MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 22947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021052	TCA	2	6	186552	186557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546180
4002	NC_021052	AGG	2	6	186579	186584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546180
4003	NC_021052	CAG	2	6	186672	186677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546180
4004	NC_021052	TGC	2	6	186746	186751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546180
4005	NC_021052	ATT	2	6	186835	186840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546180
4006	NC_021052	CAGT	2	8	186875	186882	25 %	25 %	25 %	25 %	482546180
4007	NC_021052	TCT	2	6	187071	187076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546180
4008	NC_021052	AGT	2	6	187083	187088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546180
4009	NC_021052	ATC	2	6	187120	187125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546180
4010	NC_021052	ATT	2	6	187168	187173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546180
4011	NC_021052	TTG	2	6	187211	187216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546180
4012	NC_021052	CAAC	2	8	187220	187227	50 %	0 %	0 %	50 %	482546180
4013	NC_021052	AGG	2	6	187308	187313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546180
4014	NC_021052	AAG	2	6	187358	187363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546180
4015	NC_021052	TAG	2	6	187489	187494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546180
4016	NC_021052	TCTA	2	8	187613	187620	25 %	50 %	0 %	25 %	482546181
4017	NC_021052	AT	3	6	187660	187665	50 %	50 %	0 %	0 %	482546181
4018	NC_021052	CTT	2	6	187684	187689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546181
4019	NC_021052	AC	3	6	187699	187704	50 %	0 %	0 %	50 %	482546181
4020	NC_021052	GAA	2	6	187757	187762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546181
4021	NC_021052	TAT	2	6	187771	187776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546181
4022	NC_021052	AGG	2	6	187888	187893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546181
4023	NC_021052	GGAA	2	8	187942	187949	50 %	0 %	50 %	0 %	482546181
4024	NC_021052	AGA	2	6	188018	188023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546181
4025	NC_021052	GA	3	6	188040	188045	50 %	0 %	50 %	0 %	482546181
4026	NC_021052	GTT	2	6	188092	188097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546181
4027	NC_021052	TGA	2	6	188098	188103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546181
4028	NC_021052	GA	3	6	188164	188169	50 %	0 %	50 %	0 %	482546181
4029	NC_021052	GCT	2	6	188209	188214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546181
4030	NC_021052	TCT	2	6	188271	188276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546181
4031	NC_021052	ATA	2	6	188324	188329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546181
4032	NC_021052	GAG	2	6	188471	188476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546181
4033	NC_021052	TCAC	2	8	188518	188525	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_021052	AG	3	6	188568	188573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021052	AGAGC	2	10	188588	188597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4036	NC_021052	ATT	2	6	188637	188642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021052	ATA	2	6	188675	188680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021052	AAT	2	6	188756	188761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021052	TAA	2	6	188764	188769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021052	GT	3	6	188816	188821	0 %	50 %	50 %	0 %	482546182
4041	NC_021052	TTTC	2	8	188918	188925	0 %	75 %	0 %	25 %	482546182
4042	NC_021052	ATT	2	6	189006	189011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546182
4043	NC_021052	AAT	2	6	189017	189022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546182
4044	NC_021052	CGT	2	6	189073	189078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546182
4045	NC_021052	GAT	2	6	189089	189094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546182
4046	NC_021052	TATG	2	8	189125	189132	25 %	50 %	25 %	0 %	482546182
4047	NC_021052	GCTT	2	8	189162	189169	0 %	50 %	25 %	25 %	482546182
4048	NC_021052	AGA	2	6	189205	189210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546182
4049	NC_021052	CAG	2	6	189221	189226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546182
4050	NC_021052	TTG	2	6	189371	189376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546182
4051	NC_021052	TTC	2	6	189389	189394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546182
4052	NC_021052	G	8	8	189508	189515	0 %	0 %	100 %	0 %	482546182
4053	NC_021052	ATA	2	6	189559	189564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546183
4054	NC_021052	A	6	6	189604	189609	100 %	0 %	0 %	0 %	482546183
4055	NC_021052	T	6	6	189623	189628	0 %	100 %	0 %	0 %	482546183
4056	NC_021052	T	6	6	189661	189666	0 %	100 %	0 %	0 %	482546183
4057	NC_021052	ATG	2	6	189768	189773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
4058	NC_021052	CAG	2	6	189781	189786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546183
4059	NC_021052	CTT	2	6	189813	189818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546183
4060	NC_021052	TGA	2	6	189835	189840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
4061	NC_021052	TGGT	2	8	189886	189893	0 %	50 %	50 %	0 %	482546183
4062	NC_021052	GAT	2	6	190061	190066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
4063	NC_021052	ACT	2	6	190172	190177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546183
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4065	NC_021052	TCCT	2	8	190236	190243	0 %	50 %	0 %	50 %	482546183
4066	NC_021052	TGT	2	6	190307	190312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546183
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4068	NC_021052	GAT	2	6	190352	190357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
4069	NC_021052	TGA	2	6	190358	190363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546183
4070	NC_021052	TAT	2	6	190409	190414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546183
4071	NC_021052	TGC	2	6	190418	190423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546183
4072	NC_021052	CTTC	2	8	190443	190450	0 %	50 %	0 %	50 %	482546183
4073	NC_021052	GTT	3	9	190461	190469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546183
4074	NC_021052	GGA	2	6	190470	190475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546183
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4077	NC_021052	GA	3	6	190774	190779	50 %	0 %	50 %	0 %	482546183
4078	NC_021052	GAC	2	6	190840	190845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546183
4079	NC_021052	TAT	3	9	190901	190909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546183
4080	NC_021052	TGC	2	6	190928	190933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546183
4081	NC_021052	ATC	2	6	190936	190941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546183
4082	NC_021052	TGG	2	6	190945	190950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546183
4083	NC_021052	A	6	6	191033	191038	100 %	0 %	0 %	0 %	482546183
4084	NC_021052	ATT	2	6	191150	191155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546183
4085	NC_021052	GAAG	2	8	191210	191217	50 %	0 %	50 %	0 %	482546184
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4087	NC_021052	CG	3	6	191350	191355	0 %	0 %	50 %	50 %	482546184
4088	NC_021052	TTG	2	6	191449	191454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546184
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4090	NC_021052	ATCT	2	8	191539	191546	25 %	50 %	0 %	25 %	482546184
4091	NC_021052	T	7	7	191548	191554	0 %	100 %	0 %	0 %	482546184
4092	NC_021052	ATC	2	6	191593	191598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546184
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4094	NC_021052	TCTGT	2	10	191656	191665	0 %	60 %	20 %	20 %	482546184
4095	NC_021052	TCA	2	6	191717	191722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546184
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4100	NC_021052	AAG	2	6	191989	191994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546184
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4102	NC_021052	A	6	6	192043	192048	100 %	0 %	0 %	0 %	482546184
4103	NC_021052	GCA	2	6	192057	192062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546184
4104	NC_021052	CT	4	8	192081	192088	0 %	50 %	0 %	50 %	482546184
4105	NC_021052	TCC	2	6	192158	192163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546184
4106	NC_021052	AAG	2	6	192211	192216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546184
4107	NC_021052	TTGC	2	8	192234	192241	0 %	50 %	25 %	25 %	482546184
4108	NC_021052	AGA	2	6	192262	192267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546184
4109	NC_021052	CAA	2	6	192289	192294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546184
4110	NC_021052	AG	3	6	192441	192446	50 %	0 %	50 %	0 %	482546185
4111	NC_021052	GT	4	8	192475	192482	0 %	50 %	50 %	0 %	482546185
4112	NC_021052	GGA	2	6	192555	192560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546185
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4115	NC_021052	AT	3	6	192756	192761	50 %	50 %	0 %	0 %	482546185
4116	NC_021052	TG	3	6	192831	192836	0 %	50 %	50 %	0 %	482546185
4117	NC_021052	CAT	2	6	192883	192888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546185
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4121	NC_021052	ATG	2	6	193141	193146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546185
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4123	NC_021052	GAA	2	6	193181	193186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546185
4124	NC_021052	AAT	2	6	193187	193192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546185
4125	NC_021052	GA	3	6	193243	193248	50 %	0 %	50 %	0 %	482546185
4126	NC_021052	T	6	6	193267	193272	0 %	100 %	0 %	0 %	482546185
4127	NC_021052	AAGA	2	8	193295	193302	75 %	0 %	25 %	0 %	482546185
4128	NC_021052	TAG	2	6	193306	193311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546185
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4132	NC_021052	ATG	2	6	193572	193577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546185
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4233	NC_021052	GACATA	2	12	198402	198413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482546189
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4240	NC_021052	A	7	7	198767	198773	100 %	0 %	0 %	0 %	482546189
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4243	NC_021052	TCA	2	6	198862	198867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546189
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4247	NC_021052	AAAT	2	8	199046	199053	75 %	25 %	0 %	0 %	482546189
4248	NC_021052	ATCC	2	8	199104	199111	25 %	25 %	0 %	50 %	482546189
4249	NC_021052	AG	3	6	199234	199239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_021052	A	7	7	199261	199267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_021052	GCT	2	6	199294	199299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4283	NC_021052	TAG	2	6	201147	201152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_021052	TTAAA	2	10	204332	204341	60 %	40 %	0 %	0 %	482546198
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4499	NC_021052	TGGGG	2	10	210358	210367	0 %	20 %	80 %	0 %	482546202
4500	NC_021052	TTC	2	6	210485	210490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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