MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(i)

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021050	CTA	2	6	139077	139082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_021050	TCT	2	6	139083	139088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021050	CTG	2	6	139221	139226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_021050	ATGT	2	8	139241	139248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021050	AAG	2	6	139300	139305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021050	TTA	2	6	139357	139362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021050	GAAA	2	8	139375	139382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021050	GAA	2	6	139394	139399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021050	TGT	2	6	139401	139406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021050	CTT	2	6	139415	139420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_021050	GAA	2	6	139430	139435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021050	ATC	2	6	139469	139474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545202
3013	NC_021050	AGA	2	6	139484	139489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545202
3014	NC_021050	CTA	2	6	139527	139532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545202
3015	NC_021050	TCT	2	6	139569	139574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545202
3016	NC_021050	GA	4	8	139684	139691	50 %	0 %	50 %	0 %	482545202
3017	NC_021050	TTCT	2	8	139718	139725	0 %	75 %	0 %	25 %	482545202
3018	NC_021050	CTT	2	6	139741	139746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545202
3019	NC_021050	CTT	2	6	139836	139841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545202
3020	NC_021050	AGA	2	6	139847	139852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545202
3021	NC_021050	CCT	2	6	139860	139865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545202
3022	NC_021050	GTT	2	6	139886	139891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545202
3023	NC_021050	AG	3	6	139950	139955	50 %	0 %	50 %	0 %	482545202
3024	NC_021050	AT	3	6	139957	139962	50 %	50 %	0 %	0 %	482545202
3025	NC_021050	GGTCG	2	10	139988	139997	0 %	20 %	60 %	20 %	482545202
3026	NC_021050	AAG	2	6	140014	140019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545202
3027	NC_021050	CTG	2	6	140059	140064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545202
3028	NC_021050	AAG	2	6	140068	140073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545202
3029	NC_021050	AGAT	2	8	140111	140118	50 %	25 %	25 %	0 %	482545202
3030	NC_021050	AGG	2	6	140213	140218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545202
3031	NC_021050	AGAA	2	8	140276	140283	75 %	0 %	25 %	0 %	482545202
3032	NC_021050	ACA	2	6	140322	140327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545202
3033	NC_021050	AAG	3	9	140338	140346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545202
3034	NC_021050	TCT	2	6	140361	140366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545202
3035	NC_021050	TGC	2	6	140430	140435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545202
3036	NC_021050	TCA	2	6	140469	140474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545202
3037	NC_021050	AGC	2	6	140510	140515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545202
3038	NC_021050	TAA	2	6	140555	140560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545202
3039	NC_021050	ATC	2	6	140606	140611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545202
3040	NC_021050	ATT	2	6	140612	140617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545202
3041	NC_021050	TAA	2	6	140644	140649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545202
3042	NC_021050	TGC	2	6	140705	140710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545202
3043	NC_021050	A	6	6	140813	140818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021050	T	6	6	140828	140833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021050	TTA	2	6	140840	140845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021050	TG	3	6	140973	140978	0 %	50 %	50 %	0 %	482545203
3047	NC_021050	CTTTTT	2	12	141046	141057	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482545203
3048	NC_021050	GAC	2	6	141068	141073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545203
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3050	NC_021050	A	6	6	141219	141224	100 %	0 %	0 %	0 %	482545203
3051	NC_021050	TTA	2	6	141251	141256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021050	T	7	7	141496	141502	0 %	100 %	0 %	0 %	482545204
3053	NC_021050	GAG	2	6	141553	141558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545204
3054	NC_021050	GAAG	2	8	141582	141589	50 %	0 %	50 %	0 %	482545204
3055	NC_021050	AAT	2	6	141707	141712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545204
3056	NC_021050	T	8	8	141712	141719	0 %	100 %	0 %	0 %	482545204
3057	NC_021050	AG	3	6	141772	141777	50 %	0 %	50 %	0 %	482545204
3058	NC_021050	TCT	2	6	141780	141785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545204
3059	NC_021050	T	6	6	141823	141828	0 %	100 %	0 %	0 %	482545204
3060	NC_021050	CTT	2	6	141858	141863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545204
3061	NC_021050	TTG	2	6	141905	141910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545204
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3063	NC_021050	TAA	2	6	142019	142024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545204
3064	NC_021050	TTG	2	6	142028	142033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545204
3065	NC_021050	TTC	2	6	142067	142072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545204
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3067	NC_021050	TTTA	2	8	142151	142158	25 %	75 %	0 %	0 %	482545204
3068	NC_021050	TGG	2	6	142160	142165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545204
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3071	NC_021050	TCA	2	6	142236	142241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545204
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3073	NC_021050	T	6	6	142306	142311	0 %	100 %	0 %	0 %	482545204
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3079	NC_021050	GAG	2	6	142474	142479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545204
3080	NC_021050	AAAG	2	8	142545	142552	75 %	0 %	25 %	0 %	482545205
3081	NC_021050	TCC	2	6	142564	142569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545205
3082	NC_021050	AGG	2	6	142572	142577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545205
3083	NC_021050	A	8	8	142635	142642	100 %	0 %	0 %	0 %	482545205
3084	NC_021050	A	6	6	142699	142704	100 %	0 %	0 %	0 %	482545205
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3088	NC_021050	T	7	7	142779	142785	0 %	100 %	0 %	0 %	482545205
3089	NC_021050	TAG	2	6	142805	142810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545205
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3094	NC_021050	AGC	2	6	142893	142898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545205
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3096	NC_021050	T	7	7	142907	142913	0 %	100 %	0 %	0 %	482545205
3097	NC_021050	T	6	6	142925	142930	0 %	100 %	0 %	0 %	482545205
3098	NC_021050	TGC	2	6	143004	143009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545205
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3101	NC_021050	GTCA	2	8	143064	143071	25 %	25 %	25 %	25 %	482545205
3102	NC_021050	T	8	8	143072	143079	0 %	100 %	0 %	0 %	482545205
3103	NC_021050	A	6	6	143101	143106	100 %	0 %	0 %	0 %	482545205
3104	NC_021050	GTT	3	9	143116	143124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545205
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3106	NC_021050	GTTT	2	8	143159	143166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021050	AGC	2	6	143214	143219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_021050	T	6	6	143287	143292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_021050	TGC	2	6	143304	143309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021050	AGAAA	2	10	143359	143368	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021050	AGA	2	6	143391	143396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021050	TTC	2	6	143397	143402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_021050	ATT	2	6	143422	143427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021050	ATG	2	6	143439	143444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3116	NC_021050	T	6	6	143486	143491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_021050	CTTT	2	8	143576	143583	0 %	75 %	0 %	25 %	482545206
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3122	NC_021050	ATC	2	6	143931	143936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545206
3123	NC_021050	CTTT	2	8	143942	143949	0 %	75 %	0 %	25 %	482545206
3124	NC_021050	ATA	2	6	143952	143957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545206
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3126	NC_021050	GAG	2	6	144047	144052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545206
3127	NC_021050	CTT	2	6	144118	144123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545206
3128	NC_021050	AG	3	6	144217	144222	50 %	0 %	50 %	0 %	482545206
3129	NC_021050	A	7	7	144251	144257	100 %	0 %	0 %	0 %	482545206
3130	NC_021050	AAG	2	6	144285	144290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545206
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3132	NC_021050	A	6	6	144443	144448	100 %	0 %	0 %	0 %	482545206
3133	NC_021050	TTA	2	6	144473	144478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545206
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3135	NC_021050	CTT	2	6	144532	144537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545206
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3140	NC_021050	GA	3	6	144730	144735	50 %	0 %	50 %	0 %	482545206
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3150	NC_021050	CT	3	6	144992	144997	0 %	50 %	0 %	50 %	482545206
3151	NC_021050	GA	3	6	145038	145043	50 %	0 %	50 %	0 %	482545206
3152	NC_021050	AGA	2	6	145078	145083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482545206
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3155	NC_021050	TCA	2	6	145156	145161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545206
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3159	NC_021050	ATT	2	6	145459	145464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545206
3160	NC_021050	TTG	2	6	145478	145483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545206
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3162	NC_021050	TAT	2	6	145616	145621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482545206
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3169	NC_021050	AT	3	6	145894	145899	50 %	50 %	0 %	0 %	482545206
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3172	NC_021050	GACCTG	2	12	146008	146019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482545207
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3182	NC_021050	ATGC	2	8	146350	146357	25 %	25 %	25 %	25 %	482545207
3183	NC_021050	AG	3	6	146375	146380	50 %	0 %	50 %	0 %	482545207
3184	NC_021050	TCT	2	6	146427	146432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545207
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3194	NC_021050	TTTG	2	8	146899	146906	0 %	75 %	25 %	0 %	482545207
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3197	NC_021050	GT	3	6	147027	147032	0 %	50 %	50 %	0 %	482545207
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3200	NC_021050	TTG	2	6	147086	147091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545207
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3212	NC_021050	AG	3	6	147659	147664	50 %	0 %	50 %	0 %	482545208
3213	NC_021050	ATC	2	6	147718	147723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545208
3214	NC_021050	GTTT	2	8	147929	147936	0 %	75 %	25 %	0 %	482545208
3215	NC_021050	TGTT	2	8	147949	147956	0 %	75 %	25 %	0 %	482545208
3216	NC_021050	TTC	2	6	148033	148038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545208
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3218	NC_021050	CT	3	6	148150	148155	0 %	50 %	0 %	50 %	482545208
3219	NC_021050	TTC	2	6	148186	148191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545208
3220	NC_021050	A	7	7	148207	148213	100 %	0 %	0 %	0 %	482545208
3221	NC_021050	CCA	2	6	148274	148279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482545208
3222	NC_021050	TTC	2	6	148301	148306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545208
3223	NC_021050	TAA	2	6	148312	148317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545208
3224	NC_021050	ACA	2	6	148391	148396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545208
3225	NC_021050	AAAG	2	8	148448	148455	75 %	0 %	25 %	0 %	482545208
3226	NC_021050	GAG	2	6	148505	148510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545208
3227	NC_021050	CGA	2	6	148521	148526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482545208
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3229	NC_021050	GAG	2	6	148548	148553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545208
3230	NC_021050	ACA	2	6	148603	148608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482545209
3231	NC_021050	AGT	2	6	148732	148737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545209
3232	NC_021050	AGG	2	6	148896	148901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545209
3233	NC_021050	GAG	2	6	148970	148975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545209
3234	NC_021050	C	6	6	149143	149148	0 %	0 %	0 %	100 %	482545209
3235	NC_021050	AG	3	6	149355	149360	50 %	0 %	50 %	0 %	482545209
3236	NC_021050	TAA	2	6	149394	149399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482545209
3237	NC_021050	A	9	9	149443	149451	100 %	0 %	0 %	0 %	482545209
3238	NC_021050	TA	3	6	149493	149498	50 %	50 %	0 %	0 %	482545209
3239	NC_021050	GGA	2	6	149513	149518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482545209
3240	NC_021050	GTT	2	6	149534	149539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545209
3241	NC_021050	CCTCTA	2	12	149583	149594	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3242	NC_021050	CTT	2	6	149630	149635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545210
3243	NC_021050	T	6	6	149678	149683	0 %	100 %	0 %	0 %	482545210
3244	NC_021050	TTTG	2	8	149687	149694	0 %	75 %	25 %	0 %	482545210
3245	NC_021050	CTG	2	6	149709	149714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545210
3246	NC_021050	AT	3	6	149716	149721	50 %	50 %	0 %	0 %	482545210
3247	NC_021050	CTT	2	6	149843	149848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545210
3248	NC_021050	CTC	2	6	149862	149867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482545210
3249	NC_021050	T	6	6	149888	149893	0 %	100 %	0 %	0 %	482545210
3250	NC_021050	TA	3	6	149925	149930	50 %	50 %	0 %	0 %	482545210
3251	NC_021050	GC	3	6	149943	149948	0 %	0 %	50 %	50 %	482545210
3252	NC_021050	ATC	2	6	149973	149978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545210
3253	NC_021050	T	6	6	150024	150029	0 %	100 %	0 %	0 %	482545210
3254	NC_021050	TTG	2	6	150381	150386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482545210
3255	NC_021050	GCAT	2	8	150424	150431	25 %	25 %	25 %	25 %	482545210
3256	NC_021050	TGC	2	6	150561	150566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545210
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3275	NC_021050	CTT	2	6	151550	151555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482545210
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3283	NC_021050	GCT	2	6	151714	151719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482545210
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3324	NC_021050	GGT	2	6	153962	153967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482545211
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3332	NC_021050	TAG	2	6	154226	154231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482545211
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3350	NC_021050	TCTG	2	8	154997	155004	0 %	50 %	25 %	25 %	482545211
3351	NC_021050	TCA	2	6	155037	155042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482545211
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3353	NC_021050	A	6	6	155171	155176	100 %	0 %	0 %	0 %	482545211
3354	NC_021050	GT	3	6	155193	155198	0 %	50 %	50 %	0 %	482545211
3355	NC_021050	T	6	6	155448	155453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3356	NC_021050	CAA	2	6	155460	155465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3357	NC_021050	GAAGA	2	10	155533	155542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3358	NC_021050	AAG	2	6	155556	155561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3359	NC_021050	A	8	8	155624	155631	100 %	0 %	0 %	0 %	482545212
3360	NC_021050	A	7	7	155642	155648	100 %	0 %	0 %	0 %	482545212
3361	NC_021050	AG	3	6	155653	155658	50 %	0 %	50 %	0 %	482545212
3362	NC_021050	A	8	8	155675	155682	100 %	0 %	0 %	0 %	482545212
3363	NC_021050	A	7	7	155684	155690	100 %	0 %	0 %	0 %	482545212
3364	NC_021050	GT	3	6	155729	155734	0 %	50 %	50 %	0 %	482545212
3365	NC_021050	T	6	6	155767	155772	0 %	100 %	0 %	0 %	482545212
3366	NC_021050	A	6	6	155784	155789	100 %	0 %	0 %	0 %	482545212
3367	NC_021050	A	6	6	155799	155804	100 %	0 %	0 %	0 %	482545212
3368	NC_021050	CTTT	2	8	155827	155834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3369	NC_021050	CGAA	2	8	155835	155842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3370	NC_021050	GAAG	2	8	155847	155854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3371	NC_021050	TAA	2	6	155991	155996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_021050	TA	3	6	156004	156009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_021050	GGC	2	6	156048	156053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3374	NC_021050	AAG	2	6	156215	156220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3376	NC_021050	GA	3	6	156316	156321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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