MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Moranella endobia PCVAL

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021057	TAAGCA	2	12	5456	5467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324023
2	NC_021057	TATTTA	2	12	12529	12540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021057	GGCAAT	2	12	13172	13183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021057	GCGGTA	2	12	13753	13764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324028
5	NC_021057	AATACT	2	12	18770	18781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021057	TGGCAG	2	12	19967	19978	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324032
7	NC_021057	AGCTTC	2	12	23824	23835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021057	CTAAAA	2	12	23842	23853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021057	TTTATG	2	12	25139	25150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479324036
10	NC_021057	GCCTAT	2	12	29218	29229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324039
11	NC_021057	TGAAGT	2	12	29952	29963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324040
12	NC_021057	AGCTCT	2	12	33895	33906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324043
13	NC_021057	ATGGTC	2	12	38282	38293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324046
14	NC_021057	ATCCCC	2	12	38588	38599	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479324046
15	NC_021057	TTTACC	2	12	41174	41185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324048
16	NC_021057	GTAGCA	2	12	47665	47676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324051
17	NC_021057	AGTCGC	2	12	55778	55789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021057	TTACGG	2	12	57219	57230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324058
19	NC_021057	AGCTAG	2	12	57803	57814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021057	AATATC	2	12	59784	59795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021057	GCATAA	2	12	62829	62840	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021057	TTTATG	2	12	66651	66662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021057	ATCGTA	2	12	66963	66974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324065
24	NC_021057	ACTGGC	2	12	66982	66993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324065
25	NC_021057	GGCGGA	2	12	67348	67359	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021057	TGAAAA	2	12	68732	68743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324066
27	NC_021057	AGTGCA	2	12	70125	70136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021057	GATCTT	2	12	74218	74229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324068
29	NC_021057	GCTTAT	2	12	76051	76062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324069
30	NC_021057	TGATAC	2	12	76305	76316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324069
31	NC_021057	GCGCCA	2	12	80438	80449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324072
32	NC_021057	TTTTGT	2	12	93123	93134	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479324084
33	NC_021057	TTTAAT	2	12	94080	94091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021057	CACTCC	2	12	98507	98518	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479324089
35	NC_021057	TGTATC	2	12	100419	100430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324090
36	NC_021057	GCTCGT	2	12	103203	103214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324093
37	NC_021057	GTTAAT	2	12	108420	108431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479324097
38	NC_021057	TTAGCA	2	12	109143	109154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021057	GTATGC	2	12	109228	109239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021057	TGAAAT	2	12	111362	111373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021057	AGCAAA	2	12	112332	112343	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021057	TACCAA	2	12	112972	112983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324098
43	NC_021057	CTTCAT	2	12	117171	117182	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324101
44	NC_021057	TAAATC	2	12	118477	118488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324102
45	NC_021057	ATTAGC	2	12	120341	120352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021057	CTTGAG	2	12	122117	122128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324105
47	NC_021057	AGCTAC	2	12	123417	123428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324107
48	NC_021057	TAACTA	2	12	124640	124651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021057	TTTAGT	2	12	124802	124813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021057	TGTAGA	2	12	125204	125215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021057	CTAGGA	2	12	128787	128798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021057	TATATG	2	12	130766	130777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021057	CGGCGC	2	12	132026	132037	0 %	0 %	50 %	50 %	479324113
54	NC_021057	CTGCGG	2	12	133020	133031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021057	CAGTAA	2	12	133139	133150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021057	AGCAAT	2	12	134600	134611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324115
57	NC_021057	GCAAAC	2	12	135292	135303	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021057	ATTAAT	2	12	140194	140205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021057	ATTGGA	2	12	140458	140469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324119
60	NC_021057	GTACCA	2	12	140988	140999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021057	AATATT	2	12	144436	144447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021057	ATGCTG	2	12	149318	149329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324125
63	NC_021057	AGGTAA	2	12	150858	150869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021057	TAAAAA	2	12	151001	151012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479324126
65	NC_021057	AGCGTG	2	12	151462	151473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324126
66	NC_021057	AGCAAC	2	12	151594	151605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324126
67	NC_021057	GAAGCA	2	12	151995	152006	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479324126
68	NC_021057	TGTTAC	2	12	155871	155882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021057	GTTACT	2	12	156113	156124	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021057	TAATCT	2	12	156361	156372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021057	CAGCTA	2	12	157284	157295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021057	AGCTTT	2	12	157413	157424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479324131
73	NC_021057	TTGCTG	2	12	159118	159129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021057	GCAAAA	2	12	163303	163314	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479324135
75	NC_021057	AGGTAA	2	12	168068	168079	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324137
76	NC_021057	TACACT	2	12	169585	169596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324139
77	NC_021057	GAAGCT	2	12	170608	170619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021057	AAAAGA	2	12	172092	172103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479324141
79	NC_021057	TAGAAG	2	12	173963	173974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324142
80	NC_021057	TATAGA	2	12	175961	175972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479324144
81	NC_021057	AGAATG	2	12	180928	180939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324149
82	NC_021057	TGCTGT	2	12	181426	181437	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479324149
83	NC_021057	TTTTAC	2	12	184257	184268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021057	AGATAC	2	12	185771	185782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324154
85	NC_021057	GTTTTG	2	12	188695	188706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479324156
86	NC_021057	GAACAC	2	12	190804	190815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324158
87	NC_021057	TAAACT	2	12	191017	191028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479324158
88	NC_021057	TGAAGA	2	12	192671	192682	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324160
89	NC_021057	TACTTC	2	12	192962	192973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021057	TCGCGC	2	12	200925	200936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479324166
91	NC_021057	TTATCA	2	12	201383	201394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021057	ATGGTA	2	12	209260	209271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324170
93	NC_021057	GATGGT	2	12	209898	209909	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021057	TAGTGG	2	12	209921	209932	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021057	ATTTTT	2	12	210028	210039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021057	GTAATA	2	12	210063	210074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021057	TACATG	2	12	214177	214188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324173
98	NC_021057	AACGAC	2	12	217884	217895	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479324177
99	NC_021057	ATTAAG	2	12	218987	218998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021057	CATTAT	2	12	219530	219541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324178
101	NC_021057	GCCAAT	2	12	220412	220423	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324179
102	NC_021057	GATAAT	2	12	223364	223375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021057	CCCTGG	2	12	223468	223479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021057	TGGTGT	2	12	225189	225200	0 %	50 %	50 %	0 %	479324182
105	NC_021057	GCACAG	2	12	228931	228942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479324184
106	NC_021057	TAGCTG	2	12	229378	229389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021057	TTGGTA	2	12	233036	233047	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324188
108	NC_021057	AGGCTG	2	12	233460	233471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324188
109	NC_021057	GCACCG	2	12	234552	234563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324188
110	NC_021057	TGCTGG	2	12	234612	234623	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479324188
111	NC_021057	CTTTGC	2	12	237377	237388	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479324190
112	NC_021057	AGAACT	2	12	244281	244292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_021057	CATCTA	2	12	246489	246500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021057	GCCGCG	2	12	247495	247506	0 %	0 %	50 %	50 %	479324196
115	NC_021057	ATTTAA	2	12	249562	249573	50 %	50 %	0 %	0 %	479324198
116	NC_021057	TGGTAT	2	12	253924	253935	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479324202
117	NC_021057	CCGGAG	2	12	257574	257585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324206
118	NC_021057	TCGCCA	2	12	260018	260029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479324208
119	NC_021057	CACCGG	2	12	264413	264424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324210
120	NC_021057	GCGGTG	2	12	265418	265429	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479324210
121	NC_021057	TTTGGT	2	12	266404	266415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021057	CTGCTA	2	12	270835	270846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324217
123	NC_021057	TAAAGG	2	12	275264	275275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479324227
124	NC_021057	TTGGCT	2	12	275852	275863	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479324229
125	NC_021057	AGTACC	2	12	279831	279842	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021057	ATAAAA	2	12	281265	281276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479324238
127	NC_021057	TTCAAT	2	12	281315	281326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021057	GTCAGT	2	12	283347	283358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021057	TCAGGC	2	12	284222	284233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324241
130	NC_021057	AGTAAA	2	12	287560	287571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021057	GGTGAC	2	12	290575	290586	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479324247
132	NC_021057	GGATAA	2	12	291064	291075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021057	ACAGTA	2	12	304087	304098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021057	CACGCG	2	12	305883	305894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324255
135	NC_021057	CGCTTG	2	12	306082	306093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479324255
136	NC_021057	CTTTTA	2	12	306547	306558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021057	CCCAGC	2	12	310422	310433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479324260
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140	NC_021057	AAAGGG	2	12	324482	324493	50 %	0 %	50 %	0 %	479324268
141	NC_021057	CTACTT	2	12	324915	324926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479324268
142	NC_021057	TCGATC	2	12	325869	325880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324269
143	NC_021057	AAACCT	2	12	327784	327795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324270
144	NC_021057	GATGCT	2	12	328166	328177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324270
145	NC_021057	GTGATA	2	12	331159	331170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324272
146	NC_021057	GCTCCT	2	12	331175	331186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479324272
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148	NC_021057	CAAGAA	2	12	332610	332621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_021057	ATCGTA	2	12	332930	332941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_021057	GAGGCA	2	12	334938	334949	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479324278
151	NC_021057	GCAAAA	2	12	340937	340948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479324280
152	NC_021057	ATTGGA	2	12	342776	342787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479324282
153	NC_021057	TAAAAT	2	12	343555	343566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479324283
154	NC_021057	GTAAAA	2	12	343634	343645	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479324283
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156	NC_021057	ATTTCA	2	12	345433	345444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_021057	ATGCTA	2	12	347651	347662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_021057	GGTGTA	2	12	350642	350653	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479324285
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160	NC_021057	TATTTA	2	12	358557	358568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021057	CTGATG	2	12	360262	360273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479324292
162	NC_021057	TTAGCA	2	12	360441	360452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479324292
163	NC_021057	AATTTT	2	12	361819	361830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021057	ATTTTT	2	12	364401	364412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479324295
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172	NC_021057	CATTTT	2	12	383460	383471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479324309
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180	NC_021057	CTAGGA	2	12	396846	396857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324320
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182	NC_021057	CGTAGC	2	12	415644	415655	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324335
183	NC_021057	TGACCG	2	12	416778	416789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479324336
184	NC_021057	TGGCAA	2	12	418236	418247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324337
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188	NC_021057	GGCGCT	2	12	422466	422477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479324341
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192	NC_021057	ACCAGT	2	12	434014	434025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479324348
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200	NC_021057	CCATTG	2	12	464525	464536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479324371
201	NC_021057	CGAGCG	2	12	470229	470240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324376
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204	NC_021057	CTATCA	2	12	478554	478565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479324382
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207	NC_021057	CGGCAG	2	12	481155	481166	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479324385
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209	NC_021057	GAAAAC	2	12	486513	486524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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212	NC_021057	GCGTTG	2	12	488988	488999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479324393
213	NC_021057	AAAAAT	2	12	495678	495689	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_021057	ATAGCA	2	12	496267	496278	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479324396
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218	NC_021057	CAGGCC	2	12	508652	508663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479324408
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220	NC_021057	CGCACC	2	12	515824	515835	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
221	NC_021057	CGCCGT	2	12	520927	520938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479324416
222	NC_021057	GCAGAT	2	12	528445	528456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479324425
223	NC_021057	ACTTTA	2	12	532307	532318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479324428
224	NC_021057	TCCCTA	2	12	535359	535370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479324430
225	NC_021057	ATAACC	2	12	536985	536996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	479324430
226	NC_021057	GCAGAA	2	12	537250	537261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479324430

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.