MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium pasteurianum BC1 plasmid pCLOPA01

Total Repeats: 1472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021183	A	6	6	13	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021183	ATT	2	6	21	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021183	TAAA	2	8	27	34	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021183	ACA	2	6	41	46	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021183	TGT	2	6	55	60	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021183	TA	4	8	81	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021183	ATA	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021183	ATA	2	6	170	175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021183	ATA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021183	ATA	2	6	214	219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021183	ATA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021183	ATA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021183	ATA	2	6	279	284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021183	ATA	2	6	300	305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021183	ATA	2	6	323	328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021183	TAA	2	6	341	346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021183	ATA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021183	ATACAT	2	12	390	401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021183	GTATTA	2	12	409	420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021183	TATG	2	8	421	428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021183	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021183	TAT	2	6	451	456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827229
23	NC_021183	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827229
24	NC_021183	TAA	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
25	NC_021183	TAGC	2	8	546	553	25 %	25 %	25 %	25 %	498827229
26	NC_021183	ATA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
27	NC_021183	A	6	6	841	846	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
28	NC_021183	A	6	6	911	916	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
29	NC_021183	AT	3	6	980	985	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
30	NC_021183	AAT	2	6	1003	1008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
31	NC_021183	AT	3	6	1044	1049	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
32	NC_021183	TTTTGA	2	12	1051	1062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	498827229
33	NC_021183	ATA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
34	NC_021183	AGAA	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	498827229
35	NC_021183	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	498827229
36	NC_021183	A	8	8	1234	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
37	NC_021183	AAT	2	6	1373	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827229
38	NC_021183	AC	3	6	1388	1393	50 %	0 %	0 %	50 %	498827229
39	NC_021183	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	498827229
40	NC_021183	AGA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827229
41	NC_021183	GA	3	6	1482	1487	50 %	0 %	50 %	0 %	498827229
42	NC_021183	ACT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021183	TAG	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021183	TAT	2	6	1590	1595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021183	TAT	2	6	1612	1617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021183	AATAA	2	10	1683	1692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021183	ATTTA	2	10	1699	1708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021183	AT	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021183	ATA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021183	GTAT	2	8	1818	1825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021183	TAA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021183	TTA	2	6	1943	1948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021183	A	6	6	1954	1959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021183	TCT	3	9	1983	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827230
55	NC_021183	AGC	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	498827230
56	NC_021183	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827230
57	NC_021183	AT	3	6	2041	2046	50 %	50 %	0 %	0 %	498827230
58	NC_021183	GAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827230
59	NC_021183	TAT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
60	NC_021183	TCT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827230
61	NC_021183	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
62	NC_021183	CAA	2	6	2116	2121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827230
63	NC_021183	ATT	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
64	NC_021183	T	6	6	2216	2221	0 %	100 %	0 %	0 %	498827230
65	NC_021183	TGC	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	498827230
66	NC_021183	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827230
67	NC_021183	CAT	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827230
68	NC_021183	ATGTAA	2	12	2266	2277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	498827230
69	NC_021183	T	7	7	2330	2336	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
70	NC_021183	TAAA	2	8	2347	2354	75 %	25 %	0 %	0 %	498827231
71	NC_021183	AGT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827231
72	NC_021183	TGT	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	498827231
73	NC_021183	ACC	2	6	2441	2446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	498827231
74	NC_021183	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
75	NC_021183	CTTT	2	8	2533	2540	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
76	NC_021183	AT	3	6	2541	2546	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
77	NC_021183	T	6	6	2564	2569	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
78	NC_021183	CTT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827231
79	NC_021183	AACATT	2	12	2612	2623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	498827231
80	NC_021183	TCC	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	498827231
81	NC_021183	T	6	6	2795	2800	0 %	100 %	0 %	0 %	498827231
82	NC_021183	TTCAAA	2	12	2870	2881	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	498827231
83	NC_021183	ATC	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
84	NC_021183	ATTT	2	8	2897	2904	25 %	75 %	0 %	0 %	498827231
85	NC_021183	TAA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827231
86	NC_021183	TTCT	3	12	3090	3101	0 %	75 %	0 %	25 %	498827231
87	NC_021183	AT	3	6	3120	3125	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
88	NC_021183	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
89	NC_021183	TAC	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
90	NC_021183	ATC	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
91	NC_021183	AT	3	6	3174	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
92	NC_021183	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	498827231
93	NC_021183	ATT	2	6	3242	3247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827231
94	NC_021183	TAC	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827231
95	NC_021183	AT	3	6	3315	3320	50 %	50 %	0 %	0 %	498827231
96	NC_021183	TCC	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021183	T	7	7	3398	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021183	ACAT	2	8	3414	3421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021183	ACAT	2	8	3426	3433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021183	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021183	A	7	7	3462	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021183	T	6	6	3512	3517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021183	AT	3	6	3558	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021183	AATT	2	8	3604	3611	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
105	NC_021183	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
106	NC_021183	AAATA	2	10	3636	3645	80 %	20 %	0 %	0 %	498827232
107	NC_021183	TA	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
108	NC_021183	ATC	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827232
109	NC_021183	TAA	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
110	NC_021183	TAA	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
111	NC_021183	ATA	3	9	3789	3797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
112	NC_021183	CTA	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	498827232
113	NC_021183	AGAAAA	2	12	3904	3915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	498827232
114	NC_021183	ACA	3	9	3941	3949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	498827232
115	NC_021183	TAAAGA	2	12	4048	4059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	498827232
116	NC_021183	AGA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	498827232
117	NC_021183	TA	3	6	4188	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	498827232
118	NC_021183	A	6	6	4193	4198	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
119	NC_021183	A	7	7	4225	4231	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
120	NC_021183	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	498827232
121	NC_021183	ATA	2	6	4297	4302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	498827232
122	NC_021183	ATTA	2	8	4319	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021183	ATA	2	6	4340	4345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021183	AGA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021183	TTAT	2	8	4387	4394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021183	ACA	2	6	4424	4429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021183	AGG	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021183	TAG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827233
129	NC_021183	GTA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	498827233
130	NC_021183	A	6	6	4564	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	498827233
131	NC_021183	TAT	2	6	4570	4575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827233
132	NC_021183	TAATA	2	10	4589	4598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021183	GTATA	2	10	4604	4613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021183	ATA	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021183	CAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021183	A	6	6	4639	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021183	TTG	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021183	T	6	6	4652	4657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021183	AT	3	6	4658	4663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021183	TTCT	2	8	4745	4752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021183	ATT	3	9	4787	4795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021183	GTA	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021183	AAT	2	6	4834	4839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021183	T	6	6	4924	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021183	T	7	7	4959	4965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021183	TAA	2	6	4992	4997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021183	GCG	2	6	5009	5014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	498827234
148	NC_021183	CTT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
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150	NC_021183	TCCG	2	8	5094	5101	0 %	25 %	25 %	50 %	498827234
151	NC_021183	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
152	NC_021183	TTA	2	6	5127	5132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	498827234
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157	NC_021183	AT	3	6	5352	5357	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
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160	NC_021183	AT	3	6	5451	5456	50 %	50 %	0 %	0 %	498827234
161	NC_021183	CTTT	2	8	5514	5521	0 %	75 %	0 %	25 %	498827234
162	NC_021183	CTTTC	2	10	5544	5553	0 %	60 %	0 %	40 %	498827234
163	NC_021183	TTC	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
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165	NC_021183	CTT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	498827234
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169	NC_021183	T	6	6	5794	5799	0 %	100 %	0 %	0 %	498827234
170	NC_021183	TTTTA	2	10	5878	5887	20 %	80 %	0 %	0 %	498827234
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180	NC_021183	T	6	6	6474	6479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021183	ATT	2	6	6480	6485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_021183	T	6	6	6513	6518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021183	AT	3	6	6519	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021183	A	6	6	6587	6592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021183	TAA	2	6	6792	6797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021183	GA	3	6	6832	6837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021183	CAAATA	2	12	6855	6866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	498827235
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256	NC_021183	TGA	2	6	9866	9871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_021183	TAA	2	6	10307	10312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_021183	TCA	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_021183	A	6	6	10383	10388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021183	TCT	2	6	10424	10429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_021183	CAT	2	6	10460	10465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_021183	TCT	2	6	10510	10515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_021183	AAT	2	6	10533	10538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021183	TA	3	6	10617	10622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021183	CTTT	2	8	10655	10662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
275	NC_021183	ATTT	2	8	10698	10705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021183	CTTT	2	8	10711	10718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
277	NC_021183	TAT	2	6	10748	10753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_021183	TCCT	2	8	10932	10939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
279	NC_021183	ATC	2	6	10959	10964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_021183	CTG	2	6	10989	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_021183	CCTT	2	8	11002	11009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_021183	CTT	2	6	11011	11016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_021183	TAGG	2	8	11095	11102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021183	TGTT	2	8	11120	11127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_021183	CAT	2	6	11187	11192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_021183	AT	3	6	11724	11729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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