	18404	18411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021183	GTAT	2	8	19902	19909	25 %	50 %	25 %	0 %	498827243
53	NC_021183	TAAA	2	8	20141	20148	75 %	25 %	0 %	0 %	498827244
54	NC_021183	CAAT	2	8	20538	20545	50 %	25 %	0 %	25 %	498827245
55	NC_021183	TGAT	2	8	20755	20762	25 %	50 %	25 %	0 %	498827245
56	NC_021183	GAAT	2	8	20837	20844	50 %	25 %	25 %	0 %	498827245
57	NC_021183	ATTT	2	8	20941	20948	25 %	75 %	0 %	0 %	498827245
58	NC_021183	GTTC	2	8	20949	20956	0 %	50 %	25 %	25 %	498827245
59	NC_021183	ACCA	2	8	20963	20970	50 %	0 %	0 %	50 %	498827245
60	NC_021183	CCAT	2	8	21317	21324	25 %	25 %	0 %	50 %	498827245
61	NC_021183	ATAA	2	8	21779	21786	75 %	25 %	0 %	0 %	498827246
62	NC_021183	ATTG	2	8	22447	22454	25 %	50 %	25 %	0 %	498827246
63	NC_021183	ATCC	2	8	22695	22702	25 %	25 %	0 %	50 %	498827246
64	NC_021183	TTTC	2	8	23222	23229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021183	TTTA	2	8	23654	23661	25 %	75 %	0 %	0 %	498827248
66	NC_021183	ATTA	2	8	23701	23708	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
67	NC_021183	TTAT	2	8	23973	23980	25 %	75 %	0 %	0 %	498827248
68	NC_021183	TATT	3	12	24122	24133	25 %	75 %	0 %	0 %	498827248
69	NC_021183	AATT	2	8	24555	24562	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
70	NC_021183	TTAA	2	8	24572	24579	50 %	50 %	0 %	0 %	498827248
71	NC_021183	TTTG	2	8	24733	24740	0 %	75 %	25 %	0 %	498827248
72	NC_021183	ATCT	2	8	25109	25116	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
73	NC_021183	CATT	2	8	25267	25274	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
74	NC_021183	AACA	2	8	25607	25614	75 %	0 %	0 %	25 %	498827249
75	NC_021183	TGTT	2	8	25864	25871	0 %	75 %	25 %	0 %	498827249
76	NC_021183	TATT	2	8	26209	26216	25 %	75 %	0 %	0 %	498827249
77	NC_021183	ACTT	2	8	26317	26324	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
78	NC_021183	TATC	2	8	26473	26480	25 %	50 %	0 %	25 %	498827249
79	NC_021183	ATTA	2	8	26558	26565	50 %	50 %	0 %	0 %	498827249
80	NC_021183	GAAG	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021183	AGAT	2	8	27069	27076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021183	TTTA	2	8	27561	27568	25 %	75 %	0 %	0 %	498827250
83	NC_021183	TCTT	2	8	27650	27657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021183	TTTA	2	8	27756	27763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021183	CGTT	2	8	28486	28493	0 %	50 %	25 %	25 %	498827251
86	NC_021183	AATT	2	8	29002	29009	50 %	50 %	0 %	0 %	498827251
87	NC_021183	CTGT	2	8	29087	29094	0 %	50 %	25 %	25 %	498827251
88	NC_021183	TGCT	2	8	29330	29337	0 %	50 %	25 %	25 %	498827251
89	NC_021183	CTTT	2	8	29798	29805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021183	CCAT	2	8	30926	30933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021183	TCCA	2	8	31462	31469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021183	ACTG	2	8	32195	32202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021183	TATT	2	8	33116	33123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021183	TATC	2	8	34169	34176	25 %	50 %	0 %	25 %	498827253
95	NC_021183	TCCC	2	8	35323	35330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_021183	TAAT	2	8	35563	35570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021183	TCTA	2	8	36492	36499	25 %	50 %	0 %	25 %	498827254
98	NC_021183	TAAA	2	8	36826	36833	75 %	25 %	0 %	0 %	498827255
99	NC_021183	ATAA	2	8	37721	37728	75 %	25 %	0 %	0 %	498827255
100	NC_021183	TAAA	2	8	37753	37760	75 %	25 %	0 %	0 %	498827255
101	NC_021183	TTAT	2	8	38039	38046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021183	ACTT	2	8	38174	38181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021183	AATT	2	8	38574	38581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021183	AGAT	2	8	39701	39708	50 %	25 %	25 %	0 %	498827256
105	NC_021183	AGAA	2	8	39839	39846	75 %	0 %	25 %	0 %	498827256
106	NC_021183	GGTT	2	8	40316	40323	0 %	50 %	50 %	0 %	498827256
107	NC_021183	ACTG	2	8	40437	40444	25 %	25 %	25 %	25 %	498827256
108	NC_021183	GATG	2	8	40545	40552	25 %	25 %	50 %	0 %	498827256
109	NC_021183	TTTA	2	8	40823	40830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021183	TATT	2	8	41211	41218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021183	ATTT	2	8	41400	41407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021183	ATTT	2	8	41572	41579	25 %	75 %	0 %	0 %	498827257
113	NC_021183	TAAA	2	8	41977	41984	75 %	25 %	0 %	0 %	498827257
114	NC_021183	TTTA	2	8	41988	41995	25 %	75 %	0 %	0 %	498827257
115	NC_021183	AATT	2	8	42524	42531	50 %	50 %	0 %	0 %	498827259
116	NC_021183	CTCC	2	8	42949	42956	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_021183	ATTG	2	8	43090	43097	25 %	50 %	25 %	0 %	498827260
118	NC_021183	ATGA	2	8	43151	43158	50 %	25 %	25 %	0 %	498827260
119	NC_021183	TCTT	2	8	43169	43176	0 %	75 %	0 %	25 %	498827260
120	NC_021183	AATG	2	8	43177	43184	50 %	25 %	25 %	0 %	498827260
121	NC_021183	ATTT	2	8	43658	43665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021183	TAAT	2	8	43702	43709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021183	AATT	2	8	43743	43750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021183	CTTG	2	8	44374	44381	0 %	50 %	25 %	25 %	498827261
125	NC_021183	AATG	2	8	44389	44396	50 %	25 %	25 %	0 %	498827261
126	NC_021183	TAAA	2	8	44567	44574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021183	GATT	2	8	44623	44630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021183	ATAA	2	8	44943	44950	75 %	25 %	0 %	0 %	498827262
129	NC_021183	CTTC	2	8	45810	45817	0 %	50 %	0 %	50 %	498827262
130	NC_021183	GCAC	2	8	45950	45957	25 %	0 %	25 %	50 %	498827262
131	NC_021183	CAAT	2	8	46706	46713	50 %	25 %	0 %	25 %	498827263
132	NC_021183	ATCT	2	8	46995	47002	25 %	50 %	0 %	25 %	498827263
133	NC_021183	TCTT	2	8	47329	47336	0 %	75 %	0 %	25 %	498827263
134	NC_021183	AAAT	2	8	47440	47447	75 %	25 %	0 %	0 %	498827263
135	NC_021183	TTTC	2	8	47570	47577	0 %	75 %	0 %	25 %	498827263
136	NC_021183	AGCA	2	8	48198	48205	50 %	0 %	25 %	25 %	498827264
137	NC_021183	AGTA	2	8	48918	48925	50 %	25 %	25 %	0 %	498827266
138	NC_021183	GATT	2	8	49192	49199	25 %	50 %	25 %	0 %	498827266
139	NC_021183	TTTC	2	8	49499	49506	0 %	75 %	0 %	25 %	498827267
140	NC_021183	CATT	2	8	50224	50231	25 %	50 %	0 %	25 %	498827269
141	NC_021183	TTCT	2	8	51037	51044	0 %	75 %	0 %	25 %	498827270
142	NC_021183	AATT	2	8	51155	51162	50 %	50 %	0 %	0 %	498827270
143	NC_021183	TTCT	2	8	52066	52073	0 %	75 %	0 %	25 %	498827270

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.