MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i) plasmid pL2/434/Bu(i)

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021051	TAT	2	6	22	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021051	GTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021051	ATG	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021051	AGA	2	6	253	258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021051	GTT	2	6	344	349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021051	TCC	2	6	358	363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021051	AAT	2	6	530	535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545079
8	NC_021051	TTG	2	6	553	558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545079
9	NC_021051	TAA	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545079
10	NC_021051	TAA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545080
11	NC_021051	TGA	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545080
12	NC_021051	AAC	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545080
13	NC_021051	GCC	2	6	1063	1068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482545080
14	NC_021051	AAT	2	6	1084	1089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545080
15	NC_021051	CTG	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545080
16	NC_021051	TCC	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545080
17	NC_021051	TAA	2	6	1162	1167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545080
18	NC_021051	TTA	2	6	1211	1216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545080
19	NC_021051	GTT	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545080
20	NC_021051	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545080
21	NC_021051	TGT	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545080
22	NC_021051	CAA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545080
23	NC_021051	CCA	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545080
24	NC_021051	ATT	2	6	1414	1419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545080
25	NC_021051	TGT	2	6	1477	1482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545080
26	NC_021051	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545080
27	NC_021051	TTC	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545081
28	NC_021051	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545081
29	NC_021051	TCT	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545081
30	NC_021051	GCT	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545081
31	NC_021051	TTC	2	6	2189	2194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545081
32	NC_021051	CTA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545081
33	NC_021051	CTT	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545081
34	NC_021051	AAC	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545081
35	NC_021051	GCT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545081
36	NC_021051	TCT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545081
37	NC_021051	TGA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545081
38	NC_021051	AGA	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545082
39	NC_021051	TCT	2	6	3089	3094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545082
40	NC_021051	CTT	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545082
41	NC_021051	AAT	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545082
42	NC_021051	TCT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545082
43	NC_021051	AAT	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545082
44	NC_021051	CAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545082
45	NC_021051	GCT	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545082
46	NC_021051	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545082
47	NC_021051	TTC	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545082
48	NC_021051	ATC	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545082
49	NC_021051	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545082
50	NC_021051	ACG	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545082
51	NC_021051	ATG	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545082
52	NC_021051	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545082
53	NC_021051	AAC	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021051	ATT	2	6	4114	4119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021051	GCA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545083
56	NC_021051	TTA	2	6	4297	4302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545083
57	NC_021051	CAA	2	6	4322	4327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545083
58	NC_021051	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545083
59	NC_021051	AGC	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545083
60	NC_021051	AGG	2	6	4721	4726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545083
61	NC_021051	CTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545083
62	NC_021051	CAA	2	6	4776	4781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545083
63	NC_021051	ATT	2	6	4830	4835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545083
64	NC_021051	TGG	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545083
65	NC_021051	GAT	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545083
66	NC_021051	TCT	2	6	5115	5120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545083
67	NC_021051	AGA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545083
68	NC_021051	TTG	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545084
69	NC_021051	CTC	2	6	5503	5508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545084
70	NC_021051	AAC	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545084
71	NC_021051	CAA	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021051	ACC	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_021051	ACC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021051	ACC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021051	ACC	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021051	GGA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021051	TGT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545085
78	NC_021051	AGA	2	6	6395	6400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545085
79	NC_021051	AGG	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545085
80	NC_021051	ATG	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545085
81	NC_021051	TTC	2	6	6479	6484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545085
82	NC_021051	AGA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545085
83	NC_021051	GTT	2	6	6782	6787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545085
84	NC_021051	GAG	2	6	6788	6793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545085
85	NC_021051	AAG	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545085
86	NC_021051	TCT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545085
87	NC_021051	TTC	2	6	6922	6927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545085
88	NC_021051	AAT	2	6	6956	6961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545085
89	NC_021051	TCT	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545085
90	NC_021051	AAG	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545085
91	NC_021051	CTT	2	6	7080	7085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545085
92	NC_021051	TCT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021051	TCT	2	6	7219	7224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021051	AAG	2	6	7227	7232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021051	CGA	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021051	ATC	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021051	TTC	3	9	7371	7379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021051	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021051	CTT	2	6	7484	7489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.