MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 22947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021052	GGT	2	6	21150	21155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546042
502	NC_021052	TTTC	2	8	21212	21219	0 %	75 %	0 %	25 %	482546042
503	NC_021052	CTT	2	6	21276	21281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546042
504	NC_021052	T	6	6	21298	21303	0 %	100 %	0 %	0 %	482546042
505	NC_021052	AAG	2	6	21324	21329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
506	NC_021052	GCA	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546042
507	NC_021052	GTA	2	6	21404	21409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546042
508	NC_021052	CT	3	6	21453	21458	0 %	50 %	0 %	50 %	482546042
509	NC_021052	GGA	2	6	21460	21465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546042
510	NC_021052	G	6	6	21469	21474	0 %	0 %	100 %	0 %	482546042
511	NC_021052	TCT	2	6	21532	21537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546042
512	NC_021052	T	6	6	21556	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	482546042
513	NC_021052	TGA	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546042
514	NC_021052	AAG	2	6	21603	21608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
515	NC_021052	TTA	2	6	21653	21658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546042
516	NC_021052	CTT	2	6	21672	21677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546042
517	NC_021052	AAG	2	6	21690	21695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
518	NC_021052	TATC	2	8	21731	21738	25 %	50 %	0 %	25 %	482546042
519	NC_021052	ATC	2	6	21785	21790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546042
520	NC_021052	CT	3	6	21809	21814	0 %	50 %	0 %	50 %	482546042
521	NC_021052	AAG	2	6	21822	21827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
522	NC_021052	TC	3	6	21906	21911	0 %	50 %	0 %	50 %	482546042
523	NC_021052	A	7	7	21935	21941	100 %	0 %	0 %	0 %	482546042
524	NC_021052	GC	3	6	21975	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	482546042
525	NC_021052	AG	3	6	22046	22051	50 %	0 %	50 %	0 %	482546042
526	NC_021052	TCGG	2	8	22084	22091	0 %	25 %	50 %	25 %	482546042
527	NC_021052	CAG	2	6	22094	22099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546042
528	NC_021052	AAG	2	6	22107	22112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
529	NC_021052	AAG	2	6	22170	22175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
530	NC_021052	ATT	2	6	22230	22235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546042
531	NC_021052	AGA	2	6	22246	22251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546042
532	NC_021052	TTCC	2	8	22254	22261	0 %	50 %	0 %	50 %	482546042
533	NC_021052	GAG	2	6	22262	22267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546042
534	NC_021052	ATG	2	6	22317	22322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546042
535	NC_021052	TTCT	2	8	22374	22381	0 %	75 %	0 %	25 %	482546042
536	NC_021052	AGGG	2	8	22426	22433	25 %	0 %	75 %	0 %	482546042
537	NC_021052	GCT	2	6	22483	22488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546043
538	NC_021052	CAG	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546043
539	NC_021052	GA	3	6	22563	22568	50 %	0 %	50 %	0 %	482546043
540	NC_021052	TCT	2	6	22591	22596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546043
541	NC_021052	AGC	2	6	22626	22631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546043
542	NC_021052	GA	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	482546043
543	NC_021052	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546043
544	NC_021052	AGA	2	6	22776	22781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546043
545	NC_021052	GA	3	6	22814	22819	50 %	0 %	50 %	0 %	482546043
546	NC_021052	GTT	2	6	22827	22832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546043
547	NC_021052	TAT	2	6	22877	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546043
548	NC_021052	TCTT	2	8	22926	22933	0 %	75 %	0 %	25 %	482546043
549	NC_021052	TCA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546043
550	NC_021052	TG	3	6	23008	23013	0 %	50 %	50 %	0 %	482546043
551	NC_021052	TC	4	8	23183	23190	0 %	50 %	0 %	50 %	482546044
552	NC_021052	TACA	2	8	23216	23223	50 %	25 %	0 %	25 %	482546044
553	NC_021052	GCA	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546044
554	NC_021052	ACG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546044
555	NC_021052	AAT	2	6	23304	23309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546044
556	NC_021052	GTT	2	6	23417	23422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546044
557	NC_021052	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546044
558	NC_021052	GGAA	2	8	23536	23543	50 %	0 %	50 %	0 %	482546044
559	NC_021052	GAA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
560	NC_021052	AAAC	2	8	23613	23620	75 %	0 %	0 %	25 %	482546044
561	NC_021052	TTG	2	6	23679	23684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546044
562	NC_021052	AGA	3	9	23687	23695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
563	NC_021052	GAA	2	6	23748	23753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
564	NC_021052	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546044
565	NC_021052	GAA	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546044
566	NC_021052	TTA	2	6	23967	23972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546044
567	NC_021052	TCT	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546044
568	NC_021052	AGG	2	6	24227	24232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546044
569	NC_021052	AAAG	2	8	24239	24246	75 %	0 %	25 %	0 %	482546044
570	NC_021052	GTT	2	6	24309	24314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546045
571	NC_021052	CGA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
572	NC_021052	AGC	2	6	24342	24347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
573	NC_021052	AGC	2	6	24370	24375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
574	NC_021052	CTC	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546045
575	NC_021052	GGAT	2	8	24519	24526	25 %	25 %	50 %	0 %	482546045
576	NC_021052	AG	3	6	24559	24564	50 %	0 %	50 %	0 %	482546045
577	NC_021052	CTA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546045
578	NC_021052	T	6	6	24703	24708	0 %	100 %	0 %	0 %	482546045
579	NC_021052	AGC	2	6	24753	24758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546045
580	NC_021052	ATG	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546045
581	NC_021052	CTCC	2	8	24844	24851	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
582	NC_021052	TCTGCA	2	12	24857	24868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021052	T	8	8	24872	24879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021052	A	6	6	24881	24886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021052	AG	3	6	24913	24918	50 %	0 %	50 %	0 %	482546046
586	NC_021052	A	7	7	24936	24942	100 %	0 %	0 %	0 %	482546046
587	NC_021052	T	7	7	24951	24957	0 %	100 %	0 %	0 %	482546046
588	NC_021052	TGT	2	6	24976	24981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546046
589	NC_021052	TCT	2	6	25050	25055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546046
590	NC_021052	CAA	2	6	25064	25069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546046
591	NC_021052	CCGA	2	8	25090	25097	25 %	0 %	25 %	50 %	482546047
592	NC_021052	TTC	2	6	25175	25180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546047
593	NC_021052	GAA	2	6	25258	25263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546047
594	NC_021052	AAC	2	6	25298	25303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546047
595	NC_021052	GGC	2	6	25349	25354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546047
596	NC_021052	TGC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546047
597	NC_021052	TGTGAT	2	12	25499	25510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	482546047
598	NC_021052	AGC	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546047
599	NC_021052	ATG	2	6	25590	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546047
600	NC_021052	GGA	2	6	25713	25718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546047
601	NC_021052	TTC	2	6	25736	25741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546047
602	NC_021052	TCG	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546047
603	NC_021052	GAG	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546047
604	NC_021052	A	6	6	25826	25831	100 %	0 %	0 %	0 %	482546047
605	NC_021052	CTC	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546047
606	NC_021052	TTC	2	6	25889	25894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546047
607	NC_021052	A	7	7	25924	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	482546047
608	NC_021052	TAT	2	6	25931	25936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546047
609	NC_021052	GTT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546047
610	NC_021052	AAG	2	6	26172	26177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546048
611	NC_021052	TCT	2	6	26182	26187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546048
612	NC_021052	TTTCT	2	10	26200	26209	0 %	80 %	0 %	20 %	482546048
613	NC_021052	TGT	2	6	26220	26225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546048
614	NC_021052	T	6	6	26300	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	482546048
615	NC_021052	CTT	2	6	26337	26342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021052	CGAG	2	8	26408	26415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
617	NC_021052	T	7	7	26493	26499	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
618	NC_021052	GA	3	6	26504	26509	50 %	0 %	50 %	0 %	482546049
619	NC_021052	AG	3	6	26559	26564	50 %	0 %	50 %	0 %	482546049
620	NC_021052	TGT	2	6	26619	26624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546049
621	NC_021052	AAAG	2	8	26647	26654	75 %	0 %	25 %	0 %	482546049
622	NC_021052	T	6	6	26674	26679	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
623	NC_021052	TTTTG	2	10	26711	26720	0 %	80 %	20 %	0 %	482546049
624	NC_021052	GTT	2	6	26729	26734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546049
625	NC_021052	T	6	6	26759	26764	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
626	NC_021052	T	6	6	26838	26843	0 %	100 %	0 %	0 %	482546049
627	NC_021052	GGT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546049
628	NC_021052	AGA	2	6	26981	26986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546049
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