MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium pasteurianum BC1

Total Repeats: 5253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021182	TTTTA	2	10	258	267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021182	TAGAA	2	10	1510	1519	60 %	20 %	20 %	0 %	488769000
3	NC_021182	ATCTA	2	10	1953	1962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021182	AAACT	2	10	2166	2175	60 %	20 %	0 %	20 %	488769001
5	NC_021182	AATTA	2	10	2290	2299	60 %	40 %	0 %	0 %	488769001
6	NC_021182	CTTAT	2	10	3069	3078	20 %	60 %	0 %	20 %	488769001
7	NC_021182	AAAAT	2	10	3159	3168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021182	TATAA	2	10	3425	3434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021182	TGTAG	2	10	3581	3590	20 %	40 %	40 %	0 %	488769003
10	NC_021182	CTAAA	2	10	3867	3876	60 %	20 %	0 %	20 %	488769003
11	NC_021182	AGATT	2	10	4025	4034	40 %	40 %	20 %	0 %	488769003
12	NC_021182	TAAAT	2	10	4042	4051	60 %	40 %	0 %	0 %	488769003
13	NC_021182	AATTT	2	10	5743	5752	40 %	60 %	0 %	0 %	488769005
14	NC_021182	AGATA	2	10	6221	6230	60 %	20 %	20 %	0 %	488769005
15	NC_021182	AAGGT	2	10	6947	6956	40 %	20 %	40 %	0 %	488769006
16	NC_021182	TCGTG	2	10	10996	11005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021182	AGTAA	2	10	11588	11597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021182	TAAGT	2	10	12759	12768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021182	GGGAT	2	10	14438	14447	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021182	AGATT	2	10	14484	14493	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021182	ATATT	2	10	14645	14654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021182	TATTT	2	10	15089	15098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021182	AATAT	2	10	15141	15150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021182	TAATA	2	10	16361	16370	60 %	40 %	0 %	0 %	488769008
25	NC_021182	TATTT	2	10	16623	16632	20 %	80 %	0 %	0 %	488769009
26	NC_021182	CATTT	2	10	17320	17329	20 %	60 %	0 %	20 %	488769009
27	NC_021182	ATTTA	2	10	17416	17425	40 %	60 %	0 %	0 %	488769009
28	NC_021182	AGTAA	2	10	17738	17747	60 %	20 %	20 %	0 %	488769009
29	NC_021182	ATCAA	2	10	19339	19348	60 %	20 %	0 %	20 %	488769010
30	NC_021182	TAAAG	2	10	19816	19825	60 %	20 %	20 %	0 %	488769010
31	NC_021182	AATTT	2	10	20125	20134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021182	TAATT	2	10	20136	20145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021182	TGATT	2	10	21174	21183	20 %	60 %	20 %	0 %	488769011
34	NC_021182	GAAAA	2	10	22386	22395	80 %	0 %	20 %	0 %	488769012
35	NC_021182	TATTT	2	10	23518	23527	20 %	80 %	0 %	0 %	488769013
36	NC_021182	AAGAA	2	10	23602	23611	80 %	0 %	20 %	0 %	488769013
37	NC_021182	TTTTA	2	10	26133	26142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021182	ATTTA	2	10	26476	26485	40 %	60 %	0 %	0 %	488769015
39	NC_021182	TATTT	2	10	26605	26614	20 %	80 %	0 %	0 %	488769015
40	NC_021182	ATTTG	2	10	26885	26894	20 %	60 %	20 %	0 %	488769015
41	NC_021182	TTGCT	2	10	27272	27281	0 %	60 %	20 %	20 %	488769015
42	NC_021182	ATTGA	2	10	28646	28655	40 %	40 %	20 %	0 %	488769016
43	NC_021182	TCTTT	2	10	29396	29405	0 %	80 %	0 %	20 %	488769017
44	NC_021182	TTTCC	2	10	29706	29715	0 %	60 %	0 %	40 %	488769017
45	NC_021182	TTTAG	2	10	29953	29962	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021182	TTTAT	2	10	30533	30542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021182	AAGCT	2	10	31282	31291	40 %	20 %	20 %	20 %	488769018
48	NC_021182	TGAAT	2	10	31397	31406	40 %	40 %	20 %	0 %	488769018
49	NC_021182	TATAT	2	10	32492	32501	40 %	60 %	0 %	0 %	488769018
50	NC_021182	TATGA	2	10	34552	34561	40 %	40 %	20 %	0 %	488769019
51	NC_021182	AAAGT	2	10	34682	34691	60 %	20 %	20 %	0 %	488769019
52	NC_021182	TGTTA	2	10	35497	35506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021182	TTTTC	2	10	36211	36220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021182	AGAAT	2	10	37422	37431	60 %	20 %	20 %	0 %	488769022
55	NC_021182	AAAAG	2	10	37582	37591	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021182	TATAA	2	10	37800	37809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021182	GTTAT	2	10	38087	38096	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021182	GTAAA	2	10	38332	38341	60 %	20 %	20 %	0 %	488769023
59	NC_021182	ATCTT	2	10	38860	38869	20 %	60 %	0 %	20 %	488769023
60	NC_021182	GAGAA	2	10	42071	42080	60 %	0 %	40 %	0 %	488769027
61	NC_021182	ATTTC	2	10	42589	42598	20 %	60 %	0 %	20 %	488769029
62	NC_021182	TTTTA	2	10	42993	43002	20 %	80 %	0 %	0 %	488769029
63	NC_021182	ATTAT	2	10	43386	43395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021182	AGAAA	2	10	43853	43862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021182	ATTTT	2	10	44580	44589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021182	ATATA	2	10	45411	45420	60 %	40 %	0 %	0 %	488769032
67	NC_021182	AATTT	2	10	45932	45941	40 %	60 %	0 %	0 %	488769033
68	NC_021182	TAAAT	2	10	46026	46035	60 %	40 %	0 %	0 %	488769033
69	NC_021182	AATTA	2	10	46130	46139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021182	ATTTA	2	10	46449	46458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021182	TTCAA	2	10	46576	46585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021182	CAGTG	2	10	48305	48314	20 %	20 %	40 %	20 %	488769034
73	NC_021182	CATAT	2	10	49225	49234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021182	ATAAA	2	10	49572	49581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021182	GTTAT	2	10	50772	50781	20 %	60 %	20 %	0 %	488769035
76	NC_021182	AATTC	2	10	51468	51477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021182	AAAAT	2	10	51865	51874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021182	TGCTA	2	10	53601	53610	20 %	40 %	20 %	20 %	488769038
79	NC_021182	AGGAC	2	10	53872	53881	40 %	0 %	40 %	20 %	488769038
80	NC_021182	TTTTA	2	10	53913	53922	20 %	80 %	0 %	0 %	488769038
81	NC_021182	GAATG	2	10	55118	55127	40 %	20 %	40 %	0 %	488769039
82	NC_021182	AAATT	2	10	59311	59320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021182	ATTAT	2	10	59487	59496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021182	AAATT	2	10	59699	59708	60 %	40 %	0 %	0 %	488769043
85	NC_021182	CTACA	2	10	62288	62297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021182	AAATA	2	10	63528	63537	80 %	20 %	0 %	0 %	488769046
87	NC_021182	AATAA	2	10	65081	65090	80 %	20 %	0 %	0 %	488769047
88	NC_021182	CATGG	2	10	65150	65159	20 %	20 %	40 %	20 %	488769047
89	NC_021182	TATTT	2	10	71757	71766	20 %	80 %	0 %	0 %	488769051
90	NC_021182	TTGGA	2	10	71791	71800	20 %	40 %	40 %	0 %	488769051
91	NC_021182	AGAAA	2	10	72465	72474	80 %	0 %	20 %	0 %	488769053
92	NC_021182	TCTGG	2	10	75019	75028	0 %	40 %	40 %	20 %	488769054
93	NC_021182	AATTC	2	10	75884	75893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021182	ATTGA	2	10	76264	76273	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021182	TTCTT	2	10	77543	77552	0 %	80 %	0 %	20 %	488769056
96	NC_021182	CTTTT	2	10	78115	78124	0 %	80 %	0 %	20 %	488769057
97	NC_021182	TTTCA	2	10	78146	78155	20 %	60 %	0 %	20 %	488769057
98	NC_021182	AGTTA	2	10	79343	79352	40 %	40 %	20 %	0 %	488769060
99	NC_021182	ATTTT	2	10	79627	79636	20 %	80 %	0 %	0 %	488769061
100	NC_021182	TACAA	2	10	81195	81204	60 %	20 %	0 %	20 %	488769063
101	NC_021182	ATATT	2	10	82700	82709	40 %	60 %	0 %	0 %	488769064
102	NC_021182	AGAAA	2	10	83852	83861	80 %	0 %	20 %	0 %	488769067
103	NC_021182	TAAAT	2	10	84372	84381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021182	AAATT	2	10	85579	85588	60 %	40 %	0 %	0 %	488769070
105	NC_021182	ATTTA	2	10	86787	86796	40 %	60 %	0 %	0 %	488769073
106	NC_021182	GATAA	2	10	89208	89217	60 %	20 %	20 %	0 %	488769074
107	NC_021182	TATAT	2	10	90238	90247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021182	CTAAA	2	10	91036	91045	60 %	20 %	0 %	20 %	488769076
109	NC_021182	GTATT	2	10	91352	91361	20 %	60 %	20 %	0 %	488769076
110	NC_021182	AATAT	2	10	92228	92237	60 %	40 %	0 %	0 %	488769077
111	NC_021182	TATTT	2	10	93544	93553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021182	TATTT	2	10	95267	95276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021182	AAATA	2	10	95299	95308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021182	ATGTT	2	10	96973	96982	20 %	60 %	20 %	0 %	488769083
115	NC_021182	GATTT	2	10	97042	97051	20 %	60 %	20 %	0 %	488769083
116	NC_021182	AAAGA	2	10	98037	98046	80 %	0 %	20 %	0 %	488769083
117	NC_021182	TAAAA	2	10	98406	98415	80 %	20 %	0 %	0 %	488769084
118	NC_021182	TGAAA	2	10	98514	98523	60 %	20 %	20 %	0 %	488769084
119	NC_021182	TTAAT	2	10	99851	99860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021182	TATAT	2	10	100128	100137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021182	TCGTG	2	10	101675	101684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021182	AGTAA	2	10	102267	102276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021182	TAAGT	2	10	103438	103447	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021182	GGGAT	2	10	105116	105125	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021182	AGATT	2	10	105162	105171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021182	AATGT	2	10	107160	107169	40 %	40 %	20 %	0 %	488769088
127	NC_021182	TTATA	2	10	107208	107217	40 %	60 %	0 %	0 %	488769088
128	NC_021182	TTTTA	2	10	107235	107244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021182	AATAA	2	10	107262	107271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021182	TTATG	2	10	108747	108756	20 %	60 %	20 %	0 %	488769090
131	NC_021182	TTGAA	2	10	109003	109012	40 %	40 %	20 %	0 %	488769090
132	NC_021182	ATTAT	2	10	110212	110221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021182	TGAAA	2	10	113220	113229	60 %	20 %	20 %	0 %	488769095
134	NC_021182	AATGA	2	10	113362	113371	60 %	20 %	20 %	0 %	488769095
135	NC_021182	AAATT	2	10	113501	113510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021182	ATCTT	2	10	113659	113668	20 %	60 %	0 %	20 %	488769096
137	NC_021182	TAATA	2	10	115230	115239	60 %	40 %	0 %	0 %	488769097
138	NC_021182	CTTTT	2	10	115291	115300	0 %	80 %	0 %	20 %	488769097
139	NC_021182	AAATT	2	10	116220	116229	60 %	40 %	0 %	0 %	488769098
140	NC_021182	ATATT	2	10	116557	116566	40 %	60 %	0 %	0 %	488769098
141	NC_021182	ATATA	2	10	117295	117304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021182	TCGTG	2	10	118496	118505	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021182	AGTAA	2	10	119088	119097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021182	TAAGT	2	10	120259	120268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021182	GGGAT	2	10	121937	121946	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021182	AGATT	2	10	121983	121992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021182	ATATT	2	10	122144	122153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_021182	AAGTG	2	10	124661	124670	40 %	20 %	40 %	0 %	488769101
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154	NC_021182	TGATA	2	10	124950	124959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021182	TATAA	2	10	124961	124970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021182	TAATA	2	10	126420	126429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021182	ATATA	2	10	126559	126568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021182	TCGTG	2	10	127760	127769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_021182	AGTAA	2	10	128352	128361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021182	TAAGT	2	10	129523	129532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021182	GGGAT	2	10	131201	131210	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021182	AGATT	2	10	131247	131256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021182	ATATT	2	10	131408	131417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021182	TAAAA	2	10	132337	132346	80 %	20 %	0 %	0 %	488769103
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166	NC_021182	TGTTT	2	10	133087	133096	0 %	80 %	20 %	0 %	488769104
167	NC_021182	TATTT	2	10	133288	133297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_021182	TCGTG	2	10	141046	141055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_021182	AGTAA	2	10	141638	141647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021182	TAAGT	2	10	142809	142818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021182	TAAAA	2	10	145185	145194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021182	TATAA	2	10	155906	155915	60 %	40 %	0 %	0 %	488769120
192	NC_021182	TATTG	2	10	156380	156389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021182	AATTA	2	10	156394	156403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021182	ATTAT	2	10	156459	156468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_021182	ATGTA	2	10	158285	158294	40 %	40 %	20 %	0 %	488769121
198	NC_021182	TAATC	2	10	160123	160132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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241	NC_021182	ATATA	2	10	197949	197958	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_021182	AAATT	2	10	198630	198639	60 %	40 %	0 %	0 %	488769150
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251	NC_021182	CTGTA	2	10	205405	205414	20 %	40 %	20 %	20 %	488769155
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254	NC_021182	TTATA	2	10	205991	206000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021182	TATAT	2	10	210467	210476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_021182	GTGAT	2	10	216382	216391	20 %	40 %	40 %	0 %	488769167
263	NC_021182	TATTT	2	10	220526	220535	20 %	80 %	0 %	0 %	488769171
264	NC_021182	TATAT	2	10	221505	221514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021182	AACAA	2	10	221780	221789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_021182	ATTAT	2	10	222562	222571	40 %	60 %	0 %	0 %	488769172
267	NC_021182	AGGTA	2	10	222659	222668	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021182	TAAAA	2	10	222698	222707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021182	AGGTG	2	10	223486	223495	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021182	TATAA	2	10	225514	225523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021182	TTTAT	2	10	225911	225920	20 %	80 %	0 %	0 %	488769176
272	NC_021182	ATATA	2	10	226120	226129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021182	ATTAA	2	10	228270	228279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021182	TATAA	2	10	228531	228540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021182	TGGAT	2	10	229746	229755	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021182	TACAA	2	10	229897	229906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_021182	ATATA	2	10	230175	230184	60 %	40 %	0 %	0 %	488769181
278	NC_021182	ATTAT	2	10	234261	234270	40 %	60 %	0 %	0 %	488769187
279	NC_021182	ATGTA	2	10	235326	235335	40 %	40 %	20 %	0 %	488769188
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281	NC_021182	ATACT	2	10	235606	235615	40 %	40 %	0 %	20 %	488769188
282	NC_021182	AATTT	2	10	237316	237325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_021182	ATATA	2	10	237350	237359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021182	AAAAT	2	10	237425	237434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_021182	AATTA	2	10	373601	373610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_021182	ATTAT	2	10	373641	373650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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