MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 22947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021052	TCA	2	6	637601	637606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546588
14002	NC_021052	TGA	2	6	637608	637613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14003	NC_021052	TGC	2	6	637623	637628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546588
14004	NC_021052	CT	3	6	637636	637641	0 %	50 %	0 %	50 %	482546588
14005	NC_021052	TTC	2	6	637664	637669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546588
14006	NC_021052	A	6	6	637769	637774	100 %	0 %	0 %	0 %	482546588
14007	NC_021052	GCT	2	6	637822	637827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546588
14008	NC_021052	TGA	2	6	637836	637841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14009	NC_021052	AGA	2	6	637844	637849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14010	NC_021052	ACA	2	6	637878	637883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546588
14011	NC_021052	GAA	2	6	637900	637905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14012	NC_021052	TGA	2	6	637920	637925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14013	NC_021052	AGT	2	6	637941	637946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14014	NC_021052	AAAG	2	8	638028	638035	75 %	0 %	25 %	0 %	482546588
14015	NC_021052	CGT	2	6	638080	638085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546588
14016	NC_021052	TCCT	2	8	638125	638132	0 %	50 %	0 %	50 %	482546588
14017	NC_021052	GCA	2	6	638172	638177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546588
14018	NC_021052	GGA	2	6	638197	638202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546588
14019	NC_021052	GAT	2	6	638262	638267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14020	NC_021052	TCC	2	6	638274	638279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546588
14021	NC_021052	CGC	2	6	638329	638334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482546588
14022	NC_021052	TGTGT	2	10	638341	638350	0 %	60 %	40 %	0 %	482546588
14023	NC_021052	TGA	2	6	638355	638360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14024	NC_021052	CAT	3	9	638463	638471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546588
14025	NC_021052	GTG	2	6	638510	638515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546588
14026	NC_021052	TGC	2	6	638574	638579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546588
14027	NC_021052	AAG	2	6	638584	638589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14028	NC_021052	AAG	2	6	638651	638656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14029	NC_021052	TAA	2	6	638685	638690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546588
14030	NC_021052	GGA	2	6	638823	638828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546588
14031	NC_021052	AAG	2	6	638867	638872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14032	NC_021052	CG	4	8	638884	638891	0 %	0 %	50 %	50 %	482546588
14033	NC_021052	AGA	2	6	638898	638903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14034	NC_021052	GTT	2	6	638908	638913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546588
14035	NC_021052	AGA	3	9	638922	638930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546588
14036	NC_021052	TGA	2	6	638982	638987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546588
14037	NC_021052	CTC	3	9	639007	639015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546589
14038	NC_021052	TAAAG	2	10	639228	639237	60 %	20 %	20 %	0 %	482546589
14039	NC_021052	GAT	2	6	639238	639243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546589
14040	NC_021052	TCC	2	6	639314	639319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546589
14041	NC_021052	TAA	2	6	639351	639356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546589
14042	NC_021052	TGT	2	6	639384	639389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546589
14043	NC_021052	AAT	2	6	639401	639406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546589
14044	NC_021052	T	7	7	639488	639494	0 %	100 %	0 %	0 %	482546589
14045	NC_021052	CTT	2	6	639514	639519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546589
14046	NC_021052	CTC	2	6	639664	639669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546589
14047	NC_021052	AAT	2	6	639673	639678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546589
14048	NC_021052	A	6	6	639690	639695	100 %	0 %	0 %	0 %	482546589
14049	NC_021052	CTT	2	6	639716	639721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546589
14050	NC_021052	TAA	2	6	639725	639730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546589
14051	NC_021052	ATGGA	2	10	639853	639862	40 %	20 %	40 %	0 %	482546589
14052	NC_021052	CAA	2	6	639958	639963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546589
14053	NC_021052	CTT	2	6	639980	639985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546589
14054	NC_021052	CAA	2	6	639997	640002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546589
14055	NC_021052	CTC	2	6	640015	640020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546589
14056	NC_021052	CAA	2	6	640030	640035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546589
14057	NC_021052	CAT	2	6	640104	640109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_021052	A	7	7	640116	640122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_021052	A	7	7	640130	640136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_021052	GCC	2	6	640149	640154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_021052	AATT	2	8	640183	640190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_021052	A	6	6	640200	640205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_021052	TTG	2	6	640221	640226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_021052	A	7	7	640228	640234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_021052	ATA	2	6	640251	640256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_021052	TCA	2	6	640300	640305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546590
14067	NC_021052	GAG	2	6	640461	640466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546590
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14069	NC_021052	TGC	2	6	640498	640503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546590
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14072	NC_021052	AAAACA	2	12	640567	640578	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	482546590
14073	NC_021052	A	8	8	640722	640729	100 %	0 %	0 %	0 %	482546590
14074	NC_021052	AAG	2	6	640737	640742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546590
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14076	NC_021052	GAG	2	6	640845	640850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546590
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14080	NC_021052	TA	3	6	641001	641006	50 %	50 %	0 %	0 %	482546590
14081	NC_021052	GTC	2	6	641060	641065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546590
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14088	NC_021052	TAA	2	6	641404	641409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546590
14089	NC_021052	ACA	2	6	641416	641421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546590
14090	NC_021052	CTTA	2	8	641457	641464	25 %	50 %	0 %	25 %	482546590
14091	NC_021052	TAA	2	6	641476	641481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546590
14092	NC_021052	CGA	2	6	641482	641487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546590
14093	NC_021052	TAAA	2	8	641559	641566	75 %	25 %	0 %	0 %	482546590
14094	NC_021052	ACG	2	6	641587	641592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546590
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14100	NC_021052	GGC	2	6	641809	641814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546590
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14102	NC_021052	AC	3	6	641909	641914	50 %	0 %	0 %	50 %	482546590
14103	NC_021052	CT	3	6	641930	641935	0 %	50 %	0 %	50 %	482546590
14104	NC_021052	ACA	2	6	641941	641946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546590
14105	NC_021052	TTC	2	6	641981	641986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_021052	AAAAAG	2	12	641996	642007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_021052	CCT	4	12	642080	642091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546591
14108	NC_021052	GAG	2	6	642098	642103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546591
14109	NC_021052	ACC	2	6	642170	642175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546591
14110	NC_021052	TACA	2	8	642180	642187	50 %	25 %	0 %	25 %	482546591
14111	NC_021052	AAG	2	6	642222	642227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546591
14112	NC_021052	GAA	2	6	642248	642253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546591
14113	NC_021052	TGA	2	6	642266	642271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546591
14114	NC_021052	TAT	2	6	642297	642302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546591
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14116	NC_021052	TCA	2	6	642389	642394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546591
14117	NC_021052	CAT	2	6	642510	642515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546591
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14119	NC_021052	TCT	2	6	642638	642643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546591
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14121	NC_021052	TGC	2	6	642673	642678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546591
14122	NC_021052	TTC	2	6	642694	642699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546591
14123	NC_021052	CTTT	2	8	642742	642749	0 %	75 %	0 %	25 %	482546591
14124	NC_021052	ATC	2	6	642751	642756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546591
14125	NC_021052	TTCT	2	8	642787	642794	0 %	75 %	0 %	25 %	482546591
14126	NC_021052	GTT	2	6	642803	642808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546591
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14128	NC_021052	ACT	2	6	642833	642838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546591
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14130	NC_021052	GCT	2	6	642885	642890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546591
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14133	NC_021052	T	7	7	642984	642990	0 %	100 %	0 %	0 %	482546591
14134	NC_021052	T	6	6	642997	643002	0 %	100 %	0 %	0 %	482546591
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14137	NC_021052	T	7	7	643251	643257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14138	NC_021052	AAGA	2	8	643333	643340	75 %	0 %	25 %	0 %	482546592
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14146	NC_021052	T	6	6	643685	643690	0 %	100 %	0 %	0 %	482546592
14147	NC_021052	CCCCT	2	10	643695	643704	0 %	20 %	0 %	80 %	482546592
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14154	NC_021052	CTT	2	6	643973	643978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546593
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14168	NC_021052	GAAC	2	8	644678	644685	50 %	0 %	25 %	25 %	482546594
14169	NC_021052	CT	3	6	644739	644744	0 %	50 %	0 %	50 %	482546594
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14244	NC_021052	CAG	2	6	647844	647849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546597
14245	NC_021052	TCC	2	6	647911	647916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546597
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14248	NC_021052	TCT	2	6	648144	648149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546597
14249	NC_021052	CT	3	6	648289	648294	0 %	50 %	0 %	50 %	482546597
14250	NC_021052	ACA	2	6	648347	648352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546597
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14252	NC_021052	TTAG	2	8	648581	648588	25 %	50 %	25 %	0 %	482546598
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14262	NC_021052	CCT	2	6	648919	648924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546598
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14264	NC_021052	A	6	6	649146	649151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14265	NC_021052	GCA	2	6	649159	649164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546599
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14282	NC_021052	A	7	7	649789	649795	100 %	0 %	0 %	0 %	482546599
14283	NC_021052	TGC	2	6	649810	649815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546599
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14332	NC_021052	TTAA	2	8	651914	651921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14333	NC_021052	T	6	6	651977	651982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14334	NC_021052	CTG	2	6	652031	652036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14335	NC_021052	TAC	2	6	652071	652076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14336	NC_021052	TAA	2	6	652117	652122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14337	NC_021052	CTC	2	6	652123	652128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14338	NC_021052	GCAAC	2	10	652137	652146	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14339	NC_021052	GAA	2	6	652172	652177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14340	NC_021052	CTTGT	2	10	652197	652206	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14341	NC_021052	C	6	6	652244	652249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14342	NC_021052	CAGT	2	8	652259	652266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14343	NC_021052	TCA	2	6	652316	652321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546602
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14346	NC_021052	C	7	7	652367	652373	0 %	0 %	0 %	100 %	482546602
14347	NC_021052	A	6	6	652374	652379	100 %	0 %	0 %	0 %	482546602
14348	NC_021052	TGG	2	6	652381	652386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546602
14349	NC_021052	TTGT	2	8	652400	652407	0 %	75 %	25 %	0 %	482546602
14350	NC_021052	CTG	2	6	652415	652420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546602
14351	NC_021052	ATT	2	6	652470	652475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546602
14352	NC_021052	GCA	2	6	652487	652492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546602
14353	NC_021052	GCT	2	6	652532	652537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546602
14354	NC_021052	GTT	2	6	652544	652549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546602
14355	NC_021052	CTG	2	6	652612	652617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546602
14356	NC_021052	TCA	2	6	652627	652632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546602
14357	NC_021052	CCTTT	2	10	652656	652665	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14358	NC_021052	T	7	7	652693	652699	0 %	100 %	0 %	0 %	482546603
14359	NC_021052	A	7	7	652704	652710	100 %	0 %	0 %	0 %	482546603
14360	NC_021052	GAA	3	9	652778	652786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546603
14361	NC_021052	TCT	2	6	652811	652816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546603
14362	NC_021052	CCA	2	6	652818	652823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546603
14363	NC_021052	AAT	2	6	652838	652843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546603
14364	NC_021052	AT	3	6	652847	652852	50 %	50 %	0 %	0 %	482546603
14365	NC_021052	CA	3	6	652860	652865	50 %	0 %	0 %	50 %	482546603
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14367	NC_021052	TAT	2	6	653070	653075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546603
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