MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 22947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021052	CGAA	2	8	67964	67971	50 %	0 %	25 %	25 %	482546086
1502	NC_021052	GCT	2	6	68052	68057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546086
1503	NC_021052	CAT	2	6	68118	68123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546086
1504	NC_021052	GA	3	6	68131	68136	50 %	0 %	50 %	0 %	482546086
1505	NC_021052	GAGG	2	8	68190	68197	25 %	0 %	75 %	0 %	482546086
1506	NC_021052	TTA	2	6	68256	68261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546086
1507	NC_021052	A	6	6	68500	68505	100 %	0 %	0 %	0 %	482546087
1508	NC_021052	GT	3	6	68580	68585	0 %	50 %	50 %	0 %	482546087
1509	NC_021052	TTC	2	6	68613	68618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546087
1510	NC_021052	A	7	7	68889	68895	100 %	0 %	0 %	0 %	482546087
1511	NC_021052	GAT	2	6	68905	68910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546087
1512	NC_021052	TTC	2	6	69005	69010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546087
1513	NC_021052	A	6	6	69181	69186	100 %	0 %	0 %	0 %	482546087
1514	NC_021052	TCC	2	6	69204	69209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546087
1515	NC_021052	AGG	3	9	69216	69224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546087
1516	NC_021052	ATTAGG	2	12	69315	69326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546087
1517	NC_021052	GCG	2	6	69328	69333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546087
1518	NC_021052	ATT	2	6	69338	69343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546087
1519	NC_021052	AGC	2	6	69404	69409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546087
1520	NC_021052	GTA	2	6	69473	69478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546087
1521	NC_021052	T	6	6	69513	69518	0 %	100 %	0 %	0 %	482546087
1522	NC_021052	CAGC	2	8	69565	69572	25 %	0 %	25 %	50 %	482546087
1523	NC_021052	TTC	2	6	69641	69646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546087
1524	NC_021052	TCGT	2	8	69684	69691	0 %	50 %	25 %	25 %	482546087
1525	NC_021052	AG	3	6	69710	69715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021052	CTGT	2	8	69783	69790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_021052	TTCT	2	8	69941	69948	0 %	75 %	0 %	25 %	482546088
1528	NC_021052	TCC	2	6	69972	69977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546088
1529	NC_021052	TAT	2	6	70015	70020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546088
1530	NC_021052	CGT	2	6	70039	70044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546088
1531	NC_021052	GC	3	6	70047	70052	0 %	0 %	50 %	50 %	482546088
1532	NC_021052	TGT	2	6	70083	70088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546088
1533	NC_021052	TGA	2	6	70107	70112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546088
1534	NC_021052	GCA	2	6	70117	70122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546088
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1536	NC_021052	A	6	6	70234	70239	100 %	0 %	0 %	0 %	482546088
1537	NC_021052	GAA	2	6	70245	70250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546088
1538	NC_021052	TC	3	6	70283	70288	0 %	50 %	0 %	50 %	482546088
1539	NC_021052	A	6	6	70307	70312	100 %	0 %	0 %	0 %	482546088
1540	NC_021052	GA	3	6	70322	70327	50 %	0 %	50 %	0 %	482546088
1541	NC_021052	CTT	2	6	70469	70474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546088
1542	NC_021052	AGA	2	6	70479	70484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546088
1543	NC_021052	TTC	2	6	70488	70493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546088
1544	NC_021052	CTT	2	6	70499	70504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546088
1545	NC_021052	CAA	2	6	70535	70540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546088
1546	NC_021052	T	6	6	70594	70599	0 %	100 %	0 %	0 %	482546088
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1548	NC_021052	TCT	3	9	70648	70656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546088
1549	NC_021052	CTTAA	2	10	70665	70674	40 %	40 %	0 %	20 %	482546088
1550	NC_021052	CGG	2	6	70691	70696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546089
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1552	NC_021052	GT	3	6	70737	70742	0 %	50 %	50 %	0 %	482546089
1553	NC_021052	TGC	2	6	70748	70753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546089
1554	NC_021052	TTC	2	6	70768	70773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546089
1555	NC_021052	GAC	2	6	70837	70842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546089
1556	NC_021052	AAAT	2	8	70857	70864	75 %	25 %	0 %	0 %	482546089
1557	NC_021052	TTG	2	6	70882	70887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546089
1558	NC_021052	ATAG	2	8	70925	70932	50 %	25 %	25 %	0 %	482546089
1559	NC_021052	TCA	2	6	70952	70957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546089
1560	NC_021052	AG	3	6	71059	71064	50 %	0 %	50 %	0 %	482546089
1561	NC_021052	CCA	2	6	71067	71072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546089
1562	NC_021052	TTC	2	6	71104	71109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546089
1563	NC_021052	GAT	2	6	71124	71129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546089
1564	NC_021052	CCTT	2	8	71230	71237	0 %	50 %	0 %	50 %	482546089
1565	NC_021052	T	6	6	71236	71241	0 %	100 %	0 %	0 %	482546089
1566	NC_021052	AGT	2	6	71323	71328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546089
1567	NC_021052	GTA	2	6	71405	71410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546089
1568	NC_021052	T	6	6	71416	71421	0 %	100 %	0 %	0 %	482546089
1569	NC_021052	TAA	2	6	71447	71452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546089
1570	NC_021052	GCTT	2	8	71467	71474	0 %	50 %	25 %	25 %	482546089
1571	NC_021052	GGA	2	6	71475	71480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546089
1572	NC_021052	ATT	2	6	71488	71493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546089
1573	NC_021052	GAT	3	9	71515	71523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546090
1574	NC_021052	GAG	2	6	71584	71589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546090
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1584	NC_021052	TTG	2	6	72113	72118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546090
1585	NC_021052	GAG	2	6	72218	72223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546090
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1592	NC_021052	A	7	7	72507	72513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021052	A	6	6	72515	72520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021052	AT	5	10	72551	72560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021052	AGG	2	6	72563	72568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021052	A	6	6	72602	72607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021052	TTC	2	6	72683	72688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546091
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1599	NC_021052	TTC	2	6	72770	72775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546091
1600	NC_021052	AAG	2	6	72812	72817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546091
1601	NC_021052	TTC	2	6	72838	72843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546091
1602	NC_021052	CG	3	6	72850	72855	0 %	0 %	50 %	50 %	482546091
1603	NC_021052	TTG	2	6	72921	72926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546091
1604	NC_021052	GAG	2	6	72960	72965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546091
1605	NC_021052	TTC	2	6	72969	72974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546091
1606	NC_021052	GA	3	6	73027	73032	50 %	0 %	50 %	0 %	482546091
1607	NC_021052	TCT	2	6	73050	73055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546091
1608	NC_021052	AGTG	2	8	73091	73098	25 %	25 %	50 %	0 %	482546091
1609	NC_021052	TTC	2	6	73155	73160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546091
1610	NC_021052	ATT	2	6	73209	73214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546091
1611	NC_021052	TAA	2	6	73235	73240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546091
1612	NC_021052	GAGT	2	8	73261	73268	25 %	25 %	50 %	0 %	482546091
1613	NC_021052	AGA	2	6	73277	73282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546091
1614	NC_021052	TGC	2	6	73299	73304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546092
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1616	NC_021052	AAGC	2	8	73409	73416	50 %	0 %	25 %	25 %	482546092
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1622	NC_021052	GGA	2	6	73736	73741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546092
1623	NC_021052	TCT	2	6	73758	73763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546092
1624	NC_021052	TA	3	6	73785	73790	50 %	50 %	0 %	0 %	482546092
1625	NC_021052	ATT	2	6	73844	73849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546092
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1628	NC_021052	T	6	6	73948	73953	0 %	100 %	0 %	0 %	482546092
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1650	NC_021052	TTC	2	6	74628	74633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1752	NC_021052	AAGA	2	8	79671	79678	75 %	0 %	25 %	0 %	482546097
1753	NC_021052	AC	3	6	79688	79693	50 %	0 %	0 %	50 %	482546097
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