MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 14073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021052	GAA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546029
2	NC_021052	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546029
3	NC_021052	ACA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546029
4	NC_021052	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546029
5	NC_021052	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546029
6	NC_021052	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546029
7	NC_021052	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546029
8	NC_021052	ATG	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546029
9	NC_021052	TTC	2	6	636	641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546029
10	NC_021052	AAG	2	6	695	700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546029
11	NC_021052	GAA	3	9	724	732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546029
12	NC_021052	TGA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546029
13	NC_021052	GGT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546029
14	NC_021052	GCT	2	6	856	861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546029
15	NC_021052	GGT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546029
16	NC_021052	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546029
17	NC_021052	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546029
18	NC_021052	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546029
19	NC_021052	GCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021052	GAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546030
21	NC_021052	TCT	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546030
22	NC_021052	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546030
23	NC_021052	TAA	3	9	1216	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546030
24	NC_021052	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546030
25	NC_021052	TCT	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546030
26	NC_021052	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546030
27	NC_021052	AGG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546030
28	NC_021052	TGT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546030
29	NC_021052	ACA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546030
30	NC_021052	TGA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546030
31	NC_021052	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546030
32	NC_021052	TAA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546030
33	NC_021052	TCT	2	6	1920	1925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546030
34	NC_021052	GAA	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546030
35	NC_021052	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546030
36	NC_021052	GAG	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546030
37	NC_021052	CTT	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546030
38	NC_021052	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546030
39	NC_021052	CAG	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546030
40	NC_021052	AAC	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546030
41	NC_021052	GAG	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546031
42	NC_021052	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546031
43	NC_021052	ATT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546031
44	NC_021052	GTC	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546031
45	NC_021052	AGG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546031
46	NC_021052	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546031
47	NC_021052	TAA	3	9	2920	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021052	ATC	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546032
49	NC_021052	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546032
50	NC_021052	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546032
51	NC_021052	ACA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546032
52	NC_021052	TCA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546032
53	NC_021052	GGT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546032
54	NC_021052	TTG	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546032
55	NC_021052	AAG	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
56	NC_021052	AGC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546032
57	NC_021052	TGG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546032
58	NC_021052	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
59	NC_021052	TGG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546032
60	NC_021052	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546032
61	NC_021052	ATG	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546032
62	NC_021052	AAG	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
63	NC_021052	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546032
64	NC_021052	TCA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546032
65	NC_021052	TTG	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546032
66	NC_021052	TGT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546032
67	NC_021052	AGA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
68	NC_021052	CAA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546032
69	NC_021052	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
70	NC_021052	AGC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546032
71	NC_021052	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
72	NC_021052	TAT	2	6	4586	4591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546032
73	NC_021052	AAG	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
74	NC_021052	AGA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
75	NC_021052	GAA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
76	NC_021052	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546032
77	NC_021052	AGA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
78	NC_021052	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
79	NC_021052	GTT	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546032
80	NC_021052	AAG	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546032
81	NC_021052	TCT	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546032
82	NC_021052	CAA	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021052	TTG	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021052	GAA	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021052	ACA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021052	AGC	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021052	TTA	2	6	5441	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546033
88	NC_021052	AGA	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546033
89	NC_021052	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546033
90	NC_021052	TAT	2	6	5774	5779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546033
91	NC_021052	TTG	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546033
92	NC_021052	ATT	2	6	5936	5941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546033
93	NC_021052	AGA	3	9	6001	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546033
94	NC_021052	TCG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546033
95	NC_021052	TAC	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546033
96	NC_021052	AGA	2	6	6163	6168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546033
97	NC_021052	AGA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546033
98	NC_021052	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546034
99	NC_021052	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546034
100	NC_021052	TTC	2	6	6664	6669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546034
101	NC_021052	TTG	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546034
102	NC_021052	TTG	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546034
103	NC_021052	TGT	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546034
104	NC_021052	GTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546034
105	NC_021052	TGG	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546034
106	NC_021052	TTG	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546034
107	NC_021052	TCA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546034
108	NC_021052	GTG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546034
109	NC_021052	TTC	2	6	7384	7389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546034
110	NC_021052	ACC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546034
111	NC_021052	AGT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546034
112	NC_021052	ATG	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
113	NC_021052	GCT	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546035
114	NC_021052	GAT	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
115	NC_021052	CGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546035
116	NC_021052	CTT	3	9	7835	7843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546035
117	NC_021052	GTA	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
118	NC_021052	GAA	2	6	7909	7914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546035
119	NC_021052	AAT	2	6	7956	7961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546035
120	NC_021052	AAT	2	6	7993	7998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546035
121	NC_021052	TTC	2	6	8019	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546035
122	NC_021052	AGC	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546035
123	NC_021052	AGA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546035
124	NC_021052	AGG	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546035
125	NC_021052	TGA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
126	NC_021052	CTA	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546035
127	NC_021052	ATG	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
128	NC_021052	TAC	2	6	8511	8516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546035
129	NC_021052	CGA	2	6	8583	8588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546035
130	NC_021052	TCA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546035
131	NC_021052	TGA	2	6	8630	8635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
132	NC_021052	AAT	2	6	8734	8739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546035
133	NC_021052	AGA	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546035
134	NC_021052	TCA	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546035
135	NC_021052	TTG	2	6	8922	8927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546035
136	NC_021052	TAG	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546035
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139	NC_021052	TCT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546035
140	NC_021052	GAG	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546035
141	NC_021052	CTT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546035
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145	NC_021052	TGT	2	6	9649	9654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546035
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159	NC_021052	ACC	2	6	10731	10736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546036
160	NC_021052	ACT	2	6	10741	10746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546036
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162	NC_021052	AGG	2	6	10915	10920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546036
163	NC_021052	GGA	2	6	10953	10958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546036
164	NC_021052	CTT	2	6	10965	10970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546036
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240	NC_021052	ATC	2	6	16112	16117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546038
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249	NC_021052	TTC	2	6	16851	16856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_021052	GAA	2	6	16897	16902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_021052	ATC	2	6	30132	30137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546052
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480	NC_021052	TTG	2	6	34424	34429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546058
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482	NC_021052	TCT	2	6	34699	34704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_021052	TTG	2	6	35595	35600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546059
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499	NC_021052	AAT	2	6	36276	36281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546060
500	NC_021052	TCT	3	9	36493	36501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546060

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